More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Coch_2115 on replicon NC_013162
Organism: Capnocytophaga ochracea DSM 7271



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013162  Coch_2115  ABC transporter related  100 
 
 		 621 aa  1271    Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.0255573  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4996  ABC transporter related  70.1 
 
 		 620 aa  919    Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_07215  ABC transporter ATP-binding protein  68.12 
 
 		 622 aa  884    Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4406  ABC transporter related protein  50.63 
 
 		 630 aa  648    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.336146  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4068  ABC transporter related  49.21 
 
 		 630 aa  625  1e-178  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.000000802504  hitchhiker  0.000858095 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1093  ABC transporter related  48.27 
 
 		 634 aa  610  1e-173  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG1225  ABC transporter, ATP-binding protein  46.42 
 
 		 623 aa  595  1e-169  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.701491 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0008  ABC transporter related  45.45 
 
 		 620 aa  578  1.0000000000000001e-163  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.925372  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1982  ABC transporter, ATP-binding protein  46.9 
 
 		 631 aa  556  1e-157  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000663544  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1964  ABC transporter, ATP-binding protein  46.9 
 
 		 631 aa  556  1e-157  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0386922  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2308  ABC transporter, ATP-binding protein  46.9 
 
 		 631 aa  556  1e-157  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000184058  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2225  ABC transporter, ATP-binding protein  46.9 
 
 		 631 aa  553  1e-156  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.0000195061  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2173  ABC transporter, ATP-binding protein  46.26 
 
 		 631 aa  552  1e-156  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00208736  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0800  ABC transporter, ATP-binding protein  45.59 
 
 		 622 aa  554  1e-156  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00285677 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3145  ABC transporter, ATP-binding protein  46.42 
 
 		 631 aa  553  1e-156  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.0000000568363  normal  0.0176571 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2010  ABC transporter ATP-binding protein  46.74 
 
 		 631 aa  550  1e-155  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  unclonable  0.00000675061  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2164  ABC transporter ATP-binding protein  46.74 
 
 		 631 aa  550  1e-155  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00326588  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2190  ABC transporter, ATP-binding protein  46.58 
 
 		 631 aa  550  1e-155  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.783831 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2000  ABC transporter related  45.63 
 
 		 631 aa  543  1e-153  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.000123424  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1613  ABC transporter-related protein  45.06 
 
 		 630 aa  541  9.999999999999999e-153  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.000050504  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1814  ABC transporter related  41.86 
 
 		 639 aa  523  1e-147  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3220  ABC transporter related  42.28 
 
 		 653 aa  517  1.0000000000000001e-145  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000221597  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1571  ABC transporter related  42.79 
 
 		 631 aa  518  1.0000000000000001e-145  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.459004  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0123  ABC transporter related  43.59 
 
 		 643 aa  512  1e-143  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2868  ABC transporter, ATP-binding protein  42.57 
 
 		 642 aa  499  1e-140  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.914914  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1447  ABC transporter related  40.98 
 
 		 632 aa  495  9.999999999999999e-139  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2553  ABC transporter ATPase  42.11 
 
 		 642 aa  493  9.999999999999999e-139  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0299  ABC transporter related  41.15 
 
 		 642 aa  494  9.999999999999999e-139  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2364  ABC transporter related  39.81 
 
 		 642 aa  491  1e-137  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.217741  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2312  ABC transporter related  39.97 
 
 		 642 aa  490  1e-137  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1500  ABC transporter related  41.73 
 
 		 630 aa  488  1e-136  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.384495  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1381  ATPase  42.63 
 
 		 641 aa  486  1e-136  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.981261  normal  0.290816 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1040  ABC transporter-related protein  40.79 
 
 		 629 aa  486  1e-136  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0768  ABC transporter related  38.84 
 
 		 636 aa  482  1e-135  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0375  ATPase  42.16 
 
 		 631 aa  478  1e-133  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0718  ABC transporter related  40.22 
 
 		 626 aa  476  1e-133  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.332523  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1823  ABC transporter related  41.13 
 
 		 632 aa  475  1e-132  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  decreased coverage  0.00644209  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3020  ABC transporter-like  41.58 
 
 		 646 aa  475  1e-132  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.511953  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1008  Fis family transcriptional regulator  40.35 
 
 		 629 aa  473  1e-132  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3547  ABC transporter-like protein protein  40.59 
 
 		 640 aa  471  1.0000000000000001e-131  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3897  ABC transporter related  38.88 
 
 		 613 aa  465  1e-129  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0780  ATPase  39.75 
 
 		 630 aa  454  1.0000000000000001e-126  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.989868  normal  1 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1278  ABC transporter ATPase  38.83 
 
 		 625 aa  446  1.0000000000000001e-124  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.760109  n/a   
 
 
-
 
NC_009357  OSTLU_30493  ABC(ATP-binding) family transporter  40.49 
 
 		 723 aa  433  1e-120  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.658611 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_18141  hypothetical protein  38.79 
 
 		 641 aa  429  1e-119  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.0376333  normal  0.70207 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1340  ABC transporter, ATP-binding protein  38.5 
 
 		 622 aa  424  1e-117  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0950  ATPase  38.79 
 
 		 641 aa  425  1e-117  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.61977  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0743  ABC transporter related  36.76 
 
 		 625 aa  419  1e-116  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0760  ABC transporter related  36.76 
 
 		 625 aa  419  1e-116  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011697  PHATRDRAFT_41351  predicted protein  36.91 
 
 		 679 aa  419  1e-116  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1822  ATPase  37.36 
 
 		 631 aa  417  9.999999999999999e-116  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0514  ATPase  37.29 
 
 		 633 aa  413  1e-114  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.11743  normal  0.506629 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0462  ABC transporter ATPase  37.9 
 
 		 626 aa  407  1.0000000000000001e-112  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_03991  ABC transporter ATP-binding protein  36.17 
 
 		 652 aa  403  1e-111  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_12061  ABC transporter ATPase  35.35 
 
 		 644 aa  402  9.999999999999999e-111  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.393632  normal  0.504812 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1648  ABC transporter ATPase  38 
 
 		 623 aa  401  9.999999999999999e-111  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0383  ABC transporter, ATP-binding protein  36.16 
 
 		 627 aa  397  1e-109  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.386036  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3285  ABC transporter related  37.29 
 
 		 636 aa  397  1e-109  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.000000124669  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0928  ABC transporter related  35.59 
 
 		 633 aa  395  1e-108  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.11608e-27 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3318  ABC transporter related protein  35.56 
 
 		 632 aa  393  1e-108  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2479  ABC transporter-related protein  36.47 
 
 		 634 aa  390  1e-107  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0549886  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0889  putative ABC transporter ATP-binding protein  39.85 
 
 		 554 aa  384  1e-105  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0513  ABC transporter related protein  35.14 
 
 		 592 aa  384  1e-105  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3221  putative ABC transporter ATP-binding protein  40.08 
 
 		 589 aa  382  1e-105  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1845  putative ABC transporter ATP-binding protein  38.37 
 
 		 556 aa  384  1e-105  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000460921 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3066  putative ABC transporter ATP-binding protein  39.47 
 
 		 555 aa  378  1e-103  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  hitchhiker  0.00794174  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2430  putative ABC transporter ATP-binding protein  39.4 
 
 		 595 aa  377  1e-103  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2279  ABC transporter related  33.85 
 
 		 649 aa  378  1e-103  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2397  ABC transporter related  33.85 
 
 		 649 aa  377  1e-103  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0489  putative ABC transporter ATP-binding protein  39.32 
 
 		 555 aa  374  1e-102  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.890406 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0660  ABC transporter related  35.55 
 
 		 626 aa  375  1e-102  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.14515  normal  0.023928 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2913  putative ABC transporter ATP-binding protein  38.56 
 
 		 555 aa  375  1e-102  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.010089  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3159  putative ABC transporter ATP-binding protein  38.94 
 
 		 555 aa  375  1e-102  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000146292 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2810  putative ABC transporter ATP-binding protein  38.94 
 
 		 555 aa  375  1e-102  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.923334 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2382  ABC transporter related  33.69 
 
 		 649 aa  373  1e-102  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.629954  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5700  ABC transporter, fused ATPase subunits  33.69 
 
 		 649 aa  372  1e-102  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3581  putative ABC transporter ATP-binding protein  39.32 
 
 		 555 aa  374  1e-102  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.078032  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2361  ABC transporter related  33.54 
 
 		 661 aa  372  1e-102  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5234  ABC transporter related protein  38.24 
 
 		 555 aa  373  1e-102  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.547616  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1749  ABC transporter related  33.54 
 
 		 661 aa  372  1e-102  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2587  putative ABC transporter ATP-binding protein  39.32 
 
 		 705 aa  374  1e-102  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2713  putative ABC transporter ATP-binding protein  39.51 
 
 		 555 aa  372  1e-102  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.776803  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0517  putative ABC transporter ATP-binding protein  39.32 
 
 		 555 aa  374  1e-102  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.817295  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2125  ABC transporter related  34.42 
 
 		 641 aa  370  1e-101  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.279958 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0510  putative ABC transporter ATP-binding protein  39.13 
 
 		 555 aa  372  1e-101  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.292633  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3606  putative ABC transporter ATP-binding protein  39.13 
 
 		 555 aa  372  1e-101  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.776726  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1799  putative ABC transporter ATP-binding protein  38.56 
 
 		 554 aa  372  1e-101  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.255837 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3595  putative ABC transporter ATP-binding protein  39.13 
 
 		 555 aa  372  1e-101  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.431194  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3681  putative ABC transporter ATP-binding protein  39.7 
 
 		 553 aa  372  1e-101  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3604  putative ABC transporter ATP-binding protein  38.94 
 
 		 555 aa  370  1e-101  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.943392 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0964  putative ABC transporter ATP-binding protein  39.13 
 
 		 555 aa  372  1e-101  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.322458  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0447  putative ABC transporter ATP-binding protein  39.13 
 
 		 570 aa  370  1e-101  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.46914  normal  0.303037 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3917  putative ABC transporter ATP-binding protein  38.83 
 
 		 554 aa  371  1e-101  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0668  putative ABC transporter ATP-binding protein  39.13 
 
 		 555 aa  372  1e-101  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0443  putative ABC transporter ATP-binding protein  39.7 
 
 		 555 aa  372  1e-101  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.317561  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3514  putative ABC transporter ATP-binding protein  39.02 
 
 		 554 aa  370  1e-101  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0491494  normal  0.117692 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4758  putative ABC transporter ATP-binding protein  39.33 
 
 		 553 aa  369  1e-101  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.45011  normal  0.440295 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2105  putative ABC transporter ATP-binding protein  37.43 
 
 		 555 aa  370  1e-101  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0421  putative ABC transporter ATP-binding protein  39.13 
 
 		 555 aa  370  1e-101  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1934  putative ABC transporter ATP-binding protein  39.13 
 
 		 555 aa  372  1e-101  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.628337  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>