More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CA2559_07215 on replicon NC_014230
Organism: Croceibacter atlanticus HTCC2559



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013162  Coch_2115  ABC transporter related  68.12 
 
 
621 aa  884    Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.0255573  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4996  ABC transporter related  67.9 
 
 
620 aa  879    Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_07215  ABC transporter ATP-binding protein  100 
 
 
622 aa  1271    Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4406  ABC transporter related protein  50.64 
 
 
630 aa  645    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.336146  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4068  ABC transporter related  51.1 
 
 
630 aa  648    Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.000000802504  hitchhiker  0.000858095 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1093  ABC transporter related  49.76 
 
 
634 aa  623  1e-177  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002950  PG1225  ABC transporter, ATP-binding protein  48.22 
 
 
623 aa  620  1e-176  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.701491 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0800  ABC transporter, ATP-binding protein  46.71 
 
 
622 aa  570  1e-161  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00285677 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0008  ABC transporter related  46.02 
 
 
620 aa  565  1.0000000000000001e-159  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.925372  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2190  ABC transporter, ATP-binding protein  44.48 
 
 
631 aa  526  1e-148  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.783831 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0123  ABC transporter related  44.62 
 
 
643 aa  525  1e-148  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1982  ABC transporter, ATP-binding protein  44.32 
 
 
631 aa  523  1e-147  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000663544  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1964  ABC transporter, ATP-binding protein  44.32 
 
 
631 aa  523  1e-147  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0386922  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2308  ABC transporter, ATP-binding protein  44.32 
 
 
631 aa  523  1e-147  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000184058  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1571  ABC transporter related  43.88 
 
 
631 aa  519  1e-146  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.459004  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2225  ABC transporter, ATP-binding protein  44.48 
 
 
631 aa  521  1e-146  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.0000195061  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2000  ABC transporter related  43.76 
 
 
631 aa  520  1e-146  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.000123424  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1613  ABC transporter-related protein  44.23 
 
 
630 aa  520  1e-146  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.000050504  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2173  ABC transporter, ATP-binding protein  43.24 
 
 
631 aa  519  1e-146  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00208736  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2010  ABC transporter ATP-binding protein  44.01 
 
 
631 aa  516  1.0000000000000001e-145  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  unclonable  0.00000675061  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3220  ABC transporter related  42.68 
 
 
653 aa  516  1.0000000000000001e-145  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000221597  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2164  ABC transporter ATP-binding protein  44.01 
 
 
631 aa  516  1.0000000000000001e-145  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00326588  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3145  ABC transporter, ATP-binding protein  43.08 
 
 
631 aa  517  1.0000000000000001e-145  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.0000000568363  normal  0.0176571 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1814  ABC transporter related  42.83 
 
 
639 aa  515  1e-144  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2364  ABC transporter related  39.75 
 
 
642 aa  511  1e-143  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.217741  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2312  ABC transporter related  40.47 
 
 
642 aa  511  1e-143  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0299  ABC transporter related  40.69 
 
 
642 aa  510  1e-143  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1447  ABC transporter related  44.24 
 
 
632 aa  506  9.999999999999999e-143  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1040  ABC transporter-related protein  41.75 
 
 
629 aa  496  1e-139  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0768  ABC transporter related  41.2 
 
 
636 aa  497  1e-139  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2553  ABC transporter ATPase  42.22 
 
 
642 aa  493  9.999999999999999e-139  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1500  ABC transporter related  41.61 
 
 
630 aa  493  9.999999999999999e-139  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.384495  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3020  ABC transporter-like  41.34 
 
 
646 aa  489  1e-137  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.511953  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1381  ATPase  41.47 
 
 
641 aa  491  1e-137  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.981261  normal  0.290816 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2868  ABC transporter, ATP-binding protein  42.06 
 
 
642 aa  491  1e-137  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.914914  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1008  Fis family transcriptional regulator  40.92 
 
 
629 aa  488  1e-136  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1278  ABC transporter ATPase  42.31 
 
 
625 aa  483  1e-135  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.760109  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3547  ABC transporter-like protein protein  39.88 
 
 
640 aa  479  1e-134  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0780  ATPase  41.32 
 
 
630 aa  477  1e-133  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.989868  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1823  ABC transporter related  39.91 
 
 
632 aa  478  1e-133  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  decreased coverage  0.00644209  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3897  ABC transporter related  40.89 
 
 
613 aa  472  1e-132  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0375  ATPase  41.25 
 
 
631 aa  466  9.999999999999999e-131  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0718  ABC transporter related  38.21 
 
 
626 aa  464  1e-129  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.332523  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0383  ABC transporter, ATP-binding protein  41.55 
 
 
627 aa  453  1.0000000000000001e-126  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.386036  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0760  ABC transporter related  41.38 
 
 
625 aa  454  1.0000000000000001e-126  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0743  ABC transporter related  41.38 
 
 
625 aa  454  1.0000000000000001e-126  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0514  ATPase  38.16 
 
 
633 aa  446  1.0000000000000001e-124  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.11743  normal  0.506629 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_18141  hypothetical protein  38.64 
 
 
641 aa  443  1e-123  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.0376333  normal  0.70207 
 
 
-
 
NC_009357  OSTLU_30493  ABC(ATP-binding) family transporter  42.96 
 
 
723 aa  443  1e-123  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal  0.658611 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1648  ABC transporter ATPase  41.42 
 
 
623 aa  441  9.999999999999999e-123  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0950  ATPase  38.27 
 
 
641 aa  436  1e-121  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.61977  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_03991  ABC transporter ATP-binding protein  37.5 
 
 
652 aa  437  1e-121  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1340  ABC transporter, ATP-binding protein  39.13 
 
 
622 aa  433  1e-120  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0462  ABC transporter ATPase  39.77 
 
 
626 aa  434  1e-120  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_12061  ABC transporter ATPase  38.95 
 
 
644 aa  427  1e-118  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.393632  normal  0.504812 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1822  ATPase  35.9 
 
 
631 aa  421  1e-116  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011697  PHATRDRAFT_41351  predicted protein  36.27 
 
 
679 aa  414  1e-114  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2430  putative ABC transporter ATP-binding protein  40.7 
 
 
595 aa  400  9.999999999999999e-111  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0889  putative ABC transporter ATP-binding protein  40.45 
 
 
554 aa  402  9.999999999999999e-111  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3285  ABC transporter related  35.91 
 
 
636 aa  395  1e-109  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.000000124669  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3221  putative ABC transporter ATP-binding protein  39.89 
 
 
589 aa  393  1e-108  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2392  putative ABC transporter ATP-binding protein  41.89 
 
 
551 aa  389  1e-107  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.935698  normal  0.570925 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3681  putative ABC transporter ATP-binding protein  40.87 
 
 
553 aa  389  1e-107  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2479  ABC transporter-related protein  35.65 
 
 
634 aa  390  1e-107  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0549886  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8452  ABC transporter related  35.89 
 
 
608 aa  392  1e-107  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.030329  decreased coverage  0.00000193115 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0928  ABC transporter related  35.84 
 
 
633 aa  390  1e-107  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.11608e-27 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3318  ABC transporter related protein  36.33 
 
 
632 aa  390  1e-107  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3066  putative ABC transporter ATP-binding protein  39.19 
 
 
555 aa  387  1e-106  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  hitchhiker  0.00794174  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3581  putative ABC transporter ATP-binding protein  39.59 
 
 
555 aa  386  1e-106  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.078032  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0489  putative ABC transporter ATP-binding protein  39.78 
 
 
555 aa  388  1e-106  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.890406 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2171  putative ABC transporter ATP-binding protein  40.66 
 
 
553 aa  388  1e-106  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2713  putative ABC transporter ATP-binding protein  39.7 
 
 
555 aa  386  1e-106  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.776803  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2587  putative ABC transporter ATP-binding protein  39.93 
 
 
705 aa  387  1e-106  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0517  putative ABC transporter ATP-binding protein  39.78 
 
 
555 aa  388  1e-106  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.817295  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2686  putative ABC transporter ATP-binding protein  40.62 
 
 
549 aa  384  1e-105  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0530992  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1794  putative ABC transporter ATP-binding protein  40.19 
 
 
555 aa  382  1e-105  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.482874  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3606  putative ABC transporter ATP-binding protein  39.41 
 
 
555 aa  384  1e-105  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.776726  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0510  putative ABC transporter ATP-binding protein  39.41 
 
 
555 aa  384  1e-105  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.292633  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1799  putative ABC transporter ATP-binding protein  38.76 
 
 
554 aa  384  1e-105  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.255837 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3595  putative ABC transporter ATP-binding protein  39.41 
 
 
555 aa  384  1e-105  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.431194  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1329  ABC transporter related protein  40.65 
 
 
554 aa  384  1e-105  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.461505  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3514  putative ABC transporter ATP-binding protein  39.44 
 
 
554 aa  384  1e-105  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0491494  normal  0.117692 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3604  putative ABC transporter ATP-binding protein  39.7 
 
 
555 aa  384  1e-105  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.943392 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2810  putative ABC transporter ATP-binding protein  39.03 
 
 
555 aa  383  1e-105  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.923334 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0513  ABC transporter related protein  34.34 
 
 
592 aa  385  1e-105  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4758  putative ABC transporter ATP-binding protein  40.3 
 
 
553 aa  384  1e-105  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.45011  normal  0.440295 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0443  putative ABC transporter ATP-binding protein  40.07 
 
 
555 aa  384  1e-105  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.317561  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0447  putative ABC transporter ATP-binding protein  39.78 
 
 
570 aa  385  1e-105  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.46914  normal  0.303037 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0668  putative ABC transporter ATP-binding protein  39.41 
 
 
555 aa  384  1e-105  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0964  putative ABC transporter ATP-binding protein  39.41 
 
 
555 aa  384  1e-105  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.322458  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0421  putative ABC transporter ATP-binding protein  39.78 
 
 
555 aa  384  1e-105  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1934  putative ABC transporter ATP-binding protein  39.41 
 
 
555 aa  384  1e-105  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.628337  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3159  putative ABC transporter ATP-binding protein  39.22 
 
 
555 aa  384  1e-105  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000146292 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2913  putative ABC transporter ATP-binding protein  40.19 
 
 
555 aa  382  1e-104  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.010089  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1060  putative ABC transporter ATP-binding protein  38.72 
 
 
554 aa  382  1e-104  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.298194  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1281  putative ABC transporter ATP-binding protein  38.3 
 
 
561 aa  381  1e-104  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.0000308368  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2924  putative ABC transporter ATP-binding protein  39.59 
 
 
555 aa  380  1e-104  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.570812  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0660  ABC transporter related  36.28 
 
 
626 aa  380  1e-104  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.14515  normal  0.023928 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1845  putative ABC transporter ATP-binding protein  38.25 
 
 
556 aa  379  1e-104  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000460921 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2881  putative ABC transporter ATP-binding protein  39.63 
 
 
555 aa  382  1e-104  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.41932  normal  0.0832413 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>