More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Noca_1369 on replicon NC_008699
Organism: Nocardioides sp. JS614



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013521  Sked_24710  ATPase component of ABC transporters with duplicated ATPase domain  75.71 
 
 		 560 aa  848    Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0377191  normal  0.041371 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5309  ABC transporter related protein  58.93 
 
 		 559 aa  660    Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1644  putative ABC transporter ATP-binding protein  57.3 
 
 		 559 aa  666    Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_22290  putative ABC transporter ATP-binding protein  71.07 
 
 		 559 aa  790    Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.793295  normal  0.525138 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1794  putative ABC transporter ATP-binding protein  59.86 
 
 		 555 aa  667    Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.482874  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_11480  putative ABC transporter ATP-binding protein  71.96 
 
 		 560 aa  818    Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.105111  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1002  ABC transporter related protein  61.36 
 
 		 551 aa  636    Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.856091  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3241  putative ABC transporter ATP-binding protein  56.01 
 
 		 561 aa  641    Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000308971  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_08900  putative ABC transporter ATP-binding protein  73.21 
 
 		 560 aa  827    Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.210485  normal  0.0113448 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5318  putative ABC transporter ATP-binding protein  74.11 
 
 		 560 aa  827    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.134924  normal  0.268079 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2152  putative ABC transporter ATP-binding protein  57.53 
 
 		 556 aa  649    Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.0875259  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3917  putative ABC transporter ATP-binding protein  72.55 
 
 		 558 aa  815    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.426446 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1329  ABC transporter related protein  75.04 
 
 		 554 aa  840    Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.461505  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0740  putative ABC transporter ATP-binding protein  54.72 
 
 		 557 aa  635    Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1448  putative ABC transporter ATP-binding protein  60.22 
 
 		 555 aa  672    Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.391667  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2216  putative ABC transporter ATP-binding protein  73.65 
 
 		 547 aa  807    Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.885012  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2171  putative ABC transporter ATP-binding protein  76.79 
 
 		 560 aa  863    Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000196153 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0834  putative ABC transporter ATP-binding protein  57.27 
 
 		 561 aa  644    Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00294599  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_10980  putative ABC transporter ATP-binding protein  69.64 
 
 		 558 aa  783    Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5234  ABC transporter related protein  58.12 
 
 		 555 aa  659    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.547616  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1687  putative ABC transporter ATP-binding protein  57.68 
 
 		 557 aa  639    Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.00296418  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0931  putative ABC transporter ATP-binding protein  74.82 
 
 		 560 aa  844    Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1361  putative ABC transporter ATP-binding protein  56.37 
 
 		 561 aa  649    Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000127735  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0300  putative ABC transporter ATP-binding protein  69.82 
 
 		 559 aa  791    Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  0.208774 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1127  putative ABC transporter ATP-binding protein  71.66 
 
 		 558 aa  808    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1117  putative ABC transporter ATP-binding protein  56.86 
 
 		 558 aa  638    Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.406197  hitchhiker  0.00000247304 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1855  putative ABC transporter ATP-binding protein  70.3 
 
 		 559 aa  789    Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3542  putative ABC transporter ATP-binding protein  72.73 
 
 		 558 aa  816    Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.610631  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1926  putative ABC transporter ATP-binding protein  56.76 
 
 		 559 aa  654    Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000000896956  normal  0.905041 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_11760  putative ABC transporter ATP-binding protein  73.08 
 
 		 558 aa  821    Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.406602 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1527  putative ABC transporter ATP-binding protein  57.32 
 
 		 559 aa  647    Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1148  putative ABC transporter ATP-binding protein  75 
 
 		 560 aa  834    Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.493052  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1522  ABC transporter related protein  70.71 
 
 		 556 aa  803    Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.256666  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2351  putative ABC transporter ATP-binding protein  57.12 
 
 		 559 aa  650    Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.701309  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2642  putative ABC transporter ATP-binding protein  75.54 
 
 		 560 aa  843    Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.520141 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1089  ABC transporter related protein  75.71 
 
 		 560 aa  852    Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.545835  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2568  putative ABC transporter ATP-binding protein  73.98 
 
 		 557 aa  824    Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.878611  normal  0.580087 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4641  ABC transporter related protein  72.73 
 
 		 558 aa  820    Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.310211  hitchhiker  0.00496143 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1384  ABC transporter related protein  69.88 
 
 		 557 aa  786    Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_09750  putative ABC transporter ATP-binding protein  73.75 
 
 		 560 aa  834    Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2552  ABC transporter-like protein  75.04 
 
 		 554 aa  832    Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.410797 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3542  putative ABC transporter ATP-binding protein  72.55 
 
 		 558 aa  822    Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.195737  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1352  ABC transporter related protein  76.07 
 
 		 560 aa  837    Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  decreased coverage  0.000271939  hitchhiker  0.0000279927 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1284  putative ABC transporter ATP-binding protein  56.05 
 
 		 670 aa  636    Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7359  putative ABC transporter ATP-binding protein  72.37 
 
 		 554 aa  813    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.625389 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3615  putative ABC transporter ATP-binding protein  74.51 
 
 		 557 aa  826    Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1816  putative ABC transporter ATP-binding protein  72.68 
 
 		 559 aa  824    Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.461866  normal  0.0107915 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1129  ABC transporter, ATP-binding protein YjiK  71.74 
 
 		 558 aa  806    Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2026  ABC transporter related protein  72.91 
 
 		 557 aa  814    Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2098  putative ABC transporter ATP-binding protein  59.5 
 
 		 555 aa  663    Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.249977 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7358  putative ABC transporter ATP-binding protein  76.11 
 
 		 554 aa  850    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3426  putative ABC transporter ATP-binding protein  57.27 
 
 		 561 aa  645    Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1442  putative ABC transporter ATP-binding protein  71.61 
 
 		 559 aa  801    Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.465539  normal  0.471645 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3620  putative ABC transporter ATP-binding protein  74.51 
 
 		 557 aa  826    Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.914588  normal  0.710746 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2418  putative ABC transporter ATP-binding protein  76.07 
 
 		 560 aa  851    Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0404573  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2441  putative ABC transporter ATP-binding protein  57.12 
 
 		 558 aa  658    Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00204105  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_4019  putative ABC transporter ATP-binding protein  56.19 
 
 		 561 aa  654    Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.186099 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1614  putative ABC transporter ATP-binding protein  71.43 
 
 		 556 aa  815    Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.682319  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1057  putative ABC transporter ATP-binding protein  55.68 
 
 		 559 aa  640    Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1369  putative ABC transporter ATP-binding protein  100 
 
 		 560 aa  1144    Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.482048  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3426  ABC transporter related protein  72.55 
 
 		 554 aa  808    Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.543642 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3688  putative ABC transporter ATP-binding protein  74.51 
 
 		 557 aa  826    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12501  putative ABC transporter ATP-binding protein  74.11 
 
 		 558 aa  834    Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  decreased coverage  0.0036999  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4070  putative ABC transporter ATP-binding protein  74.29 
 
 		 557 aa  820    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.715968 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2580  putative ABC transporter ATP-binding protein  55.66 
 
 		 560 aa  640    Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.471915  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0877  ABC transporter related protein  57.25 
 
 		 555 aa  635    Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0758  putative ABC transporter ATP-binding protein  54.55 
 
 		 557 aa  632  1e-180  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4119  putative ABC transporter ATP-binding protein  56.32 
 
 		 555 aa  634  1e-180  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2255  putative ABC transporter ATP-binding protein  57.42 
 
 		 555 aa  632  1e-180  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1060  putative ABC transporter ATP-binding protein  56.89 
 
 		 554 aa  632  1e-180  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.298194  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6356  putative ABC transporter ATP-binding protein  58.96 
 
 		 550 aa  630  1e-179  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.109322 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1403  putative ABC transporter ATP-binding protein  56.15 
 
 		 556 aa  629  1e-179  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.595923  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0809  putative ABC transporter ATP-binding protein  55.3 
 
 		 560 aa  630  1e-179  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3489  putative ABC transporter ATP-binding protein  56.43 
 
 		 555 aa  630  1e-179  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2495  putative ABC transporter ATP-binding protein  56.25 
 
 		 558 aa  628  1e-179  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.290369 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1117  putative ABC transporter ATP-binding protein  57.17 
 
 		 550 aa  628  1e-179  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.188653 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3618  putative ABC transporter ATP-binding protein  56.43 
 
 		 555 aa  630  1e-179  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2008  putative ABC transporter ATP-binding protein  56.45 
 
 		 551 aa  629  1e-179  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2240  putative ABC transporter ATP-binding protein  56.27 
 
 		 551 aa  626  1e-178  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.497585 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2485  putative ABC transporter ATP-binding protein  59.32 
 
 		 550 aa  626  1e-178  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.445071  normal  0.555297 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0587  putative ABC transporter ATP-binding protein  56.27 
 
 		 551 aa  626  1e-178  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0762  putative ABC transporter ATP-binding protein  56.96 
 
 		 555 aa  627  1e-178  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1466  putative ABC transporter ATP-binding protein  55.04 
 
 		 558 aa  626  1e-178  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.000105508  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0822  putative ABC transporter ATP-binding protein  56.25 
 
 		 555 aa  625  1e-178  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2845  putative ABC transporter ATP-binding protein  56.07 
 
 		 559 aa  622  1e-177  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.493421  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2392  putative ABC transporter ATP-binding protein  58.24 
 
 		 551 aa  623  1e-177  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.935698  normal  0.570925 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0490  putative ABC transporter ATP-binding protein  55.73 
 
 		 551 aa  622  1e-177  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.191061  normal  0.167217 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7137  putative ABC transporter ATP-binding protein  58.24 
 
 		 550 aa  623  1e-177  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0238  putative ABC transporter ATP-binding protein  55.97 
 
 		 559 aa  622  1e-177  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.331867 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0674  putative ABC transporter ATP-binding protein  56.43 
 
 		 555 aa  618  1e-176  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.599551  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4264  putative ABC transporter ATP-binding protein  56.53 
 
 		 554 aa  619  1e-176  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4510  putative ABC transporter ATP-binding protein  56.25 
 
 		 555 aa  620  1e-176  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.29936  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3627  putative ABC transporter ATP-binding protein  56.45 
 
 		 551 aa  618  1e-176  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.108497 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2197  putative ABC transporter ATP-binding protein  56.27 
 
 		 551 aa  620  1e-176  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4129  putative ABC transporter ATP-binding protein  59.07 
 
 		 549 aa  620  1e-176  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0563  putative ABC transporter ATP-binding protein  55.1 
 
 		 572 aa  618  1e-176  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.499297  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1845  putative ABC transporter ATP-binding protein  54.82 
 
 		 556 aa  620  1e-176  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000460921 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6251  putative ABC transporter ATP-binding protein  57.45 
 
 		 549 aa  619  1e-176  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.223769  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_60800  putative ABC transporter ATP-binding protein  56.35 
 
 		 554 aa  618  1e-176  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0705  putative ABC transporter ATP-binding protein  56.43 
 
 		 555 aa  618  1e-176  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.0956761 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>