More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gura_3285 on replicon NC_009483
Organism: Geobacter uraniireducens Rf4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007517  Gmet_2479  ABC transporter-related protein  67.59 
 
 		 634 aa  806    Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0549886  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3285  ABC transporter related  100 
 
 		 636 aa  1293    Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.000000124669  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0928  ABC transporter related  68.98 
 
 		 633 aa  854    Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.11608e-27 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3318  ABC transporter related protein  69.39 
 
 		 632 aa  850    Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3380  ABC transporter related  42.68 
 
 		 651 aa  478  1e-133  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1816  ABC transporter-related protein  42.59 
 
 		 654 aa  474  1e-132  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0210138  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2061  ABC transporter, ATPase subunit  42.4 
 
 		 654 aa  473  1e-132  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1895  ABC transporter related  42.18 
 
 		 656 aa  469  1.0000000000000001e-131  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.438014  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0834  putative ABC transporter ATP-binding protein  43.5 
 
 		 561 aa  465  1e-129  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00294599  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1644  putative ABC transporter ATP-binding protein  43.62 
 
 		 559 aa  464  1e-129  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3426  putative ABC transporter ATP-binding protein  43.5 
 
 		 561 aa  464  1e-129  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1926  putative ABC transporter ATP-binding protein  43.81 
 
 		 559 aa  463  1e-129  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000000896956  normal  0.905041 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1057  putative ABC transporter ATP-binding protein  43.13 
 
 		 559 aa  462  1e-129  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3241  putative ABC transporter ATP-binding protein  43.31 
 
 		 561 aa  461  9.999999999999999e-129  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000308971  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0660  ABC transporter related  40.69 
 
 		 626 aa  460  9.999999999999999e-129  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.14515  normal  0.023928 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1040  ABC transporter-related protein  39.34 
 
 		 629 aa  450  1e-125  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1281  putative ABC transporter ATP-binding protein  43.07 
 
 		 561 aa  451  1e-125  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.0000308368  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2700  ABC transporter related  40.45 
 
 		 640 aa  451  1e-125  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.725807  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2351  putative ABC transporter ATP-binding protein  44 
 
 		 559 aa  451  1e-125  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.701309  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2441  putative ABC transporter ATP-binding protein  42.86 
 
 		 558 aa  450  1e-125  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00204105  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1284  putative ABC transporter ATP-binding protein  43.73 
 
 		 670 aa  450  1e-125  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1500  ABC transporter related  40 
 
 		 630 aa  449  1e-125  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.384495  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0661  putative ABC transporter ATP-binding protein  42.88 
 
 		 560 aa  447  1.0000000000000001e-124  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1058  putative ABC transporter ATP-binding protein  42.21 
 
 		 560 aa  447  1.0000000000000001e-124  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3785  ABC transporter related  42.04 
 
 		 628 aa  447  1.0000000000000001e-124  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.485733  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3059  ABC transporter related  41.89 
 
 		 628 aa  447  1.0000000000000001e-124  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2580  putative ABC transporter ATP-binding protein  43.34 
 
 		 560 aa  448  1.0000000000000001e-124  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.471915  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2312  ABC transporter related  39.64 
 
 		 642 aa  447  1.0000000000000001e-124  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1794  putative ABC transporter ATP-binding protein  42.58 
 
 		 555 aa  445  1e-123  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.482874  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2279  ABC transporter related  38.8 
 
 		 649 aa  442  1e-123  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0893  putative ABC transporter ATP-binding protein  42 
 
 		 560 aa  445  1e-123  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.100195  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5309  ABC transporter related protein  42.72 
 
 		 559 aa  442  1e-123  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5234  ABC transporter related protein  42.29 
 
 		 555 aa  445  1e-123  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.547616  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0642  ABC transporter related  40.59 
 
 		 629 aa  443  1e-123  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.64323  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4229  ABC transporter related  41.24 
 
 		 648 aa  445  1e-123  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.868359 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1845  putative ABC transporter ATP-binding protein  42.5 
 
 		 556 aa  443  1e-123  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000460921 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2397  ABC transporter related  39.11 
 
 		 649 aa  444  1e-123  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_4019  putative ABC transporter ATP-binding protein  41.56 
 
 		 561 aa  442  1e-123  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.186099 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0740  putative ABC transporter ATP-binding protein  43 
 
 		 557 aa  440  9.999999999999999e-123  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4373  ABC transporter-related protein  40.47 
 
 		 629 aa  440  9.999999999999999e-123  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0223118  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1137  putative ABC transporter ATP-binding protein  41.28 
 
 		 560 aa  441  9.999999999999999e-123  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  decreased coverage  0.000210355  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1117  putative ABC transporter ATP-binding protein  41.9 
 
 		 558 aa  441  9.999999999999999e-123  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.406197  hitchhiker  0.00000247304 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2255  putative ABC transporter ATP-binding protein  42.42 
 
 		 555 aa  440  9.999999999999999e-123  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2364  ABC transporter related  38.95 
 
 		 642 aa  441  9.999999999999999e-123  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.217741  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_08326  putative ATP-binding component of ABC transporter  42.57 
 
 		 564 aa  441  9.999999999999999e-123  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1008  Fis family transcriptional regulator  39.81 
 
 		 629 aa  439  9.999999999999999e-123  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1823  ABC transporter related  39.69 
 
 		 632 aa  436  1e-121  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  decreased coverage  0.00644209  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2152  putative ABC transporter ATP-binding protein  41.4 
 
 		 556 aa  436  1e-121  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.0875259  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0758  putative ABC transporter ATP-binding protein  42.8 
 
 		 557 aa  438  1e-121  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1998  putative ABC transporter ATP-binding protein  42.2 
 
 		 563 aa  436  1e-121  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.237018  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1204  ABC transporter related  39.11 
 
 		 648 aa  438  1e-121  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1361  putative ABC transporter ATP-binding protein  41.05 
 
 		 561 aa  437  1e-121  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000127735  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1527  putative ABC transporter ATP-binding protein  42.64 
 
 		 559 aa  437  1e-121  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1117  putative ABC transporter ATP-binding protein  43.13 
 
 		 550 aa  437  1e-121  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.188653 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2495  putative ABC transporter ATP-binding protein  42.64 
 
 		 558 aa  436  1e-121  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.290369 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0490  putative ABC transporter ATP-binding protein  41.49 
 
 		 551 aa  438  1e-121  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.191061  normal  0.167217 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1749  ABC transporter related  38.89 
 
 		 661 aa  436  1e-121  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0918  ABC transporter related  39.2 
 
 		 688 aa  439  1e-121  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.101083 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2105  putative ABC transporter ATP-binding protein  41.97 
 
 		 555 aa  438  1e-121  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6251  putative ABC transporter ATP-binding protein  43.38 
 
 		 549 aa  435  1e-121  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.223769  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2361  ABC transporter related  38.89 
 
 		 661 aa  436  1e-121  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2991  putative ABC transporter ATP-binding protein  42.61 
 
 		 559 aa  436  1e-121  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.187094  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2382  ABC transporter related  38.89 
 
 		 649 aa  434  1e-120  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.629954  normal  1 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_10980  putative ABC transporter ATP-binding protein  43.59 
 
 		 558 aa  434  1e-120  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0587  putative ABC transporter ATP-binding protein  41.87 
 
 		 551 aa  435  1e-120  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5700  ABC transporter, fused ATPase subunits  38.93 
 
 		 649 aa  435  1e-120  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0780  ATPase  40.66 
 
 		 630 aa  434  1e-120  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.989868  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0718  ABC transporter related  38.58 
 
 		 626 aa  433  1e-120  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.332523  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0939  ABC transporter, ATP-binding protein  38.46 
 
 		 648 aa  433  1e-120  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0496893  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0238  putative ABC transporter ATP-binding protein  42.21 
 
 		 559 aa  433  1e-120  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.331867 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6107  ABC transporter related protein  39.97 
 
 		 653 aa  434  1e-120  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3340  ABC transporter, duplicated ATPase subunits  39.14 
 
 		 645 aa  432  1e-120  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.790276  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0809  putative ABC transporter ATP-binding protein  40.61 
 
 		 560 aa  435  1e-120  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2868  ABC transporter, ATP-binding protein  39.2 
 
 		 642 aa  433  1e-120  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.914914  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2240  putative ABC transporter ATP-binding protein  41.87 
 
 		 551 aa  435  1e-120  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.497585 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1864  putative ABC transporter ATP-binding protein  42.33 
 
 		 560 aa  434  1e-120  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.733773  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2308  ABC transporter, ATP-binding protein  39.94 
 
 		 631 aa  432  1e-120  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000184058  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2225  ABC transporter, ATP-binding protein  39.78 
 
 		 631 aa  429  1e-119  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.0000195061  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1982  ABC transporter, ATP-binding protein  39.94 
 
 		 631 aa  432  1e-119  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000663544  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1964  ABC transporter, ATP-binding protein  39.94 
 
 		 631 aa  432  1e-119  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0386922  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7137  putative ABC transporter ATP-binding protein  44.97 
 
 		 550 aa  432  1e-119  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2173  ABC transporter, ATP-binding protein  39.78 
 
 		 631 aa  429  1e-119  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00208736  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6356  putative ABC transporter ATP-binding protein  44.78 
 
 		 550 aa  429  1e-119  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.109322 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1466  putative ABC transporter ATP-binding protein  42.58 
 
 		 558 aa  431  1e-119  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.000105508  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1687  putative ABC transporter ATP-binding protein  41.73 
 
 		 557 aa  431  1e-119  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.00296418  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3414  putative ABC transporter ATP-binding protein  42.56 
 
 		 555 aa  431  1e-119  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.106241  normal  0.225653 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0413  ABC transporter related  40.18 
 
 		 641 aa  429  1e-119  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  decreased coverage  0.00715783  hitchhiker  0.000000249616 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1919  putative ABC transporter ATP-binding protein  43.46 
 
 		 549 aa  430  1e-119  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.137087  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2190  ABC transporter, ATP-binding protein  39.78 
 
 		 631 aa  429  1e-119  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.783831 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3452  putative ABC transporter ATP-binding protein  43.27 
 
 		 549 aa  430  1e-119  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.747993  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4129  putative ABC transporter ATP-binding protein  43.65 
 
 		 549 aa  431  1e-119  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2553  ABC transporter ATPase  39.2 
 
 		 642 aa  430  1e-119  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2098  putative ABC transporter ATP-binding protein  41.89 
 
 		 555 aa  432  1e-119  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.249977 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3145  ABC transporter, ATP-binding protein  40.37 
 
 		 631 aa  429  1e-119  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.0000000568363  normal  0.0176571 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2008  putative ABC transporter ATP-binding protein  41.83 
 
 		 551 aa  429  1e-119  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2125  ABC transporter related  38.76 
 
 		 641 aa  427  1e-118  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.279958 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2010  ABC transporter ATP-binding protein  39.78 
 
 		 631 aa  427  1e-118  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  unclonable  0.00000675061  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2485  putative ABC transporter ATP-binding protein  44.06 
 
 		 550 aa  426  1e-118  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.445071  normal  0.555297 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1199  ABC transporter related  39.81 
 
 		 648 aa  427  1e-118  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.219582  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0762  putative ABC transporter ATP-binding protein  40.08 
 
 		 555 aa  427  1e-118  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>