More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Meso_2033 on replicon NC_008254
Organism: Chelativorans sp. BNC1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011757  Mchl_2211  putative ABC transporter ATP-binding protein  72.55 
 
 
550 aa  822    Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.670605  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1448  putative ABC transporter ATP-binding protein  60.8 
 
 
555 aa  695    Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.391667  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1644  putative ABC transporter ATP-binding protein  62.27 
 
 
559 aa  727    Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2891  putative ABC transporter ATP-binding protein  65.17 
 
 
559 aa  736    Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.315278  decreased coverage  0.00408651 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1794  putative ABC transporter ATP-binding protein  62.07 
 
 
555 aa  707    Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.482874  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2913  putative ABC transporter ATP-binding protein  58.84 
 
 
555 aa  656    Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.010089  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3542  putative ABC transporter ATP-binding protein  60 
 
 
558 aa  650    Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.610631  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2991  putative ABC transporter ATP-binding protein  58.96 
 
 
559 aa  681    Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.187094  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1456  putative ABC transporter ATP-binding protein  87.61 
 
 
549 aa  992    Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.504666  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3542  putative ABC transporter ATP-binding protein  60.18 
 
 
558 aa  653    Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.195737  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3159  putative ABC transporter ATP-binding protein  59.75 
 
 
555 aa  667    Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000146292 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1117  putative ABC transporter ATP-binding protein  74.91 
 
 
550 aa  862    Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.188653 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4993  putative ABC transporter ATP-binding protein  56.96 
 
 
555 aa  635    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1411  putative ABC transporter ATP-binding protein  87.59 
 
 
584 aa  989    Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4939  putative ABC transporter ATP-binding protein  56.96 
 
 
555 aa  635    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.909016  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0758  putative ABC transporter ATP-binding protein  55.05 
 
 
557 aa  644    Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0740  putative ABC transporter ATP-binding protein  55.23 
 
 
557 aa  646    Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0834  putative ABC transporter ATP-binding protein  60.47 
 
 
561 aa  719    Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00294599  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3917  putative ABC transporter ATP-binding protein  60.18 
 
 
558 aa  650    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.426446 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2929  putative ABC transporter ATP-binding protein  81.79 
 
 
549 aa  934    Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2216  putative ABC transporter ATP-binding protein  61.9 
 
 
547 aa  672    Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.885012  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3463  putative ABC transporter ATP-binding protein  73.27 
 
 
550 aa  829    Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.427951  normal  0.154208 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3066  putative ABC transporter ATP-binding protein  57.32 
 
 
555 aa  642    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  hitchhiker  0.00794174  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2430  putative ABC transporter ATP-binding protein  57.43 
 
 
595 aa  644    Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2485  putative ABC transporter ATP-binding protein  76.55 
 
 
550 aa  855    Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.445071  normal  0.555297 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2117  putative ABC transporter ATP-binding protein  87.07 
 
 
549 aa  984    Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.129596  normal  0.211481 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2441  putative ABC transporter ATP-binding protein  58.95 
 
 
558 aa  688    Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00204105  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1687  putative ABC transporter ATP-binding protein  59.67 
 
 
557 aa  680    Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.00296418  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3618  putative ABC transporter ATP-binding protein  56.24 
 
 
555 aa  634    Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0587  putative ABC transporter ATP-binding protein  72.58 
 
 
551 aa  843    Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1361  putative ABC transporter ATP-binding protein  58.27 
 
 
561 aa  689    Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000127735  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7137  putative ABC transporter ATP-binding protein  75.27 
 
 
550 aa  853    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4119  putative ABC transporter ATP-binding protein  58.91 
 
 
555 aa  667    Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2152  putative ABC transporter ATP-binding protein  59.71 
 
 
556 aa  685    Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.0875259  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6251  putative ABC transporter ATP-binding protein  76.87 
 
 
549 aa  875    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.223769  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2460  putative ABC transporter ATP-binding protein  65.05 
 
 
559 aa  723    Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.561949  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3241  putative ABC transporter ATP-binding protein  60.65 
 
 
561 aa  716    Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000308971  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1926  putative ABC transporter ATP-binding protein  62.32 
 
 
559 aa  728    Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000000896956  normal  0.905041 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1826  putative ABC transporter ATP-binding protein  71.64 
 
 
550 aa  813    Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.365039  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1281  putative ABC transporter ATP-binding protein  55.78 
 
 
561 aa  660    Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.0000308368  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1403  putative ABC transporter ATP-binding protein  59.31 
 
 
556 aa  678    Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.595923  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1127  putative ABC transporter ATP-binding protein  60.72 
 
 
558 aa  658    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2810  putative ABC transporter ATP-binding protein  59.75 
 
 
555 aa  668    Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.923334 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0563  putative ABC transporter ATP-binding protein  55.62 
 
 
572 aa  634    Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.499297  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1527  putative ABC transporter ATP-binding protein  67.21 
 
 
559 aa  778    Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4905  putative ABC transporter ATP-binding protein  56.96 
 
 
555 aa  635    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1148  putative ABC transporter ATP-binding protein  61.04 
 
 
560 aa  654    Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.493052  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1919  putative ABC transporter ATP-binding protein  75.77 
 
 
549 aa  860    Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.137087  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2351  putative ABC transporter ATP-binding protein  64.58 
 
 
559 aa  740    Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.701309  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3627  putative ABC transporter ATP-binding protein  69.76 
 
 
551 aa  811    Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.108497 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1117  putative ABC transporter ATP-binding protein  59.11 
 
 
558 aa  675    Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.406197  hitchhiker  0.00000247304 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0416  putative ABC transporter ATP-binding protein  57.35 
 
 
553 aa  642    Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2131  putative ABC transporter ATP-binding protein  74.32 
 
 
549 aa  845    Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.198515  normal  0.0197095 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12501  putative ABC transporter ATP-binding protein  60.72 
 
 
558 aa  651    Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  decreased coverage  0.0036999  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2620  putative ABC transporter ATP-binding protein  79.6 
 
 
549 aa  913    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2495  putative ABC transporter ATP-binding protein  60.58 
 
 
558 aa  690    Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.290369 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3452  putative ABC transporter ATP-binding protein  76.5 
 
 
549 aa  865    Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.747993  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1935  putative ABC transporter ATP-binding protein  72.55 
 
 
550 aa  822    Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.461584  normal  0.714392 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4129  putative ABC transporter ATP-binding protein  76.32 
 
 
549 aa  862    Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2911  putative ABC transporter ATP-binding protein  74.91 
 
 
550 aa  848    Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.608005  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2197  putative ABC transporter ATP-binding protein  72.68 
 
 
551 aa  844    Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4832  putative ABC transporter ATP-binding protein  56.96 
 
 
555 aa  637    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.218638  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3221  putative ABC transporter ATP-binding protein  57.32 
 
 
589 aa  650    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2255  putative ABC transporter ATP-binding protein  68.97 
 
 
555 aa  808    Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1284  putative ABC transporter ATP-binding protein  66.73 
 
 
670 aa  776    Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0959  putative ABC transporter ATP-binding protein  82.15 
 
 
549 aa  931    Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.465393  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1058  putative ABC transporter ATP-binding protein  55.42 
 
 
560 aa  644    Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3615  putative ABC transporter ATP-binding protein  59.64 
 
 
557 aa  638    Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3474  putative ABC transporter ATP-binding protein  73.86 
 
 
551 aa  820    Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.128055  normal  0.617651 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2033  putative ABC transporter ATP-binding protein  100 
 
 
549 aa  1129    Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1845  putative ABC transporter ATP-binding protein  57.53 
 
 
556 aa  673    Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000460921 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3620  putative ABC transporter ATP-binding protein  59.64 
 
 
557 aa  638    Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.914588  normal  0.710746 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3489  putative ABC transporter ATP-binding protein  56.24 
 
 
555 aa  634    Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6356  putative ABC transporter ATP-binding protein  75.09 
 
 
550 aa  852    Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.109322 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2568  putative ABC transporter ATP-binding protein  61.98 
 
 
557 aa  660    Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.878611  normal  0.580087 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2845  putative ABC transporter ATP-binding protein  59.28 
 
 
559 aa  671    Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.493421  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3426  putative ABC transporter ATP-binding protein  60.11 
 
 
561 aa  716    Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2098  putative ABC transporter ATP-binding protein  61.52 
 
 
555 aa  705    Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.249977 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0238  putative ABC transporter ATP-binding protein  65.47 
 
 
559 aa  758    Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.331867 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2105  putative ABC transporter ATP-binding protein  65.52 
 
 
555 aa  766    Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0115  putative ABC transporter ATP-binding protein  72.91 
 
 
550 aa  821    Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2240  putative ABC transporter ATP-binding protein  72.58 
 
 
551 aa  843    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.497585 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2881  putative ABC transporter ATP-binding protein  57.76 
 
 
555 aa  636    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.41932  normal  0.0832413 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1718  putative ABC transporter ATP-binding protein  87.07 
 
 
549 aa  985    Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2880  putative ABC transporter ATP-binding protein  80.51 
 
 
549 aa  919    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.824373  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1466  putative ABC transporter ATP-binding protein  59.1 
 
 
558 aa  676    Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.000105508  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_4019  putative ABC transporter ATP-binding protein  59.75 
 
 
561 aa  703    Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.186099 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1864  putative ABC transporter ATP-binding protein  58.63 
 
 
560 aa  665    Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.733773  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5318  putative ABC transporter ATP-binding protein  59.96 
 
 
560 aa  649    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.134924  normal  0.268079 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1614  putative ABC transporter ATP-binding protein  62.57 
 
 
556 aa  680    Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.682319  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1057  putative ABC transporter ATP-binding protein  61.23 
 
 
559 aa  703    Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0490  putative ABC transporter ATP-binding protein  72.21 
 
 
551 aa  837    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.191061  normal  0.167217 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2008  putative ABC transporter ATP-binding protein  74.95 
 
 
551 aa  867    Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2580  putative ABC transporter ATP-binding protein  60.07 
 
 
560 aa  706    Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.471915  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2392  putative ABC transporter ATP-binding protein  71.22 
 
 
551 aa  806    Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.935698  normal  0.570925 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3688  putative ABC transporter ATP-binding protein  59.64 
 
 
557 aa  638    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1137  putative ABC transporter ATP-binding protein  55.42 
 
 
560 aa  653    Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  decreased coverage  0.000210355  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4070  putative ABC transporter ATP-binding protein  61.62 
 
 
557 aa  661    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.715968 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3414  putative ABC transporter ATP-binding protein  65.65 
 
 
555 aa  768    Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.106241  normal  0.225653 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0661  putative ABC transporter ATP-binding protein  57.4 
 
 
560 aa  657    Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>