More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tbis_2552 on replicon NC_014165
Organism: Thermobispora bispora DSM 43833



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
CP001509  ECD_04267  fused predicted transporter subunits of ABC superfamily: ATP-binding components  57.63 
 
 		 555 aa  638    Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3606  ABC transporter related protein  57.63 
 
 		 555 aa  638    Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1644  putative ABC transporter ATP-binding protein  60.62 
 
 		 559 aa  698    Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0674  putative ABC transporter ATP-binding protein  58.89 
 
 		 555 aa  651    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.599551  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1794  putative ABC transporter ATP-binding protein  63.42 
 
 		 555 aa  712    Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.482874  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4991  putative ABC transporter ATP-binding protein  58.35 
 
 		 555 aa  643    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.170616  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2240  putative ABC transporter ATP-binding protein  60.87 
 
 		 551 aa  693    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.497585 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3883  putative ABC transporter ATP-binding protein  56.88 
 
 		 559 aa  639    Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1456  putative ABC transporter ATP-binding protein  64.25 
 
 		 549 aa  702    Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.504666  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3489  putative ABC transporter ATP-binding protein  59.07 
 
 		 555 aa  653    Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4602  ABC transporter, ATP-binding protein  58.59 
 
 		 563 aa  645    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.29694  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2152  putative ABC transporter ATP-binding protein  59.28 
 
 		 556 aa  677    Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.0875259  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2392  putative ABC transporter ATP-binding protein  62.14 
 
 		 551 aa  692    Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.935698  normal  0.570925 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3241  putative ABC transporter ATP-binding protein  58.41 
 
 		 561 aa  678    Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000308971  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0705  putative ABC transporter ATP-binding protein  58.89 
 
 		 555 aa  651    Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.0956761 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4627  putative ABC transporter ATP-binding protein  57.63 
 
 		 555 aa  638    Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0758  putative ABC transporter ATP-binding protein  57.63 
 
 		 557 aa  665    Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0740  putative ABC transporter ATP-binding protein  57.63 
 
 		 557 aa  667    Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4264  putative ABC transporter ATP-binding protein  58.45 
 
 		 554 aa  648    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4941  putative ABC transporter ATP-binding protein  57.63 
 
 		 555 aa  638    Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.963786 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3463  putative ABC transporter ATP-binding protein  60.04 
 
 		 550 aa  647    Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.427951  normal  0.154208 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2216  putative ABC transporter ATP-binding protein  85.01 
 
 		 547 aa  953    Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.885012  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0822  putative ABC transporter ATP-binding protein  58.89 
 
 		 555 aa  650    Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5318  putative ABC transporter ATP-binding protein  74.33 
 
 		 560 aa  847    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.134924  normal  0.268079 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2495  putative ABC transporter ATP-binding protein  57.43 
 
 		 558 aa  645    Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.290369 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1826  putative ABC transporter ATP-binding protein  59.49 
 
 		 550 aa  639    Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.365039  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2485  putative ABC transporter ATP-binding protein  64.31 
 
 		 550 aa  690    Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.445071  normal  0.555297 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2197  putative ABC transporter ATP-binding protein  60.14 
 
 		 551 aa  677    Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1687  putative ABC transporter ATP-binding protein  62.05 
 
 		 557 aa  696    Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.00296418  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4875  putative ABC transporter ATP-binding protein  58.63 
 
 		 554 aa  646    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.54223  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0587  putative ABC transporter ATP-binding protein  60.87 
 
 		 551 aa  693    Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1361  putative ABC transporter ATP-binding protein  58.77 
 
 		 561 aa  678    Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000127735  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12501  putative ABC transporter ATP-binding protein  78.46 
 
 		 558 aa  885    Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  decreased coverage  0.0036999  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3620  putative ABC transporter ATP-binding protein  76.88 
 
 		 557 aa  865    Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.914588  normal  0.710746 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0959  putative ABC transporter ATP-binding protein  61.71 
 
 		 549 aa  662    Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.465393  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3542  putative ABC transporter ATP-binding protein  77.42 
 
 		 558 aa  890    Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.195737  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2916  putative ABC transporter ATP-binding protein  56.53 
 
 		 563 aa  637    Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0621526  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1926  putative ABC transporter ATP-binding protein  59.53 
 
 		 559 aa  684    Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000000896956  normal  0.905041 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0762  putative ABC transporter ATP-binding protein  59.96 
 
 		 555 aa  660    Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1281  putative ABC transporter ATP-binding protein  56.42 
 
 		 561 aa  657    Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.0000308368  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1403  putative ABC transporter ATP-binding protein  57.89 
 
 		 556 aa  654    Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.595923  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6251  putative ABC transporter ATP-binding protein  61.89 
 
 		 549 aa  680    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.223769  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5235  putative ABC transporter ATP-binding protein  59.89 
 
 		 579 aa  657    Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1527  putative ABC transporter ATP-binding protein  60.79 
 
 		 559 aa  696    Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4990  putative ABC transporter ATP-binding protein  57.63 
 
 		 555 aa  637    Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6356  putative ABC transporter ATP-binding protein  61.59 
 
 		 550 aa  661    Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.109322 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1411  putative ABC transporter ATP-binding protein  64.18 
 
 		 584 aa  698    Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1148  putative ABC transporter ATP-binding protein  74.51 
 
 		 560 aa  843    Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.493052  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1919  putative ABC transporter ATP-binding protein  62.61 
 
 		 549 aa  678    Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.137087  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2351  putative ABC transporter ATP-binding protein  58.6 
 
 		 559 aa  658    Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.701309  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3627  putative ABC transporter ATP-binding protein  59.42 
 
 		 551 aa  659    Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.108497 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2580  putative ABC transporter ATP-binding protein  58.41 
 
 		 560 aa  685    Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.471915  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2131  putative ABC transporter ATP-binding protein  60.98 
 
 		 549 aa  660    Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.198515  normal  0.0197095 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2242  putative ABC transporter ATP-binding protein  58.02 
 
 		 553 aa  641    Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3618  putative ABC transporter ATP-binding protein  59.07 
 
 		 555 aa  653    Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0490  putative ABC transporter ATP-binding protein  61.59 
 
 		 551 aa  698    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.191061  normal  0.167217 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0238  putative ABC transporter ATP-binding protein  57.35 
 
 		 559 aa  639    Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.331867 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3452  putative ABC transporter ATP-binding protein  62.43 
 
 		 549 aa  677    Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.747993  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4939  putative ABC transporter ATP-binding protein  58.53 
 
 		 555 aa  644    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.909016  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2911  putative ABC transporter ATP-binding protein  61.78 
 
 		 550 aa  672    Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.608005  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1117  putative ABC transporter ATP-binding protein  61.59 
 
 		 550 aa  678    Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.188653 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2568  putative ABC transporter ATP-binding protein  77.24 
 
 		 557 aa  870    Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.878611  normal  0.580087 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3665  putative ABC transporter ATP-binding protein  57.63 
 
 		 555 aa  638    Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2255  putative ABC transporter ATP-binding protein  59.06 
 
 		 555 aa  674    Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1284  putative ABC transporter ATP-binding protein  58.78 
 
 		 670 aa  662    Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2845  putative ABC transporter ATP-binding protein  57.07 
 
 		 559 aa  641    Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.493421  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4939  putative ABC transporter ATP-binding protein  57.45 
 
 		 555 aa  635    Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3615  putative ABC transporter ATP-binding protein  76.88 
 
 		 557 aa  865    Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1718  putative ABC transporter ATP-binding protein  63.88 
 
 		 549 aa  696    Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2033  putative ABC transporter ATP-binding protein  64.25 
 
 		 549 aa  696    Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1845  putative ABC transporter ATP-binding protein  57.91 
 
 		 556 aa  666    Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000460921 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3542  putative ABC transporter ATP-binding protein  79.21 
 
 		 558 aa  905    Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.610631  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1855  putative ABC transporter ATP-binding protein  69.82 
 
 		 559 aa  784    Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0372  putative ABC transporter ATP-binding protein  58.38 
 
 		 556 aa  646    Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3474  putative ABC transporter ATP-binding protein  62.5 
 
 		 551 aa  669    Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.128055  normal  0.617651 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1935  putative ABC transporter ATP-binding protein  59.67 
 
 		 550 aa  636    Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.461584  normal  0.714392 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0706  putative ABC transporter ATP-binding protein  58.71 
 
 		 555 aa  648    Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.483075  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2098  putative ABC transporter ATP-binding protein  62.82 
 
 		 555 aa  710    Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.249977 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3159  putative ABC transporter ATP-binding protein  57.55 
 
 		 555 aa  636    Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000146292 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2105  putative ABC transporter ATP-binding protein  58.95 
 
 		 555 aa  666    Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2117  putative ABC transporter ATP-binding protein  63.34 
 
 		 549 aa  693    Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.129596  normal  0.211481 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2441  putative ABC transporter ATP-binding protein  59.53 
 
 		 558 aa  682    Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00204105  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_60800  putative ABC transporter ATP-binding protein  60.07 
 
 		 554 aa  660    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2418  putative ABC transporter ATP-binding protein  75.94 
 
 		 560 aa  849    Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0404573  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4510  putative ABC transporter ATP-binding protein  58.89 
 
 		 555 aa  651    Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.29936  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3917  putative ABC transporter ATP-binding protein  78.85 
 
 		 558 aa  901    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.426446 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_4019  putative ABC transporter ATP-binding protein  58.23 
 
 		 561 aa  675    Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.186099 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1864  putative ABC transporter ATP-binding protein  57.63 
 
 		 560 aa  659    Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.733773  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3414  putative ABC transporter ATP-binding protein  59.13 
 
 		 555 aa  670    Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.106241  normal  0.225653 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1614  putative ABC transporter ATP-binding protein  80.97 
 
 		 556 aa  909    Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.682319  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1057  putative ABC transporter ATP-binding protein  57.53 
 
 		 559 aa  663    Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2991  putative ABC transporter ATP-binding protein  58.56 
 
 		 559 aa  664    Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.187094  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2008  putative ABC transporter ATP-binding protein  61.41 
 
 		 551 aa  694    Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1369  putative ABC transporter ATP-binding protein  75.04 
 
 		 560 aa  830    Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.482048  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0671  putative ABC transporter ATP-binding protein  57.01 
 
 		 555 aa  634    Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3688  putative ABC transporter ATP-binding protein  76.88 
 
 		 557 aa  865    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2460  putative ABC transporter ATP-binding protein  60.43 
 
 		 559 aa  652    Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.561949  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4070  putative ABC transporter ATP-binding protein  78.82 
 
 		 557 aa  882    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.715968 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4129  putative ABC transporter ATP-binding protein  63.88 
 
 		 549 aa  684    Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0661  putative ABC transporter ATP-binding protein  56.24 
 
 		 560 aa  651    Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>