More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Smed_2117 on replicon NC_009636
Organism: Sinorhizobium medicae WSM419



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010511  M446_6356  putative ABC transporter ATP-binding protein  73.45 
 
 		 550 aa  836    Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.109322 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1826  putative ABC transporter ATP-binding protein  72.55 
 
 		 550 aa  819    Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.365039  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1644  putative ABC transporter ATP-binding protein  61.37 
 
 		 559 aa  727    Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0447  putative ABC transporter ATP-binding protein  57.14 
 
 		 570 aa  641    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.46914  normal  0.303037 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0959  putative ABC transporter ATP-binding protein  81.42 
 
 		 549 aa  924    Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.465393  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1794  putative ABC transporter ATP-binding protein  61.34 
 
 		 555 aa  697    Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.482874  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2913  putative ABC transporter ATP-binding protein  58.27 
 
 		 555 aa  660    Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.010089  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3620  putative ABC transporter ATP-binding protein  58.74 
 
 		 557 aa  637    Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.914588  normal  0.710746 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0706  putative ABC transporter ATP-binding protein  56.42 
 
 		 555 aa  634    Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.483075  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR1456  putative ABC transporter ATP-binding protein  87.8 
 
 		 549 aa  991    Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.504666  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2117  putative ABC transporter ATP-binding protein  100 
 
 		 549 aa  1130    Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.129596  normal  0.211481 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3463  putative ABC transporter ATP-binding protein  72.36 
 
 		 550 aa  822    Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.427951  normal  0.154208 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2713  putative ABC transporter ATP-binding protein  56.78 
 
 		 555 aa  640    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.776803  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6251  putative ABC transporter ATP-binding protein  75.77 
 
 		 549 aa  867    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.223769  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2568  putative ABC transporter ATP-binding protein  60.36 
 
 		 557 aa  656    Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.878611  normal  0.580087 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0510  putative ABC transporter ATP-binding protein  56.78 
 
 		 555 aa  639    Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.292633  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0758  putative ABC transporter ATP-binding protein  55.23 
 
 		 557 aa  649    Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0740  putative ABC transporter ATP-binding protein  55.23 
 
 		 557 aa  648    Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0822  putative ABC transporter ATP-binding protein  56.78 
 
 		 555 aa  651    Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2881  putative ABC transporter ATP-binding protein  58.05 
 
 		 555 aa  648    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.41932  normal  0.0832413 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4129  putative ABC transporter ATP-binding protein  75.77 
 
 		 549 aa  859    Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2216  putative ABC transporter ATP-binding protein  60.62 
 
 		 547 aa  667    Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.885012  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1411  putative ABC transporter ATP-binding protein  87.77 
 
 		 584 aa  988    Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3066  putative ABC transporter ATP-binding protein  56.96 
 
 		 555 aa  654    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  hitchhiker  0.00794174  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2430  putative ABC transporter ATP-binding protein  56.6 
 
 		 595 aa  647    Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3618  putative ABC transporter ATP-binding protein  56.78 
 
 		 555 aa  652    Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2485  putative ABC transporter ATP-binding protein  76.91 
 
 		 550 aa  863    Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.445071  normal  0.555297 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3606  putative ABC transporter ATP-binding protein  56.78 
 
 		 555 aa  639    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.776726  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3595  putative ABC transporter ATP-binding protein  56.78 
 
 		 555 aa  639    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.431194  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1687  putative ABC transporter ATP-binding protein  60.04 
 
 		 557 aa  689    Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.00296418  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0489  putative ABC transporter ATP-binding protein  57.14 
 
 		 555 aa  644    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.890406 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0587  putative ABC transporter ATP-binding protein  71.66 
 
 		 551 aa  835    Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1361  putative ABC transporter ATP-binding protein  58.99 
 
 		 561 aa  691    Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000127735  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3604  putative ABC transporter ATP-binding protein  56.96 
 
 		 555 aa  639    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.943392 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2197  putative ABC transporter ATP-binding protein  72.5 
 
 		 551 aa  845    Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3241  putative ABC transporter ATP-binding protein  59.03 
 
 		 561 aa  707    Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000308971  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0668  putative ABC transporter ATP-binding protein  56.78 
 
 		 555 aa  639    Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2152  putative ABC transporter ATP-binding protein  59.35 
 
 		 556 aa  686    Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.0875259  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1926  putative ABC transporter ATP-binding protein  60.87 
 
 		 559 aa  718    Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000000896956  normal  0.905041 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1935  putative ABC transporter ATP-binding protein  72.91 
 
 		 550 aa  824    Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.461584  normal  0.714392 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1281  putative ABC transporter ATP-binding protein  55.05 
 
 		 561 aa  659    Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.0000308368  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1403  putative ABC transporter ATP-binding protein  59.49 
 
 		 556 aa  680    Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.595923  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1934  putative ABC transporter ATP-binding protein  56.78 
 
 		 555 aa  639    Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.628337  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3159  putative ABC transporter ATP-binding protein  59.57 
 
 		 555 aa  667    Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000146292 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2240  putative ABC transporter ATP-binding protein  71.66 
 
 		 551 aa  835    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.497585 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1527  putative ABC transporter ATP-binding protein  66.49 
 
 		 559 aa  772    Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2924  putative ABC transporter ATP-binding protein  56.96 
 
 		 555 aa  642    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.570812  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4941  putative ABC transporter ATP-binding protein  55.52 
 
 		 555 aa  635    Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.963786 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1148  putative ABC transporter ATP-binding protein  59.43 
 
 		 560 aa  645    Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.493052  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1919  putative ABC transporter ATP-binding protein  76.14 
 
 		 549 aa  867    Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.137087  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2351  putative ABC transporter ATP-binding protein  64.04 
 
 		 559 aa  738    Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.701309  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3627  putative ABC transporter ATP-binding protein  69.76 
 
 		 551 aa  808    Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.108497 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2891  putative ABC transporter ATP-binding protein  64.45 
 
 		 559 aa  734    Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.315278  decreased coverage  0.00408651 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0834  putative ABC transporter ATP-binding protein  60.29 
 
 		 561 aa  721    Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00294599  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2131  putative ABC transporter ATP-binding protein  73.77 
 
 		 549 aa  837    Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.198515  normal  0.0197095 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0238  putative ABC transporter ATP-binding protein  65.3 
 
 		 559 aa  756    Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.331867 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0443  putative ABC transporter ATP-binding protein  56.96 
 
 		 555 aa  644    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.317561  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3489  putative ABC transporter ATP-binding protein  56.78 
 
 		 555 aa  652    Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3452  putative ABC transporter ATP-binding protein  76.5 
 
 		 549 aa  865    Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.747993  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5318  putative ABC transporter ATP-binding protein  58.35 
 
 		 560 aa  639    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.134924  normal  0.268079 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2911  putative ABC transporter ATP-binding protein  76.55 
 
 		 550 aa  863    Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.608005  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2495  putative ABC transporter ATP-binding protein  59.67 
 
 		 558 aa  682    Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.290369 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0964  putative ABC transporter ATP-binding protein  56.78 
 
 		 555 aa  639    Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.322458  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3221  putative ABC transporter ATP-binding protein  57.5 
 
 		 589 aa  670    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2255  putative ABC transporter ATP-binding protein  67.51 
 
 		 555 aa  794    Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1284  putative ABC transporter ATP-binding protein  67.08 
 
 		 670 aa  779    Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2587  putative ABC transporter ATP-binding protein  57.14 
 
 		 705 aa  644    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3615  putative ABC transporter ATP-binding protein  58.74 
 
 		 557 aa  637    Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1117  putative ABC transporter ATP-binding protein  74.73 
 
 		 550 aa  860    Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.188653 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2033  putative ABC transporter ATP-binding protein  87.07 
 
 		 549 aa  980    Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1845  putative ABC transporter ATP-binding protein  57.17 
 
 		 556 aa  677    Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000460921 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3542  putative ABC transporter ATP-binding protein  59.64 
 
 		 558 aa  650    Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.610631  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0490  putative ABC transporter ATP-binding protein  71.66 
 
 		 551 aa  836    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.191061  normal  0.167217 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3414  putative ABC transporter ATP-binding protein  63.85 
 
 		 555 aa  754    Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.106241  normal  0.225653 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2460  putative ABC transporter ATP-binding protein  64.14 
 
 		 559 aa  725    Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.561949  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2392  putative ABC transporter ATP-binding protein  71.4 
 
 		 551 aa  810    Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.935698  normal  0.570925 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12501  putative ABC transporter ATP-binding protein  60 
 
 		 558 aa  653    Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  decreased coverage  0.0036999  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2098  putative ABC transporter ATP-binding protein  60.98 
 
 		 555 aa  704    Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.249977 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0671  putative ABC transporter ATP-binding protein  55.52 
 
 		 555 aa  638    Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2105  putative ABC transporter ATP-binding protein  66.25 
 
 		 555 aa  780    Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0421  putative ABC transporter ATP-binding protein  56.78 
 
 		 555 aa  635    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2991  putative ABC transporter ATP-binding protein  58.42 
 
 		 559 aa  682    Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.187094  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3514  putative ABC transporter ATP-binding protein  56.6 
 
 		 554 aa  635    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0491494  normal  0.117692 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0517  putative ABC transporter ATP-binding protein  57.14 
 
 		 555 aa  644    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.817295  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_4019  putative ABC transporter ATP-binding protein  57.94 
 
 		 561 aa  690    Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.186099 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1864  putative ABC transporter ATP-binding protein  56.47 
 
 		 560 aa  649    Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.733773  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3542  putative ABC transporter ATP-binding protein  59.28 
 
 		 558 aa  655    Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.195737  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1614  putative ABC transporter ATP-binding protein  61.84 
 
 		 556 aa  677    Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.682319  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1057  putative ABC transporter ATP-binding protein  59.42 
 
 		 559 aa  685    Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3917  putative ABC transporter ATP-binding protein  58.92 
 
 		 558 aa  645    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.426446 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2008  putative ABC transporter ATP-binding protein  72.76 
 
 		 551 aa  842    Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3474  putative ABC transporter ATP-binding protein  73.86 
 
 		 551 aa  826    Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.128055  normal  0.617651 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1718  putative ABC transporter ATP-binding protein  87.61 
 
 		 549 aa  990    Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3688  putative ABC transporter ATP-binding protein  58.74 
 
 		 557 aa  637    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2845  putative ABC transporter ATP-binding protein  58.2 
 
 		 559 aa  665    Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.493421  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4070  putative ABC transporter ATP-binding protein  60.18 
 
 		 557 aa  650    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.715968 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2580  putative ABC transporter ATP-binding protein  57.91 
 
 		 560 aa  685    Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.471915  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0661  putative ABC transporter ATP-binding protein  55.42 
 
 		 560 aa  653    Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2441  putative ABC transporter ATP-binding protein  59.49 
 
 		 558 aa  694    Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00204105  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3581  putative ABC transporter ATP-binding protein  56.78 
 
 		 555 aa  639    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.078032  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>