More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sked_24710 on replicon NC_013521
Organism: Sanguibacter keddieii DSM 10542



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002939  GSU1644  putative ABC transporter ATP-binding protein  58.42 
 
 		 559 aa  676    Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1794  putative ABC transporter ATP-binding protein  59.86 
 
 		 555 aa  671    Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.482874  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1522  ABC transporter related protein  78.75 
 
 		 556 aa  885    Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.256666  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_10980  putative ABC transporter ATP-binding protein  72.86 
 
 		 558 aa  816    Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1448  putative ABC transporter ATP-binding protein  58.6 
 
 		 555 aa  654    Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.391667  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3241  putative ABC transporter ATP-binding protein  57.42 
 
 		 561 aa  654    Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000308971  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1352  ABC transporter related protein  91.25 
 
 		 560 aa  994    Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  decreased coverage  0.000271939  hitchhiker  0.0000279927 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4641  ABC transporter related protein  76.65 
 
 		 558 aa  868    Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.310211  hitchhiker  0.00496143 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3426  ABC transporter related protein  76.65 
 
 		 554 aa  845    Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.543642 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2216  putative ABC transporter ATP-binding protein  74.73 
 
 		 547 aa  823    Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.885012  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7359  putative ABC transporter ATP-binding protein  78.07 
 
 		 554 aa  875    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.625389 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5318  putative ABC transporter ATP-binding protein  74.64 
 
 		 560 aa  842    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.134924  normal  0.268079 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1687  putative ABC transporter ATP-binding protein  58.93 
 
 		 557 aa  650    Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.00296418  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2552  ABC transporter-like protein  76.65 
 
 		 554 aa  860    Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.410797 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1361  putative ABC transporter ATP-binding protein  57.78 
 
 		 561 aa  657    Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000127735  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5309  ABC transporter related protein  57.68 
 
 		 559 aa  649    Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2441  putative ABC transporter ATP-binding protein  58.89 
 
 		 558 aa  669    Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00204105  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2568  putative ABC transporter ATP-binding protein  78.25 
 
 		 557 aa  872    Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.878611  normal  0.580087 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1926  putative ABC transporter ATP-binding protein  57.63 
 
 		 559 aa  663    Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000000896956  normal  0.905041 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7358  putative ABC transporter ATP-binding protein  77.18 
 
 		 554 aa  873    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1403  putative ABC transporter ATP-binding protein  57.58 
 
 		 556 aa  648    Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.595923  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3542  putative ABC transporter ATP-binding protein  81.96 
 
 		 558 aa  929    Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.195737  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1855  putative ABC transporter ATP-binding protein  73.88 
 
 		 559 aa  838    Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1527  putative ABC transporter ATP-binding protein  58.21 
 
 		 559 aa  649    Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3620  putative ABC transporter ATP-binding protein  77.9 
 
 		 557 aa  865    Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.914588  normal  0.710746 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3917  putative ABC transporter ATP-binding protein  75.22 
 
 		 558 aa  857    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.426446 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1148  putative ABC transporter ATP-binding protein  75 
 
 		 560 aa  850    Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.493052  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1060  putative ABC transporter ATP-binding protein  57.96 
 
 		 554 aa  637    Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.298194  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1089  ABC transporter related protein  90.18 
 
 		 560 aa  1017    Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.545835  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2642  putative ABC transporter ATP-binding protein  84.64 
 
 		 560 aa  954    Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.520141 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1329  ABC transporter related protein  77.9 
 
 		 554 aa  869    Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.461505  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0300  putative ABC transporter ATP-binding protein  71.43 
 
 		 559 aa  815    Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  0.208774 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_09750  putative ABC transporter ATP-binding protein  83.39 
 
 		 560 aa  937    Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1127  putative ABC transporter ATP-binding protein  79.68 
 
 		 558 aa  895    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1002  ABC transporter related protein  60.82 
 
 		 551 aa  645    Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.856091  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_11760  putative ABC transporter ATP-binding protein  79.32 
 
 		 558 aa  878    Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.406602 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1129  ABC transporter, ATP-binding protein YjiK  73.88 
 
 		 558 aa  839    Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_22290  putative ABC transporter ATP-binding protein  73.21 
 
 		 559 aa  828    Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.793295  normal  0.525138 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1284  putative ABC transporter ATP-binding protein  57.12 
 
 		 670 aa  638    Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3542  putative ABC transporter ATP-binding protein  75.76 
 
 		 558 aa  864    Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.610631  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2026  ABC transporter related protein  78.97 
 
 		 557 aa  874    Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3615  putative ABC transporter ATP-binding protein  77.9 
 
 		 557 aa  865    Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0834  putative ABC transporter ATP-binding protein  57.25 
 
 		 561 aa  650    Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00294599  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3426  putative ABC transporter ATP-binding protein  56.89 
 
 		 561 aa  649    Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_08900  putative ABC transporter ATP-binding protein  83.21 
 
 		 560 aa  933    Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.210485  normal  0.0113448 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2580  putative ABC transporter ATP-binding protein  55.99 
 
 		 560 aa  643    Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.471915  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_24710  ATPase component of ABC transporters with duplicated ATPase domain  100 
 
 		 560 aa  1142    Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0377191  normal  0.041371 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2171  putative ABC transporter ATP-binding protein  86.96 
 
 		 560 aa  978    Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000196153 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_11480  putative ABC transporter ATP-binding protein  80.54 
 
 		 560 aa  911    Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.105111  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2098  putative ABC transporter ATP-binding protein  59.5 
 
 		 555 aa  664    Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.249977 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0931  putative ABC transporter ATP-binding protein  92.68 
 
 		 560 aa  1035    Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12501  putative ABC transporter ATP-binding protein  78.93 
 
 		 558 aa  879    Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  decreased coverage  0.0036999  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5234  ABC transporter related protein  57.3 
 
 		 555 aa  635    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.547616  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2418  putative ABC transporter ATP-binding protein  86.79 
 
 		 560 aa  978    Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0404573  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_4019  putative ABC transporter ATP-binding protein  55.46 
 
 		 561 aa  640    Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.186099 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1864  putative ABC transporter ATP-binding protein  56.86 
 
 		 560 aa  644    Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.733773  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1614  putative ABC transporter ATP-binding protein  73.75 
 
 		 556 aa  843    Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.682319  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1057  putative ABC transporter ATP-binding protein  56.37 
 
 		 559 aa  650    Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2152  putative ABC transporter ATP-binding protein  56.99 
 
 		 556 aa  646    Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.0875259  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0877  ABC transporter related protein  57.25 
 
 		 555 aa  639    Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1369  putative ABC transporter ATP-binding protein  75.71 
 
 		 560 aa  850    Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.482048  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1384  ABC transporter related protein  76.11 
 
 		 557 aa  852    Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3688  putative ABC transporter ATP-binding protein  77.9 
 
 		 557 aa  865    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1442  putative ABC transporter ATP-binding protein  75.18 
 
 		 559 aa  851    Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.465539  normal  0.471645 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4070  putative ABC transporter ATP-binding protein  78.04 
 
 		 557 aa  868    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.715968 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1816  putative ABC transporter ATP-binding protein  77.68 
 
 		 559 aa  877    Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.461866  normal  0.0107915 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4264  putative ABC transporter ATP-binding protein  57.78 
 
 		 554 aa  632  1e-180  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2351  putative ABC transporter ATP-binding protein  57.12 
 
 		 559 aa  633  1e-180  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.701309  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4119  putative ABC transporter ATP-binding protein  58.09 
 
 		 555 aa  634  1e-180  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4602  ABC transporter, ATP-binding protein  57.91 
 
 		 563 aa  631  1e-179  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.29694  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3678  putative ABC transporter ATP-binding protein  56.58 
 
 		 555 aa  630  1e-179  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0229  putative ABC transporter ATP-binding protein  55.89 
 
 		 555 aa  629  1e-179  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3489  putative ABC transporter ATP-binding protein  56.41 
 
 		 555 aa  629  1e-179  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3618  putative ABC transporter ATP-binding protein  56.41 
 
 		 555 aa  629  1e-179  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2242  putative ABC transporter ATP-binding protein  56.17 
 
 		 553 aa  630  1e-179  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3872  putative ABC transporter ATP-binding protein  56.58 
 
 		 555 aa  629  1e-179  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0797074  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4832  putative ABC transporter ATP-binding protein  56.76 
 
 		 555 aa  628  1e-179  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.218638  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0674  putative ABC transporter ATP-binding protein  56.96 
 
 		 555 aa  628  1e-178  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.599551  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0706  putative ABC transporter ATP-binding protein  56.61 
 
 		 555 aa  625  1e-178  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.483075  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0758  putative ABC transporter ATP-binding protein  54.72 
 
 		 557 aa  627  1e-178  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0740  putative ABC transporter ATP-binding protein  54.55 
 
 		 557 aa  627  1e-178  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4510  putative ABC transporter ATP-binding protein  56.79 
 
 		 555 aa  627  1e-178  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.29936  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4991  putative ABC transporter ATP-binding protein  56.58 
 
 		 555 aa  626  1e-178  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.170616  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0705  putative ABC transporter ATP-binding protein  56.96 
 
 		 555 aa  627  1e-178  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.0956761 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0893  putative ABC transporter ATP-binding protein  56.83 
 
 		 560 aa  625  1e-178  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.100195  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1466  putative ABC transporter ATP-binding protein  55.2 
 
 		 558 aa  626  1e-178  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.000105508  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4905  putative ABC transporter ATP-binding protein  56.76 
 
 		 555 aa  627  1e-178  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4939  putative ABC transporter ATP-binding protein  56.76 
 
 		 555 aa  627  1e-178  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.909016  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4993  putative ABC transporter ATP-binding protein  56.76 
 
 		 555 aa  627  1e-178  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_04267  fused predicted transporter subunits of ABC superfamily: ATP-binding components  56.23 
 
 		 555 aa  624  1e-177  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3606  ABC transporter related protein  56.23 
 
 		 555 aa  624  1e-177  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5906  putative ABC transporter ATP-binding protein  56.23 
 
 		 555 aa  624  1e-177  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4941  putative ABC transporter ATP-binding protein  56.23 
 
 		 555 aa  624  1e-177  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.963786 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4627  putative ABC transporter ATP-binding protein  56.23 
 
 		 555 aa  624  1e-177  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3665  putative ABC transporter ATP-binding protein  56.23 
 
 		 555 aa  624  1e-177  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4875  putative ABC transporter ATP-binding protein  56.71 
 
 		 554 aa  622  1e-177  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.54223  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0762  putative ABC transporter ATP-binding protein  56.96 
 
 		 555 aa  624  1e-177  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4990  putative ABC transporter ATP-binding protein  56.23 
 
 		 555 aa  624  1e-177  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0822  putative ABC transporter ATP-binding protein  56.23 
 
 		 555 aa  624  1e-177  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0372  putative ABC transporter ATP-binding protein  55.46 
 
 		 556 aa  622  1e-177  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>