More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rleg2_2620 on replicon NC_011369
Organism: Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013037  Dfer_4119  putative ABC transporter ATP-binding protein  56.91 
 
 
555 aa  642    Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1644  putative ABC transporter ATP-binding protein  59.57 
 
 
559 aa  697    Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1060  putative ABC transporter ATP-binding protein  56.88 
 
 
554 aa  640    Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.298194  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1794  putative ABC transporter ATP-binding protein  60.25 
 
 
555 aa  684    Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.482874  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2460  putative ABC transporter ATP-binding protein  62.88 
 
 
559 aa  694    Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.561949  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1137  putative ABC transporter ATP-binding protein  55.23 
 
 
560 aa  647    Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  decreased coverage  0.000210355  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1456  putative ABC transporter ATP-binding protein  84.52 
 
 
549 aa  954    Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.504666  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3426  putative ABC transporter ATP-binding protein  58.3 
 
 
561 aa  682    Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2991  putative ABC transporter ATP-binding protein  56.27 
 
 
559 aa  651    Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.187094  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0490  putative ABC transporter ATP-binding protein  68.01 
 
 
551 aa  799    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.191061  normal  0.167217 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2552  ABC transporter-like protein  61.16 
 
 
554 aa  667    Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.410797 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2929  putative ABC transporter ATP-binding protein  87.61 
 
 
549 aa  988    Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1826  putative ABC transporter ATP-binding protein  68.91 
 
 
550 aa  785    Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.365039  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3414  putative ABC transporter ATP-binding protein  62.95 
 
 
555 aa  729    Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.106241  normal  0.225653 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3474  putative ABC transporter ATP-binding protein  70.93 
 
 
551 aa  796    Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.128055  normal  0.617651 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2216  putative ABC transporter ATP-binding protein  59.71 
 
 
547 aa  652    Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.885012  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2891  putative ABC transporter ATP-binding protein  63.38 
 
 
559 aa  710    Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.315278  decreased coverage  0.00408651 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0959  putative ABC transporter ATP-binding protein  79.6 
 
 
549 aa  898    Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.465393  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2485  putative ABC transporter ATP-binding protein  73.27 
 
 
550 aa  836    Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.445071  normal  0.555297 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5309  ABC transporter related protein  59.57 
 
 
559 aa  689    Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1466  putative ABC transporter ATP-binding protein  56.94 
 
 
558 aa  640    Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.000105508  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1687  putative ABC transporter ATP-binding protein  59.45 
 
 
557 aa  668    Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.00296418  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2197  putative ABC transporter ATP-binding protein  68.67 
 
 
551 aa  801    Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0587  putative ABC transporter ATP-binding protein  68.19 
 
 
551 aa  797    Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1361  putative ABC transporter ATP-binding protein  57.84 
 
 
561 aa  672    Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000127735  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1117  putative ABC transporter ATP-binding protein  57.22 
 
 
558 aa  648    Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.406197  hitchhiker  0.00000247304 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4129  putative ABC transporter ATP-binding protein  73.22 
 
 
549 aa  836    Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0834  putative ABC transporter ATP-binding protein  58.66 
 
 
561 aa  685    Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00294599  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3620  putative ABC transporter ATP-binding protein  59.1 
 
 
557 aa  634    Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.914588  normal  0.710746 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1117  putative ABC transporter ATP-binding protein  70.91 
 
 
550 aa  823    Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.188653 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0809  putative ABC transporter ATP-binding protein  55.6 
 
 
560 aa  651    Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1926  putative ABC transporter ATP-binding protein  59.42 
 
 
559 aa  688    Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000000896956  normal  0.905041 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3241  putative ABC transporter ATP-binding protein  58.12 
 
 
561 aa  680    Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000308971  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1403  putative ABC transporter ATP-binding protein  58.23 
 
 
556 aa  657    Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.595923  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2117  putative ABC transporter ATP-binding protein  81.97 
 
 
549 aa  941    Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.129596  normal  0.211481 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1527  putative ABC transporter ATP-binding protein  65.95 
 
 
559 aa  754    Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4641  ABC transporter related protein  59.39 
 
 
558 aa  641    Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.310211  hitchhiker  0.00496143 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2495  putative ABC transporter ATP-binding protein  57.5 
 
 
558 aa  655    Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.290369 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2147  ABC transporter related protein  54.41 
 
 
558 aa  635    Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1919  putative ABC transporter ATP-binding protein  71.95 
 
 
549 aa  829    Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.137087  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2351  putative ABC transporter ATP-binding protein  62.08 
 
 
559 aa  714    Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.701309  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3627  putative ABC transporter ATP-binding protein  68.49 
 
 
551 aa  793    Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.108497 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2131  putative ABC transporter ATP-binding protein  69.76 
 
 
549 aa  808    Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.198515  normal  0.0197095 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1718  putative ABC transporter ATP-binding protein  84.15 
 
 
549 aa  954    Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1448  putative ABC transporter ATP-binding protein  57.35 
 
 
555 aa  655    Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.391667  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6251  putative ABC transporter ATP-binding protein  72.5 
 
 
549 aa  838    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.223769  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3452  putative ABC transporter ATP-binding protein  71.95 
 
 
549 aa  827    Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.747993  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7358  putative ABC transporter ATP-binding protein  58.8 
 
 
554 aa  639    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3463  putative ABC transporter ATP-binding protein  70.36 
 
 
550 aa  794    Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.427951  normal  0.154208 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2911  putative ABC transporter ATP-binding protein  72.55 
 
 
550 aa  833    Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.608005  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1329  ABC transporter related protein  60.8 
 
 
554 aa  666    Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.461505  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2392  putative ABC transporter ATP-binding protein  69.76 
 
 
551 aa  785    Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.935698  normal  0.570925 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3221  putative ABC transporter ATP-binding protein  55.88 
 
 
589 aa  639    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2255  putative ABC transporter ATP-binding protein  65.34 
 
 
555 aa  766    Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1284  putative ABC transporter ATP-binding protein  65.65 
 
 
670 aa  759    Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0893  putative ABC transporter ATP-binding protein  57.35 
 
 
560 aa  652    Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.100195  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7359  putative ABC transporter ATP-binding protein  58.26 
 
 
554 aa  637    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.625389 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3615  putative ABC transporter ATP-binding protein  59.1 
 
 
557 aa  634    Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7137  putative ABC transporter ATP-binding protein  71.27 
 
 
550 aa  812    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2033  putative ABC transporter ATP-binding protein  79.6 
 
 
549 aa  908    Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1845  putative ABC transporter ATP-binding protein  56.09 
 
 
556 aa  650    Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000460921 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2845  putative ABC transporter ATP-binding protein  55.86 
 
 
559 aa  640    Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.493421  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2240  putative ABC transporter ATP-binding protein  68.19 
 
 
551 aa  797    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.497585 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1411  putative ABC transporter ATP-binding protein  84.49 
 
 
584 aa  951    Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0238  putative ABC transporter ATP-binding protein  64.94 
 
 
559 aa  756    Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.331867 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2098  putative ABC transporter ATP-binding protein  60.25 
 
 
555 aa  686    Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.249977 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1935  putative ABC transporter ATP-binding protein  69.64 
 
 
550 aa  788    Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.461584  normal  0.714392 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2105  putative ABC transporter ATP-binding protein  64.98 
 
 
555 aa  753    Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2152  putative ABC transporter ATP-binding protein  58.26 
 
 
556 aa  669    Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.0875259  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3426  ABC transporter related protein  59.17 
 
 
554 aa  654    Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.543642 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2441  putative ABC transporter ATP-binding protein  56.96 
 
 
558 aa  655    Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00204105  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1002  ABC transporter related protein  61.45 
 
 
551 aa  676    Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.856091  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2880  putative ABC transporter ATP-binding protein  95.99 
 
 
549 aa  1068    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.824373  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_4019  putative ABC transporter ATP-binding protein  56.86 
 
 
561 aa  661    Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.186099 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1864  putative ABC transporter ATP-binding protein  55.76 
 
 
560 aa  635    Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.733773  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5234  ABC transporter related protein  57.45 
 
 
555 aa  641    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.547616  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1614  putative ABC transporter ATP-binding protein  58.59 
 
 
556 aa  639    Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.682319  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1057  putative ABC transporter ATP-binding protein  58.33 
 
 
559 aa  668    Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6356  putative ABC transporter ATP-binding protein  70.36 
 
 
550 aa  804    Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.109322 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2008  putative ABC transporter ATP-binding protein  70.75 
 
 
551 aa  819    Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2211  putative ABC transporter ATP-binding protein  69.64 
 
 
550 aa  788    Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.670605  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12501  putative ABC transporter ATP-binding protein  59.1 
 
 
558 aa  640    Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  decreased coverage  0.0036999  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3688  putative ABC transporter ATP-binding protein  59.1 
 
 
557 aa  634    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2580  putative ABC transporter ATP-binding protein  56.47 
 
 
560 aa  665    Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.471915  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4070  putative ABC transporter ATP-binding protein  60 
 
 
557 aa  639    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.715968 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0115  putative ABC transporter ATP-binding protein  71.09 
 
 
550 aa  793    Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2620  putative ABC transporter ATP-binding protein  100 
 
 
549 aa  1131    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2913  putative ABC transporter ATP-binding protein  56.06 
 
 
555 aa  631  1e-180  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.010089  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2568  putative ABC transporter ATP-binding protein  58.74 
 
 
557 aa  632  1e-180  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.878611  normal  0.580087 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0877  ABC transporter related protein  56.7 
 
 
555 aa  632  1e-180  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1281  putative ABC transporter ATP-binding protein  53.79 
 
 
561 aa  632  1e-180  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.0000308368  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1058  putative ABC transporter ATP-binding protein  54.33 
 
 
560 aa  634  1e-180  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1998  putative ABC transporter ATP-binding protein  55 
 
 
563 aa  628  1e-179  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.237018  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2026  ABC transporter related protein  57.94 
 
 
557 aa  628  1e-179  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3066  putative ABC transporter ATP-binding protein  55.33 
 
 
555 aa  630  1e-179  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  hitchhiker  0.00794174  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3542  putative ABC transporter ATP-binding protein  57.3 
 
 
558 aa  629  1e-179  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.195737  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2881  putative ABC transporter ATP-binding protein  56.42 
 
 
555 aa  628  1e-179  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.41932  normal  0.0832413 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2171  putative ABC transporter ATP-binding protein  56.81 
 
 
553 aa  629  1e-179  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0447  putative ABC transporter ATP-binding protein  56.24 
 
 
570 aa  628  1e-179  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.46914  normal  0.303037 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4832  putative ABC transporter ATP-binding protein  56.42 
 
 
555 aa  628  1e-179  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.218638  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>