More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcav_2642 on replicon NC_012669
Organism: Beutenbergia cavernae DSM 12333



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
CP001509  ECD_04267  fused predicted transporter subunits of ABC superfamily: ATP-binding components  56.61 
 
 		 555 aa  640    Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3606  ABC transporter related protein  56.61 
 
 		 555 aa  640    Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1644  putative ABC transporter ATP-binding protein  58.92 
 
 		 559 aa  686    Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0674  putative ABC transporter ATP-binding protein  57.86 
 
 		 555 aa  637    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.599551  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1794  putative ABC transporter ATP-binding protein  61.29 
 
 		 555 aa  689    Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.482874  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3665  putative ABC transporter ATP-binding protein  56.61 
 
 		 555 aa  640    Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1855  putative ABC transporter ATP-binding protein  74.96 
 
 		 559 aa  857    Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3883  putative ABC transporter ATP-binding protein  57.19 
 
 		 559 aa  638    Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1456  putative ABC transporter ATP-binding protein  59.61 
 
 		 549 aa  639    Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.504666  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5318  putative ABC transporter ATP-binding protein  76.07 
 
 		 560 aa  859    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.134924  normal  0.268079 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4602  ABC transporter, ATP-binding protein  58.09 
 
 		 563 aa  639    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.29694  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0822  putative ABC transporter ATP-binding protein  56.79 
 
 		 555 aa  637    Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2197  putative ABC transporter ATP-binding protein  57.35 
 
 		 551 aa  637    Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2900  putative ABC transporter ATP-binding protein  57.53 
 
 		 554 aa  639    Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0196259 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1466  putative ABC transporter ATP-binding protein  57.19 
 
 		 558 aa  648    Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.000105508  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0758  putative ABC transporter ATP-binding protein  55.79 
 
 		 557 aa  644    Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0740  putative ABC transporter ATP-binding protein  55.97 
 
 		 557 aa  646    Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4264  putative ABC transporter ATP-binding protein  58.14 
 
 		 554 aa  643    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7359  putative ABC transporter ATP-binding protein  77.54 
 
 		 554 aa  881    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.625389 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0834  putative ABC transporter ATP-binding protein  57.81 
 
 		 561 aa  662    Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00294599  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2216  putative ABC transporter ATP-binding protein  75.99 
 
 		 547 aa  839    Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.885012  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3678  putative ABC transporter ATP-binding protein  57.5 
 
 		 555 aa  649    Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12501  putative ABC transporter ATP-binding protein  78.21 
 
 		 558 aa  876    Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  decreased coverage  0.0036999  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4993  putative ABC transporter ATP-binding protein  57.5 
 
 		 555 aa  645    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3542  putative ABC transporter ATP-binding protein  82.89 
 
 		 558 aa  943    Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.195737  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0931  putative ABC transporter ATP-binding protein  85.89 
 
 		 560 aa  975    Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3426  putative ABC transporter ATP-binding protein  57.63 
 
 		 561 aa  662    Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1687  putative ABC transporter ATP-binding protein  60.18 
 
 		 557 aa  671    Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.00296418  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4875  putative ABC transporter ATP-binding protein  57.96 
 
 		 554 aa  636    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.54223  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0587  putative ABC transporter ATP-binding protein  55.73 
 
 		 551 aa  637    Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1361  putative ABC transporter ATP-binding protein  57.27 
 
 		 561 aa  659    Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000127735  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_22290  putative ABC transporter ATP-binding protein  74.46 
 
 		 559 aa  839    Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.793295  normal  0.525138 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0552  putative ABC transporter ATP-binding protein  56.43 
 
 		 555 aa  638    Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3241  putative ABC transporter ATP-binding protein  56.73 
 
 		 561 aa  659    Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000308971  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0490  putative ABC transporter ATP-binding protein  55.91 
 
 		 551 aa  637    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.191061  normal  0.167217 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1926  putative ABC transporter ATP-binding protein  57.84 
 
 		 559 aa  671    Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000000896956  normal  0.905041 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0762  putative ABC transporter ATP-binding protein  59.29 
 
 		 555 aa  660    Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1281  putative ABC transporter ATP-binding protein  56.19 
 
 		 561 aa  645    Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.0000308368  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1403  putative ABC transporter ATP-binding protein  58.11 
 
 		 556 aa  659    Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.595923  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4627  putative ABC transporter ATP-binding protein  56.61 
 
 		 555 aa  640    Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1527  putative ABC transporter ATP-binding protein  59.64 
 
 		 559 aa  670    Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3618  putative ABC transporter ATP-binding protein  56.96 
 
 		 555 aa  642    Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_04232  hypothetical protein  56.61 
 
 		 555 aa  640    Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2495  putative ABC transporter ATP-binding protein  55.4 
 
 		 558 aa  635    Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.290369 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1148  putative ABC transporter ATP-binding protein  75.36 
 
 		 560 aa  854    Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.493052  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0705  putative ABC transporter ATP-binding protein  57.86 
 
 		 555 aa  635    Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.0956761 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2351  putative ABC transporter ATP-binding protein  56.94 
 
 		 559 aa  635    Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.701309  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3414  putative ABC transporter ATP-binding protein  58.57 
 
 		 555 aa  639    Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.106241  normal  0.225653 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0706  putative ABC transporter ATP-binding protein  57.68 
 
 		 555 aa  635    Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.483075  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5235  putative ABC transporter ATP-binding protein  58.68 
 
 		 579 aa  651    Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0229  putative ABC transporter ATP-binding protein  56.61 
 
 		 555 aa  639    Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_09750  putative ABC transporter ATP-binding protein  84.82 
 
 		 560 aa  955    Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4941  putative ABC transporter ATP-binding protein  56.61 
 
 		 555 aa  641    Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.963786 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1058  putative ABC transporter ATP-binding protein  55.12 
 
 		 560 aa  638    Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4510  putative ABC transporter ATP-binding protein  57.86 
 
 		 555 aa  635    Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.29936  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2242  putative ABC transporter ATP-binding protein  57.6 
 
 		 553 aa  648    Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4119  putative ABC transporter ATP-binding protein  57.76 
 
 		 555 aa  644    Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1411  putative ABC transporter ATP-binding protein  59.53 
 
 		 584 aa  637    Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0144  putative ABC transporter ATP-binding protein  56.35 
 
 		 553 aa  634    Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2240  putative ABC transporter ATP-binding protein  55.73 
 
 		 551 aa  637    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.497585 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3221  putative ABC transporter ATP-binding protein  56.79 
 
 		 589 aa  635    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1284  putative ABC transporter ATP-binding protein  56.94 
 
 		 670 aa  637    Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1127  putative ABC transporter ATP-binding protein  79.32 
 
 		 558 aa  900    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1117  putative ABC transporter ATP-binding protein  56.68 
 
 		 558 aa  640    Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.406197  hitchhiker  0.00000247304 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3615  putative ABC transporter ATP-binding protein  76.65 
 
 		 557 aa  857    Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2171  putative ABC transporter ATP-binding protein  86.96 
 
 		 560 aa  981    Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000196153 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2441  putative ABC transporter ATP-binding protein  58.56 
 
 		 558 aa  676    Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00204105  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4939  putative ABC transporter ATP-binding protein  56.43 
 
 		 555 aa  637    Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4991  putative ABC transporter ATP-binding protein  57.5 
 
 		 555 aa  645    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.170616  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3620  putative ABC transporter ATP-binding protein  76.65 
 
 		 557 aa  857    Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.914588  normal  0.710746 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2642  putative ABC transporter ATP-binding protein  100 
 
 		 560 aa  1139    Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.520141 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5906  putative ABC transporter ATP-binding protein  56.61 
 
 		 555 aa  640    Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1448  putative ABC transporter ATP-binding protein  59.14 
 
 		 555 aa  664    Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.391667  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3489  putative ABC transporter ATP-binding protein  56.96 
 
 		 555 aa  642    Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2098  putative ABC transporter ATP-binding protein  61.83 
 
 		 555 aa  697    Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.249977 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_08900  putative ABC transporter ATP-binding protein  84.29 
 
 		 560 aa  939    Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.210485  normal  0.0113448 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2105  putative ABC transporter ATP-binding protein  58.39 
 
 		 555 aa  637    Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_40960  putative ABC transporter ATP-binding protein  60.11 
 
 		 554 aa  648    Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.512675  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4939  putative ABC transporter ATP-binding protein  57.5 
 
 		 555 aa  645    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.909016  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_60800  putative ABC transporter ATP-binding protein  58.68 
 
 		 554 aa  652    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2418  putative ABC transporter ATP-binding protein  86.61 
 
 		 560 aa  977    Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0404573  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_11760  putative ABC transporter ATP-binding protein  80.21 
 
 		 558 aa  895    Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.406602 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2568  putative ABC transporter ATP-binding protein  77.36 
 
 		 557 aa  868    Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.878611  normal  0.580087 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_4019  putative ABC transporter ATP-binding protein  55.66 
 
 		 561 aa  652    Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.186099 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0809  putative ABC transporter ATP-binding protein  55.48 
 
 		 560 aa  638    Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4990  putative ABC transporter ATP-binding protein  56.61 
 
 		 555 aa  640    Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1614  putative ABC transporter ATP-binding protein  74.82 
 
 		 556 aa  860    Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.682319  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1057  putative ABC transporter ATP-binding protein  56.76 
 
 		 559 aa  657    Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3542  putative ABC transporter ATP-binding protein  77.36 
 
 		 558 aa  884    Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.610631  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2008  putative ABC transporter ATP-binding protein  57.17 
 
 		 551 aa  643    Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1369  putative ABC transporter ATP-binding protein  75.54 
 
 		 560 aa  848    Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.482048  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4832  putative ABC transporter ATP-binding protein  57.5 
 
 		 555 aa  646    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.218638  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3688  putative ABC transporter ATP-binding protein  76.65 
 
 		 557 aa  857    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2580  putative ABC transporter ATP-binding protein  56.55 
 
 		 560 aa  651    Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.471915  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4070  putative ABC transporter ATP-binding protein  78.93 
 
 		 557 aa  877    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.715968 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4905  putative ABC transporter ATP-binding protein  57.5 
 
 		 555 aa  645    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_10980  putative ABC transporter ATP-binding protein  74.29 
 
 		 558 aa  837    Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_11480  putative ABC transporter ATP-binding protein  83.75 
 
 		 560 aa  940    Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.105111  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2152  putative ABC transporter ATP-binding protein  57.53 
 
 		 556 aa  653    Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.0875259  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3917  putative ABC transporter ATP-binding protein  77.54 
 
 		 558 aa  885    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.426446 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>