More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Apar_0300 on replicon NC_013203
Organism: Atopobium parvulum DSM 20469



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002939  GSU1644  putative ABC transporter ATP-binding protein  54.48 
 
 		 559 aa  644    Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0674  putative ABC transporter ATP-binding protein  56.96 
 
 		 555 aa  640    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.599551  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1794  putative ABC transporter ATP-binding protein  58.09 
 
 		 555 aa  658    Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.482874  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_40960  putative ABC transporter ATP-binding protein  58.09 
 
 		 554 aa  635    Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.512675  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1089  ABC transporter related protein  73.57 
 
 		 560 aa  835    Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.545835  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_09750  putative ABC transporter ATP-binding protein  73.57 
 
 		 560 aa  842    Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_11760  putative ABC transporter ATP-binding protein  72.37 
 
 		 558 aa  822    Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.406602 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_08900  putative ABC transporter ATP-binding protein  72.32 
 
 		 560 aa  837    Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.210485  normal  0.0113448 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2171  putative ABC transporter ATP-binding protein  73.39 
 
 		 560 aa  840    Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000196153 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4264  putative ABC transporter ATP-binding protein  56.35 
 
 		 554 aa  636    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1127  putative ABC transporter ATP-binding protein  69.16 
 
 		 558 aa  788    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2216  putative ABC transporter ATP-binding protein  70.4 
 
 		 547 aa  776    Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.885012  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12501  putative ABC transporter ATP-binding protein  70.36 
 
 		 558 aa  793    Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  decreased coverage  0.0036999  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4510  putative ABC transporter ATP-binding protein  56.61 
 
 		 555 aa  640    Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.29936  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2552  ABC transporter-like protein  70.05 
 
 		 554 aa  789    Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.410797 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3542  putative ABC transporter ATP-binding protein  68.45 
 
 		 558 aa  778    Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.610631  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4875  putative ABC transporter ATP-binding protein  56.53 
 
 		 554 aa  637    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.54223  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_24710  ATPase component of ABC transporters with duplicated ATPase domain  71.43 
 
 		 560 aa  812    Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0377191  normal  0.041371 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2026  ABC transporter related protein  71.3 
 
 		 557 aa  805    Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0931  putative ABC transporter ATP-binding protein  73.57 
 
 		 560 aa  834    Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7358  putative ABC transporter ATP-binding protein  67.56 
 
 		 554 aa  761    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0762  putative ABC transporter ATP-binding protein  58.63 
 
 		 555 aa  659    Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4641  ABC transporter related protein  68.98 
 
 		 558 aa  777    Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.310211  hitchhiker  0.00496143 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5318  putative ABC transporter ATP-binding protein  68.21 
 
 		 560 aa  771    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.134924  normal  0.268079 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0706  putative ABC transporter ATP-binding protein  56.79 
 
 		 555 aa  640    Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.483075  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1148  putative ABC transporter ATP-binding protein  68.75 
 
 		 560 aa  778    Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.493052  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1522  ABC transporter related protein  67.86 
 
 		 556 aa  768    Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.256666  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1329  ABC transporter related protein  71.3 
 
 		 554 aa  798    Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.461505  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1129  ABC transporter, ATP-binding protein YjiK  79.93 
 
 		 558 aa  928    Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3426  ABC transporter related protein  67.91 
 
 		 554 aa  761    Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.543642 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0705  putative ABC transporter ATP-binding protein  56.79 
 
 		 555 aa  639    Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.0956761 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_10980  putative ABC transporter ATP-binding protein  81.93 
 
 		 558 aa  937    Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1448  putative ABC transporter ATP-binding protein  56.63 
 
 		 555 aa  635    Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.391667  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_11480  putative ABC transporter ATP-binding protein  73.57 
 
 		 560 aa  847    Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.105111  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1284  putative ABC transporter ATP-binding protein  58.53 
 
 		 670 aa  640    Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3615  putative ABC transporter ATP-binding protein  69.88 
 
 		 557 aa  789    Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0300  putative ABC transporter ATP-binding protein  100 
 
 		 559 aa  1149    Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  0.208774 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5235  putative ABC transporter ATP-binding protein  57.55 
 
 		 579 aa  645    Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5309  ABC transporter related protein  56.79 
 
 		 559 aa  647    Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2568  putative ABC transporter ATP-binding protein  70.77 
 
 		 557 aa  799    Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.878611  normal  0.580087 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2441  putative ABC transporter ATP-binding protein  55.48 
 
 		 558 aa  645    Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00204105  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2098  putative ABC transporter ATP-binding protein  57.71 
 
 		 555 aa  661    Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.249977 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3542  putative ABC transporter ATP-binding protein  70.54 
 
 		 558 aa  804    Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.195737  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1855  putative ABC transporter ATP-binding protein  79.21 
 
 		 559 aa  919    Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3917  putative ABC transporter ATP-binding protein  68.27 
 
 		 558 aa  777    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.426446 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_60800  putative ABC transporter ATP-binding protein  57.91 
 
 		 554 aa  649    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2418  putative ABC transporter ATP-binding protein  73.04 
 
 		 560 aa  834    Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0404573  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7359  putative ABC transporter ATP-binding protein  69.52 
 
 		 554 aa  777    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.625389 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1614  putative ABC transporter ATP-binding protein  68.39 
 
 		 556 aa  785    Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.682319  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3620  putative ABC transporter ATP-binding protein  69.88 
 
 		 557 aa  789    Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.914588  normal  0.710746 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2642  putative ABC transporter ATP-binding protein  72.86 
 
 		 560 aa  827    Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.520141 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1369  putative ABC transporter ATP-binding protein  69.82 
 
 		 560 aa  789    Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.482048  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1442  putative ABC transporter ATP-binding protein  81.57 
 
 		 559 aa  929    Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.465539  normal  0.471645 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3688  putative ABC transporter ATP-binding protein  69.88 
 
 		 557 aa  789    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1816  putative ABC transporter ATP-binding protein  70.71 
 
 		 559 aa  803    Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.461866  normal  0.0107915 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4070  putative ABC transporter ATP-binding protein  71.07 
 
 		 557 aa  798    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.715968 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1384  ABC transporter related protein  69.16 
 
 		 557 aa  777    Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1352  ABC transporter related protein  73.21 
 
 		 560 aa  815    Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  decreased coverage  0.000271939  hitchhiker  0.0000279927 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_22290  putative ABC transporter ATP-binding protein  81.22 
 
 		 559 aa  923    Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.793295  normal  0.525138 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4602  ABC transporter, ATP-binding protein  56.29 
 
 		 563 aa  631  1e-180  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.29694  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1687  putative ABC transporter ATP-binding protein  56.4 
 
 		 557 aa  632  1e-180  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.00296418  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3618  putative ABC transporter ATP-binding protein  55.54 
 
 		 555 aa  632  1e-180  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1926  putative ABC transporter ATP-binding protein  53.93 
 
 		 559 aa  632  1e-180  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000000896956  normal  0.905041 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1527  putative ABC transporter ATP-binding protein  56.43 
 
 		 559 aa  632  1e-180  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3489  putative ABC transporter ATP-binding protein  55.54 
 
 		 555 aa  632  1e-180  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0822  putative ABC transporter ATP-binding protein  55.36 
 
 		 555 aa  628  1e-179  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0740  putative ABC transporter ATP-binding protein  53.3 
 
 		 557 aa  630  1e-179  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4832  putative ABC transporter ATP-binding protein  56.65 
 
 		 555 aa  628  1e-179  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.218638  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2152  putative ABC transporter ATP-binding protein  54.14 
 
 		 556 aa  631  1e-179  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.0875259  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_04267  fused predicted transporter subunits of ABC superfamily: ATP-binding components  56.12 
 
 		 555 aa  625  1e-178  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3606  ABC transporter related protein  56.12 
 
 		 555 aa  625  1e-178  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4119  putative ABC transporter ATP-binding protein  55.15 
 
 		 555 aa  627  1e-178  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0758  putative ABC transporter ATP-binding protein  52.94 
 
 		 557 aa  625  1e-178  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5234  ABC transporter related protein  56.53 
 
 		 555 aa  627  1e-178  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.547616  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4905  putative ABC transporter ATP-binding protein  56.47 
 
 		 555 aa  626  1e-178  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5906  putative ABC transporter ATP-binding protein  56.12 
 
 		 555 aa  625  1e-178  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1060  putative ABC transporter ATP-binding protein  56.53 
 
 		 554 aa  626  1e-178  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.298194  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0877  ABC transporter related protein  55.22 
 
 		 555 aa  625  1e-178  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3665  putative ABC transporter ATP-binding protein  56.12 
 
 		 555 aa  625  1e-178  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_04232  hypothetical protein  56.12 
 
 		 555 aa  625  1e-178  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2351  putative ABC transporter ATP-binding protein  55.34 
 
 		 559 aa  625  1e-178  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.701309  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4993  putative ABC transporter ATP-binding protein  56.47 
 
 		 555 aa  626  1e-178  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4990  putative ABC transporter ATP-binding protein  56.12 
 
 		 555 aa  625  1e-178  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4627  putative ABC transporter ATP-binding protein  56.12 
 
 		 555 aa  625  1e-178  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4939  putative ABC transporter ATP-binding protein  56.47 
 
 		 555 aa  626  1e-178  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.909016  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_4019  putative ABC transporter ATP-binding protein  53.56 
 
 		 561 aa  625  1e-178  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.186099 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4991  putative ABC transporter ATP-binding protein  56.29 
 
 		 555 aa  625  1e-178  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.170616  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1466  putative ABC transporter ATP-binding protein  53.58 
 
 		 558 aa  621  1e-177  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.000105508  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1403  putative ABC transporter ATP-binding protein  55.76 
 
 		 556 aa  624  1e-177  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.595923  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3241  putative ABC transporter ATP-binding protein  54.38 
 
 		 561 aa  624  1e-177  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000308971  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4941  putative ABC transporter ATP-binding protein  55.94 
 
 		 555 aa  623  1e-177  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.963786 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4939  putative ABC transporter ATP-binding protein  55.94 
 
 		 555 aa  622  1e-177  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1117  putative ABC transporter ATP-binding protein  54.78 
 
 		 558 aa  619  1e-176  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.406197  hitchhiker  0.00000247304 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0563  putative ABC transporter ATP-binding protein  54.68 
 
 		 572 aa  618  1e-176  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.499297  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0834  putative ABC transporter ATP-binding protein  53.91 
 
 		 561 aa  619  1e-176  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00294599  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3678  putative ABC transporter ATP-binding protein  54.86 
 
 		 555 aa  619  1e-176  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3872  putative ABC transporter ATP-binding protein  55.04 
 
 		 555 aa  618  1e-176  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0797074  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0372  putative ABC transporter ATP-binding protein  54.59 
 
 		 556 aa  618  1e-176  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1057  putative ABC transporter ATP-binding protein  53.5 
 
 		 559 aa  618  1e-176  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2580  putative ABC transporter ATP-binding protein  52.95 
 
 		 560 aa  619  1e-176  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.471915  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>