More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Saro_2351 on replicon NC_007794
Organism: Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
CP001509  ECD_04267  fused predicted transporter subunits of ABC superfamily: ATP-binding components  56.73 
 
 		 555 aa  646    Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3606  ABC transporter related protein  56.73 
 
 		 555 aa  646    Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1644  putative ABC transporter ATP-binding protein  61.83 
 
 		 559 aa  727    Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0674  putative ABC transporter ATP-binding protein  57.09 
 
 		 555 aa  650    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.599551  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2460  putative ABC transporter ATP-binding protein  63.31 
 
 		 559 aa  708    Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.561949  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4070  putative ABC transporter ATP-binding protein  58.97 
 
 		 557 aa  637    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.715968 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1794  putative ABC transporter ATP-binding protein  61.08 
 
 		 555 aa  694    Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.482874  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2913  putative ABC transporter ATP-binding protein  57.45 
 
 		 555 aa  654    Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.010089  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3241  putative ABC transporter ATP-binding protein  60.4 
 
 		 561 aa  705    Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000308971  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0705  putative ABC transporter ATP-binding protein  57.09 
 
 		 555 aa  650    Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.0956761 
 
 
-
 
NC_004310  BR1456  putative ABC transporter ATP-binding protein  64.94 
 
 		 549 aa  722    Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.504666  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4990  putative ABC transporter ATP-binding protein  56.73 
 
 		 555 aa  645    Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4602  ABC transporter, ATP-binding protein  56.68 
 
 		 563 aa  641    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.29694  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2197  putative ABC transporter ATP-binding protein  64.87 
 
 		 551 aa  737    Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1934  putative ABC transporter ATP-binding protein  57.81 
 
 		 555 aa  650    Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.628337  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3606  putative ABC transporter ATP-binding protein  57.81 
 
 		 555 aa  650    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.776726  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0510  putative ABC transporter ATP-binding protein  57.81 
 
 		 555 aa  650    Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.292633  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0758  putative ABC transporter ATP-binding protein  55.76 
 
 		 557 aa  659    Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0740  putative ABC transporter ATP-binding protein  55.94 
 
 		 557 aa  662    Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4264  putative ABC transporter ATP-binding protein  56.65 
 
 		 554 aa  643    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0822  putative ABC transporter ATP-binding protein  56.73 
 
 		 555 aa  654    Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4627  putative ABC transporter ATP-binding protein  56.73 
 
 		 555 aa  646    Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2216  putative ABC transporter ATP-binding protein  59.31 
 
 		 547 aa  639    Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.885012  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0964  putative ABC transporter ATP-binding protein  57.81 
 
 		 555 aa  650    Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.322458  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0490  putative ABC transporter ATP-binding protein  62.41 
 
 		 551 aa  720    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.191061  normal  0.167217 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3066  putative ABC transporter ATP-binding protein  57.63 
 
 		 555 aa  636    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  hitchhiker  0.00794174  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2430  putative ABC transporter ATP-binding protein  56.73 
 
 		 595 aa  638    Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2485  putative ABC transporter ATP-binding protein  62.08 
 
 		 550 aa  696    Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.445071  normal  0.555297 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0552  putative ABC transporter ATP-binding protein  55.66 
 
 		 555 aa  635    Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3595  putative ABC transporter ATP-binding protein  57.81 
 
 		 555 aa  650    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.431194  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1687  putative ABC transporter ATP-binding protein  58.02 
 
 		 557 aa  665    Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.00296418  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4875  putative ABC transporter ATP-binding protein  56.83 
 
 		 554 aa  645    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.54223  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0587  putative ABC transporter ATP-binding protein  63.13 
 
 		 551 aa  724    Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1361  putative ABC transporter ATP-binding protein  59.67 
 
 		 561 aa  693    Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000127735  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3604  putative ABC transporter ATP-binding protein  57.45 
 
 		 555 aa  649    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.943392 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6251  putative ABC transporter ATP-binding protein  60.64 
 
 		 549 aa  687    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.223769  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2152  putative ABC transporter ATP-binding protein  58.92 
 
 		 556 aa  678    Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.0875259  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3581  putative ABC transporter ATP-binding protein  57.81 
 
 		 555 aa  649    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.078032  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0661  putative ABC transporter ATP-binding protein  56.96 
 
 		 560 aa  650    Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2580  putative ABC transporter ATP-binding protein  59.14 
 
 		 560 aa  688    Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.471915  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1926  putative ABC transporter ATP-binding protein  61.3 
 
 		 559 aa  714    Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000000896956  normal  0.905041 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2242  putative ABC transporter ATP-binding protein  56.83 
 
 		 553 aa  640    Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1281  putative ABC transporter ATP-binding protein  54.61 
 
 		 561 aa  636    Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.0000308368  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1403  putative ABC transporter ATP-binding protein  58.17 
 
 		 556 aa  662    Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.595923  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2845  putative ABC transporter ATP-binding protein  58.06 
 
 		 559 aa  667    Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.493421  normal  1 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0959  putative ABC transporter ATP-binding protein  62.25 
 
 		 549 aa  680    Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.465393  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0889  putative ABC transporter ATP-binding protein  57.45 
 
 		 554 aa  645    Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0668  putative ABC transporter ATP-binding protein  57.81 
 
 		 555 aa  650    Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1527  putative ABC transporter ATP-binding protein  65.29 
 
 		 559 aa  756    Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0229  putative ABC transporter ATP-binding protein  56.19 
 
 		 555 aa  635    Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2924  putative ABC transporter ATP-binding protein  58.53 
 
 		 555 aa  657    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.570812  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3474  putative ABC transporter ATP-binding protein  63.31 
 
 		 551 aa  704    Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.128055  normal  0.617651 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1148  putative ABC transporter ATP-binding protein  59.15 
 
 		 560 aa  642    Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.493052  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1919  putative ABC transporter ATP-binding protein  61 
 
 		 549 aa  687    Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.137087  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2351  putative ABC transporter ATP-binding protein  100 
 
 		 559 aa  1152    Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.701309  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3627  putative ABC transporter ATP-binding protein  63.26 
 
 		 551 aa  728    Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.108497 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2171  putative ABC transporter ATP-binding protein  57.12 
 
 		 553 aa  637    Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2131  putative ABC transporter ATP-binding protein  59.39 
 
 		 549 aa  668    Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.198515  normal  0.0197095 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5235  putative ABC transporter ATP-binding protein  56.83 
 
 		 579 aa  644    Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0443  putative ABC transporter ATP-binding protein  57.27 
 
 		 555 aa  649    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.317561  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2240  putative ABC transporter ATP-binding protein  63.13 
 
 		 551 aa  724    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.497585 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1411  putative ABC transporter ATP-binding protein  64.87 
 
 		 584 aa  719    Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3452  putative ABC transporter ATP-binding protein  60.82 
 
 		 549 aa  686    Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.747993  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2626  putative ABC transporter ATP-binding protein  57.12 
 
 		 578 aa  654    Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.663821  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2911  putative ABC transporter ATP-binding protein  61.18 
 
 		 550 aa  688    Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.608005  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3414  putative ABC transporter ATP-binding protein  62.75 
 
 		 555 aa  717    Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.106241  normal  0.225653 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1718  putative ABC transporter ATP-binding protein  64.04 
 
 		 549 aa  709    Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3221  putative ABC transporter ATP-binding protein  57.99 
 
 		 589 aa  655    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2255  putative ABC transporter ATP-binding protein  64.03 
 
 		 555 aa  731    Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1284  putative ABC transporter ATP-binding protein  81.22 
 
 		 670 aa  949    Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2587  putative ABC transporter ATP-binding protein  57.63 
 
 		 705 aa  653    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2991  putative ABC transporter ATP-binding protein  57.96 
 
 		 559 aa  686    Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.187094  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0238  putative ABC transporter ATP-binding protein  76.21 
 
 		 559 aa  899    Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.331867 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2033  putative ABC transporter ATP-binding protein  64.58 
 
 		 549 aa  718    Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2608  putative ABC transporter ATP-binding protein  57.12 
 
 		 579 aa  635    Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.234433  normal  0.107182 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1845  putative ABC transporter ATP-binding protein  57.07 
 
 		 556 aa  668    Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000460921 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2881  putative ABC transporter ATP-binding protein  58.17 
 
 		 555 aa  654    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.41932  normal  0.0832413 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2916  putative ABC transporter ATP-binding protein  56.83 
 
 		 563 aa  654    Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0621526  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0372  putative ABC transporter ATP-binding protein  55.81 
 
 		 556 aa  639    Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0762  putative ABC transporter ATP-binding protein  58.53 
 
 		 555 aa  659    Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3665  putative ABC transporter ATP-binding protein  56.73 
 
 		 555 aa  646    Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3618  putative ABC transporter ATP-binding protein  56.73 
 
 		 555 aa  655    Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2098  putative ABC transporter ATP-binding protein  60.36 
 
 		 555 aa  691    Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.249977 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3489  putative ABC transporter ATP-binding protein  56.73 
 
 		 555 aa  655    Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2105  putative ABC transporter ATP-binding protein  63.86 
 
 		 555 aa  741    Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0421  putative ABC transporter ATP-binding protein  57.09 
 
 		 555 aa  643    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0840  putative ABC transporter ATP-binding protein  57.55 
 
 		 553 aa  642    Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_60800  putative ABC transporter ATP-binding protein  56.83 
 
 		 554 aa  644    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2117  putative ABC transporter ATP-binding protein  64.04 
 
 		 549 aa  719    Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.129596  normal  0.211481 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0517  putative ABC transporter ATP-binding protein  57.63 
 
 		 555 aa  650    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.817295  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_4019  putative ABC transporter ATP-binding protein  57.32 
 
 		 561 aa  679    Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.186099 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1864  putative ABC transporter ATP-binding protein  55.22 
 
 		 560 aa  639    Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.733773  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1935  putative ABC transporter ATP-binding protein  61.54 
 
 		 550 aa  689    Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.461584  normal  0.714392 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1614  putative ABC transporter ATP-binding protein  58.53 
 
 		 556 aa  657    Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.682319  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1057  putative ABC transporter ATP-binding protein  59.49 
 
 		 559 aa  687    Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2495  putative ABC transporter ATP-binding protein  58.77 
 
 		 558 aa  675    Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.290369 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2008  putative ABC transporter ATP-binding protein  63.31 
 
 		 551 aa  720    Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0706  putative ABC transporter ATP-binding protein  57.27 
 
 		 555 aa  652    Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.483075  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0671  putative ABC transporter ATP-binding protein  55.83 
 
 		 555 aa  636    Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2392  putative ABC transporter ATP-binding protein  64.34 
 
 		 551 aa  718    Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.935698  normal  0.570925 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>