More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cfla_1352 on replicon NC_014151
Organism: Cellulomonas flavigena DSM 20109



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
CP001509  ECD_04267  fused predicted transporter subunits of ABC superfamily: ATP-binding components  59.64 
 
 
555 aa  665    Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3606  ABC transporter related protein  59.64 
 
 
555 aa  665    Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1644  putative ABC transporter ATP-binding protein  59.14 
 
 
559 aa  692    Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0674  putative ABC transporter ATP-binding protein  58.42 
 
 
555 aa  641    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.599551  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1794  putative ABC transporter ATP-binding protein  62.37 
 
 
555 aa  704    Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.482874  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7359  putative ABC transporter ATP-binding protein  77.36 
 
 
554 aa  872    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.625389 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0563  putative ABC transporter ATP-binding protein  58.04 
 
 
572 aa  650    Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.499297  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4119  putative ABC transporter ATP-binding protein  59.96 
 
 
555 aa  652    Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004310  BR1456  putative ABC transporter ATP-binding protein  60.32 
 
 
549 aa  645    Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.504666  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4510  putative ABC transporter ATP-binding protein  58.24 
 
 
555 aa  641    Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.29936  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4602  ABC transporter, ATP-binding protein  58.74 
 
 
563 aa  642    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.29694  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_04232  hypothetical protein  59.64 
 
 
555 aa  665    Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0840  putative ABC transporter ATP-binding protein  58.78 
 
 
553 aa  639    Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2580  putative ABC transporter ATP-binding protein  56.89 
 
 
560 aa  657    Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.471915  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5318  putative ABC transporter ATP-binding protein  76.07 
 
 
560 aa  860    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.134924  normal  0.268079 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0758  putative ABC transporter ATP-binding protein  55.54 
 
 
557 aa  644    Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0740  putative ABC transporter ATP-binding protein  55.71 
 
 
557 aa  647    Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4264  putative ABC transporter ATP-binding protein  58.6 
 
 
554 aa  644    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0133  putative ABC transporter ATP-binding protein  56.99 
 
 
553 aa  640    Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.0668164  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2242  putative ABC transporter ATP-binding protein  59.32 
 
 
553 aa  659    Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2216  putative ABC transporter ATP-binding protein  76.17 
 
 
547 aa  842    Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.885012  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0822  putative ABC transporter ATP-binding protein  58.36 
 
 
555 aa  652    Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2152  putative ABC transporter ATP-binding protein  58.42 
 
 
556 aa  667    Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.0875259  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3241  putative ABC transporter ATP-binding protein  56.89 
 
 
561 aa  658    Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000308971  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3426  putative ABC transporter ATP-binding protein  57.09 
 
 
561 aa  652    Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_09750  putative ABC transporter ATP-binding protein  84.64 
 
 
560 aa  952    Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1411  putative ABC transporter ATP-binding protein  60.36 
 
 
584 aa  643    Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0671  putative ABC transporter ATP-binding protein  58.39 
 
 
555 aa  649    Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1687  putative ABC transporter ATP-binding protein  60.18 
 
 
557 aa  676    Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.00296418  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4875  putative ABC transporter ATP-binding protein  58.24 
 
 
554 aa  640    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.54223  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0587  putative ABC transporter ATP-binding protein  57.53 
 
 
551 aa  647    Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1361  putative ABC transporter ATP-binding protein  56.71 
 
 
561 aa  658    Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000127735  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0705  putative ABC transporter ATP-binding protein  58.42 
 
 
555 aa  640    Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.0956761 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3542  putative ABC transporter ATP-binding protein  77.9 
 
 
558 aa  886    Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.610631  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4941  putative ABC transporter ATP-binding protein  59.46 
 
 
555 aa  664    Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.963786 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0490  putative ABC transporter ATP-binding protein  57.53 
 
 
551 aa  647    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.191061  normal  0.167217 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1926  putative ABC transporter ATP-binding protein  58.35 
 
 
559 aa  677    Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000000896956  normal  0.905041 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0762  putative ABC transporter ATP-binding protein  59.68 
 
 
555 aa  659    Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1281  putative ABC transporter ATP-binding protein  55.1 
 
 
561 aa  640    Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.0000308368  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1403  putative ABC transporter ATP-binding protein  59.53 
 
 
556 aa  667    Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.595923  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_40960  putative ABC transporter ATP-binding protein  60.93 
 
 
554 aa  655    Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.512675  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2642  putative ABC transporter ATP-binding protein  87.32 
 
 
560 aa  986    Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.520141 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1527  putative ABC transporter ATP-binding protein  60.54 
 
 
559 aa  679    Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3414  putative ABC transporter ATP-binding protein  58.29 
 
 
555 aa  641    Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.106241  normal  0.225653 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4627  putative ABC transporter ATP-binding protein  59.64 
 
 
555 aa  665    Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1148  putative ABC transporter ATP-binding protein  75.89 
 
 
560 aa  861    Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.493052  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4905  putative ABC transporter ATP-binding protein  60.36 
 
 
555 aa  668    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2351  putative ABC transporter ATP-binding protein  58.54 
 
 
559 aa  655    Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.701309  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3627  putative ABC transporter ATP-binding protein  57.89 
 
 
551 aa  636    Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.108497 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5906  putative ABC transporter ATP-binding protein  59.64 
 
 
555 aa  665    Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4993  putative ABC transporter ATP-binding protein  60.36 
 
 
555 aa  668    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3917  putative ABC transporter ATP-binding protein  77.36 
 
 
558 aa  879    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.426446 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1127  putative ABC transporter ATP-binding protein  81.28 
 
 
558 aa  918    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2495  putative ABC transporter ATP-binding protein  55.81 
 
 
558 aa  639    Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.290369 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1448  putative ABC transporter ATP-binding protein  60.39 
 
 
555 aa  681    Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.391667  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5235  putative ABC transporter ATP-binding protein  58.96 
 
 
579 aa  650    Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1718  putative ABC transporter ATP-binding protein  59.78 
 
 
549 aa  636    Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1141  putative ABC transporter ATP-binding protein  57.35 
 
 
555 aa  637    Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.776403  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1466  putative ABC transporter ATP-binding protein  56.81 
 
 
558 aa  647    Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.000105508  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12501  putative ABC transporter ATP-binding protein  80.36 
 
 
558 aa  896    Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  decreased coverage  0.0036999  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0524  putative ABC transporter ATP-binding protein  58.04 
 
 
554 aa  650    Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3542  putative ABC transporter ATP-binding protein  83.39 
 
 
558 aa  946    Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.195737  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0144  putative ABC transporter ATP-binding protein  56.99 
 
 
553 aa  640    Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2568  putative ABC transporter ATP-binding protein  80.57 
 
 
557 aa  895    Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.878611  normal  0.580087 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3618  putative ABC transporter ATP-binding protein  58.54 
 
 
555 aa  655    Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2255  putative ABC transporter ATP-binding protein  57.17 
 
 
555 aa  635    Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1284  putative ABC transporter ATP-binding protein  59.07 
 
 
670 aa  660    Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4990  putative ABC transporter ATP-binding protein  59.64 
 
 
555 aa  665    Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2197  putative ABC transporter ATP-binding protein  57.89 
 
 
551 aa  635    Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3615  putative ABC transporter ATP-binding protein  79.5 
 
 
557 aa  882    Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3665  putative ABC transporter ATP-binding protein  59.64 
 
 
555 aa  665    Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2171  putative ABC transporter ATP-binding protein  88.39 
 
 
560 aa  990    Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000196153 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4939  putative ABC transporter ATP-binding protein  59.46 
 
 
555 aa  662    Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2392  putative ABC transporter ATP-binding protein  57.89 
 
 
551 aa  637    Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.935698  normal  0.570925 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2240  putative ABC transporter ATP-binding protein  57.53 
 
 
551 aa  647    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.497585 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0372  putative ABC transporter ATP-binding protein  58.14 
 
 
556 aa  653    Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0552  putative ABC transporter ATP-binding protein  58.36 
 
 
555 aa  651    Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2441  putative ABC transporter ATP-binding protein  58.71 
 
 
558 aa  676    Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00204105  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4939  putative ABC transporter ATP-binding protein  60.36 
 
 
555 aa  668    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.909016  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2098  putative ABC transporter ATP-binding protein  62.19 
 
 
555 aa  702    Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.249977 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1117  putative ABC transporter ATP-binding protein  56.94 
 
 
558 aa  642    Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.406197  hitchhiker  0.00000247304 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1855  putative ABC transporter ATP-binding protein  75.85 
 
 
559 aa  863    Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0238  putative ABC transporter ATP-binding protein  59.08 
 
 
559 aa  636    Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.331867 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4832  putative ABC transporter ATP-binding protein  60.36 
 
 
555 aa  669    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.218638  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_60800  putative ABC transporter ATP-binding protein  59.14 
 
 
554 aa  653    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2418  putative ABC transporter ATP-binding protein  87.32 
 
 
560 aa  982    Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0404573  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3678  putative ABC transporter ATP-binding protein  59.11 
 
 
555 aa  657    Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3620  putative ABC transporter ATP-binding protein  79.5 
 
 
557 aa  882    Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.914588  normal  0.710746 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_4019  putative ABC transporter ATP-binding protein  55.64 
 
 
561 aa  652    Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.186099 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1864  putative ABC transporter ATP-binding protein  56.33 
 
 
560 aa  641    Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.733773  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4991  putative ABC transporter ATP-binding protein  60.18 
 
 
555 aa  667    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.170616  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1614  putative ABC transporter ATP-binding protein  74.64 
 
 
556 aa  852    Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.682319  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1057  putative ABC transporter ATP-binding protein  56.58 
 
 
559 aa  656    Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3489  putative ABC transporter ATP-binding protein  58.54 
 
 
555 aa  655    Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2008  putative ABC transporter ATP-binding protein  58.6 
 
 
551 aa  650    Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1369  putative ABC transporter ATP-binding protein  76.07 
 
 
560 aa  858    Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.482048  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0834  putative ABC transporter ATP-binding protein  57.27 
 
 
561 aa  653    Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00294599  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3688  putative ABC transporter ATP-binding protein  79.5 
 
 
557 aa  882    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0706  putative ABC transporter ATP-binding protein  58.42 
 
 
555 aa  641    Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.483075  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4070  putative ABC transporter ATP-binding protein  80.18 
 
 
557 aa  892    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.715968 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>