More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ava_3020 on replicon NC_007413
Organism: Anabaena variabilis ATCC 29413



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011726  PCC8801_2312  ABC transporter related  71.16 
 
 
642 aa  931    Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2364  ABC transporter related  71.47 
 
 
642 aa  938    Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.217741  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3020  ABC transporter-like  100 
 
 
646 aa  1320    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.511953  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3547  ABC transporter-like protein protein  83.33 
 
 
640 aa  1089    'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1381  ATPase  57.98 
 
 
641 aa  726    Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.981261  normal  0.290816 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0299  ABC transporter related  73.68 
 
 
642 aa  987    Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_03991  ABC transporter ATP-binding protein  48.17 
 
 
652 aa  635    Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0950  ATPase  47.76 
 
 
641 aa  622  1e-177  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.61977  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_18141  hypothetical protein  47.44 
 
 
641 aa  621  1e-176  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.0376333  normal  0.70207 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1613  ABC transporter-related protein  48.52 
 
 
630 aa  610  1e-173  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.000050504  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0514  ATPase  48.14 
 
 
633 aa  609  1e-173  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.11743  normal  0.506629 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1040  ABC transporter-related protein  47.51 
 
 
629 aa  606  9.999999999999999e-173  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1814  ABC transporter related  45.94 
 
 
639 aa  603  1.0000000000000001e-171  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0780  ATPase  48.21 
 
 
630 aa  603  1.0000000000000001e-171  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.989868  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1008  Fis family transcriptional regulator  48.05 
 
 
629 aa  604  1.0000000000000001e-171  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_12061  ABC transporter ATPase  47.77 
 
 
644 aa  598  1e-170  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.393632  normal  0.504812 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1823  ABC transporter related  47.36 
 
 
632 aa  599  1e-170  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  decreased coverage  0.00644209  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1822  ATPase  47.05 
 
 
631 aa  600  1e-170  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3145  ABC transporter, ATP-binding protein  48.12 
 
 
631 aa  601  1e-170  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.0000000568363  normal  0.0176571 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1500  ABC transporter related  46.02 
 
 
630 aa  598  1e-169  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.384495  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2173  ABC transporter, ATP-binding protein  47.66 
 
 
631 aa  596  1e-169  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00208736  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1447  ABC transporter related  47.34 
 
 
632 aa  597  1e-169  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2225  ABC transporter, ATP-binding protein  47.81 
 
 
631 aa  593  1e-168  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.0000195061  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2010  ABC transporter ATP-binding protein  47.81 
 
 
631 aa  593  1e-168  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  unclonable  0.00000675061  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1982  ABC transporter, ATP-binding protein  47.81 
 
 
631 aa  593  1e-168  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000663544  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1964  ABC transporter, ATP-binding protein  47.81 
 
 
631 aa  593  1e-168  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0386922  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3220  ABC transporter related  46.18 
 
 
653 aa  593  1e-168  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000221597  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2308  ABC transporter, ATP-binding protein  47.81 
 
 
631 aa  595  1e-168  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000184058  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2164  ABC transporter ATP-binding protein  47.81 
 
 
631 aa  593  1e-168  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00326588  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2190  ABC transporter, ATP-binding protein  47.5 
 
 
631 aa  593  1e-168  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.783831 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2000  ABC transporter related  47.5 
 
 
631 aa  588  1e-166  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.000123424  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0375  ATPase  47.58 
 
 
631 aa  587  1e-166  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1571  ABC transporter related  46.82 
 
 
631 aa  583  1.0000000000000001e-165  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.459004  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0123  ABC transporter related  47.06 
 
 
643 aa  583  1.0000000000000001e-165  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0718  ABC transporter related  44.81 
 
 
626 aa  574  1.0000000000000001e-162  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.332523  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3897  ABC transporter related  45.03 
 
 
613 aa  546  1e-154  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2553  ABC transporter ATPase  45.98 
 
 
642 aa  543  1e-153  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2868  ABC transporter, ATP-binding protein  45.82 
 
 
642 aa  541  9.999999999999999e-153  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.914914  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4406  ABC transporter related protein  42.99 
 
 
630 aa  519  1e-146  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.336146  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_07215  ABC transporter ATP-binding protein  41.34 
 
 
622 aa  509  1e-143  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1225  ABC transporter, ATP-binding protein  41.5 
 
 
623 aa  505  9.999999999999999e-143  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.701491 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4996  ABC transporter related  40.71 
 
 
620 aa  503  1e-141  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4068  ABC transporter related  43.12 
 
 
630 aa  502  1e-141  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.000000802504  hitchhiker  0.000858095 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_2115  ABC transporter related  41.58 
 
 
621 aa  496  1e-139  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.0255573  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0768  ABC transporter related  40.38 
 
 
636 aa  497  1e-139  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1093  ABC transporter related  40.62 
 
 
634 aa  497  1e-139  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1340  ABC transporter, ATP-binding protein  41.33 
 
 
622 aa  485  1e-135  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0008  ABC transporter related  41.51 
 
 
620 aa  485  1e-135  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.925372  normal 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0383  ABC transporter, ATP-binding protein  39 
 
 
627 aa  466  9.999999999999999e-131  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.386036  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0800  ABC transporter, ATP-binding protein  41.4 
 
 
622 aa  468  9.999999999999999e-131  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00285677 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0462  ABC transporter ATPase  41.74 
 
 
626 aa  462  1e-129  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0743  ABC transporter related  37.56 
 
 
625 aa  459  9.999999999999999e-129  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0760  ABC transporter related  37.56 
 
 
625 aa  459  9.999999999999999e-129  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2351  putative ABC transporter ATP-binding protein  42.21 
 
 
559 aa  430  1e-119  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.701309  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2360  ABC transporter related  40.2 
 
 
642 aa  426  1e-118  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.257541  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3318  ABC transporter related protein  38.88 
 
 
632 aa  419  1e-116  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1278  ABC transporter ATPase  37.31 
 
 
625 aa  420  1e-116  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.760109  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2125  ABC transporter related  37.75 
 
 
641 aa  413  1e-114  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.279958 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5700  ABC transporter, fused ATPase subunits  36.73 
 
 
649 aa  415  1e-114  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3340  ABC transporter, duplicated ATPase subunits  37.94 
 
 
645 aa  413  1e-114  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.790276  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0928  ABC transporter related  39.16 
 
 
633 aa  414  1e-114  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.11608e-27 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2279  ABC transporter related  36.83 
 
 
649 aa  412  1e-113  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2700  ABC transporter related  36.75 
 
 
640 aa  409  1e-113  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.725807  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1199  ABC transporter related  38.63 
 
 
648 aa  411  1e-113  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.219582  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_08326  putative ATP-binding component of ABC transporter  40.62 
 
 
564 aa  409  1e-113  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2397  ABC transporter related  36.67 
 
 
649 aa  411  1e-113  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0828  ABC transporter related  38 
 
 
636 aa  402  1e-111  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0568  ABC transporter related protein  36.09 
 
 
632 aa  403  1e-111  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2382  ABC transporter related  36.02 
 
 
649 aa  404  1e-111  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.629954  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0660  ABC transporter related  36.46 
 
 
626 aa  404  1e-111  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.14515  normal  0.023928 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2430  putative ABC transporter ATP-binding protein  41.52 
 
 
595 aa  403  1e-111  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2197  putative ABC transporter ATP-binding protein  39.62 
 
 
551 aa  402  1e-111  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2479  ABC transporter-related protein  38.91 
 
 
634 aa  404  1e-111  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0549886  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3627  putative ABC transporter ATP-binding protein  39.22 
 
 
551 aa  404  1e-111  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.108497 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0899  ABC transporter related  38.17 
 
 
663 aa  403  1e-111  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.998664  normal  0.488704 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2361  ABC transporter related  35.87 
 
 
661 aa  402  1e-111  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2523  ABC transporter-related protein  39 
 
 
641 aa  404  1e-111  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.377883  normal  0.503235 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2255  putative ABC transporter ATP-binding protein  39.25 
 
 
555 aa  405  1e-111  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1749  ABC transporter related  35.87 
 
 
661 aa  402  1e-111  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2441  putative ABC transporter ATP-binding protein  40.15 
 
 
558 aa  399  9.999999999999999e-111  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00204105  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0918  ABC transporter related  36.18 
 
 
688 aa  399  9.999999999999999e-111  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.101083 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3285  ABC transporter related  37.6 
 
 
636 aa  399  9.999999999999999e-111  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.000000124669  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3414  putative ABC transporter ATP-binding protein  40.19 
 
 
555 aa  400  9.999999999999999e-111  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.106241  normal  0.225653 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2686  putative ABC transporter ATP-binding protein  41.49 
 
 
549 aa  399  9.999999999999999e-111  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0530992  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1204  ABC transporter related  37.42 
 
 
648 aa  402  9.999999999999999e-111  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1117  putative ABC transporter ATP-binding protein  40.26 
 
 
558 aa  399  9.999999999999999e-111  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.406197  hitchhiker  0.00000247304 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1648  ABC transporter ATPase  37.54 
 
 
623 aa  401  9.999999999999999e-111  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1644  putative ABC transporter ATP-binding protein  39.11 
 
 
559 aa  398  1e-109  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2087  ABC transporter, ATP-binding protein  36.63 
 
 
648 aa  396  1e-109  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2207  ABC transporter, ATP-binding protein  36.63 
 
 
648 aa  396  1e-109  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.829349  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4119  putative ABC transporter ATP-binding protein  38.87 
 
 
555 aa  397  1e-109  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1281  putative ABC transporter ATP-binding protein  40.45 
 
 
561 aa  396  1e-109  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.0000308368  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0939  ABC transporter, ATP-binding protein  36.79 
 
 
648 aa  395  1e-109  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0496893  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0642  ABC transporter related  36.75 
 
 
629 aa  397  1e-109  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.64323  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0693  ABC transporter, ATP-binding protein  36.63 
 
 
648 aa  396  1e-109  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1284  putative ABC transporter ATP-binding protein  39.69 
 
 
670 aa  398  1e-109  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2916  putative ABC transporter ATP-binding protein  39.45 
 
 
563 aa  397  1e-109  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0621526  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2105  putative ABC transporter ATP-binding protein  39.22 
 
 
555 aa  397  1e-109  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2525  ABC transporter, ATP-binding protein  36.63 
 
 
660 aa  396  1e-109  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0889  putative ABC transporter ATP-binding protein  39.23 
 
 
554 aa  393  1e-108  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>