More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CCV52592_0077 on replicon NC_009715
Organism: Campylobacter curvus 525.92



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_003912  CJE0967  ABC transporter, ATP-binding protein  65.01 
 
 
643 aa  827    Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0897  ABC transporter, ATP-binding protein  65.32 
 
 
643 aa  846    Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0077  lipoprotein-releasing system ATP-binding protein LolD  100 
 
 
644 aa  1303    Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.0439155  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0619  ABC transporter ATP-binding protein uup  69.1 
 
 
646 aa  903    Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.828103  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1268  ABC transporter-related protein  54.29 
 
 
646 aa  675    Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0540  ABC transporter ATP-binding protein uup  71.76 
 
 
644 aa  929    Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.692263  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0925  ABC transporter, ATP-binding protein  65.01 
 
 
643 aa  842    Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.511016  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0644  peptidase T (tripeptide aminopeptidase; aminotripeptidase; tripeptidase)  78.44 
 
 
643 aa  1023    Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0571  ABC transporter, ATP-binding protein  63.98 
 
 
645 aa  818    Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.940937  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1433  ABC transporter related protein  59.07 
 
 
649 aa  711    Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2360  ABC transporter related  36.6 
 
 
642 aa  388  1e-106  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.257541  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2700  ABC transporter related  37.13 
 
 
640 aa  386  1e-106  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.725807  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0568  ABC transporter related protein  37.99 
 
 
632 aa  388  1e-106  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1761  ABC transporter related  37.6 
 
 
642 aa  384  1e-105  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2523  ABC transporter-related protein  37.16 
 
 
641 aa  385  1e-105  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.377883  normal  0.503235 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2551  ABC transporter ATPase component  36.26 
 
 
637 aa  381  1e-104  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2640  ABC transporter ATPase component  36.26 
 
 
637 aa  381  1e-104  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02012  ABC transporter, ATP-binding protein  36.62 
 
 
646 aa  381  1e-104  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0535295  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1988  ABC transporter ATPase component  36.26 
 
 
637 aa  381  1e-104  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2479  ABC transporter-related protein  36.67 
 
 
634 aa  376  1e-103  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0549886  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0828  ABC transporter related  35.4 
 
 
636 aa  376  1e-103  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0975  ABC transporter ATP-binding protein  35.39 
 
 
636 aa  374  1e-102  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  decreased coverage  0.000424481  normal  0.109741 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1650  ABC transporter ATPase component  36.84 
 
 
637 aa  375  1e-102  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2382  ABC transporter related  36.38 
 
 
649 aa  374  1e-102  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.629954  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1744  ABC transporter ATPase component  36.27 
 
 
634 aa  374  1e-102  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.30913  hitchhiker  0.0000434555 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2361  ABC transporter related  36.38 
 
 
661 aa  374  1e-102  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3285  ABC transporter related  36.93 
 
 
636 aa  375  1e-102  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.000000124669  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0899  ABC transporter related  35.73 
 
 
663 aa  375  1e-102  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.998664  normal  0.488704 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1749  ABC transporter related  36.38 
 
 
661 aa  374  1e-102  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003440  ABC transporter ATP-binding protein uup  37.35 
 
 
639 aa  375  1e-102  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.550149  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1204  ABC transporter related  36.1 
 
 
648 aa  370  1e-101  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0660  ABC transporter related  35.89 
 
 
626 aa  372  1e-101  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.14515  normal  0.023928 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1093  ABC transporter ATPase component  38.12 
 
 
639 aa  370  1e-101  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.140566  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3340  ABC transporter, duplicated ATPase subunits  36.12 
 
 
645 aa  371  1e-101  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.790276  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02335  ABC transporter ATPase component  37.35 
 
 
639 aa  371  1e-101  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2397  ABC transporter related  35.58 
 
 
649 aa  369  1e-101  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1113  ABC transporter ATPase component  36.27 
 
 
635 aa  368  1e-100  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00085111  normal  0.933236 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1681  ABC transporter ATPase component  35 
 
 
649 aa  368  1e-100  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5700  ABC transporter, fused ATPase subunits  35.42 
 
 
649 aa  368  1e-100  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1461  ABC transporter ATPase component  35.03 
 
 
635 aa  366  1e-100  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.185296  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1013  ABC transporter component  34.66 
 
 
610 aa  367  1e-100  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2279  ABC transporter related  35.26 
 
 
649 aa  367  1e-100  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2125  ABC transporter related  35.86 
 
 
641 aa  369  1e-100  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.279958 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2170  ABC transporter ATPase component  35.96 
 
 
635 aa  367  1e-100  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00000710719  normal  0.220785 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2052  ABC transporter related  36.22 
 
 
640 aa  367  1e-100  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0425216  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1020  ABC transporter ATPase component  36.31 
 
 
635 aa  365  1e-100  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00168337  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1542  ABC transporter ATPase component  37.04 
 
 
640 aa  367  1e-100  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1609  ABC transporter ATPase component  36.66 
 
 
640 aa  368  1e-100  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.111541 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1603  ABC transporter ATPase component  36.41 
 
 
640 aa  369  1e-100  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0251377  normal  0.331537 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0609  ABC transporter, ATP-binding protein  37.62 
 
 
632 aa  365  1e-99  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.446122  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0918  ABC transporter related  36.38 
 
 
688 aa  365  1e-99  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.101083 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1853  ABC transporter ATPase component  36.61 
 
 
640 aa  364  3e-99  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1124  ABC transporter ATPase component  36.15 
 
 
635 aa  364  3e-99  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.915369  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0499  ABC transporter related  37.09 
 
 
631 aa  364  3e-99  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.107412  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1950  ABC transporter related  35.44 
 
 
653 aa  364  3e-99  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00953  fused predicted transporter subunits of ABC superfamily: ATP-binding components  35.96 
 
 
635 aa  363  5.0000000000000005e-99  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.000475773  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2694  ABC transporter related protein  35.96 
 
 
635 aa  363  5.0000000000000005e-99  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.562851  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1171  ABC transporter ATPase component  36.15 
 
 
635 aa  363  5.0000000000000005e-99  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.311518  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1058  ABC transporter ATPase component  35.96 
 
 
635 aa  363  5.0000000000000005e-99  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000000977813  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1137  ABC transporter ATPase component  36.15 
 
 
635 aa  363  5.0000000000000005e-99  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00960  hypothetical protein  35.96 
 
 
635 aa  363  5.0000000000000005e-99  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.000554098  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2647  ABC transporter ATPase component  35.96 
 
 
635 aa  363  5.0000000000000005e-99  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0437839  hitchhiker  0.000617984 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1064  ABC transporter ATPase component  35.96 
 
 
635 aa  363  5.0000000000000005e-99  Escherichia coli E24377A  Bacteria  unclonable  0.0000000000187784  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1103  ABC transporter ATPase component  36.15 
 
 
635 aa  363  5.0000000000000005e-99  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.320404 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1199  ABC transporter related  36.24 
 
 
648 aa  363  6e-99  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.219582  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2368  ABC transporter ATPase component  35.8 
 
 
635 aa  361  2e-98  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.561386  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3059  ABC transporter related  35.48 
 
 
628 aa  360  3e-98  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3785  ABC transporter related  35.48 
 
 
628 aa  360  4e-98  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.485733  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3277  ABC transporter, ATP-binding protein Uup  35.99 
 
 
645 aa  358  9.999999999999999e-98  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3318  ABC transporter related protein  35.67 
 
 
632 aa  358  9.999999999999999e-98  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0138  ABC transporter related  35.56 
 
 
643 aa  358  1.9999999999999998e-97  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1582  ABC transporter related  36.24 
 
 
648 aa  358  1.9999999999999998e-97  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  hitchhiker  0.0018197  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1814  ABC transporter ATPase component  36.8 
 
 
639 aa  357  5e-97  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000485056  normal 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1419  ABC transporter:AAA ATPase  35.57 
 
 
648 aa  356  6.999999999999999e-97  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal  0.148207 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0928  ABC transporter related  35.4 
 
 
633 aa  356  8.999999999999999e-97  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.11608e-27 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4229  ABC transporter related  35.48 
 
 
648 aa  356  8.999999999999999e-97  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.868359 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2145  ABC transporter ATPase component  36.48 
 
 
639 aa  355  1e-96  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.338763  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0181  ferric-enterobactin ABC transporter ATPase  35.11 
 
 
626 aa  355  1e-96  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.530164  normal 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2207  ABC transporter, ATP-binding protein  34.78 
 
 
648 aa  355  2e-96  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.829349  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0413  ABC transporter related  35.47 
 
 
641 aa  355  2e-96  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  decreased coverage  0.00715783  hitchhiker  0.000000249616 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2087  ABC transporter, ATP-binding protein  34.78 
 
 
648 aa  355  2e-96  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2065  ABC transporter ATPase component  36.48 
 
 
636 aa  355  2e-96  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0693  ABC transporter, ATP-binding protein  34.78 
 
 
648 aa  355  2e-96  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4373  ABC transporter-related protein  36.11 
 
 
629 aa  354  2e-96  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0223118  normal 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2525  ABC transporter, ATP-binding protein  34.78 
 
 
660 aa  354  2e-96  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1136  ABC transporter, ATP-binding protein  34.78 
 
 
660 aa  354  2.9999999999999997e-96  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0642  ABC transporter related  34.89 
 
 
629 aa  354  2.9999999999999997e-96  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.64323  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1144  ABC transporter, ATP-binding protein  34.78 
 
 
660 aa  354  2.9999999999999997e-96  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.261137  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1634  ABC transporter ATPase component  35.31 
 
 
641 aa  353  5e-96  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.202979  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0431  putative ATP-binding component of a transport system  34.88 
 
 
641 aa  352  8e-96  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000000359167  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1776  ABC transporter ATPase component  35.65 
 
 
641 aa  352  8.999999999999999e-96  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.205391  hitchhiker  0.000192841 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2568  ABC transporter ATPase component  35.65 
 
 
641 aa  352  8.999999999999999e-96  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.452475  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2683  ABC transporter ATPase component  35.65 
 
 
641 aa  352  8.999999999999999e-96  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0324813  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1792  ABC transporter ATPase component  36.29 
 
 
642 aa  352  1e-95  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1605  ABC transporter related  34.92 
 
 
644 aa  352  1e-95  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0890354  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1553  ABC transporter ATPase component  37.07 
 
 
636 aa  352  1e-95  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.318875  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2608  ABC transporter ATPase component  35.65 
 
 
641 aa  352  1e-95  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00157626  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0618  ABC transporter related  35.09 
 
 
635 aa  351  2e-95  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000117313 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1298  ABC transporter, ATP-binding protein  34.78 
 
 
1065 aa  350  4e-95  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.524137  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2398  ABC transporter related  34.67 
 
 
650 aa  350  4e-95  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>