More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Avi_2929 on replicon NC_011989
Organism: Agrobacterium vitis S4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
CP001509  ECD_04267  fused predicted transporter subunits of ABC superfamily: ATP-binding components  56.06 
 
 
555 aa  640    Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3606  ABC transporter related protein  56.06 
 
 
555 aa  640    Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1644  putative ABC transporter ATP-binding protein  60.87 
 
 
559 aa  724    Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2991  putative ABC transporter ATP-binding protein  57.53 
 
 
559 aa  676    Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.187094  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2608  putative ABC transporter ATP-binding protein  56.99 
 
 
579 aa  639    Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.234433  normal  0.107182 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1794  putative ABC transporter ATP-binding protein  60.62 
 
 
555 aa  699    Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.482874  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2913  putative ABC transporter ATP-binding protein  57.32 
 
 
555 aa  653    Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.010089  normal 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3581  putative ABC transporter ATP-binding protein  56.96 
 
 
555 aa  644    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.078032  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2117  putative ABC transporter ATP-binding protein  83.06 
 
 
549 aa  955    Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.129596  normal  0.211481 
 
 
-
 
NC_004310  BR1456  putative ABC transporter ATP-binding protein  85.43 
 
 
549 aa  964    Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.504666  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2881  putative ABC transporter ATP-binding protein  58.05 
 
 
555 aa  654    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.41932  normal  0.0832413 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4990  putative ABC transporter ATP-binding protein  56.06 
 
 
555 aa  640    Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1934  putative ABC transporter ATP-binding protein  56.96 
 
 
555 aa  645    Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.628337  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4941  putative ABC transporter ATP-binding protein  56.06 
 
 
555 aa  640    Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.963786 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3606  putative ABC transporter ATP-binding protein  56.96 
 
 
555 aa  645    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.776726  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0510  putative ABC transporter ATP-binding protein  56.96 
 
 
555 aa  645    Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.292633  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0758  putative ABC transporter ATP-binding protein  54.87 
 
 
557 aa  640    Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0740  putative ABC transporter ATP-binding protein  54.87 
 
 
557 aa  640    Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0671  putative ABC transporter ATP-binding protein  55.52 
 
 
555 aa  637    Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3489  putative ABC transporter ATP-binding protein  57.14 
 
 
555 aa  655    Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1799  putative ABC transporter ATP-binding protein  56.42 
 
 
554 aa  644    Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.255837 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2216  putative ABC transporter ATP-binding protein  59.71 
 
 
547 aa  657    Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.885012  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0964  putative ABC transporter ATP-binding protein  56.96 
 
 
555 aa  645    Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.322458  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3066  putative ABC transporter ATP-binding protein  56.24 
 
 
555 aa  650    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  hitchhiker  0.00794174  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2430  putative ABC transporter ATP-binding protein  56.6 
 
 
595 aa  650    Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2485  putative ABC transporter ATP-binding protein  75.09 
 
 
550 aa  853    Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.445071  normal  0.555297 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2197  putative ABC transporter ATP-binding protein  70.49 
 
 
551 aa  822    Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3595  putative ABC transporter ATP-binding protein  56.96 
 
 
555 aa  645    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.431194  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1687  putative ABC transporter ATP-binding protein  57.87 
 
 
557 aa  674    Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.00296418  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2580  putative ABC transporter ATP-binding protein  57.55 
 
 
560 aa  688    Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.471915  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0587  putative ABC transporter ATP-binding protein  69.84 
 
 
551 aa  818    Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1361  putative ABC transporter ATP-binding protein  59.28 
 
 
561 aa  700    Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000127735  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3604  putative ABC transporter ATP-binding protein  57.32 
 
 
555 aa  648    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.943392 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2152  putative ABC transporter ATP-binding protein  58.26 
 
 
556 aa  679    Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.0875259  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2084  putative ABC transporter ATP-binding protein  55.98 
 
 
555 aa  640    Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.695655  normal  0.261341 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1926  putative ABC transporter ATP-binding protein  61.05 
 
 
559 aa  726    Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000000896956  normal  0.905041 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0552  putative ABC transporter ATP-binding protein  55.52 
 
 
555 aa  638    Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1281  putative ABC transporter ATP-binding protein  54.51 
 
 
561 aa  652    Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.0000308368  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1403  putative ABC transporter ATP-binding protein  58.77 
 
 
556 aa  674    Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.595923  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3241  putative ABC transporter ATP-binding protein  60.29 
 
 
561 aa  713    Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000308971  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5318  putative ABC transporter ATP-binding protein  58.71 
 
 
560 aa  639    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.134924  normal  0.268079 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1527  putative ABC transporter ATP-binding protein  66.49 
 
 
559 aa  773    Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2924  putative ABC transporter ATP-binding protein  57.14 
 
 
555 aa  648    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.570812  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0822  putative ABC transporter ATP-binding protein  57.14 
 
 
555 aa  654    Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1148  putative ABC transporter ATP-binding protein  59.25 
 
 
560 aa  640    Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.493052  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1919  putative ABC transporter ATP-binding protein  73.41 
 
 
549 aa  842    Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.137087  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2351  putative ABC transporter ATP-binding protein  63.15 
 
 
559 aa  733    Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.701309  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3627  putative ABC transporter ATP-binding protein  68.49 
 
 
551 aa  801    Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.108497 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2392  putative ABC transporter ATP-binding protein  69.4 
 
 
551 aa  790    Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.935698  normal  0.570925 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2171  putative ABC transporter ATP-binding protein  58.44 
 
 
553 aa  661    Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0416  putative ABC transporter ATP-binding protein  56.62 
 
 
553 aa  645    Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2131  putative ABC transporter ATP-binding protein  72.31 
 
 
549 aa  830    Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.198515  normal  0.0197095 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3519  putative ABC transporter ATP-binding protein  57.17 
 
 
553 aa  637    Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.876019  normal  0.0625802 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0443  putative ABC transporter ATP-binding protein  56.96 
 
 
555 aa  650    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.317561  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2495  putative ABC transporter ATP-binding protein  58.41 
 
 
558 aa  674    Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.290369 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3452  putative ABC transporter ATP-binding protein  73.77 
 
 
549 aa  843    Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.747993  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3542  putative ABC transporter ATP-binding protein  60.72 
 
 
558 aa  657    Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.610631  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4627  putative ABC transporter ATP-binding protein  56.06 
 
 
555 aa  640    Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2911  putative ABC transporter ATP-binding protein  74.18 
 
 
550 aa  848    Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.608005  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12501  putative ABC transporter ATP-binding protein  61.26 
 
 
558 aa  656    Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  decreased coverage  0.0036999  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0490  putative ABC transporter ATP-binding protein  69.65 
 
 
551 aa  816    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.191061  normal  0.167217 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3221  putative ABC transporter ATP-binding protein  56.78 
 
 
589 aa  664    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2255  putative ABC transporter ATP-binding protein  65.15 
 
 
555 aa  770    Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1284  putative ABC transporter ATP-binding protein  66.37 
 
 
670 aa  776    Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1245  putative ABC transporter ATP-binding protein  57.07 
 
 
553 aa  635    Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2587  putative ABC transporter ATP-binding protein  57.5 
 
 
705 aa  651    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3917  putative ABC transporter ATP-binding protein  60.36 
 
 
558 aa  656    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.426446 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2845  putative ABC transporter ATP-binding protein  56.94 
 
 
559 aa  657    Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.493421  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2033  putative ABC transporter ATP-binding protein  81.79 
 
 
549 aa  935    Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1845  putative ABC transporter ATP-binding protein  57.35 
 
 
556 aa  673    Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000460921 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0668  putative ABC transporter ATP-binding protein  56.96 
 
 
555 aa  645    Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0959  putative ABC transporter ATP-binding protein  80.33 
 
 
549 aa  908    Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.465393  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0372  putative ABC transporter ATP-binding protein  56.65 
 
 
556 aa  645    Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3618  putative ABC transporter ATP-binding protein  57.14 
 
 
555 aa  655    Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5235  putative ABC transporter ATP-binding protein  56.52 
 
 
579 aa  636    Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3542  putative ABC transporter ATP-binding protein  58.92 
 
 
558 aa  646    Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.195737  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2098  putative ABC transporter ATP-binding protein  60.8 
 
 
555 aa  704    Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.249977 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6251  putative ABC transporter ATP-binding protein  73.04 
 
 
549 aa  848    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.223769  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2105  putative ABC transporter ATP-binding protein  64.26 
 
 
555 aa  756    Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0421  putative ABC transporter ATP-binding protein  57.32 
 
 
555 aa  645    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2568  putative ABC transporter ATP-binding protein  60.36 
 
 
557 aa  640    Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.878611  normal  0.580087 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_60800  putative ABC transporter ATP-binding protein  56.52 
 
 
554 aa  635    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1411  putative ABC transporter ATP-binding protein  85.4 
 
 
584 aa  960    Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0517  putative ABC transporter ATP-binding protein  57.5 
 
 
555 aa  650    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.817295  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2240  putative ABC transporter ATP-binding protein  69.84 
 
 
551 aa  818    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.497585 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_4019  putative ABC transporter ATP-binding protein  57.58 
 
 
561 aa  685    Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.186099 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1864  putative ABC transporter ATP-binding protein  55.58 
 
 
560 aa  641    Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.733773  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3474  putative ABC transporter ATP-binding protein  71.85 
 
 
551 aa  813    Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.128055  normal  0.617651 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1614  putative ABC transporter ATP-binding protein  58.77 
 
 
556 aa  645    Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.682319  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1057  putative ABC transporter ATP-binding protein  59.96 
 
 
559 aa  701    Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0238  putative ABC transporter ATP-binding protein  64.04 
 
 
559 aa  753    Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.331867 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2008  putative ABC transporter ATP-binding protein  71.66 
 
 
551 aa  837    Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1718  putative ABC transporter ATP-binding protein  85.43 
 
 
549 aa  966    Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2460  putative ABC transporter ATP-binding protein  63.06 
 
 
559 aa  709    Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.561949  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1935  putative ABC transporter ATP-binding protein  70.73 
 
 
550 aa  808    Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.461584  normal  0.714392 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3665  putative ABC transporter ATP-binding protein  56.06 
 
 
555 aa  640    Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4070  putative ABC transporter ATP-binding protein  61.08 
 
 
557 aa  646    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.715968 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3414  putative ABC transporter ATP-binding protein  63.85 
 
 
555 aa  751    Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.106241  normal  0.225653 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0661  putative ABC transporter ATP-binding protein  54.51 
 
 
560 aa  642    Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1801  putative ABC transporter ATP-binding protein  56.81 
 
 
553 aa  638    Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.124805  normal  0.0665876 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>