More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tcr_1174 on replicon NC_007520
Organism: Thiomicrospira crunogena XCL-2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007520  Tcr_1174  ABC transporter related  100 
 
 		 654 aa  1336    Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3656  putative ABC transporter ATP-binding protein  45.99 
 
 		 635 aa  589  1e-167  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3729  putative ABC transporter ATP-binding protein  45.99 
 
 		 635 aa  589  1e-167  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.83809  normal  0.145902 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3764  putative ABC transporter ATP-binding protein  45.99 
 
 		 635 aa  590  1e-167  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.460675 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3847  putative ABC transporter ATP-binding protein  45.16 
 
 		 635 aa  589  1e-167  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4027  putative ABC transporter ATP-binding protein  44.46 
 
 		 635 aa  588  1e-167  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.963749  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3655  putative ABC transporter ATP-binding protein  45.83 
 
 		 635 aa  586  1e-166  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3727  putative ABC transporter ATP-binding protein  45.52 
 
 		 637 aa  586  1e-166  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.577827  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3827  putative ABC transporter ATP-binding protein  45.83 
 
 		 635 aa  588  1e-166  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03203  fused predicted transporter subunits of ABC superfamily: ATP-binding components  45.37 
 
 		 637 aa  584  1.0000000000000001e-165  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0823398  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0360  ABC transporter related protein  45.37 
 
 		 637 aa  584  1.0000000000000001e-165  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03155  hypothetical protein  45.37 
 
 		 637 aa  584  1.0000000000000001e-165  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0843095  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4662  putative ABC transporter ATP-binding protein  45.37 
 
 		 637 aa  584  1.0000000000000001e-165  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0192611  normal  0.11448 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0360  putative ABC transporter ATP-binding protein  45.37 
 
 		 637 aa  584  1.0000000000000001e-165  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0375  putative ABC transporter ATP-binding protein  45.23 
 
 		 637 aa  583  1.0000000000000001e-165  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3634  putative ABC transporter ATP-binding protein  45.37 
 
 		 637 aa  583  1.0000000000000001e-165  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000338837 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3822  putative ABC transporter ATP-binding protein  45.37 
 
 		 637 aa  584  1.0000000000000001e-165  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000840845  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3549  putative ABC transporter ATP-binding protein  45.37 
 
 		 637 aa  584  1.0000000000000001e-165  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.309193  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3932  putative ABC transporter ATP-binding protein  44.79 
 
 		 640 aa  579  1e-164  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3689  putative ABC transporter ATP-binding protein  44.79 
 
 		 640 aa  579  1e-164  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0264  putative ABC transporter ATP-binding protein  44.79 
 
 		 640 aa  580  1e-164  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00070  ABC transporter, ATP-binding subunit  45.71 
 
 		 639 aa  573  1.0000000000000001e-162  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002284  glutathione-regulated potassium-efflux system ATP-binding protein  45.77 
 
 		 659 aa  568  1e-161  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.43126  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3770  putative ABC transporter ATP-binding protein  46.15 
 
 		 634 aa  569  1e-161  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.605767  hitchhiker  0.00540958 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0299  putative ABC transporter ATP-binding protein  44.82 
 
 		 639 aa  565  1e-160  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4562  putative ABC transporter ATP-binding protein  44.48 
 
 		 637 aa  568  1e-160  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.673665 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0298  ABC transporter ATP-binding protein  45.31 
 
 		 643 aa  564  1.0000000000000001e-159  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0678  ABC transporter related  46.06 
 
 		 657 aa  560  1e-158  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2186  ABC transporter, ATP-binding protein  43.93 
 
 		 638 aa  556  1e-157  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.151795  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3197  ABC transporter ATP-binding protein  45.57 
 
 		 638 aa  557  1e-157  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.79023  normal  0.0446478 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0690  ABC transporter related  44.19 
 
 		 636 aa  553  1e-156  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3861  ABC transporter-related protein  46.64 
 
 		 636 aa  554  1e-156  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3284  ABC transporter related  45.27 
 
 		 636 aa  552  1e-156  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0593  ABC transporter-related protein  45.9 
 
 		 636 aa  548  1e-155  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.40682 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1355  ABC transporter related  44.43 
 
 		 646 aa  546  1e-154  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.195008  normal  0.583297 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3476  ABC transporter related  43.95 
 
 		 637 aa  546  1e-154  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3117  ABC transporter related  44.51 
 
 		 636 aa  547  1e-154  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2473  ABC transporter related  44.38 
 
 		 650 aa  545  1e-154  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000325943 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0741  ABC transporter related  45.75 
 
 		 637 aa  548  1e-154  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3281  ABC transporter related  45.75 
 
 		 637 aa  548  1e-154  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3393  ABC transporter related  45.75 
 
 		 637 aa  548  1e-154  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1241  ABC transporter related  44.94 
 
 		 643 aa  544  1e-153  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0863  ABC transporter related  43.95 
 
 		 637 aa  545  1e-153  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0899  ABC transporter related  43.95 
 
 		 637 aa  545  1e-153  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1664  ABC transporter ATP-binding protein  44.26 
 
 		 657 aa  542  1e-153  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0247067 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3501  ABC transporter related  45.7 
 
 		 656 aa  543  1e-153  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0885  ABC transporter, ATP-binding protein  44.91 
 
 		 637 aa  540  9.999999999999999e-153  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1623  hypothetical protein  43.76 
 
 		 636 aa  539  9.999999999999999e-153  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3178  ABC transporter related  44.27 
 
 		 650 aa  540  9.999999999999999e-153  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0886  ABC transporter related  43.8 
 
 		 637 aa  541  9.999999999999999e-153  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0433  ABC transporter, ATP-binding protein  44.12 
 
 		 641 aa  535  1e-151  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0138  ABC transporter, ATP-binding protein  45.22 
 
 		 651 aa  537  1e-151  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1743  ABC transporter related  43.3 
 
 		 633 aa  536  1e-151  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.0202205 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0052  ABC transporter  45.22 
 
 		 636 aa  534  1e-150  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0473  ABC transporter related  42.02 
 
 		 648 aa  534  1e-150  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1930  ABC transporter related  43.78 
 
 		 643 aa  528  1e-148  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2600  ABC transporter, ATP-binding protein  45.18 
 
 		 646 aa  528  1e-148  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0562857  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2511  ABC transporter, ATP-binding protein  45.18 
 
 		 646 aa  528  1e-148  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.271255  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2055  ABC transporter related  44.21 
 
 		 643 aa  526  1e-148  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.035925  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2455  ABC transporter, ATP-binding protein  45.18 
 
 		 646 aa  527  1e-148  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.242369  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1404  ABC transporter-related protein  43.93 
 
 		 640 aa  526  1e-148  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0880457  normal  0.193066 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6041  ABC transporter related  44.21 
 
 		 643 aa  526  1e-148  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2424  ABC transporter related  43.77 
 
 		 672 aa  526  1e-148  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0758588 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2036  ABC transporter related  44.21 
 
 		 643 aa  526  1e-148  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.252943  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1347  ABC transporter, ATP-binding protein  45.02 
 
 		 646 aa  524  1e-147  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0289  ABC transporter related  43.8 
 
 		 636 aa  524  1e-147  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1572  ABC transporter, ATP-binding protein  45.02 
 
 		 646 aa  524  1e-147  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.50284  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3237  ABC transporter, ATP-binding protein  45.02 
 
 		 646 aa  524  1e-147  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.660205  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2075  ABC transporter, ATP-binding protein  45.02 
 
 		 646 aa  524  1e-147  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.491633  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0279  ABC transporter related  41.54 
 
 		 673 aa  523  1e-147  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2010  ABC transporter, ATP-binding protein  44.63 
 
 		 646 aa  524  1e-147  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.146801  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0167  ABC transporter related protein  43 
 
 		 624 aa  523  1e-147  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.692888  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0112  ABC transporter related  44.5 
 
 		 650 aa  524  1e-147  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.339786  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_47520  ABC transporter , ATP-binding protein  44.51 
 
 		 633 aa  524  1e-147  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2068  ABC transporter related  44.36 
 
 		 643 aa  523  1e-147  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2996  ABC transporter, ATP-binding protein  44.2 
 
 		 635 aa  524  1e-147  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1376  ABC transporter ATP-binding protein  44.39 
 
 		 676 aa  521  1e-146  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.636737  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0061  ABC transporter related  42.62 
 
 		 635 aa  519  1e-146  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.234701 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1249  ABC transporter related  44.26 
 
 		 645 aa  516  1.0000000000000001e-145  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0840692  normal  0.705767 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1315  ABC transporter related  44.26 
 
 		 692 aa  516  1.0000000000000001e-145  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.199616  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1649  ABC transporter related  42.39 
 
 		 642 aa  516  1.0000000000000001e-145  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5478  ABC transporter-like  44.91 
 
 		 636 aa  512  1e-144  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.882087 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03980  ABC transporter ATP-binding protein  43.5 
 
 		 650 aa  514  1e-144  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5345  ABC transporter, fused ATPase subunits  43.71 
 
 		 643 aa  512  1e-144  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.249552 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1937  ABC transporter related  44.31 
 
 		 628 aa  511  1e-143  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.832952 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0048  ABC transporter related  41.58 
 
 		 664 aa  511  1e-143  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_69340  putative ATP-binding component of ABC transporter  44.2 
 
 		 638 aa  510  1e-143  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2729  ABC transporter, ATPase subunit  42.68 
 
 		 635 aa  506  9.999999999999999e-143  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0265  ABC transporter related  42.95 
 
 		 636 aa  506  9.999999999999999e-143  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0217  ABC transporter related  43.1 
 
 		 636 aa  503  1e-141  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.631932  normal  0.82416 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0196  ABC transporter ATP-binding protein  43.1 
 
 		 636 aa  503  1e-141  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.466605  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5997  ABC transporter ATP-binding protein  44.38 
 
 		 638 aa  502  1e-141  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.148625  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1302  ABC transporter, ATP-binding protein  42.6 
 
 		 639 aa  500  1e-140  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1367  ABC transporter, ATP-binding protein  39.4 
 
 		 634 aa  498  1e-139  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0581  ABC transporter related  41.74 
 
 		 647 aa  498  1e-139  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2071  ABC transporter related  41.69 
 
 		 656 aa  492  9.999999999999999e-139  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.144058 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0220  ABC transporter related  45.38 
 
 		 615 aa  492  9.999999999999999e-139  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1894  ABC transporter related  41.67 
 
 		 656 aa  494  9.999999999999999e-139  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1759  ABC transporter-related protein  45.94 
 
 		 554 aa  493  9.999999999999999e-139  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.656937  normal  0.0503302 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0037  ABC transporter ATPase  39.39 
 
 		 672 aa  488  1e-136  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.489009  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>