More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene A2cp1_1895 on replicon NC_011891
Organism: Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011145  AnaeK_1816  ABC transporter-related protein  96.65 
 
 
654 aa  1113    Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0210138  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1895  ABC transporter related  100 
 
 
656 aa  1272    Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.438014  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2061  ABC transporter, ATPase subunit  94.66 
 
 
654 aa  1124    Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3380  ABC transporter related  80.25 
 
 
651 aa  969    Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3318  ABC transporter related protein  43.82 
 
 
632 aa  492  9.999999999999999e-139  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3285  ABC transporter related  43.56 
 
 
636 aa  494  9.999999999999999e-139  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.000000124669  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0928  ABC transporter related  43.84 
 
 
633 aa  495  9.999999999999999e-139  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.11608e-27 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2479  ABC transporter-related protein  44.93 
 
 
634 aa  484  1e-135  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0549886  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2279  ABC transporter related  44.09 
 
 
649 aa  481  1e-134  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2397  ABC transporter related  44.65 
 
 
649 aa  480  1e-134  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2382  ABC transporter related  43.94 
 
 
649 aa  472  1.0000000000000001e-131  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.629954  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1749  ABC transporter related  43.94 
 
 
661 aa  472  1.0000000000000001e-131  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2361  ABC transporter related  43.94 
 
 
661 aa  472  1.0000000000000001e-131  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5700  ABC transporter, fused ATPase subunits  43.83 
 
 
649 aa  466  9.999999999999999e-131  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3340  ABC transporter, duplicated ATPase subunits  43.23 
 
 
645 aa  466  9.999999999999999e-131  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.790276  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1204  ABC transporter related  43.62 
 
 
648 aa  464  1e-129  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0939  ABC transporter, ATP-binding protein  44.07 
 
 
648 aa  463  1e-129  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0496893  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2125  ABC transporter related  43.58 
 
 
641 aa  462  1e-129  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.279958 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1136  ABC transporter, ATP-binding protein  43.84 
 
 
660 aa  460  9.999999999999999e-129  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2207  ABC transporter, ATP-binding protein  43.84 
 
 
648 aa  460  9.999999999999999e-129  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.829349  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2087  ABC transporter, ATP-binding protein  43.84 
 
 
648 aa  460  9.999999999999999e-129  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1040  ABC transporter-related protein  39.21 
 
 
629 aa  460  9.999999999999999e-129  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2525  ABC transporter, ATP-binding protein  43.84 
 
 
660 aa  460  9.999999999999999e-129  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0693  ABC transporter, ATP-binding protein  43.84 
 
 
648 aa  460  9.999999999999999e-129  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0918  ABC transporter related  43.79 
 
 
688 aa  461  9.999999999999999e-129  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.101083 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1144  ABC transporter, ATP-binding protein  43.84 
 
 
660 aa  460  9.999999999999999e-129  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.261137  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1605  ABC transporter related  45.29 
 
 
644 aa  459  1e-127  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0890354  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1298  ABC transporter, ATP-binding protein  43.94 
 
 
1065 aa  456  1e-127  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.524137  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2360  ABC transporter related  43.33 
 
 
642 aa  454  1.0000000000000001e-126  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.257541  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0568  ABC transporter related protein  39.42 
 
 
632 aa  449  1e-125  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2364  ABC transporter related  37.31 
 
 
642 aa  446  1.0000000000000001e-124  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.217741  normal 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1126  ABC transporter related  41.1 
 
 
634 aa  442  1e-123  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal  0.239651 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1500  ABC transporter related  38.3 
 
 
630 aa  442  1e-123  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.384495  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1571  ABC transporter related  40.15 
 
 
631 aa  439  9.999999999999999e-123  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.459004  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2052  ABC transporter related  39.61 
 
 
640 aa  442  9.999999999999999e-123  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0425216  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0718  ABC transporter related  40.09 
 
 
626 aa  439  9.999999999999999e-123  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.332523  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2312  ABC transporter related  37.35 
 
 
642 aa  440  9.999999999999999e-123  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0375  ATPase  40.46 
 
 
631 aa  437  1e-121  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2523  ABC transporter-related protein  42.31 
 
 
641 aa  437  1e-121  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.377883  normal  0.503235 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1447  ABC transporter related  38.5 
 
 
632 aa  433  1e-120  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0899  ABC transporter related  41.84 
 
 
663 aa  433  1e-120  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.998664  normal  0.488704 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0138  ABC transporter related  42.79 
 
 
643 aa  434  1e-120  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1823  ABC transporter related  39.29 
 
 
632 aa  435  1e-120  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  decreased coverage  0.00644209  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1008  Fis family transcriptional regulator  38.12 
 
 
629 aa  434  1e-120  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6107  ABC transporter related protein  43.18 
 
 
653 aa  429  1e-119  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0975  ABC transporter ATP-binding protein  42.06 
 
 
636 aa  432  1e-119  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  decreased coverage  0.000424481  normal  0.109741 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0721  ABC transporter related  40.88 
 
 
640 aa  430  1e-119  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0828  ABC transporter related  41.27 
 
 
636 aa  431  1e-119  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2010  ABC transporter ATP-binding protein  38.43 
 
 
631 aa  426  1e-118  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  unclonable  0.00000675061  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1982  ABC transporter, ATP-binding protein  38.43 
 
 
631 aa  427  1e-118  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000663544  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1964  ABC transporter, ATP-binding protein  38.43 
 
 
631 aa  427  1e-118  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0386922  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2308  ABC transporter, ATP-binding protein  38.43 
 
 
631 aa  427  1e-118  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000184058  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0660  ABC transporter related  39.18 
 
 
626 aa  426  1e-118  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.14515  normal  0.023928 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4373  ABC transporter-related protein  41.83 
 
 
629 aa  429  1e-118  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0223118  normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2164  ABC transporter ATP-binding protein  38.43 
 
 
631 aa  426  1e-118  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00326588  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2700  ABC transporter related  40.21 
 
 
640 aa  426  1e-118  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.725807  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2398  ABC transporter related  41.5 
 
 
650 aa  426  1e-118  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2225  ABC transporter, ATP-binding protein  38.43 
 
 
631 aa  425  1e-117  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.0000195061  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2190  ABC transporter, ATP-binding protein  38.27 
 
 
631 aa  424  1e-117  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.783831 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4229  ABC transporter related  41.19 
 
 
648 aa  424  1e-117  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.868359 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2000  ABC transporter related  37.96 
 
 
631 aa  423  1e-117  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.000123424  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1814  ABC transporter related  35.71 
 
 
639 aa  419  1e-116  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1225  ABC transporter, ATP-binding protein  40.18 
 
 
623 aa  421  1e-116  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.701491 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2173  ABC transporter, ATP-binding protein  38.58 
 
 
631 aa  421  1e-116  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00208736  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1650  ABC transporter related protein  39.79 
 
 
641 aa  422  1e-116  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0431  putative ATP-binding component of a transport system  41.13 
 
 
641 aa  421  1e-116  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000000359167  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2868  ABC transporter, ATP-binding protein  36.09 
 
 
642 aa  420  1e-116  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.914914  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3145  ABC transporter, ATP-binding protein  38.58 
 
 
631 aa  419  1e-116  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.0000000568363  normal  0.0176571 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3220  ABC transporter related  37.65 
 
 
653 aa  418  9.999999999999999e-116  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000221597  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1613  ABC transporter-related protein  37.6 
 
 
630 aa  416  9.999999999999999e-116  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.000050504  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0780  ATPase  38.65 
 
 
630 aa  417  9.999999999999999e-116  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.989868  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0642  ABC transporter related  39.79 
 
 
629 aa  416  9.999999999999999e-116  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.64323  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2553  ABC transporter ATPase  36.35 
 
 
642 aa  417  9.999999999999999e-116  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0913  ABC transporter, ATP-binding protein  43.38 
 
 
633 aa  415  1e-114  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3785  ABC transporter related  40.7 
 
 
628 aa  413  1e-114  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.485733  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0413  ABC transporter related  40.3 
 
 
641 aa  413  1e-114  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  decreased coverage  0.00715783  hitchhiker  0.000000249616 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3059  ABC transporter related  40.7 
 
 
628 aa  414  1e-114  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1602  ABC transporter ATPase component  38.69 
 
 
638 aa  415  1e-114  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.52947  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1542  ABC transporter ATPase component  37.75 
 
 
640 aa  412  1e-114  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1388  ABC transporter related  40.85 
 
 
623 aa  413  1e-114  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0285354  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3830  ABC transporter-related protein  45.02 
 
 
632 aa  409  1e-113  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.457691 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1603  ABC transporter ATPase component  37.6 
 
 
640 aa  412  1e-113  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0251377  normal  0.331537 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0609  ABC transporter, ATP-binding protein  42.09 
 
 
632 aa  411  1e-113  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.446122  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2608  ABC transporter ATPase component  37.23 
 
 
641 aa  409  1e-113  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00157626  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2568  ABC transporter ATPase component  37.23 
 
 
641 aa  409  1e-113  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.452475  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2683  ABC transporter ATPase component  37.23 
 
 
641 aa  409  1e-113  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0324813  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1634  ABC transporter ATPase component  37.2 
 
 
641 aa  409  1e-113  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.202979  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1776  ABC transporter ATPase component  37.23 
 
 
641 aa  409  1e-113  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.205391  hitchhiker  0.000192841 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1609  ABC transporter ATPase component  37.6 
 
 
640 aa  410  1e-113  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.111541 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0181  ferric-enterobactin ABC transporter ATPase  41.72 
 
 
626 aa  405  1.0000000000000001e-112  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.530164  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1853  ABC transporter ATPase component  37.6 
 
 
640 aa  409  1.0000000000000001e-112  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2810  ABC transporter ATPase  42.7 
 
 
631 aa  407  1.0000000000000001e-112  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1199  ABC transporter related  40.22 
 
 
648 aa  407  1.0000000000000001e-112  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.219582  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0123  ABC transporter related  35.74 
 
 
643 aa  405  1e-111  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1011  ABC transporter related  41.22 
 
 
636 aa  404  1e-111  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.954717  normal  0.0514719 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1948  ABC transporter ATPase component  38.76 
 
 
645 aa  404  1e-111  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.000765701  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0499  ABC transporter related  43.6 
 
 
631 aa  404  1e-111  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.107412  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4068  ABC transporter related  37.84 
 
 
630 aa  405  1e-111  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.000000802504  hitchhiker  0.000858095 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0299  ABC transporter related  34.5 
 
 
642 aa  404  1e-111  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2145  ABC transporter ATPase component  37.92 
 
 
639 aa  402  1e-111  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.338763  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>