More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Phep_0008 on replicon NC_013061
Organism: Pedobacter heparinus DSM 2366



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013061  Phep_0008  ABC transporter related  100 
 
 		 620 aa  1263    Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.925372  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4068  ABC transporter related  49.76 
 
 		 630 aa  625  1e-178  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.000000802504  hitchhiker  0.000858095 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4406  ABC transporter related protein  48.49 
 
 		 630 aa  592  1e-168  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.336146  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_2115  ABC transporter related  45.45 
 
 		 621 aa  580  1e-164  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.0255573  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1093  ABC transporter related  46.45 
 
 		 634 aa  572  1e-161  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_07215  ABC transporter ATP-binding protein  46.02 
 
 		 622 aa  568  1e-160  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4996  ABC transporter related  44.41 
 
 		 620 aa  553  1e-156  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1571  ABC transporter related  45.6 
 
 		 631 aa  531  1e-150  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.459004  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3220  ABC transporter related  43.23 
 
 		 653 aa  527  1e-148  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000221597  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0800  ABC transporter, ATP-binding protein  43.48 
 
 		 622 aa  516  1.0000000000000001e-145  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00285677 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2364  ABC transporter related  42.79 
 
 		 642 aa  510  1e-143  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.217741  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1814  ABC transporter related  42.45 
 
 		 639 aa  507  9.999999999999999e-143  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1225  ABC transporter, ATP-binding protein  42.29 
 
 		 623 aa  499  1e-140  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.701491 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0123  ABC transporter related  42.18 
 
 		 643 aa  499  1e-140  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0299  ABC transporter related  42.72 
 
 		 642 aa  500  1e-140  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2312  ABC transporter related  42.38 
 
 		 642 aa  501  1e-140  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2868  ABC transporter, ATP-binding protein  42.06 
 
 		 642 aa  491  1e-137  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.914914  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2553  ABC transporter ATPase  41.59 
 
 		 642 aa  488  1e-136  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1447  ABC transporter related  40.82 
 
 		 632 aa  482  1e-135  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3145  ABC transporter, ATP-binding protein  42.13 
 
 		 631 aa  481  1e-134  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.0000000568363  normal  0.0176571 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2173  ABC transporter, ATP-binding protein  41.97 
 
 		 631 aa  479  1e-134  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00208736  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1613  ABC transporter-related protein  41.79 
 
 		 630 aa  482  1e-134  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.000050504  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2190  ABC transporter, ATP-binding protein  41.81 
 
 		 631 aa  479  1e-134  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.783831 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1982  ABC transporter, ATP-binding protein  41.65 
 
 		 631 aa  477  1e-133  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000663544  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1964  ABC transporter, ATP-binding protein  41.65 
 
 		 631 aa  477  1e-133  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0386922  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2000  ABC transporter related  41.72 
 
 		 631 aa  478  1e-133  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.000123424  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2308  ABC transporter, ATP-binding protein  41.65 
 
 		 631 aa  477  1e-133  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000184058  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2225  ABC transporter, ATP-binding protein  41.65 
 
 		 631 aa  474  1e-132  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.0000195061  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2010  ABC transporter ATP-binding protein  41.34 
 
 		 631 aa  471  1.0000000000000001e-131  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  unclonable  0.00000675061  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3020  ABC transporter-like  41.53 
 
 		 646 aa  471  1.0000000000000001e-131  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.511953  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2164  ABC transporter ATP-binding protein  41.34 
 
 		 631 aa  471  1.0000000000000001e-131  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00326588  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3897  ABC transporter related  41.73 
 
 		 613 aa  469  1.0000000000000001e-131  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3547  ABC transporter-like protein protein  40.06 
 
 		 640 aa  468  9.999999999999999e-131  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1040  ABC transporter-related protein  39.21 
 
 		 629 aa  468  9.999999999999999e-131  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0718  ABC transporter related  40.29 
 
 		 626 aa  457  1e-127  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.332523  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1381  ATPase  38.84 
 
 		 641 aa  457  1e-127  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.981261  normal  0.290816 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0768  ABC transporter related  38.23 
 
 		 636 aa  452  1.0000000000000001e-126  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1278  ABC transporter ATPase  39.84 
 
 		 625 aa  445  1e-123  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.760109  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1500  ABC transporter related  37.97 
 
 		 630 aa  439  9.999999999999999e-123  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.384495  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0462  ABC transporter ATPase  39.87 
 
 		 626 aa  440  9.999999999999999e-123  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0760  ABC transporter related  39.1 
 
 		 625 aa  437  1e-121  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0780  ATPase  38.57 
 
 		 630 aa  437  1e-121  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.989868  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1823  ABC transporter related  38.23 
 
 		 632 aa  436  1e-121  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  decreased coverage  0.00644209  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0743  ABC transporter related  39.1 
 
 		 625 aa  437  1e-121  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1340  ABC transporter, ATP-binding protein  38.9 
 
 		 622 aa  431  1e-119  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1008  Fis family transcriptional regulator  37.89 
 
 		 629 aa  430  1e-119  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0383  ABC transporter, ATP-binding protein  39.03 
 
 		 627 aa  422  1e-117  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.386036  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0375  ATPase  38.63 
 
 		 631 aa  417  9.999999999999999e-116  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009357  OSTLU_30493  ABC(ATP-binding) family transporter  40.26 
 
 		 723 aa  418  9.999999999999999e-116  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.658611 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_03991  ABC transporter ATP-binding protein  38.07 
 
 		 652 aa  415  1e-114  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_18141  hypothetical protein  36.82 
 
 		 641 aa  406  1.0000000000000001e-112  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.0376333  normal  0.70207 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0950  ATPase  37.29 
 
 		 641 aa  407  1.0000000000000001e-112  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.61977  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1822  ATPase  36.94 
 
 		 631 aa  402  1e-111  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011697  PHATRDRAFT_41351  predicted protein  34.2 
 
 		 679 aa  400  9.999999999999999e-111  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0514  ATPase  36.8 
 
 		 633 aa  394  1e-108  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.11743  normal  0.506629 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1648  ABC transporter ATPase  39.68 
 
 		 623 aa  389  1e-106  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_12061  ABC transporter ATPase  37.07 
 
 		 644 aa  388  1e-106  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.393632  normal  0.504812 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3318  ABC transporter related protein  36.8 
 
 		 632 aa  377  1e-103  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2479  ABC transporter-related protein  35.63 
 
 		 634 aa  373  1e-102  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0549886  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0928  ABC transporter related  36.74 
 
 		 633 aa  374  1e-102  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.11608e-27 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2360  ABC transporter related  36.82 
 
 		 642 aa  372  1e-101  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.257541  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1749  ABC transporter related  35.29 
 
 		 661 aa  369  1e-101  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2382  ABC transporter related  35.45 
 
 		 649 aa  370  1e-101  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.629954  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2361  ABC transporter related  35.29 
 
 		 661 aa  369  1e-101  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2810  ABC transporter ATPase  36.58 
 
 		 631 aa  366  1e-100  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6107  ABC transporter related protein  33.74 
 
 		 653 aa  366  1e-100  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2523  ABC transporter-related protein  35.13 
 
 		 641 aa  366  1e-100  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.377883  normal  0.503235 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2125  ABC transporter related  35.48 
 
 		 641 aa  365  1e-99  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.279958 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3380  ABC transporter related  34.57 
 
 		 651 aa  364  2e-99  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2061  ABC transporter, ATPase subunit  34.52 
 
 		 654 aa  364  3e-99  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2398  ABC transporter related  36 
 
 		 650 aa  363  4e-99  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0660  ABC transporter related  35.42 
 
 		 626 aa  363  5.0000000000000005e-99  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.14515  normal  0.023928 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1895  ABC transporter related  33.75 
 
 		 656 aa  362  2e-98  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.438014  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3340  ABC transporter, duplicated ATPase subunits  34.6 
 
 		 645 aa  359  7e-98  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.790276  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0918  ABC transporter related  35.14 
 
 		 688 aa  359  9.999999999999999e-98  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.101083 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2279  ABC transporter related  34.65 
 
 		 649 aa  357  2.9999999999999997e-97  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2351  putative ABC transporter ATP-binding protein  35.99 
 
 		 559 aa  357  2.9999999999999997e-97  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.701309  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1988  ABC transporter ATPase component  34.59 
 
 		 637 aa  357  2.9999999999999997e-97  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2397  ABC transporter related  34.34 
 
 		 649 aa  357  2.9999999999999997e-97  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2640  ABC transporter ATPase component  34.59 
 
 		 637 aa  357  5e-97  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2551  ABC transporter ATPase component  34.59 
 
 		 637 aa  357  5e-97  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5700  ABC transporter, fused ATPase subunits  34.56 
 
 		 649 aa  356  5.999999999999999e-97  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2700  ABC transporter related  35.14 
 
 		 640 aa  356  7.999999999999999e-97  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.725807  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1816  ABC transporter-related protein  34.01 
 
 		 654 aa  356  8.999999999999999e-97  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0210138  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1845  putative ABC transporter ATP-binding protein  36.05 
 
 		 556 aa  355  1e-96  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000460921 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003440  ABC transporter ATP-binding protein uup  36.39 
 
 		 639 aa  354  2e-96  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.550149  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1204  ABC transporter related  34.29 
 
 		 648 aa  354  2.9999999999999997e-96  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0568  ABC transporter related protein  32.96 
 
 		 632 aa  353  5e-96  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1199  ABC transporter related  34.77 
 
 		 648 aa  353  5e-96  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.219582  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0899  ABC transporter related  36.55 
 
 		 663 aa  353  5.9999999999999994e-96  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.998664  normal  0.488704 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5234  ABC transporter related protein  35.39 
 
 		 555 aa  352  8e-96  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.547616  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2207  ABC transporter, ATP-binding protein  35.2 
 
 		 648 aa  350  3e-95  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.829349  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2087  ABC transporter, ATP-binding protein  35.2 
 
 		 648 aa  350  3e-95  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2441  putative ABC transporter ATP-binding protein  35.85 
 
 		 558 aa  350  3e-95  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00204105  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0693  ABC transporter, ATP-binding protein  35.2 
 
 		 648 aa  350  3e-95  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02335  ABC transporter ATPase component  36.03 
 
 		 639 aa  350  4e-95  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2525  ABC transporter, ATP-binding protein  35.2 
 
 		 660 aa  350  4e-95  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1136  ABC transporter, ATP-binding protein  34.88 
 
 		 660 aa  349  7e-95  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1144  ABC transporter, ATP-binding protein  34.88 
 
 		 660 aa  349  7e-95  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.261137  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4373  ABC transporter-related protein  35.05 
 
 		 629 aa  349  8e-95  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0223118  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>