More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sare_3917 on replicon NC_009953
Organism: Salinispora arenicola CNS-205



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012918  GM21_3426  putative ABC transporter ATP-binding protein  57.09 
 
 
561 aa  651    Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7359  putative ABC transporter ATP-binding protein  78.49 
 
 
554 aa  891    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.625389 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1644  putative ABC transporter ATP-binding protein  56.09 
 
 
559 aa  650    Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1002  ABC transporter related protein  62.3 
 
 
551 aa  663    Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.856091  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1794  putative ABC transporter ATP-binding protein  60.29 
 
 
555 aa  677    Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.482874  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_11760  putative ABC transporter ATP-binding protein  77.6 
 
 
558 aa  889    Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.406602 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1522  ABC transporter related protein  74.33 
 
 
556 aa  837    Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.256666  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1456  putative ABC transporter ATP-binding protein  61.62 
 
 
549 aa  663    Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.504666  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_22290  putative ABC transporter ATP-binding protein  69.88 
 
 
559 aa  793    Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.793295  normal  0.525138 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_24710  ATPase component of ABC transporters with duplicated ATPase domain  75.22 
 
 
560 aa  852    Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0377191  normal  0.041371 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2152  putative ABC transporter ATP-binding protein  56.53 
 
 
556 aa  635    Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.0875259  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3542  putative ABC transporter ATP-binding protein  98.39 
 
 
558 aa  1124    Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.610631  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2580  putative ABC transporter ATP-binding protein  56.73 
 
 
560 aa  647    Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.471915  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2197  putative ABC transporter ATP-binding protein  58.81 
 
 
551 aa  657    Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0758  putative ABC transporter ATP-binding protein  55.08 
 
 
557 aa  636    Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0740  putative ABC transporter ATP-binding protein  55.08 
 
 
557 aa  637    Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3414  putative ABC transporter ATP-binding protein  58.17 
 
 
555 aa  646    Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.106241  normal  0.225653 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1117  putative ABC transporter ATP-binding protein  58.45 
 
 
550 aa  650    Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.188653 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2216  putative ABC transporter ATP-binding protein  77.5 
 
 
547 aa  859    Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.885012  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2441  putative ABC transporter ATP-binding protein  56.91 
 
 
558 aa  648    Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00204105  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1129  ABC transporter, ATP-binding protein YjiK  71.61 
 
 
558 aa  809    Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0834  putative ABC transporter ATP-binding protein  57.09 
 
 
561 aa  650    Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00294599  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2485  putative ABC transporter ATP-binding protein  60.79 
 
 
550 aa  649    Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.445071  normal  0.555297 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5318  putative ABC transporter ATP-binding protein  73.98 
 
 
560 aa  841    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.134924  normal  0.268079 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1687  putative ABC transporter ATP-binding protein  59.46 
 
 
557 aa  661    Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.00296418  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1089  ABC transporter related protein  77.18 
 
 
560 aa  872    Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.545835  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0587  putative ABC transporter ATP-binding protein  58.81 
 
 
551 aa  669    Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1361  putative ABC transporter ATP-binding protein  56.55 
 
 
561 aa  645    Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000127735  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2171  putative ABC transporter ATP-binding protein  74.87 
 
 
560 aa  857    Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000196153 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_08900  putative ABC transporter ATP-binding protein  75.76 
 
 
560 aa  865    Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.210485  normal  0.0113448 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1926  putative ABC transporter ATP-binding protein  56.94 
 
 
559 aa  647    Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000000896956  normal  0.905041 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0762  putative ABC transporter ATP-binding protein  57.75 
 
 
555 aa  637    Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_11480  putative ABC transporter ATP-binding protein  73.08 
 
 
560 aa  828    Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.105111  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1403  putative ABC transporter ATP-binding protein  57.65 
 
 
556 aa  639    Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.595923  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1329  ABC transporter related protein  79.21 
 
 
554 aa  908    Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.461505  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1527  putative ABC transporter ATP-binding protein  59.11 
 
 
559 aa  664    Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1060  putative ABC transporter ATP-binding protein  58.04 
 
 
554 aa  649    Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.298194  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0931  putative ABC transporter ATP-binding protein  76.83 
 
 
560 aa  871    Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0238  putative ABC transporter ATP-binding protein  57.47 
 
 
559 aa  635    Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.331867 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1148  putative ABC transporter ATP-binding protein  74.87 
 
 
560 aa  847    Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.493052  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2351  putative ABC transporter ATP-binding protein  57.55 
 
 
559 aa  637    Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.701309  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3627  putative ABC transporter ATP-binding protein  58.09 
 
 
551 aa  650    Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.108497 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1816  putative ABC transporter ATP-binding protein  75.13 
 
 
559 aa  854    Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.461866  normal  0.0107915 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2929  putative ABC transporter ATP-binding protein  60.36 
 
 
549 aa  652    Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5309  ABC transporter related protein  60 
 
 
559 aa  676    Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3241  putative ABC transporter ATP-binding protein  56.19 
 
 
561 aa  645    Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000308971  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_10980  putative ABC transporter ATP-binding protein  68.81 
 
 
558 aa  772    Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3452  putative ABC transporter ATP-binding protein  58.92 
 
 
549 aa  635    Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.747993  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0490  putative ABC transporter ATP-binding protein  59.17 
 
 
551 aa  669    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.191061  normal  0.167217 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2642  putative ABC transporter ATP-binding protein  77.54 
 
 
560 aa  877    Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.520141 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0300  putative ABC transporter ATP-binding protein  68.27 
 
 
559 aa  778    Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal  0.208774 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2026  ABC transporter related protein  76.16 
 
 
557 aa  858    Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_09750  putative ABC transporter ATP-binding protein  74.33 
 
 
560 aa  838    Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2255  putative ABC transporter ATP-binding protein  59.17 
 
 
555 aa  667    Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1284  putative ABC transporter ATP-binding protein  58.26 
 
 
670 aa  646    Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7358  putative ABC transporter ATP-binding protein  78.49 
 
 
554 aa  895    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3917  putative ABC transporter ATP-binding protein  100 
 
 
558 aa  1139    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.426446 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3615  putative ABC transporter ATP-binding protein  77.24 
 
 
557 aa  865    Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1442  putative ABC transporter ATP-binding protein  69.7 
 
 
559 aa  785    Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.465539  normal  0.471645 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2033  putative ABC transporter ATP-binding protein  60.18 
 
 
549 aa  648    Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1845  putative ABC transporter ATP-binding protein  59.04 
 
 
556 aa  646    Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000460921 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2392  putative ABC transporter ATP-binding protein  57.91 
 
 
551 aa  640    Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.935698  normal  0.570925 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2240  putative ABC transporter ATP-binding protein  58.81 
 
 
551 aa  669    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.497585 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4641  ABC transporter related protein  84.95 
 
 
558 aa  959    Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.310211  hitchhiker  0.00496143 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12501  putative ABC transporter ATP-binding protein  79.17 
 
 
558 aa  896    Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  decreased coverage  0.0036999  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1718  putative ABC transporter ATP-binding protein  61.26 
 
 
549 aa  658    Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3542  putative ABC transporter ATP-binding protein  78.32 
 
 
558 aa  901    Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.195737  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2098  putative ABC transporter ATP-binding protein  60.04 
 
 
555 aa  678    Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.249977 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2552  ABC transporter-like protein  78.85 
 
 
554 aa  902    Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.410797 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2105  putative ABC transporter ATP-binding protein  57.99 
 
 
555 aa  642    Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1411  putative ABC transporter ATP-binding protein  61.55 
 
 
584 aa  660    Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2568  putative ABC transporter ATP-binding protein  78.14 
 
 
557 aa  878    Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.878611  normal  0.580087 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2418  putative ABC transporter ATP-binding protein  74.87 
 
 
560 aa  857    Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0404573  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0877  ABC transporter related protein  57.14 
 
 
555 aa  640    Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3620  putative ABC transporter ATP-binding protein  77.24 
 
 
557 aa  865    Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.914588  normal  0.710746 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1864  putative ABC transporter ATP-binding protein  56.15 
 
 
560 aa  638    Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.733773  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3426  ABC transporter related protein  78.32 
 
 
554 aa  879    Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.543642 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1614  putative ABC transporter ATP-binding protein  73.62 
 
 
556 aa  833    Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.682319  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1384  ABC transporter related protein  74.73 
 
 
557 aa  846    Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2117  putative ABC transporter ATP-binding protein  58.92 
 
 
549 aa  645    Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.129596  normal  0.211481 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2008  putative ABC transporter ATP-binding protein  59.35 
 
 
551 aa  669    Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1369  putative ABC transporter ATP-binding protein  72.55 
 
 
560 aa  812    Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.482048  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1127  putative ABC transporter ATP-binding protein  80.11 
 
 
558 aa  917    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3688  putative ABC transporter ATP-binding protein  77.24 
 
 
557 aa  865    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4070  putative ABC transporter ATP-binding protein  78.82 
 
 
557 aa  885    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.715968 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1352  ABC transporter related protein  77.36 
 
 
560 aa  854    Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  decreased coverage  0.000271939  hitchhiker  0.0000279927 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1448  putative ABC transporter ATP-binding protein  58.86 
 
 
555 aa  668    Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.391667  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1855  putative ABC transporter ATP-binding protein  70.18 
 
 
559 aa  794    Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2880  putative ABC transporter ATP-binding protein  58.38 
 
 
549 aa  632  1e-180  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.824373  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4264  putative ABC transporter ATP-binding protein  58.04 
 
 
554 aa  633  1e-180  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4129  putative ABC transporter ATP-binding protein  59.46 
 
 
549 aa  633  1e-180  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3474  putative ABC transporter ATP-binding protein  59.53 
 
 
551 aa  633  1e-180  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.128055  normal  0.617651 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1117  putative ABC transporter ATP-binding protein  58.24 
 
 
558 aa  633  1e-180  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.406197  hitchhiker  0.00000247304 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3489  putative ABC transporter ATP-binding protein  57.04 
 
 
555 aa  634  1e-180  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1919  putative ABC transporter ATP-binding protein  58.92 
 
 
549 aa  634  1e-180  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.137087  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3618  putative ABC transporter ATP-binding protein  57.04 
 
 
555 aa  634  1e-180  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_60800  putative ABC transporter ATP-binding protein  56.96 
 
 
554 aa  633  1e-180  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_4019  putative ABC transporter ATP-binding protein  55.12 
 
 
561 aa  632  1e-180  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.186099 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4510  putative ABC transporter ATP-binding protein  57.04 
 
 
555 aa  628  1e-179  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.29936  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2911  putative ABC transporter ATP-binding protein  58.27 
 
 
550 aa  629  1e-179  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.608005  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>