More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CPF_2868 on replicon NC_008261
Organism: Clostridium perfringens ATCC 13124



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011773  BCAH820_2190  ABC transporter, ATP-binding protein  52.85 
 
 		 631 aa  642    Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.783831 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2173  ABC transporter, ATP-binding protein  53.16 
 
 		 631 aa  652    Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00208736  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2225  ABC transporter, ATP-binding protein  53.08 
 
 		 631 aa  646    Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.0000195061  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3145  ABC transporter, ATP-binding protein  53.48 
 
 		 631 aa  655    Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.0000000568363  normal  0.0176571 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2010  ABC transporter ATP-binding protein  53.08 
 
 		 631 aa  648    Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  unclonable  0.00000675061  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1982  ABC transporter, ATP-binding protein  53.32 
 
 		 631 aa  650    Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000663544  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1964  ABC transporter, ATP-binding protein  53.32 
 
 		 631 aa  650    Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0386922  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1613  ABC transporter-related protein  53.16 
 
 		 630 aa  652    Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.000050504  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2164  ABC transporter ATP-binding protein  53.08 
 
 		 631 aa  648    Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00326588  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2308  ABC transporter, ATP-binding protein  53.16 
 
 		 631 aa  648    Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000184058  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3220  ABC transporter related  53.46 
 
 		 653 aa  701    Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000221597  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1814  ABC transporter related  51.93 
 
 		 639 aa  674    Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0123  ABC transporter related  57.23 
 
 		 643 aa  732    Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2868  ABC transporter, ATP-binding protein  100 
 
 		 642 aa  1298    Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.914914  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2553  ABC transporter ATPase  98.29 
 
 		 642 aa  1278    Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2000  ABC transporter related  52.76 
 
 		 631 aa  647    Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.000123424  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3897  ABC transporter related  49.23 
 
 		 613 aa  625  1e-178  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1571  ABC transporter related  49.76 
 
 		 631 aa  610  1e-173  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.459004  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2364  ABC transporter related  45.7 
 
 		 642 aa  573  1.0000000000000001e-162  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.217741  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0299  ABC transporter related  45.47 
 
 		 642 aa  567  1e-160  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2312  ABC transporter related  45.38 
 
 		 642 aa  562  1.0000000000000001e-159  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1040  ABC transporter-related protein  46.04 
 
 		 629 aa  562  1.0000000000000001e-159  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1447  ABC transporter related  44.39 
 
 		 632 aa  553  1e-156  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1381  ATPase  44.95 
 
 		 641 aa  550  1e-155  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.981261  normal  0.290816 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0768  ABC transporter related  43.64 
 
 		 636 aa  550  1e-155  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0718  ABC transporter related  46.23 
 
 		 626 aa  550  1e-155  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.332523  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1008  Fis family transcriptional regulator  45.84 
 
 		 629 aa  544  1e-153  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3020  ABC transporter-like  45.82 
 
 		 646 aa  540  9.999999999999999e-153  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.511953  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1823  ABC transporter related  45.28 
 
 		 632 aa  536  1e-151  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  decreased coverage  0.00644209  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1500  ABC transporter related  44.81 
 
 		 630 aa  533  1e-150  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.384495  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3547  ABC transporter-like protein protein  44.55 
 
 		 640 aa  525  1e-148  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4996  ABC transporter related  43.17 
 
 		 620 aa  517  1.0000000000000001e-145  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_2115  ABC transporter related  42.57 
 
 		 621 aa  512  1e-144  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.0255573  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0780  ATPase  43.8 
 
 		 630 aa  513  1e-144  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.989868  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4406  ABC transporter related protein  43.1 
 
 		 630 aa  512  1e-144  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.336146  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0375  ATPase  44.27 
 
 		 631 aa  506  9.999999999999999e-143  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0008  ABC transporter related  42.06 
 
 		 620 aa  508  9.999999999999999e-143  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.925372  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_07215  ABC transporter ATP-binding protein  42.06 
 
 		 622 aa  505  1e-141  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1278  ABC transporter ATPase  43.4 
 
 		 625 aa  504  1e-141  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.760109  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0462  ABC transporter ATPase  42.92 
 
 		 626 aa  499  1e-140  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1340  ABC transporter, ATP-binding protein  42.59 
 
 		 622 aa  498  1e-139  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4068  ABC transporter related  43.01 
 
 		 630 aa  493  9.999999999999999e-139  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.000000802504  hitchhiker  0.000858095 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0383  ABC transporter, ATP-binding protein  40.78 
 
 		 627 aa  490  1e-137  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.386036  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0743  ABC transporter related  40.31 
 
 		 625 aa  491  1e-137  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0760  ABC transporter related  40.31 
 
 		 625 aa  491  1e-137  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1093  ABC transporter related  40.44 
 
 		 634 aa  481  1e-134  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0800  ABC transporter, ATP-binding protein  40 
 
 		 622 aa  470  1.0000000000000001e-131  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00285677 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0950  ATPase  41.28 
 
 		 641 aa  466  9.999999999999999e-131  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.61977  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0514  ATPase  40.03 
 
 		 633 aa  466  9.999999999999999e-131  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.11743  normal  0.506629 
 
 
-
 
NC_002950  PG1225  ABC transporter, ATP-binding protein  39.14 
 
 		 623 aa  463  1e-129  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.701491 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_18141  hypothetical protein  40.52 
 
 		 641 aa  463  1e-129  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.0376333  normal  0.70207 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_12061  ABC transporter ATPase  40.74 
 
 		 644 aa  461  9.999999999999999e-129  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.393632  normal  0.504812 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_03991  ABC transporter ATP-binding protein  40 
 
 		 652 aa  457  1e-127  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1822  ATPase  39.81 
 
 		 631 aa  450  1e-125  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1648  ABC transporter ATPase  42.13 
 
 		 623 aa  450  1e-125  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3285  ABC transporter related  39.2 
 
 		 636 aa  432  1e-120  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.000000124669  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2479  ABC transporter-related protein  40.4 
 
 		 634 aa  428  1e-118  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0549886  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1998  putative ABC transporter ATP-binding protein  41.28 
 
 		 563 aa  427  1e-118  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.237018  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2916  putative ABC transporter ATP-binding protein  41.84 
 
 		 563 aa  423  1e-117  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0621526  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5700  ABC transporter, fused ATPase subunits  36.94 
 
 		 649 aa  421  1e-116  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2279  ABC transporter related  36.79 
 
 		 649 aa  421  1e-116  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2382  ABC transporter related  36.79 
 
 		 649 aa  419  1e-116  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.629954  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3340  ABC transporter, duplicated ATPase subunits  37.71 
 
 		 645 aa  420  1e-116  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.790276  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2397  ABC transporter related  36.79 
 
 		 649 aa  420  1e-116  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0918  ABC transporter related  36.79 
 
 		 688 aa  416  9.999999999999999e-116  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.101083 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2360  ABC transporter related  36.99 
 
 		 642 aa  417  9.999999999999999e-116  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.257541  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2361  ABC transporter related  36.63 
 
 		 661 aa  418  9.999999999999999e-116  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1749  ABC transporter related  36.63 
 
 		 661 aa  418  9.999999999999999e-116  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2197  putative ABC transporter ATP-binding protein  40.11 
 
 		 551 aa  414  1e-114  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0490  putative ABC transporter ATP-binding protein  40.6 
 
 		 551 aa  412  1e-114  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.191061  normal  0.167217 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1204  ABC transporter related  37.4 
 
 		 648 aa  415  1e-114  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0939  ABC transporter, ATP-binding protein  36.48 
 
 		 648 aa  414  1e-114  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0496893  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2351  putative ABC transporter ATP-binding protein  40.83 
 
 		 559 aa  413  1e-114  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.701309  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_08326  putative ATP-binding component of ABC transporter  40.15 
 
 		 564 aa  415  1e-114  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2441  putative ABC transporter ATP-binding protein  40.11 
 
 		 558 aa  412  1e-113  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00204105  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0409  ABC transporter, ATP-binding subunit  38.82 
 
 		 596 aa  409  1e-113  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.722245  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2240  putative ABC transporter ATP-binding protein  40.23 
 
 		 551 aa  411  1e-113  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.497585 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0587  putative ABC transporter ATP-binding protein  40.23 
 
 		 551 aa  411  1e-113  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009357  OSTLU_30493  ABC(ATP-binding) family transporter  39.56 
 
 		 723 aa  409  1e-113  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.658611 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1117  putative ABC transporter ATP-binding protein  40.37 
 
 		 558 aa  409  1e-113  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.406197  hitchhiker  0.00000247304 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2125  ABC transporter related  36.84 
 
 		 641 aa  410  1e-113  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.279958 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1144  ABC transporter, ATP-binding protein  36.32 
 
 		 660 aa  407  1.0000000000000001e-112  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.261137  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1136  ABC transporter, ATP-binding protein  36.32 
 
 		 660 aa  407  1.0000000000000001e-112  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2525  ABC transporter, ATP-binding protein  36.32 
 
 		 660 aa  408  1.0000000000000001e-112  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2207  ABC transporter, ATP-binding protein  36.32 
 
 		 648 aa  408  1.0000000000000001e-112  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.829349  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3318  ABC transporter related protein  37.11 
 
 		 632 aa  406  1.0000000000000001e-112  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1298  ABC transporter, ATP-binding protein  36.32 
 
 		 1065 aa  407  1.0000000000000001e-112  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.524137  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2087  ABC transporter, ATP-binding protein  36.32 
 
 		 648 aa  408  1.0000000000000001e-112  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2061  ABC transporter, ATPase subunit  35.6 
 
 		 654 aa  406  1.0000000000000001e-112  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0928  ABC transporter related  36.79 
 
 		 633 aa  405  1.0000000000000001e-112  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.11608e-27 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2523  ABC transporter-related protein  36.01 
 
 		 641 aa  408  1.0000000000000001e-112  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.377883  normal  0.503235 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0693  ABC transporter, ATP-binding protein  36.32 
 
 		 648 aa  408  1.0000000000000001e-112  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0660  ABC transporter related  36.7 
 
 		 626 aa  403  1e-111  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.14515  normal  0.023928 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0568  ABC transporter related protein  36.17 
 
 		 632 aa  404  1e-111  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4070  putative ABC transporter ATP-binding protein  41.05 
 
 		 557 aa  405  1e-111  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.715968 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2255  putative ABC transporter ATP-binding protein  39.47 
 
 		 555 aa  405  1e-111  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1845  putative ABC transporter ATP-binding protein  39.62 
 
 		 556 aa  404  1e-111  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000460921 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0899  ABC transporter related  36.11 
 
 		 663 aa  402  9.999999999999999e-111  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.998664  normal  0.488704 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1281  putative ABC transporter ATP-binding protein  40.53 
 
 		 561 aa  399  9.999999999999999e-111  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.0000308368  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6356  putative ABC transporter ATP-binding protein  41.61 
 
 		 550 aa  402  9.999999999999999e-111  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.109322 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>