More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene HMPREF0424_1129 on replicon NC_013721
Organism: Gardnerella vaginalis 409-05



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013530  Xcel_1089  ABC transporter related protein  77.46 
 
 		 560 aa  865    Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.545835  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1644  putative ABC transporter ATP-binding protein  55 
 
 		 559 aa  644    Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1794  putative ABC transporter ATP-binding protein  56.89 
 
 		 555 aa  639    Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.482874  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1855  putative ABC transporter ATP-binding protein  93.19 
 
 		 559 aa  1063    Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2552  ABC transporter-like protein  70.36 
 
 		 554 aa  794    Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.410797 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2171  putative ABC transporter ATP-binding protein  75.31 
 
 		 560 aa  856    Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000196153 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1442  putative ABC transporter ATP-binding protein  80.82 
 
 		 559 aa  922    Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.465539  normal  0.471645 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1127  putative ABC transporter ATP-binding protein  73.04 
 
 		 558 aa  823    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2216  putative ABC transporter ATP-binding protein  70.89 
 
 		 547 aa  780    Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.885012  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_11480  putative ABC transporter ATP-binding protein  76.39 
 
 		 560 aa  872    Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.105111  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3542  putative ABC transporter ATP-binding protein  74.24 
 
 		 558 aa  835    Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.195737  normal  1 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0300  putative ABC transporter ATP-binding protein  79.93 
 
 		 559 aa  928    Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  0.208774 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2642  putative ABC transporter ATP-binding protein  74.96 
 
 		 560 aa  852    Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.520141 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1816  putative ABC transporter ATP-binding protein  71.91 
 
 		 559 aa  811    Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.461866  normal  0.0107915 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2568  putative ABC transporter ATP-binding protein  72.14 
 
 		 557 aa  808    Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.878611  normal  0.580087 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1352  ABC transporter related protein  75.85 
 
 		 560 aa  835    Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  decreased coverage  0.000271939  hitchhiker  0.0000279927 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1926  putative ABC transporter ATP-binding protein  54.4 
 
 		 559 aa  635    Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000000896956  normal  0.905041 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1329  ABC transporter related protein  70.54 
 
 		 554 aa  797    Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.461505  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_08900  putative ABC transporter ATP-binding protein  74.06 
 
 		 560 aa  843    Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.210485  normal  0.0113448 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5318  putative ABC transporter ATP-binding protein  68.52 
 
 		 560 aa  775    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.134924  normal  0.268079 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1148  putative ABC transporter ATP-binding protein  69.41 
 
 		 560 aa  794    Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.493052  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2351  putative ABC transporter ATP-binding protein  56.76 
 
 		 559 aa  637    Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.701309  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2441  putative ABC transporter ATP-binding protein  55.66 
 
 		 558 aa  645    Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00204105  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0931  putative ABC transporter ATP-binding protein  75.67 
 
 		 560 aa  854    Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_09750  putative ABC transporter ATP-binding protein  76.03 
 
 		 560 aa  863    Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1384  ABC transporter related protein  70.18 
 
 		 557 aa  784    Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3917  putative ABC transporter ATP-binding protein  71.61 
 
 		 558 aa  809    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.426446 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2026  ABC transporter related protein  71.61 
 
 		 557 aa  797    Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1284  putative ABC transporter ATP-binding protein  58.01 
 
 		 670 aa  642    Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3615  putative ABC transporter ATP-binding protein  73.04 
 
 		 557 aa  812    Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12501  putative ABC transporter ATP-binding protein  71.61 
 
 		 558 aa  803    Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  decreased coverage  0.0036999  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_24710  ATPase component of ABC transporters with duplicated ATPase domain  73.88 
 
 		 560 aa  834    Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0377191  normal  0.041371 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3542  putative ABC transporter ATP-binding protein  72.14 
 
 		 558 aa  812    Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.610631  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7358  putative ABC transporter ATP-binding protein  67.86 
 
 		 554 aa  772    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1522  ABC transporter related protein  68.87 
 
 		 556 aa  780    Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.256666  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4641  ABC transporter related protein  71.07 
 
 		 558 aa  801    Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.310211  hitchhiker  0.00496143 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2098  putative ABC transporter ATP-binding protein  57.53 
 
 		 555 aa  649    Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.249977 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5309  ABC transporter related protein  56.61 
 
 		 559 aa  641    Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7359  putative ABC transporter ATP-binding protein  71.61 
 
 		 554 aa  803    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.625389 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_11760  putative ABC transporter ATP-binding protein  72.5 
 
 		 558 aa  813    Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.406602 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2418  putative ABC transporter ATP-binding protein  75.49 
 
 		 560 aa  859    Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0404573  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_10980  putative ABC transporter ATP-binding protein  79.39 
 
 		 558 aa  905    Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1614  putative ABC transporter ATP-binding protein  69.05 
 
 		 556 aa  792    Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.682319  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3620  putative ABC transporter ATP-binding protein  73.04 
 
 		 557 aa  812    Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.914588  normal  0.710746 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_22290  putative ABC transporter ATP-binding protein  81.54 
 
 		 559 aa  925    Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.793295  normal  0.525138 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1369  putative ABC transporter ATP-binding protein  71.74 
 
 		 560 aa  804    Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.482048  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1129  ABC transporter, ATP-binding protein YjiK  100 
 
 		 558 aa  1148    Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3688  putative ABC transporter ATP-binding protein  73.04 
 
 		 557 aa  812    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3426  ABC transporter related protein  70 
 
 		 554 aa  780    Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.543642 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4070  putative ABC transporter ATP-binding protein  73.04 
 
 		 557 aa  813    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.715968 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0762  putative ABC transporter ATP-binding protein  56.29 
 
 		 555 aa  633  1e-180  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1998  putative ABC transporter ATP-binding protein  55.58 
 
 		 563 aa  630  1e-179  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.237018  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1448  putative ABC transporter ATP-binding protein  57.17 
 
 		 555 aa  629  1e-179  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.391667  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4264  putative ABC transporter ATP-binding protein  56.53 
 
 		 554 aa  626  1e-178  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5234  ABC transporter related protein  57.33 
 
 		 555 aa  627  1e-178  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.547616  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2580  putative ABC transporter ATP-binding protein  53.85 
 
 		 560 aa  624  1e-178  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.471915  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1060  putative ABC transporter ATP-binding protein  55.81 
 
 		 554 aa  625  1e-178  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.298194  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2152  putative ABC transporter ATP-binding protein  54.5 
 
 		 556 aa  624  1e-177  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.0875259  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2255  putative ABC transporter ATP-binding protein  56.27 
 
 		 555 aa  624  1e-177  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4602  ABC transporter, ATP-binding protein  56.29 
 
 		 563 aa  620  1e-176  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.29694  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3241  putative ABC transporter ATP-binding protein  54.03 
 
 		 561 aa  618  1e-176  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000308971  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0740  putative ABC transporter ATP-binding protein  53.48 
 
 		 557 aa  619  1e-176  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_40960  putative ABC transporter ATP-binding protein  56.65 
 
 		 554 aa  620  1e-176  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.512675  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3618  putative ABC transporter ATP-binding protein  54.29 
 
 		 555 aa  619  1e-176  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1403  putative ABC transporter ATP-binding protein  56.17 
 
 		 556 aa  621  1e-176  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.595923  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3489  putative ABC transporter ATP-binding protein  54.29 
 
 		 555 aa  619  1e-176  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0834  putative ABC transporter ATP-binding protein  54.55 
 
 		 561 aa  619  1e-176  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00294599  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0238  putative ABC transporter ATP-binding protein  55.91 
 
 		 559 aa  619  1e-176  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.331867 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_60800  putative ABC transporter ATP-binding protein  55.22 
 
 		 554 aa  621  1e-176  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_4019  putative ABC transporter ATP-binding protein  52.95 
 
 		 561 aa  619  1e-176  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.186099 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3883  putative ABC transporter ATP-binding protein  54.69 
 
 		 559 aa  615  1e-175  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0758  putative ABC transporter ATP-binding protein  53.3 
 
 		 557 aa  618  1e-175  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1117  putative ABC transporter ATP-binding protein  54.64 
 
 		 558 aa  615  1e-175  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.406197  hitchhiker  0.00000247304 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1687  putative ABC transporter ATP-binding protein  55.5 
 
 		 557 aa  617  1e-175  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.00296418  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5235  putative ABC transporter ATP-binding protein  54.86 
 
 		 579 aa  617  1e-175  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1527  putative ABC transporter ATP-binding protein  55.18 
 
 		 559 aa  617  1e-175  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3426  putative ABC transporter ATP-binding protein  54.37 
 
 		 561 aa  618  1e-175  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2460  putative ABC transporter ATP-binding protein  57.04 
 
 		 559 aa  617  1e-175  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.561949  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4119  putative ABC transporter ATP-binding protein  56.3 
 
 		 555 aa  615  1e-175  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0822  putative ABC transporter ATP-binding protein  54.11 
 
 		 555 aa  615  1e-175  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1057  putative ABC transporter ATP-binding protein  53.5 
 
 		 559 aa  618  1e-175  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0674  putative ABC transporter ATP-binding protein  55.18 
 
 		 555 aa  612  9.999999999999999e-175  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.599551  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0705  putative ABC transporter ATP-binding protein  55.18 
 
 		 555 aa  612  9.999999999999999e-175  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.0956761 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4510  putative ABC transporter ATP-binding protein  55 
 
 		 555 aa  612  9.999999999999999e-175  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.29936  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4875  putative ABC transporter ATP-binding protein  55.1 
 
 		 554 aa  613  9.999999999999999e-175  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.54223  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4905  putative ABC transporter ATP-binding protein  54.68 
 
 		 555 aa  611  9.999999999999999e-175  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0563  putative ABC transporter ATP-binding protein  54.5 
 
 		 572 aa  613  9.999999999999999e-175  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.499297  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4993  putative ABC transporter ATP-binding protein  54.68 
 
 		 555 aa  611  9.999999999999999e-175  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4939  putative ABC transporter ATP-binding protein  54.68 
 
 		 555 aa  611  9.999999999999999e-175  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.909016  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0706  putative ABC transporter ATP-binding protein  55.18 
 
 		 555 aa  612  9.999999999999999e-175  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.483075  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2495  putative ABC transporter ATP-binding protein  52.95 
 
 		 558 aa  612  9.999999999999999e-175  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.290369 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4832  putative ABC transporter ATP-binding protein  54.68 
 
 		 555 aa  612  9.999999999999999e-175  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.218638  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2587  putative ABC transporter ATP-binding protein  54.68 
 
 		 705 aa  613  9.999999999999999e-175  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0489  putative ABC transporter ATP-binding protein  54.68 
 
 		 555 aa  613  9.999999999999999e-175  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.890406 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0517  putative ABC transporter ATP-binding protein  54.68 
 
 		 555 aa  613  9.999999999999999e-175  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.817295  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0809  putative ABC transporter ATP-binding protein  53.39 
 
 		 560 aa  612  9.999999999999999e-175  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0661  putative ABC transporter ATP-binding protein  53.85 
 
 		 560 aa  614  9.999999999999999e-175  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1801  putative ABC transporter ATP-binding protein  55.04 
 
 		 553 aa  612  9.999999999999999e-175  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.124805  normal  0.0665876 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3606  ABC transporter related protein  54.14 
 
 		 555 aa  608  1e-173  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2197  putative ABC transporter ATP-binding protein  54.84 
 
 		 551 aa  610  1e-173  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>