More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tfu_2216 on replicon NC_007333
Organism: Thermobifida fusca YX



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011769  DvMF_1058  putative ABC transporter ATP-binding protein  55.45 
 
 		 560 aa  636    Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2642  putative ABC transporter ATP-binding protein  75.99 
 
 		 560 aa  830    Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.520141 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1644  putative ABC transporter ATP-binding protein  59.67 
 
 		 559 aa  690    Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0674  putative ABC transporter ATP-binding protein  60.15 
 
 		 555 aa  644    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.599551  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1794  putative ABC transporter ATP-binding protein  63.69 
 
 		 555 aa  701    Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.482874  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7137  putative ABC transporter ATP-binding protein  59.6 
 
 		 550 aa  642    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3620  putative ABC transporter ATP-binding protein  74.41 
 
 		 557 aa  815    Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.914588  normal  0.710746 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3883  putative ABC transporter ATP-binding protein  57.09 
 
 		 559 aa  635    Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1456  putative ABC transporter ATP-binding protein  62.09 
 
 		 549 aa  672    Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.504666  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4510  putative ABC transporter ATP-binding protein  59.78 
 
 		 555 aa  643    Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.29936  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4602  ABC transporter, ATP-binding protein  59.7 
 
 		 563 aa  645    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.29694  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3474  putative ABC transporter ATP-binding protein  61.43 
 
 		 551 aa  655    Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.128055  normal  0.617651 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3463  putative ABC transporter ATP-binding protein  59.49 
 
 		 550 aa  635    Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.427951  normal  0.154208 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2929  putative ABC transporter ATP-binding protein  59.71 
 
 		 549 aa  653    Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2460  putative ABC transporter ATP-binding protein  60.62 
 
 		 559 aa  645    Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.561949  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2620  putative ABC transporter ATP-binding protein  59.71 
 
 		 549 aa  653    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0758  putative ABC transporter ATP-binding protein  57.14 
 
 		 557 aa  640    Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0740  putative ABC transporter ATP-binding protein  57.14 
 
 		 557 aa  641    Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4264  putative ABC transporter ATP-binding protein  59.7 
 
 		 554 aa  644    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3414  putative ABC transporter ATP-binding protein  60.22 
 
 		 555 aa  665    Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.106241  normal  0.225653 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1117  putative ABC transporter ATP-binding protein  59.23 
 
 		 550 aa  652    Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.188653 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2216  putative ABC transporter ATP-binding protein  100 
 
 		 547 aa  1117    Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.885012  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0705  putative ABC transporter ATP-binding protein  59.96 
 
 		 555 aa  643    Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.0956761 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0490  putative ABC transporter ATP-binding protein  61.24 
 
 		 551 aa  685    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.191061  normal  0.167217 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3542  putative ABC transporter ATP-binding protein  76.95 
 
 		 558 aa  864    Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.195737  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1448  putative ABC transporter ATP-binding protein  61.45 
 
 		 555 aa  677    Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.391667  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2485  putative ABC transporter ATP-binding protein  62.94 
 
 		 550 aa  667    Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.445071  normal  0.555297 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2240  putative ABC transporter ATP-binding protein  60.88 
 
 		 551 aa  682    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.497585 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2991  putative ABC transporter ATP-binding protein  57.07 
 
 		 559 aa  645    Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.187094  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1687  putative ABC transporter ATP-binding protein  61.34 
 
 		 557 aa  681    Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.00296418  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4875  putative ABC transporter ATP-binding protein  59.89 
 
 		 554 aa  639    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.54223  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0587  putative ABC transporter ATP-binding protein  60.88 
 
 		 551 aa  682    Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1361  putative ABC transporter ATP-binding protein  57.82 
 
 		 561 aa  672    Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000127735  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2117  putative ABC transporter ATP-binding protein  60.62 
 
 		 549 aa  667    Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.129596  normal  0.211481 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2495  putative ABC transporter ATP-binding protein  56.03 
 
 		 558 aa  636    Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.290369 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2568  putative ABC transporter ATP-binding protein  76.77 
 
 		 557 aa  842    Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.878611  normal  0.580087 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1466  putative ABC transporter ATP-binding protein  58.15 
 
 		 558 aa  644    Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.000105508  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0834  putative ABC transporter ATP-binding protein  59.45 
 
 		 561 aa  680    Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00294599  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1926  putative ABC transporter ATP-binding protein  58.76 
 
 		 559 aa  676    Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000000896956  normal  0.905041 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0762  putative ABC transporter ATP-binding protein  59.96 
 
 		 555 aa  644    Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1281  putative ABC transporter ATP-binding protein  56.18 
 
 		 561 aa  647    Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.0000308368  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1403  putative ABC transporter ATP-binding protein  58.78 
 
 		 556 aa  645    Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.595923  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1411  putative ABC transporter ATP-binding protein  62.02 
 
 		 584 aa  669    Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1718  putative ABC transporter ATP-binding protein  61.72 
 
 		 549 aa  668    Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3489  putative ABC transporter ATP-binding protein  57.17 
 
 		 555 aa  635    Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1527  putative ABC transporter ATP-binding protein  60.98 
 
 		 559 aa  686    Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1117  putative ABC transporter ATP-binding protein  58.49 
 
 		 558 aa  649    Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.406197  hitchhiker  0.00000247304 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2580  putative ABC transporter ATP-binding protein  57.45 
 
 		 560 aa  667    Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.471915  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3241  putative ABC transporter ATP-binding protein  58.18 
 
 		 561 aa  674    Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000308971  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1148  putative ABC transporter ATP-binding protein  72.38 
 
 		 560 aa  801    Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.493052  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1919  putative ABC transporter ATP-binding protein  62.27 
 
 		 549 aa  667    Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.137087  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2351  putative ABC transporter ATP-binding protein  59.31 
 
 		 559 aa  657    Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.701309  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3627  putative ABC transporter ATP-binding protein  59.23 
 
 		 551 aa  657    Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.108497 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3917  putative ABC transporter ATP-binding protein  77.5 
 
 		 558 aa  859    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.426446 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2197  putative ABC transporter ATP-binding protein  60.33 
 
 		 551 aa  670    Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2131  putative ABC transporter ATP-binding protein  60.07 
 
 		 549 aa  646    Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.198515  normal  0.0197095 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0238  putative ABC transporter ATP-binding protein  59.04 
 
 		 559 aa  646    Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.331867 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12501  putative ABC transporter ATP-binding protein  75.45 
 
 		 558 aa  833    Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  decreased coverage  0.0036999  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3452  putative ABC transporter ATP-binding protein  62.09 
 
 		 549 aa  666    Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.747993  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0706  putative ABC transporter ATP-binding protein  59.78 
 
 		 555 aa  639    Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.483075  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2911  putative ABC transporter ATP-binding protein  62.01 
 
 		 550 aa  659    Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.608005  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2441  putative ABC transporter ATP-binding protein  58.39 
 
 		 558 aa  663    Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00204105  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_08900  putative ABC transporter ATP-binding protein  75.27 
 
 		 560 aa  835    Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.210485  normal  0.0113448 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1855  putative ABC transporter ATP-binding protein  69.44 
 
 		 559 aa  762    Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2255  putative ABC transporter ATP-binding protein  60.33 
 
 		 555 aa  682    Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1284  putative ABC transporter ATP-binding protein  60.4 
 
 		 670 aa  677    Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1127  putative ABC transporter ATP-binding protein  75.14 
 
 		 558 aa  836    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2392  putative ABC transporter ATP-binding protein  61.52 
 
 		 551 aa  667    Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.935698  normal  0.570925 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3615  putative ABC transporter ATP-binding protein  74.41 
 
 		 557 aa  815    Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6251  putative ABC transporter ATP-binding protein  60.81 
 
 		 549 aa  664    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.223769  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2033  putative ABC transporter ATP-binding protein  61.9 
 
 		 549 aa  670    Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1845  putative ABC transporter ATP-binding protein  59.85 
 
 		 556 aa  662    Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000460921 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3542  putative ABC transporter ATP-binding protein  77.5 
 
 		 558 aa  860    Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.610631  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2880  putative ABC transporter ATP-binding protein  60.26 
 
 		 549 aa  654    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.824373  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_09750  putative ABC transporter ATP-binding protein  74.91 
 
 		 560 aa  828    Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4119  putative ABC transporter ATP-binding protein  60.15 
 
 		 555 aa  660    Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2891  putative ABC transporter ATP-binding protein  59.53 
 
 		 559 aa  637    Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.315278  decreased coverage  0.00408651 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4129  putative ABC transporter ATP-binding protein  62.82 
 
 		 549 aa  670    Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2098  putative ABC transporter ATP-binding protein  61.38 
 
 		 555 aa  682    Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.249977 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6356  putative ABC transporter ATP-binding protein  59.78 
 
 		 550 aa  644    Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.109322 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2105  putative ABC transporter ATP-binding protein  61.38 
 
 		 555 aa  669    Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2171  putative ABC transporter ATP-binding protein  76.17 
 
 		 560 aa  834    Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000196153 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5318  putative ABC transporter ATP-binding protein  73.47 
 
 		 560 aa  814    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.134924  normal  0.268079 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_60800  putative ABC transporter ATP-binding protein  58.96 
 
 		 554 aa  635    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2418  putative ABC transporter ATP-binding protein  74.91 
 
 		 560 aa  824    Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0404573  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3618  putative ABC transporter ATP-binding protein  57.17 
 
 		 555 aa  635    Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2152  putative ABC transporter ATP-binding protein  59.4 
 
 		 556 aa  659    Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.0875259  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_4019  putative ABC transporter ATP-binding protein  56.18 
 
 		 561 aa  663    Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.186099 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1864  putative ABC transporter ATP-binding protein  57.04 
 
 		 560 aa  637    Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.733773  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_11760  putative ABC transporter ATP-binding protein  77.5 
 
 		 558 aa  848    Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.406602 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1614  putative ABC transporter ATP-binding protein  78.73 
 
 		 556 aa  874    Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.682319  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1057  putative ABC transporter ATP-binding protein  58.58 
 
 		 559 aa  665    Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3426  putative ABC transporter ATP-binding protein  59.45 
 
 		 561 aa  680    Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2008  putative ABC transporter ATP-binding protein  61.97 
 
 		 551 aa  684    Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1369  putative ABC transporter ATP-binding protein  73.65 
 
 		 560 aa  804    Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.482048  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1137  putative ABC transporter ATP-binding protein  57.09 
 
 		 560 aa  639    Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  decreased coverage  0.000210355  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3688  putative ABC transporter ATP-binding protein  74.41 
 
 		 557 aa  815    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_22290  putative ABC transporter ATP-binding protein  70.22 
 
 		 559 aa  765    Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.793295  normal  0.525138 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4070  putative ABC transporter ATP-binding protein  77.09 
 
 		 557 aa  839    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.715968 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7359  putative ABC transporter ATP-binding protein  78.43 
 
 		 554 aa  879    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.625389 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>