More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PG1225 on replicon NC_002950
Organism: Porphyromonas gingivalis W83



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002950  PG1225  ABC transporter, ATP-binding protein  100 
 
 		 623 aa  1284    Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.701491 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_07215  ABC transporter ATP-binding protein  48.22 
 
 		 622 aa  620  1e-176  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_2115  ABC transporter related  46.42 
 
 		 621 aa  595  1e-169  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.0255573  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1093  ABC transporter related  47.78 
 
 		 634 aa  588  1e-166  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4996  ABC transporter related  46.38 
 
 		 620 aa  587  1e-166  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4406  ABC transporter related protein  46.89 
 
 		 630 aa  566  1e-160  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.336146  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4068  ABC transporter related  46.98 
 
 		 630 aa  559  1e-158  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.000000802504  hitchhiker  0.000858095 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2364  ABC transporter related  42.72 
 
 		 642 aa  539  9.999999999999999e-153  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.217741  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2312  ABC transporter related  42.88 
 
 		 642 aa  538  1e-151  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0299  ABC transporter related  43.74 
 
 		 642 aa  532  1e-150  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0800  ABC transporter, ATP-binding protein  43.56 
 
 		 622 aa  526  1e-148  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00285677 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0123  ABC transporter related  43.15 
 
 		 643 aa  516  1.0000000000000001e-145  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1823  ABC transporter related  42.16 
 
 		 632 aa  501  1e-140  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  decreased coverage  0.00644209  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1500  ABC transporter related  41.3 
 
 		 630 aa  496  1e-139  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.384495  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1040  ABC transporter-related protein  41.84 
 
 		 629 aa  498  1e-139  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3220  ABC transporter related  41.49 
 
 		 653 aa  497  1e-139  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000221597  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1008  Fis family transcriptional regulator  41.77 
 
 		 629 aa  496  1e-139  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0008  ABC transporter related  42.08 
 
 		 620 aa  493  9.999999999999999e-139  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.925372  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2225  ABC transporter, ATP-binding protein  43.87 
 
 		 631 aa  489  1e-137  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.0000195061  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2010  ABC transporter ATP-binding protein  44.5 
 
 		 631 aa  489  1e-137  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  unclonable  0.00000675061  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1982  ABC transporter, ATP-binding protein  44.65 
 
 		 631 aa  491  1e-137  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000663544  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1964  ABC transporter, ATP-binding protein  44.65 
 
 		 631 aa  491  1e-137  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0386922  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2000  ABC transporter related  43.31 
 
 		 631 aa  489  1e-137  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.000123424  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3145  ABC transporter, ATP-binding protein  43.62 
 
 		 631 aa  489  1e-137  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.0000000568363  normal  0.0176571 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1814  ABC transporter related  40.54 
 
 		 639 aa  490  1e-137  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2164  ABC transporter ATP-binding protein  44.5 
 
 		 631 aa  489  1e-137  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00326588  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2308  ABC transporter, ATP-binding protein  44.65 
 
 		 631 aa  491  1e-137  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000184058  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2173  ABC transporter, ATP-binding protein  43.46 
 
 		 631 aa  488  1e-136  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00208736  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2190  ABC transporter, ATP-binding protein  44.34 
 
 		 631 aa  486  1e-136  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.783831 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3020  ABC transporter-like  41.5 
 
 		 646 aa  485  1e-135  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.511953  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0375  ATPase  43 
 
 		 631 aa  483  1e-135  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3547  ABC transporter-like protein protein  40.31 
 
 		 640 aa  483  1e-135  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1613  ABC transporter-related protein  43.4 
 
 		 630 aa  479  1e-134  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.000050504  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1447  ABC transporter related  41.36 
 
 		 632 aa  481  1e-134  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0718  ABC transporter related  42.01 
 
 		 626 aa  476  1e-133  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.332523  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1571  ABC transporter related  42 
 
 		 631 aa  477  1e-133  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.459004  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0780  ATPase  43.02 
 
 		 630 aa  471  1.0000000000000001e-131  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.989868  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1381  ATPase  42.32 
 
 		 641 aa  471  1.0000000000000001e-131  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.981261  normal  0.290816 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2553  ABC transporter ATPase  39.94 
 
 		 642 aa  454  1.0000000000000001e-126  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2868  ABC transporter, ATP-binding protein  39.14 
 
 		 642 aa  448  1.0000000000000001e-124  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.914914  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0950  ATPase  38.27 
 
 		 641 aa  444  1e-123  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.61977  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_03991  ABC transporter ATP-binding protein  39.88 
 
 		 652 aa  443  1e-123  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_18141  hypothetical protein  38.13 
 
 		 641 aa  443  1e-123  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.0376333  normal  0.70207 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1822  ATPase  40.03 
 
 		 631 aa  441  9.999999999999999e-123  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0514  ATPase  40.44 
 
 		 633 aa  442  9.999999999999999e-123  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.11743  normal  0.506629 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0768  ABC transporter related  37.68 
 
 		 636 aa  441  9.999999999999999e-123  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_12061  ABC transporter ATPase  38.43 
 
 		 644 aa  426  1e-118  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.393632  normal  0.504812 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1278  ABC transporter ATPase  38.25 
 
 		 625 aa  426  1e-118  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.760109  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0462  ABC transporter ATPase  41.39 
 
 		 626 aa  427  1e-118  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1340  ABC transporter, ATP-binding protein  38.89 
 
 		 622 aa  424  1e-117  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3897  ABC transporter related  37.36 
 
 		 613 aa  419  1e-116  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011697  PHATRDRAFT_41351  predicted protein  39.38 
 
 		 679 aa  413  1e-114  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1648  ABC transporter ATPase  39.1 
 
 		 623 aa  412  1e-113  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2479  ABC transporter-related protein  39.97 
 
 		 634 aa  408  1.0000000000000001e-112  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0549886  normal  1 
 
 
-
 
NC_009357  OSTLU_30493  ABC(ATP-binding) family transporter  40.51 
 
 		 723 aa  406  1.0000000000000001e-112  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.658611 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2279  ABC transporter related  37.34 
 
 		 649 aa  402  1e-111  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2397  ABC transporter related  37.34 
 
 		 649 aa  402  1e-111  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0743  ABC transporter related  35.77 
 
 		 625 aa  402  9.999999999999999e-111  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0760  ABC transporter related  35.77 
 
 		 625 aa  402  9.999999999999999e-111  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2360  ABC transporter related  37.54 
 
 		 642 aa  397  1e-109  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.257541  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5700  ABC transporter, fused ATPase subunits  36.69 
 
 		 649 aa  396  1e-109  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2382  ABC transporter related  37.18 
 
 		 649 aa  399  1e-109  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.629954  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1749  ABC transporter related  37.44 
 
 		 661 aa  397  1e-109  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0660  ABC transporter related  37.77 
 
 		 626 aa  396  1e-109  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.14515  normal  0.023928 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2361  ABC transporter related  37.44 
 
 		 661 aa  397  1e-109  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0383  ABC transporter, ATP-binding protein  34.98 
 
 		 627 aa  394  1e-108  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.386036  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0928  ABC transporter related  39.73 
 
 		 633 aa  393  1e-108  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.11608e-27 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3285  ABC transporter related  37.68 
 
 		 636 aa  390  1e-107  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.000000124669  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2061  ABC transporter, ATPase subunit  39.39 
 
 		 654 aa  391  1e-107  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0899  ABC transporter related  37.44 
 
 		 663 aa  390  1e-107  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.998664  normal  0.488704 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3318  ABC transporter related protein  39.9 
 
 		 632 aa  390  1e-107  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1136  ABC transporter, ATP-binding protein  36.51 
 
 		 660 aa  388  1e-106  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0693  ABC transporter, ATP-binding protein  36.51 
 
 		 648 aa  387  1e-106  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0828  ABC transporter related  37.1 
 
 		 636 aa  386  1e-106  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2207  ABC transporter, ATP-binding protein  36.51 
 
 		 648 aa  387  1e-106  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.829349  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2525  ABC transporter, ATP-binding protein  36.51 
 
 		 660 aa  387  1e-106  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0568  ABC transporter related protein  36.76 
 
 		 632 aa  387  1e-106  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2087  ABC transporter, ATP-binding protein  36.51 
 
 		 648 aa  387  1e-106  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1126  ABC transporter related  39.01 
 
 		 634 aa  388  1e-106  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  0.239651 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1144  ABC transporter, ATP-binding protein  36.51 
 
 		 660 aa  388  1e-106  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.261137  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1816  ABC transporter-related protein  39.2 
 
 		 654 aa  385  1e-105  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0210138  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3785  ABC transporter related  37.56 
 
 		 628 aa  383  1e-105  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.485733  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0939  ABC transporter, ATP-binding protein  36.19 
 
 		 648 aa  383  1e-105  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0496893  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2523  ABC transporter-related protein  37.19 
 
 		 641 aa  385  1e-105  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.377883  normal  0.503235 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0918  ABC transporter related  37.03 
 
 		 688 aa  385  1e-105  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.101083 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0975  ABC transporter ATP-binding protein  36.53 
 
 		 636 aa  382  1e-104  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  decreased coverage  0.000424481  normal  0.109741 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6107  ABC transporter related protein  37.93 
 
 		 653 aa  379  1e-104  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1298  ABC transporter, ATP-binding protein  36.49 
 
 		 1065 aa  381  1e-104  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.524137  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1895  ABC transporter related  39.24 
 
 		 656 aa  382  1e-104  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.438014  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3059  ABC transporter related  37.24 
 
 		 628 aa  380  1e-104  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2125  ABC transporter related  35.83 
 
 		 641 aa  378  1e-103  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.279958 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2810  ABC transporter ATPase  39 
 
 		 631 aa  376  1e-103  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0721  ABC transporter related  37.6 
 
 		 640 aa  378  1e-103  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0431  putative ATP-binding component of a transport system  37.95 
 
 		 641 aa  377  1e-103  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000000359167  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2351  putative ABC transporter ATP-binding protein  36.65 
 
 		 559 aa  378  1e-103  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.701309  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5234  ABC transporter related protein  38.5 
 
 		 555 aa  373  1e-102  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.547616  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0238  putative ABC transporter ATP-binding protein  37.32 
 
 		 559 aa  373  1e-102  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.331867 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0642  ABC transporter related  36.19 
 
 		 629 aa  370  1e-101  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.64323  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3340  ABC transporter, duplicated ATPase subunits  35.96 
 
 		 645 aa  371  1e-101  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.790276  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3830  ABC transporter-related protein  38.37 
 
 		 632 aa  370  1e-101  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.457691 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>