More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caci_7127 on replicon NC_013131
Organism: Catenulispora acidiphila DSM 44928



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013595  Sros_5386  ABC transporter ATP-binding protein  71.27 
 
 		 544 aa  742    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.221909  normal  0.37846 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4241  ABC transporter related  66.29 
 
 		 537 aa  662    Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.189048 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4011  ABC transporter related  66.29 
 
 		 537 aa  662    Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.460893  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7127  ABC transporter related  100 
 
 		 541 aa  1077    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.618924 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4085  ABC transporter related  66.29 
 
 		 537 aa  662    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.425666  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4514  ABC transporter-related protein  64.04 
 
 		 535 aa  663    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  hitchhiker  0.00577215  normal  0.484903 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3169  ABC transporter related  66.36 
 
 		 541 aa  702    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000739402 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2181  ABC transporter related  60.15 
 
 		 565 aa  561  1e-158  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0163034  normal  0.527959 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2896  ABC transporter-like protein  54.53 
 
 		 549 aa  491  1e-137  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2147  ABC transporter related protein  50.64 
 
 		 554 aa  489  1e-137  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.168618  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5951  ABC transporter related protein  47.47 
 
 		 558 aa  453  1.0000000000000001e-126  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.810064 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2015  ABC transporter related  49.81 
 
 		 553 aa  450  1e-125  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.464297  normal  0.189706 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2987  ABC transporter related  50.19 
 
 		 555 aa  442  1e-123  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000223105 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4684  ABC transporter related protein  47.11 
 
 		 536 aa  433  1e-120  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1859  ABC transporter related protein  46.69 
 
 		 535 aa  412  1e-113  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0744608  normal  0.494788 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3386  ABC transporter related  46.21 
 
 		 516 aa  386  1e-106  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.409428  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2539  ABC transporter related  41.73 
 
 		 531 aa  379  1e-104  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.552748 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1472  ABC transporter related protein  44.44 
 
 		 520 aa  382  1e-104  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1526  ABC transporter related protein  42.04 
 
 		 548 aa  371  1e-101  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.373611  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3586  ABC transporter related protein  44.92 
 
 		 530 aa  366  1e-100  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0854  ABC transporter ATP-binding protein  37 
 
 		 534 aa  366  1e-100  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0935  ABC transporter related  41.21 
 
 		 530 aa  359  7e-98  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0822  ABC transporter related  41.05 
 
 		 531 aa  359  8e-98  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0684569  normal  0.79375 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2488  ABC transporter related  42.8 
 
 		 534 aa  351  2e-95  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0047  ABC transporter component  40.11 
 
 		 535 aa  335  2e-90  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2015  ABC transporter related  42.06 
 
 		 525 aa  329  6e-89  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.406124  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7142  ABC transporter related  34.03 
 
 		 528 aa  329  8e-89  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0217  ABC transporter related protein  40.79 
 
 		 511 aa  328  2.0000000000000001e-88  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.928543  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1888  ABC transporter related  39.89 
 
 		 545 aa  325  1e-87  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0963  ABC transporter related  39.2 
 
 		 526 aa  324  3e-87  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5557  ABC transporter related  35.17 
 
 		 529 aa  323  4e-87  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3596  ABC transporter related  39.96 
 
 		 527 aa  323  4e-87  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.737822  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2144  ABC transporter related  33.52 
 
 		 529 aa  322  9.999999999999999e-87  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0518  ABC transporter related  40.64 
 
 		 533 aa  316  6e-85  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4720  putative ABC transporter, ATP-binding protein  41.28 
 
 		 524 aa  316  7e-85  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.936106 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5053  putative ABC transporter ATP-binding protein  37.87 
 
 		 536 aa  316  7e-85  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3494  ABC transporter related  34.34 
 
 		 529 aa  313  4.999999999999999e-84  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0461  ABC transporter related  38.84 
 
 		 531 aa  306  5.0000000000000004e-82  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0218  ABC transporter, ATP-binding protein  31.44 
 
 		 529 aa  305  2.0000000000000002e-81  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.902745  normal  0.428381 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5328  ABC transporter related  37.38 
 
 		 524 aa  304  3.0000000000000004e-81  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.862409 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3837  ABC transporter related  40.11 
 
 		 532 aa  299  7e-80  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2411  ABC transporter related  36.65 
 
 		 530 aa  299  1e-79  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.235484  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6267  ABC transporter, fused ATPase subunits  37.52 
 
 		 548 aa  298  2e-79  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3913  ABC transporter ATPase  38.16 
 
 		 557 aa  297  3e-79  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.195461  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5740  ABC transporter related  37.62 
 
 		 553 aa  296  7e-79  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0750761 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2973  ABC transporter related  38.22 
 
 		 546 aa  291  2e-77  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2836  ABC transporter related  38.39 
 
 		 546 aa  291  3e-77  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4308  ABC transporter-related protein  35.8 
 
 		 539 aa  289  1e-76  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2097  ABC transporter related  31.45 
 
 		 530 aa  289  1e-76  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.0494627 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2310  ABC transporter related  36.58 
 
 		 551 aa  289  1e-76  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2924  ABC transporter related  36.58 
 
 		 551 aa  289  1e-76  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_46010  putative ATP-binding component of ABC transporter  38.45 
 
 		 538 aa  283  6.000000000000001e-75  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.640378  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2939  ABC transporter related  36.65 
 
 		 550 aa  280  5e-74  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1436  ABC transporter ATPase  38.39 
 
 		 527 aa  278  1e-73  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2265  ABC transporter related  36.23 
 
 		 525 aa  277  3e-73  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0348  peptide ABC transporter, ATP-binding protein  37.12 
 
 		 548 aa  274  3e-72  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.860489  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2418  ABC transporter related  35.63 
 
 		 525 aa  273  7e-72  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.741222  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2945  ABC transporter-like  35.31 
 
 		 541 aa  272  1e-71  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2095  ABC transporter related  40.84 
 
 		 534 aa  269  8e-71  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.472904  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0400  ABC transporter related  36.93 
 
 		 535 aa  269  8e-71  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.132459  normal  0.738425 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0092  peptide ABC transporter, ATP-binding protein  36.92 
 
 		 548 aa  265  2e-69  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0583  peptide ABC transporter, ATP-binding protein  36.92 
 
 		 548 aa  265  2e-69  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2282  ABC transporter, ATP-binding protein  36.92 
 
 		 548 aa  265  2e-69  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3090  ABC transporter, ATP-binding protein  36.92 
 
 		 548 aa  265  2e-69  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2006  peptide ABC transporter, ATP-binding protein  36.92 
 
 		 548 aa  265  2e-69  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0401  peptide ABC transporter, ATP-binding protein  36.92 
 
 		 548 aa  265  2e-69  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.15947  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0421  ABC transporter, ATP-binding protein  36.92 
 
 		 548 aa  265  2e-69  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1807  putative ATP-binding component of ABC transporter  32.82 
 
 		 531 aa  261  3e-68  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.451616  normal  1 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_06770  ATPase component of ABC transporters with duplicated ATPase domain protein  34.57 
 
 		 668 aa  242  1e-62  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  unclonable  0.00000102079  normal  0.871828 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_26480  ATPase component of ABC transporters with duplicated ATPase domain protein  37.04 
 
 		 539 aa  241  2e-62  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.460594  normal  0.379064 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1995  ABC transporter-related protein  34.96 
 
 		 532 aa  238  2e-61  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.817075  hitchhiker  0.000319079 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0224  ABC transporter related  34.3 
 
 		 540 aa  234  2.0000000000000002e-60  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001382  ABC-type transport system ATPase component  32.51 
 
 		 523 aa  233  7.000000000000001e-60  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0479008  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_14680  ATPase component of ABC transporters with duplicated ATPase domain  35.24 
 
 		 534 aa  233  9e-60  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1880  ABC transporter ATPase  35.88 
 
 		 532 aa  232  1e-59  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.548476  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_15950  ATPase component of ABC transporters with duplicated ATPase domain  34.52 
 
 		 550 aa  233  1e-59  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0135  ABC transporter related  33.33 
 
 		 540 aa  233  1e-59  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.216593 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_19010  ATPase component of ABC transporters with duplicated ATPase domain  36.04 
 
 		 555 aa  233  1e-59  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.0660652 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2563  ABC transporter related  34.32 
 
 		 532 aa  231  3e-59  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0199173  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0192  ABC transporter related  33.15 
 
 		 540 aa  231  4e-59  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.566668 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0415  ABC transporter ATPase  33.09 
 
 		 533 aa  230  5e-59  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.238248  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0750  ABC transporter related  38.09 
 
 		 537 aa  230  5e-59  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_09590  ATPase component of ABC transporters with duplicated ATPase domain  33.09 
 
 		 709 aa  230  6e-59  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  unclonable  0.000107882  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0576  ABC transporter related  33.4 
 
 		 540 aa  229  9e-59  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1411  ABC transporter related protein  35.7 
 
 		 532 aa  229  1e-58  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4586  ABC transporter, ATPase subunit  34.12 
 
 		 545 aa  228  1e-58  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.479902  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4779  ABC transporter related  34.1 
 
 		 646 aa  228  3e-58  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.000000154774  hitchhiker  0.00318423 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7527  hypothetical protein  36.35 
 
 		 536 aa  226  9e-58  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.752036  normal  1 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1467  ABC transporter related  30.22 
 
 		 639 aa  224  3e-57  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4309  ABC transporter ATP-binding protein  32.48 
 
 		 540 aa  223  8e-57  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.167754 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2970  ABC transporter related  31.82 
 
 		 540 aa  223  8e-57  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1682  ABC transporter related protein  35.45 
 
 		 532 aa  223  9e-57  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1322  ABC transporter related  32.65 
 
 		 690 aa  223  9e-57  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.225947 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1858  ABC transporter related  34.85 
 
 		 532 aa  222  9.999999999999999e-57  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00066186 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3420  ABC transporter related protein  33.75 
 
 		 554 aa  222  1.9999999999999999e-56  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.859354  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1160  ABC transporter related  34.21 
 
 		 532 aa  220  3.9999999999999997e-56  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.616262 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4079  ABC transporter related  32.67 
 
 		 540 aa  221  3.9999999999999997e-56  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.148831 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3313  ABC transporter related  32.58 
 
 		 636 aa  220  3.9999999999999997e-56  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.000905191  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_21830  ATPase component of ABC transporters with duplicated ATPase domain  33.7 
 
 		 532 aa  220  5e-56  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.976658 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1961  ABC transporter-like protein  35.91 
 
 		 532 aa  220  5e-56  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.346167 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>