More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ssed_1270 on replicon NC_009831
Organism: Shewanella sediminis HAW-EB3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
CP001509  ECD_04267  fused predicted transporter subunits of ABC superfamily: ATP-binding components  79.82 
 
 		 555 aa  933    Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3606  ABC transporter related protein  79.82 
 
 		 555 aa  933    Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1644  putative ABC transporter ATP-binding protein  57.94 
 
 		 559 aa  688    Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0674  putative ABC transporter ATP-binding protein  71.07 
 
 		 555 aa  838    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.599551  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1794  putative ABC transporter ATP-binding protein  68.17 
 
 		 555 aa  792    Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.482874  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2913  putative ABC transporter ATP-binding protein  68.06 
 
 		 555 aa  796    Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.010089  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1183  putative ABC transporter ATP-binding protein  95.13 
 
 		 554 aa  1095    Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.976373 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3883  putative ABC transporter ATP-binding protein  79.67 
 
 		 559 aa  924    Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3162  putative ABC transporter ATP-binding protein  92.97 
 
 		 555 aa  1050    Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.322679  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3472  putative ABC transporter ATP-binding protein  93.51 
 
 		 555 aa  1080    Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4602  ABC transporter, ATP-binding protein  70.18 
 
 		 563 aa  829    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.29694  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3581  putative ABC transporter ATP-binding protein  69.19 
 
 		 555 aa  807    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.078032  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1934  putative ABC transporter ATP-binding protein  69.19 
 
 		 555 aa  806    Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.628337  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3306  putative ABC transporter ATP-binding protein  92.61 
 
 		 555 aa  1047    Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000938862 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0510  putative ABC transporter ATP-binding protein  69.19 
 
 		 555 aa  806    Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.292633  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0758  putative ABC transporter ATP-binding protein  65.11 
 
 		 557 aa  763    Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0740  putative ABC transporter ATP-binding protein  65.29 
 
 		 557 aa  765    Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4264  putative ABC transporter ATP-binding protein  70.34 
 
 		 554 aa  834    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0133  putative ABC transporter ATP-binding protein  65.16 
 
 		 553 aa  774    Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.0668164  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1799  putative ABC transporter ATP-binding protein  64.5 
 
 		 554 aa  750    Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.255837 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3489  putative ABC transporter ATP-binding protein  80.18 
 
 		 555 aa  941    Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2084  putative ABC transporter ATP-binding protein  68.05 
 
 		 555 aa  779    Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.695655  normal  0.261341 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3066  putative ABC transporter ATP-binding protein  68.47 
 
 		 555 aa  780    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  hitchhiker  0.00794174  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2430  putative ABC transporter ATP-binding protein  68.47 
 
 		 595 aa  792    Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2580  putative ABC transporter ATP-binding protein  57.66 
 
 		 560 aa  667    Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.471915  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2240  putative ABC transporter ATP-binding protein  55.52 
 
 		 551 aa  639    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.497585 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3595  putative ABC transporter ATP-binding protein  69.19 
 
 		 555 aa  806    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.431194  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1687  putative ABC transporter ATP-binding protein  66.67 
 
 		 557 aa  774    Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.00296418  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4875  putative ABC transporter ATP-binding protein  71.07 
 
 		 554 aa  838    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.54223  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0587  putative ABC transporter ATP-binding protein  55.52 
 
 		 551 aa  639    Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1361  putative ABC transporter ATP-binding protein  57.48 
 
 		 561 aa  664    Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000127735  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3604  putative ABC transporter ATP-binding protein  68.83 
 
 		 555 aa  803    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.943392 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0705  putative ABC transporter ATP-binding protein  70.89 
 
 		 555 aa  837    Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.0956761 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1270  putative ABC transporter ATP-binding protein  100 
 
 		 555 aa  1139    Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000158997 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0490  putative ABC transporter ATP-binding protein  55.52 
 
 		 551 aa  638    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.191061  normal  0.167217 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0668  putative ABC transporter ATP-binding protein  69.19 
 
 		 555 aa  806    Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1926  putative ABC transporter ATP-binding protein  58.41 
 
 		 559 aa  687    Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000000896956  normal  0.905041 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0762  putative ABC transporter ATP-binding protein  70.89 
 
 		 555 aa  845    Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1403  putative ABC transporter ATP-binding protein  70.05 
 
 		 556 aa  816    Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.595923  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3606  putative ABC transporter ATP-binding protein  69.19 
 
 		 555 aa  806    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.776726  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0889  putative ABC transporter ATP-binding protein  65.95 
 
 		 554 aa  781    Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0964  putative ABC transporter ATP-binding protein  69.19 
 
 		 555 aa  806    Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.322458  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1527  putative ABC transporter ATP-binding protein  59.64 
 
 		 559 aa  672    Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2924  putative ABC transporter ATP-binding protein  68.65 
 
 		 555 aa  801    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.570812  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3917  putative ABC transporter ATP-binding protein  65.52 
 
 		 554 aa  744    Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2392  putative ABC transporter ATP-binding protein  56.96 
 
 		 551 aa  635    Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.935698  normal  0.570925 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2991  putative ABC transporter ATP-binding protein  57.3 
 
 		 559 aa  665    Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.187094  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2881  putative ABC transporter ATP-binding protein  69.37 
 
 		 555 aa  809    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.41932  normal  0.0832413 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3627  putative ABC transporter ATP-binding protein  55.9 
 
 		 551 aa  638    Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.108497 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2171  putative ABC transporter ATP-binding protein  65.82 
 
 		 553 aa  756    Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0416  putative ABC transporter ATP-binding protein  67.45 
 
 		 553 aa  792    Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2845  putative ABC transporter ATP-binding protein  58.41 
 
 		 559 aa  672    Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.493421  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3519  putative ABC transporter ATP-binding protein  66.25 
 
 		 553 aa  757    Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.876019  normal  0.0625802 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2152  putative ABC transporter ATP-binding protein  66.37 
 
 		 556 aa  779    Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.0875259  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0443  putative ABC transporter ATP-binding protein  69.33 
 
 		 555 aa  807    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.317561  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1141  putative ABC transporter ATP-binding protein  92.79 
 
 		 555 aa  1061    Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.776403  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00997  putative ABC transporter ATP-binding protein  82.16 
 
 		 555 aa  959    Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2626  putative ABC transporter ATP-binding protein  69.13 
 
 		 578 aa  812    Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.663821  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0671  putative ABC transporter ATP-binding protein  79.1 
 
 		 555 aa  926    Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0144  putative ABC transporter ATP-binding protein  64.98 
 
 		 553 aa  773    Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3221  putative ABC transporter ATP-binding protein  68.83 
 
 		 589 aa  803    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2255  putative ABC transporter ATP-binding protein  56.81 
 
 		 555 aa  646    Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1159  putative ABC transporter ATP-binding protein  96.4 
 
 		 555 aa  1084    Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0545961  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2608  putative ABC transporter ATP-binding protein  66.73 
 
 		 579 aa  759    Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.234433  normal  0.107182 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2587  putative ABC transporter ATP-binding protein  69.55 
 
 		 705 aa  813    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4990  putative ABC transporter ATP-binding protein  79.82 
 
 		 555 aa  933    Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1296  putative ABC transporter ATP-binding protein  79.28 
 
 		 555 aa  916    Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.341182  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4053  putative ABC transporter ATP-binding protein  71.3 
 
 		 553 aa  803    Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1845  putative ABC transporter ATP-binding protein  57.84 
 
 		 556 aa  660    Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000460921 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2197  putative ABC transporter ATP-binding protein  56.42 
 
 		 551 aa  642    Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2495  putative ABC transporter ATP-binding protein  58.77 
 
 		 558 aa  682    Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.290369 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0372  putative ABC transporter ATP-binding protein  80.87 
 
 		 556 aa  946    Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2781  putative ABC transporter ATP-binding protein  92.97 
 
 		 555 aa  1073    Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.957442  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1093  putative ABC transporter ATP-binding protein  92.79 
 
 		 555 aa  1077    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.53945 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1159  putative ABC transporter ATP-binding protein  92.79 
 
 		 555 aa  1077    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.294731 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2098  putative ABC transporter ATP-binding protein  67.99 
 
 		 555 aa  793    Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.249977 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1032  putative ABC transporter ATP-binding protein  92.97 
 
 		 555 aa  1068    Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.144291  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4627  putative ABC transporter ATP-binding protein  79.82 
 
 		 555 aa  933    Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0421  putative ABC transporter ATP-binding protein  69.01 
 
 		 555 aa  805    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3163  putative ABC transporter ATP-binding protein  92.61 
 
 		 555 aa  1047    Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_60800  putative ABC transporter ATP-binding protein  71.43 
 
 		 554 aa  846    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2242  putative ABC transporter ATP-binding protein  64.8 
 
 		 553 aa  771    Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0517  putative ABC transporter ATP-binding protein  69.55 
 
 		 555 aa  811    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.817295  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1245  putative ABC transporter ATP-binding protein  66.55 
 
 		 553 aa  761    Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_4019  putative ABC transporter ATP-binding protein  55.86 
 
 		 561 aa  659    Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.186099 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1864  putative ABC transporter ATP-binding protein  60.51 
 
 		 560 aa  702    Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.733773  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1093  putative ABC transporter ATP-binding protein  92.61 
 
 		 555 aa  1075    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4062  putative ABC transporter ATP-binding protein  64.86 
 
 		 554 aa  745    Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.247157  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1057  putative ABC transporter ATP-binding protein  56.96 
 
 		 559 aa  667    Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0552  putative ABC transporter ATP-binding protein  79.82 
 
 		 555 aa  934    Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2903  putative ABC transporter ATP-binding protein  66.55 
 
 		 553 aa  755    Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0207119 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3241  putative ABC transporter ATP-binding protein  59.1 
 
 		 561 aa  687    Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000308971  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1013  putative ABC transporter ATP-binding protein  90.63 
 
 		 555 aa  1054    Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0229  putative ABC transporter ATP-binding protein  81.26 
 
 		 555 aa  952    Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1437  putative ABC transporter ATP-binding protein  77.44 
 
 		 554 aa  908    Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5235  putative ABC transporter ATP-binding protein  71.07 
 
 		 579 aa  843    Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0840  putative ABC transporter ATP-binding protein  69.98 
 
 		 553 aa  828    Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0661  putative ABC transporter ATP-binding protein  55.68 
 
 		 560 aa  646    Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1801  putative ABC transporter ATP-binding protein  68.35 
 
 		 553 aa  775    Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.124805  normal  0.0665876 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4758  putative ABC transporter ATP-binding protein  66.73 
 
 		 553 aa  760    Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.45011  normal  0.440295 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>