More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ksed_08900 on replicon NC_013169
Organism: Kytococcus sedentarius DSM 20547



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
CP001509  ECD_04267  fused predicted transporter subunits of ABC superfamily: ATP-binding components  58.36 
 
 		 555 aa  661    Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3606  ABC transporter related protein  58.36 
 
 		 555 aa  661    Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1644  putative ABC transporter ATP-binding protein  59.5 
 
 		 559 aa  701    Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0674  putative ABC transporter ATP-binding protein  58.75 
 
 		 555 aa  664    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.599551  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1794  putative ABC transporter ATP-binding protein  62.01 
 
 		 555 aa  711    Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.482874  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3618  putative ABC transporter ATP-binding protein  58.9 
 
 		 555 aa  671    Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3883  putative ABC transporter ATP-binding protein  56.83 
 
 		 559 aa  641    Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1456  putative ABC transporter ATP-binding protein  60.68 
 
 		 549 aa  647    Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.504666  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3917  putative ABC transporter ATP-binding protein  75.76 
 
 		 558 aa  870    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.426446 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4602  ABC transporter, ATP-binding protein  58.27 
 
 		 563 aa  652    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.29694  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2152  putative ABC transporter ATP-binding protein  58.06 
 
 		 556 aa  674    Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.0875259  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0671  putative ABC transporter ATP-binding protein  56.79 
 
 		 555 aa  647    Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0758  putative ABC transporter ATP-binding protein  55.26 
 
 		 557 aa  653    Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0740  putative ABC transporter ATP-binding protein  55.44 
 
 		 557 aa  655    Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4264  putative ABC transporter ATP-binding protein  58.5 
 
 		 554 aa  658    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0133  putative ABC transporter ATP-binding protein  57.42 
 
 		 553 aa  654    Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.0668164  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1799  putative ABC transporter ATP-binding protein  56.07 
 
 		 554 aa  637    Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.255837 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2216  putative ABC transporter ATP-binding protein  75.27 
 
 		 547 aa  840    Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.885012  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0822  putative ABC transporter ATP-binding protein  58.72 
 
 		 555 aa  667    Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0229  putative ABC transporter ATP-binding protein  57.68 
 
 		 555 aa  648    Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3414  putative ABC transporter ATP-binding protein  59.03 
 
 		 555 aa  645    Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.106241  normal  0.225653 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5318  putative ABC transporter ATP-binding protein  74.46 
 
 		 560 aa  849    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.134924  normal  0.268079 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2485  putative ABC transporter ATP-binding protein  61.11 
 
 		 550 aa  653    Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.445071  normal  0.555297 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3489  putative ABC transporter ATP-binding protein  58.9 
 
 		 555 aa  671    Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1411  putative ABC transporter ATP-binding protein  60.61 
 
 		 584 aa  644    Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2580  putative ABC transporter ATP-binding protein  57.07 
 
 		 560 aa  665    Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.471915  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1687  putative ABC transporter ATP-binding protein  60 
 
 		 557 aa  677    Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.00296418  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4875  putative ABC transporter ATP-binding protein  58.68 
 
 		 554 aa  660    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.54223  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0587  putative ABC transporter ATP-binding protein  55.73 
 
 		 551 aa  639    Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1361  putative ABC transporter ATP-binding protein  56.53 
 
 		 561 aa  658    Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000127735  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2117  putative ABC transporter ATP-binding protein  58.35 
 
 		 549 aa  642    Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.129596  normal  0.211481 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1718  putative ABC transporter ATP-binding protein  60.32 
 
 		 549 aa  642    Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2240  putative ABC transporter ATP-binding protein  55.73 
 
 		 551 aa  639    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.497585 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00997  putative ABC transporter ATP-binding protein  57.68 
 
 		 555 aa  649    Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1926  putative ABC transporter ATP-binding protein  58.35 
 
 		 559 aa  684    Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000000896956  normal  0.905041 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0762  putative ABC transporter ATP-binding protein  58.57 
 
 		 555 aa  665    Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1281  putative ABC transporter ATP-binding protein  55.28 
 
 		 561 aa  642    Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.0000308368  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1403  putative ABC transporter ATP-binding protein  58.65 
 
 		 556 aa  669    Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.595923  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6251  putative ABC transporter ATP-binding protein  58.17 
 
 		 549 aa  636    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.223769  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3542  putative ABC transporter ATP-binding protein  75.22 
 
 		 558 aa  866    Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.610631  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1527  putative ABC transporter ATP-binding protein  59.64 
 
 		 559 aa  671    Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2900  putative ABC transporter ATP-binding protein  57.53 
 
 		 554 aa  638    Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0196259 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4941  putative ABC transporter ATP-binding protein  58.19 
 
 		 555 aa  659    Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.963786 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2460  putative ABC transporter ATP-binding protein  58.21 
 
 		 559 aa  636    Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.561949  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1148  putative ABC transporter ATP-binding protein  74.29 
 
 		 560 aa  848    Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.493052  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1919  putative ABC transporter ATP-binding protein  59.61 
 
 		 549 aa  647    Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.137087  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2351  putative ABC transporter ATP-binding protein  58.72 
 
 		 559 aa  669    Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.701309  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3627  putative ABC transporter ATP-binding protein  56.81 
 
 		 551 aa  641    Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.108497 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2845  putative ABC transporter ATP-binding protein  56.27 
 
 		 559 aa  645    Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.493421  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0416  putative ABC transporter ATP-binding protein  57.17 
 
 		 553 aa  635    Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2495  putative ABC transporter ATP-binding protein  56.81 
 
 		 558 aa  658    Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.290369 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0552  putative ABC transporter ATP-binding protein  57.65 
 
 		 555 aa  652    Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2242  putative ABC transporter ATP-binding protein  58.86 
 
 		 553 aa  668    Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12501  putative ABC transporter ATP-binding protein  81.25 
 
 		 558 aa  908    Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  decreased coverage  0.0036999  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3620  putative ABC transporter ATP-binding protein  79.86 
 
 		 557 aa  884    Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.914588  normal  0.710746 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3452  putative ABC transporter ATP-binding protein  59.25 
 
 		 549 aa  645    Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.747993  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2626  putative ABC transporter ATP-binding protein  57.35 
 
 		 578 aa  648    Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.663821  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2911  putative ABC transporter ATP-binding protein  58.78 
 
 		 550 aa  637    Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.608005  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0144  putative ABC transporter ATP-binding protein  57.42 
 
 		 553 aa  655    Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2197  putative ABC transporter ATP-binding protein  57.35 
 
 		 551 aa  648    Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3221  putative ABC transporter ATP-binding protein  56.25 
 
 		 589 aa  637    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2255  putative ABC transporter ATP-binding protein  57.53 
 
 		 555 aa  652    Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1284  putative ABC transporter ATP-binding protein  58.19 
 
 		 670 aa  667    Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2084  putative ABC transporter ATP-binding protein  56.71 
 
 		 555 aa  638    Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.695655  normal  0.261341 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2991  putative ABC transporter ATP-binding protein  55.79 
 
 		 559 aa  639    Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.187094  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3615  putative ABC transporter ATP-binding protein  79.86 
 
 		 557 aa  884    Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4627  putative ABC transporter ATP-binding protein  58.36 
 
 		 555 aa  661    Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2033  putative ABC transporter ATP-binding protein  59.07 
 
 		 549 aa  637    Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1845  putative ABC transporter ATP-binding protein  55.71 
 
 		 556 aa  638    Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000460921 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2568  putative ABC transporter ATP-binding protein  80.21 
 
 		 557 aa  897    Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.878611  normal  0.580087 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0490  putative ABC transporter ATP-binding protein  56.27 
 
 		 551 aa  642    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.191061  normal  0.167217 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0372  putative ABC transporter ATP-binding protein  57.78 
 
 		 556 aa  655    Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3542  putative ABC transporter ATP-binding protein  80.36 
 
 		 558 aa  913    Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.195737  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1093  putative ABC transporter ATP-binding protein  55.71 
 
 		 555 aa  637    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.53945 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1159  putative ABC transporter ATP-binding protein  55.71 
 
 		 555 aa  637    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.294731 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2098  putative ABC transporter ATP-binding protein  62.19 
 
 		 555 aa  714    Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.249977 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0706  putative ABC transporter ATP-binding protein  58.75 
 
 		 555 aa  665    Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.483075  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2105  putative ABC transporter ATP-binding protein  59.29 
 
 		 555 aa  649    Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0238  putative ABC transporter ATP-binding protein  59.45 
 
 		 559 aa  656    Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.331867 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3241  putative ABC transporter ATP-binding protein  56.89 
 
 		 561 aa  666    Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000308971  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_60800  putative ABC transporter ATP-binding protein  58.5 
 
 		 554 aa  664    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2418  putative ABC transporter ATP-binding protein  83.04 
 
 		 560 aa  938    Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0404573  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3665  putative ABC transporter ATP-binding protein  58.36 
 
 		 555 aa  661    Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4990  putative ABC transporter ATP-binding protein  58.36 
 
 		 555 aa  661    Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_4019  putative ABC transporter ATP-binding protein  55.1 
 
 		 561 aa  650    Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.186099 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1864  putative ABC transporter ATP-binding protein  56.86 
 
 		 560 aa  645    Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.733773  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1093  putative ABC transporter ATP-binding protein  55.71 
 
 		 555 aa  637    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1614  putative ABC transporter ATP-binding protein  72.68 
 
 		 556 aa  825    Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.682319  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1057  putative ABC transporter ATP-binding protein  56.94 
 
 		 559 aa  663    Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5235  putative ABC transporter ATP-binding protein  58.32 
 
 		 579 aa  662    Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2008  putative ABC transporter ATP-binding protein  56.63 
 
 		 551 aa  635    Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1369  putative ABC transporter ATP-binding protein  73.21 
 
 		 560 aa  829    Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.482048  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4510  putative ABC transporter ATP-binding protein  58.57 
 
 		 555 aa  663    Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.29936  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3688  putative ABC transporter ATP-binding protein  79.86 
 
 		 557 aa  884    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1379  putative ABC transporter ATP-binding protein  56.35 
 
 		 554 aa  635    Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.621698  hitchhiker  0.000163615 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4070  putative ABC transporter ATP-binding protein  81.25 
 
 		 557 aa  904    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.715968 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0840  putative ABC transporter ATP-binding protein  58.86 
 
 		 553 aa  657    Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0661  putative ABC transporter ATP-binding protein  55.99 
 
 		 560 aa  641    Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1801  putative ABC transporter ATP-binding protein  57.35 
 
 		 553 aa  636    Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.124805  normal  0.0665876 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0705  putative ABC transporter ATP-binding protein  58.75 
 
 		 555 aa  664    Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.0956761 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>