More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ndas_3426 on replicon NC_014210
Organism: Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010816  BLD_1855  putative ABC transporter ATP-binding protein  68.93 
 
 
559 aa  766    Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2891  putative ABC transporter ATP-binding protein  58.99 
 
 
559 aa  639    Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.315278  decreased coverage  0.00408651 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1644  putative ABC transporter ATP-binding protein  59.89 
 
 
559 aa  685    Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0674  putative ABC transporter ATP-binding protein  58.89 
 
 
555 aa  648    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.599551  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1794  putative ABC transporter ATP-binding protein  62.52 
 
 
555 aa  708    Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.482874  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1117  putative ABC transporter ATP-binding protein  59.06 
 
 
550 aa  654    Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.188653 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0834  putative ABC transporter ATP-binding protein  58.77 
 
 
561 aa  669    Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00294599  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3620  putative ABC transporter ATP-binding protein  74.73 
 
 
557 aa  829    Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.914588  normal  0.710746 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1117  putative ABC transporter ATP-binding protein  56.47 
 
 
558 aa  637    Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.406197  hitchhiker  0.00000247304 
 
 
-
 
NC_004310  BR1456  putative ABC transporter ATP-binding protein  60.98 
 
 
549 aa  669    Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.504666  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5318  putative ABC transporter ATP-binding protein  72.55 
 
 
560 aa  816    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.134924  normal  0.268079 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4602  ABC transporter, ATP-binding protein  59.67 
 
 
563 aa  649    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.29694  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_08900  putative ABC transporter ATP-binding protein  75.4 
 
 
560 aa  844    Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.210485  normal  0.0113448 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3542  putative ABC transporter ATP-binding protein  78.67 
 
 
558 aa  884    Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.610631  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_09750  putative ABC transporter ATP-binding protein  75.04 
 
 
560 aa  840    Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1127  putative ABC transporter ATP-binding protein  74.91 
 
 
558 aa  840    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2392  putative ABC transporter ATP-binding protein  59.24 
 
 
551 aa  657    Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.935698  normal  0.570925 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0758  putative ABC transporter ATP-binding protein  55.66 
 
 
557 aa  646    Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0740  putative ABC transporter ATP-binding protein  55.66 
 
 
557 aa  647    Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4264  putative ABC transporter ATP-binding protein  59.53 
 
 
554 aa  652    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2880  putative ABC transporter ATP-binding protein  60.07 
 
 
549 aa  658    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.824373  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2441  putative ABC transporter ATP-binding protein  58.08 
 
 
558 aa  664    Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00204105  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2216  putative ABC transporter ATP-binding protein  88.85 
 
 
547 aa  986    Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.885012  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7359  putative ABC transporter ATP-binding protein  78.16 
 
 
554 aa  890    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.625389 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2568  putative ABC transporter ATP-binding protein  76.88 
 
 
557 aa  853    Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.878611  normal  0.580087 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1442  putative ABC transporter ATP-binding protein  68.98 
 
 
559 aa  763    Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.465539  normal  0.471645 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_22290  putative ABC transporter ATP-binding protein  68.45 
 
 
559 aa  756    Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.793295  normal  0.525138 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2485  putative ABC transporter ATP-binding protein  61.96 
 
 
550 aa  665    Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.445071  normal  0.555297 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4119  putative ABC transporter ATP-binding protein  59.17 
 
 
555 aa  655    Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1687  putative ABC transporter ATP-binding protein  60.43 
 
 
557 aa  683    Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.00296418  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4875  putative ABC transporter ATP-binding protein  58.99 
 
 
554 aa  645    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.54223  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0587  putative ABC transporter ATP-binding protein  59.24 
 
 
551 aa  672    Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1361  putative ABC transporter ATP-binding protein  57.32 
 
 
561 aa  666    Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000127735  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_11480  putative ABC transporter ATP-binding protein  74.87 
 
 
560 aa  833    Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.105111  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2580  putative ABC transporter ATP-binding protein  56.78 
 
 
560 aa  660    Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.471915  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0893  putative ABC transporter ATP-binding protein  59.85 
 
 
560 aa  652    Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.100195  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4510  putative ABC transporter ATP-binding protein  58.53 
 
 
555 aa  647    Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.29936  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1926  putative ABC transporter ATP-binding protein  58.62 
 
 
559 aa  671    Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000000896956  normal  0.905041 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0762  putative ABC transporter ATP-binding protein  58.71 
 
 
555 aa  647    Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1281  putative ABC transporter ATP-binding protein  56.06 
 
 
561 aa  643    Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.0000308368  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1403  putative ABC transporter ATP-binding protein  58.24 
 
 
556 aa  656    Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.595923  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1137  putative ABC transporter ATP-binding protein  56.6 
 
 
560 aa  635    Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  decreased coverage  0.000210355  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5235  putative ABC transporter ATP-binding protein  58.27 
 
 
579 aa  639    Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6251  putative ABC transporter ATP-binding protein  60.07 
 
 
549 aa  661    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.223769  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1527  putative ABC transporter ATP-binding protein  60.07 
 
 
559 aa  685    Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1718  putative ABC transporter ATP-binding protein  60.62 
 
 
549 aa  665    Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0300  putative ABC transporter ATP-binding protein  67.91 
 
 
559 aa  761    Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal  0.208774 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3241  putative ABC transporter ATP-binding protein  58.23 
 
 
561 aa  668    Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000308971  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1148  putative ABC transporter ATP-binding protein  71.48 
 
 
560 aa  804    Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.493052  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1919  putative ABC transporter ATP-binding protein  62.07 
 
 
549 aa  665    Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.137087  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2351  putative ABC transporter ATP-binding protein  58.6 
 
 
559 aa  654    Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.701309  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3627  putative ABC transporter ATP-binding protein  58.33 
 
 
551 aa  657    Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.108497 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0931  putative ABC transporter ATP-binding protein  77.9 
 
 
560 aa  861    Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12501  putative ABC transporter ATP-binding protein  76.66 
 
 
558 aa  856    Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  decreased coverage  0.0036999  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2131  putative ABC transporter ATP-binding protein  60.44 
 
 
549 aa  649    Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.198515  normal  0.0197095 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2460  putative ABC transporter ATP-binding protein  59.53 
 
 
559 aa  642    Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.561949  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3542  putative ABC transporter ATP-binding protein  77.42 
 
 
558 aa  884    Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.195737  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3917  putative ABC transporter ATP-binding protein  78.32 
 
 
558 aa  879    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.426446 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2117  putative ABC transporter ATP-binding protein  58.8 
 
 
549 aa  655    Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.129596  normal  0.211481 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3452  putative ABC transporter ATP-binding protein  62.07 
 
 
549 aa  666    Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.747993  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2642  putative ABC transporter ATP-binding protein  75.58 
 
 
560 aa  838    Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.520141 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2911  putative ABC transporter ATP-binding protein  60.69 
 
 
550 aa  658    Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.608005  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3426  putative ABC transporter ATP-binding protein  58.41 
 
 
561 aa  668    Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3474  putative ABC transporter ATP-binding protein  61.59 
 
 
551 aa  662    Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.128055  normal  0.617651 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6356  putative ABC transporter ATP-binding protein  59.6 
 
 
550 aa  643    Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.109322 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2255  putative ABC transporter ATP-binding protein  60.14 
 
 
555 aa  682    Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1284  putative ABC transporter ATP-binding protein  59.68 
 
 
670 aa  676    Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2152  putative ABC transporter ATP-binding protein  58.02 
 
 
556 aa  660    Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.0875259  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_11760  putative ABC transporter ATP-binding protein  76.88 
 
 
558 aa  861    Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.406602 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3615  putative ABC transporter ATP-binding protein  74.73 
 
 
557 aa  829    Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0238  putative ABC transporter ATP-binding protein  58.78 
 
 
559 aa  658    Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.331867 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2033  putative ABC transporter ATP-binding protein  59.89 
 
 
549 aa  654    Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1845  putative ABC transporter ATP-binding protein  58.45 
 
 
556 aa  653    Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000460921 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0490  putative ABC transporter ATP-binding protein  59.78 
 
 
551 aa  674    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.191061  normal  0.167217 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4129  putative ABC transporter ATP-binding protein  62.98 
 
 
549 aa  672    Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0706  putative ABC transporter ATP-binding protein  58.53 
 
 
555 aa  643    Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.483075  normal 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1411  putative ABC transporter ATP-binding protein  60.91 
 
 
584 aa  665    Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2929  putative ABC transporter ATP-binding protein  59.17 
 
 
549 aa  655    Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2620  putative ABC transporter ATP-binding protein  59.17 
 
 
549 aa  655    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2098  putative ABC transporter ATP-binding protein  61.55 
 
 
555 aa  699    Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.249977 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0705  putative ABC transporter ATP-binding protein  58.71 
 
 
555 aa  646    Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.0956761 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2105  putative ABC transporter ATP-binding protein  58.77 
 
 
555 aa  660    Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7137  putative ABC transporter ATP-binding protein  59.06 
 
 
550 aa  639    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3463  putative ABC transporter ATP-binding protein  60.04 
 
 
550 aa  646    Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.427951  normal  0.154208 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_60800  putative ABC transporter ATP-binding protein  58.45 
 
 
554 aa  641    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2418  putative ABC transporter ATP-binding protein  75.94 
 
 
560 aa  848    Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0404573  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3414  putative ABC transporter ATP-binding protein  59.86 
 
 
555 aa  665    Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.106241  normal  0.225653 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2240  putative ABC transporter ATP-binding protein  59.24 
 
 
551 aa  672    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.497585 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_4019  putative ABC transporter ATP-binding protein  55.7 
 
 
561 aa  655    Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.186099 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1864  putative ABC transporter ATP-binding protein  56.37 
 
 
560 aa  637    Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.733773  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2197  putative ABC transporter ATP-binding protein  59.78 
 
 
551 aa  675    Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1614  putative ABC transporter ATP-binding protein  75.58 
 
 
556 aa  852    Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.682319  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1057  putative ABC transporter ATP-binding protein  57.53 
 
 
559 aa  656    Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_10980  putative ABC transporter ATP-binding protein  68.81 
 
 
558 aa  757    Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2008  putative ABC transporter ATP-binding protein  60.69 
 
 
551 aa  678    Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1369  putative ABC transporter ATP-binding protein  72.55 
 
 
560 aa  806    Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.482048  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2171  putative ABC transporter ATP-binding protein  76.83 
 
 
560 aa  857    Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000196153 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3688  putative ABC transporter ATP-binding protein  74.73 
 
 
557 aa  829    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4070  putative ABC transporter ATP-binding protein  76.48 
 
 
557 aa  849    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.715968 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1448  putative ABC transporter ATP-binding protein  61.26 
 
 
555 aa  691    Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.391667  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>