More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mrad2831_3463 on replicon NC_010505
Organism: Methylobacterium radiotolerans JCM 2831



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
CP001509  ECD_04267  fused predicted transporter subunits of ABC superfamily: ATP-binding components  56.06 
 
 
555 aa  635    Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3606  ABC transporter related protein  56.06 
 
 
555 aa  635    Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1644  putative ABC transporter ATP-binding protein  59.82 
 
 
559 aa  705    Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1718  putative ABC transporter ATP-binding protein  71.45 
 
 
549 aa  810    Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2608  putative ABC transporter ATP-binding protein  55.74 
 
 
579 aa  635    Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.234433  normal  0.107182 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6251  putative ABC transporter ATP-binding protein  78.55 
 
 
549 aa  904    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.223769  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1794  putative ABC transporter ATP-binding protein  60.25 
 
 
555 aa  693    Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.482874  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2913  putative ABC transporter ATP-binding protein  56.06 
 
 
555 aa  644    Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.010089  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4832  putative ABC transporter ATP-binding protein  56.06 
 
 
555 aa  634    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.218638  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3883  putative ABC transporter ATP-binding protein  56.62 
 
 
559 aa  647    Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1456  putative ABC transporter ATP-binding protein  72.18 
 
 
549 aa  822    Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.504666  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0447  putative ABC transporter ATP-binding protein  55.88 
 
 
570 aa  640    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.46914  normal  0.303037 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4627  putative ABC transporter ATP-binding protein  56.06 
 
 
555 aa  635    Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3159  putative ABC transporter ATP-binding protein  56.78 
 
 
555 aa  654    Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000146292 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3414  putative ABC transporter ATP-binding protein  64.57 
 
 
555 aa  758    Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.106241  normal  0.225653 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3606  putative ABC transporter ATP-binding protein  56.24 
 
 
555 aa  642    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.776726  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0510  putative ABC transporter ATP-binding protein  56.24 
 
 
555 aa  642    Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.292633  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0758  putative ABC transporter ATP-binding protein  55.78 
 
 
557 aa  660    Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0740  putative ABC transporter ATP-binding protein  56.14 
 
 
557 aa  662    Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3474  putative ABC transporter ATP-binding protein  78.98 
 
 
551 aa  889    Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.128055  normal  0.617651 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2392  putative ABC transporter ATP-binding protein  69.4 
 
 
551 aa  790    Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.935698  normal  0.570925 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3463  putative ABC transporter ATP-binding protein  100 
 
 
550 aa  1133    Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.427951  normal  0.154208 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2216  putative ABC transporter ATP-binding protein  59.49 
 
 
547 aa  639    Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.885012  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1935  putative ABC transporter ATP-binding protein  93.27 
 
 
550 aa  1039    Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.461584  normal  0.714392 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3066  putative ABC transporter ATP-binding protein  57.37 
 
 
555 aa  653    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  hitchhiker  0.00794174  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2430  putative ABC transporter ATP-binding protein  57.07 
 
 
595 aa  659    Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2240  putative ABC transporter ATP-binding protein  68.19 
 
 
551 aa  803    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.497585 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2485  putative ABC transporter ATP-binding protein  78.18 
 
 
550 aa  900    Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.445071  normal  0.555297 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2495  putative ABC transporter ATP-binding protein  58.41 
 
 
558 aa  684    Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.290369 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3595  putative ABC transporter ATP-binding protein  56.24 
 
 
555 aa  642    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.431194  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1687  putative ABC transporter ATP-binding protein  59.53 
 
 
557 aa  679    Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.00296418  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0238  putative ABC transporter ATP-binding protein  62.08 
 
 
559 aa  726    Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.331867 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0587  putative ABC transporter ATP-binding protein  68.19 
 
 
551 aa  803    Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1361  putative ABC transporter ATP-binding protein  58.53 
 
 
561 aa  681    Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000127735  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3604  putative ABC transporter ATP-binding protein  55.7 
 
 
555 aa  639    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.943392 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3581  putative ABC transporter ATP-binding protein  56.42 
 
 
555 aa  643    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.078032  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1934  putative ABC transporter ATP-binding protein  56.24 
 
 
555 aa  642    Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.628337  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1926  putative ABC transporter ATP-binding protein  59.86 
 
 
559 aa  702    Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000000896956  normal  0.905041 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2580  putative ABC transporter ATP-binding protein  57.99 
 
 
560 aa  682    Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.471915  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1281  putative ABC transporter ATP-binding protein  54.95 
 
 
561 aa  650    Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.0000308368  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1403  putative ABC transporter ATP-binding protein  59.93 
 
 
556 aa  692    Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.595923  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2568  putative ABC transporter ATP-binding protein  59.25 
 
 
557 aa  639    Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.878611  normal  0.580087 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0964  putative ABC transporter ATP-binding protein  56.24 
 
 
555 aa  642    Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.322458  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4129  putative ABC transporter ATP-binding protein  78.55 
 
 
549 aa  895    Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1527  putative ABC transporter ATP-binding protein  66.49 
 
 
559 aa  762    Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2924  putative ABC transporter ATP-binding protein  56.06 
 
 
555 aa  642    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.570812  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1913  putative ABC transporter ATP-binding protein  57.25 
 
 
554 aa  645    Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.129102  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0037  putative ABC transporter ATP-binding protein  57.5 
 
 
555 aa  649    Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.264543  normal  0.674738 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1919  putative ABC transporter ATP-binding protein  78 
 
 
549 aa  887    Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.137087  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2351  putative ABC transporter ATP-binding protein  61.36 
 
 
559 aa  711    Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.701309  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3627  putative ABC transporter ATP-binding protein  69.03 
 
 
551 aa  805    Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.108497 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0668  putative ABC transporter ATP-binding protein  56.24 
 
 
555 aa  642    Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2171  putative ABC transporter ATP-binding protein  57.12 
 
 
553 aa  646    Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12501  putative ABC transporter ATP-binding protein  58.53 
 
 
558 aa  635    Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  decreased coverage  0.0036999  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2131  putative ABC transporter ATP-binding protein  77.82 
 
 
549 aa  880    Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.198515  normal  0.0197095 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1411  putative ABC transporter ATP-binding protein  72.13 
 
 
584 aa  818    Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0443  putative ABC transporter ATP-binding protein  55.15 
 
 
555 aa  640    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.317561  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4990  putative ABC transporter ATP-binding protein  56.06 
 
 
555 aa  635    Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3452  putative ABC transporter ATP-binding protein  78.18 
 
 
549 aa  891    Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.747993  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2152  putative ABC transporter ATP-binding protein  58.62 
 
 
556 aa  683    Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.0875259  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1852  putative ABC transporter ATP-binding protein  57.25 
 
 
554 aa  645    Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2911  putative ABC transporter ATP-binding protein  76.55 
 
 
550 aa  882    Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.608005  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2117  putative ABC transporter ATP-binding protein  72.36 
 
 
549 aa  826    Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.129596  normal  0.211481 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3221  putative ABC transporter ATP-binding protein  57.45 
 
 
589 aa  657    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2255  putative ABC transporter ATP-binding protein  66.24 
 
 
555 aa  776    Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1284  putative ABC transporter ATP-binding protein  63.69 
 
 
670 aa  741    Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2587  putative ABC transporter ATP-binding protein  56.42 
 
 
705 aa  645    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1117  putative ABC transporter ATP-binding protein  80 
 
 
550 aa  928    Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.188653 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0571  putative ABC transporter ATP-binding protein  57.07 
 
 
554 aa  635    Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2033  putative ABC transporter ATP-binding protein  73.27 
 
 
549 aa  830    Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1845  putative ABC transporter ATP-binding protein  58.78 
 
 
556 aa  685    Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000460921 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3241  putative ABC transporter ATP-binding protein  59.82 
 
 
561 aa  692    Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000308971  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0490  putative ABC transporter ATP-binding protein  67.28 
 
 
551 aa  795    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.191061  normal  0.167217 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2197  putative ABC transporter ATP-binding protein  69.22 
 
 
551 aa  815    Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2713  putative ABC transporter ATP-binding protein  55.33 
 
 
555 aa  635    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.776803  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1826  putative ABC transporter ATP-binding protein  91.09 
 
 
550 aa  1016    Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.365039  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3665  putative ABC transporter ATP-binding protein  56.06 
 
 
555 aa  635    Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2098  putative ABC transporter ATP-binding protein  61.71 
 
 
555 aa  711    Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.249977 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2991  putative ABC transporter ATP-binding protein  57.53 
 
 
559 aa  674    Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.187094  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2105  putative ABC transporter ATP-binding protein  64.98 
 
 
555 aa  751    Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0421  putative ABC transporter ATP-binding protein  55.88 
 
 
555 aa  639    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2460  putative ABC transporter ATP-binding protein  65.41 
 
 
559 aa  743    Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.561949  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2916  putative ABC transporter ATP-binding protein  55.36 
 
 
563 aa  641    Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0621526  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0517  putative ABC transporter ATP-binding protein  56.42 
 
 
555 aa  644    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.817295  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_4019  putative ABC transporter ATP-binding protein  58.74 
 
 
561 aa  684    Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.186099 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1864  putative ABC transporter ATP-binding protein  56.47 
 
 
560 aa  643    Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.733773  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0489  putative ABC transporter ATP-binding protein  56.42 
 
 
555 aa  644    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.890406 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2441  putative ABC transporter ATP-binding protein  57.94 
 
 
558 aa  672    Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00204105  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1057  putative ABC transporter ATP-binding protein  59.31 
 
 
559 aa  680    Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2903  putative ABC transporter ATP-binding protein  55.74 
 
 
553 aa  637    Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.0207119 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2008  putative ABC transporter ATP-binding protein  71.12 
 
 
551 aa  825    Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2845  putative ABC transporter ATP-binding protein  56.76 
 
 
559 aa  662    Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.493421  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2881  putative ABC transporter ATP-binding protein  56.24 
 
 
555 aa  642    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.41932  normal  0.0832413 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0834  putative ABC transporter ATP-binding protein  59.46 
 
 
561 aa  690    Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00294599  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3514  putative ABC transporter ATP-binding protein  56.06 
 
 
554 aa  644    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0491494  normal  0.117692 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4070  putative ABC transporter ATP-binding protein  59.43 
 
 
557 aa  640    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.715968 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6356  putative ABC transporter ATP-binding protein  84.55 
 
 
550 aa  952    Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.109322 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5906  putative ABC transporter ATP-binding protein  56.06 
 
 
555 aa  635    Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1801  putative ABC transporter ATP-binding protein  56.28 
 
 
553 aa  636    Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.124805  normal  0.0665876 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0959  putative ABC transporter ATP-binding protein  69.64 
 
 
549 aa  790    Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.465393  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>