More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cpin_1093 on replicon NC_013132
Organism: Chitinophaga pinensis DSM 2588



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013132  Cpin_1093  ABC transporter related  100 
 
 		 634 aa  1300    Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4068  ABC transporter related  50.78 
 
 		 630 aa  625  1e-178  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.000000802504  hitchhiker  0.000858095 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_07215  ABC transporter ATP-binding protein  49.76 
 
 		 622 aa  623  1e-177  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4406  ABC transporter related protein  50.31 
 
 		 630 aa  610  1e-173  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.336146  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_2115  ABC transporter related  48.27 
 
 		 621 aa  610  1e-173  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.0255573  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4996  ABC transporter related  48.81 
 
 		 620 aa  606  9.999999999999999e-173  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1225  ABC transporter, ATP-binding protein  47.78 
 
 		 623 aa  588  1e-166  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.701491 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0008  ABC transporter related  46.45 
 
 		 620 aa  557  1e-157  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.925372  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0800  ABC transporter, ATP-binding protein  46.72 
 
 		 622 aa  538  1e-151  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00285677 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1040  ABC transporter-related protein  42.34 
 
 		 629 aa  525  1e-147  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1500  ABC transporter related  42.46 
 
 		 630 aa  525  1e-147  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.384495  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2364  ABC transporter related  40 
 
 		 642 aa  521  1e-146  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.217741  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2312  ABC transporter related  40.31 
 
 		 642 aa  517  1.0000000000000001e-145  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1447  ABC transporter related  43.26 
 
 		 632 aa  516  1.0000000000000001e-145  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1823  ABC transporter related  42.81 
 
 		 632 aa  510  1e-143  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  decreased coverage  0.00644209  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1008  Fis family transcriptional regulator  42.17 
 
 		 629 aa  511  1e-143  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1814  ABC transporter related  41.85 
 
 		 639 aa  505  9.999999999999999e-143  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2010  ABC transporter ATP-binding protein  44.11 
 
 		 631 aa  503  1e-141  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  unclonable  0.00000675061  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1982  ABC transporter, ATP-binding protein  44.11 
 
 		 631 aa  503  1e-141  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000663544  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1964  ABC transporter, ATP-binding protein  44.11 
 
 		 631 aa  503  1e-141  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0386922  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2308  ABC transporter, ATP-binding protein  44.27 
 
 		 631 aa  504  1e-141  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000184058  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2164  ABC transporter ATP-binding protein  44.11 
 
 		 631 aa  503  1e-141  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00326588  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3220  ABC transporter related  41.53 
 
 		 653 aa  504  1e-141  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000221597  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2225  ABC transporter, ATP-binding protein  44.11 
 
 		 631 aa  501  1e-140  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.0000195061  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3145  ABC transporter, ATP-binding protein  43.8 
 
 		 631 aa  501  1e-140  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.0000000568363  normal  0.0176571 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2000  ABC transporter related  43.96 
 
 		 631 aa  501  1e-140  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.000123424  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2190  ABC transporter, ATP-binding protein  43.8 
 
 		 631 aa  499  1e-140  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.783831 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2173  ABC transporter, ATP-binding protein  43.49 
 
 		 631 aa  498  1e-139  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00208736  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1571  ABC transporter related  43.26 
 
 		 631 aa  498  1e-139  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.459004  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1613  ABC transporter-related protein  43.17 
 
 		 630 aa  495  9.999999999999999e-139  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.000050504  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0299  ABC transporter related  39.78 
 
 		 642 aa  493  9.999999999999999e-139  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0780  ATPase  42.12 
 
 		 630 aa  488  1e-136  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.989868  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0375  ATPase  43.08 
 
 		 631 aa  486  1e-136  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3547  ABC transporter-like protein protein  40.09 
 
 		 640 aa  486  1e-136  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0123  ABC transporter related  41.81 
 
 		 643 aa  481  1e-134  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3020  ABC transporter-like  40.62 
 
 		 646 aa  477  1e-133  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.511953  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1381  ATPase  40.31 
 
 		 641 aa  472  1e-132  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.981261  normal  0.290816 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0768  ABC transporter related  39.56 
 
 		 636 aa  470  1.0000000000000001e-131  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0718  ABC transporter related  40.56 
 
 		 626 aa  461  9.999999999999999e-129  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.332523  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2868  ABC transporter, ATP-binding protein  40.44 
 
 		 642 aa  461  9.999999999999999e-129  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.914914  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2553  ABC transporter ATPase  40.44 
 
 		 642 aa  457  1e-127  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3897  ABC transporter related  38.16 
 
 		 613 aa  437  1e-121  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0462  ABC transporter ATPase  40.44 
 
 		 626 aa  431  1e-119  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009357  OSTLU_30493  ABC(ATP-binding) family transporter  42 
 
 		 723 aa  429  1e-119  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.658611 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1278  ABC transporter ATPase  38.93 
 
 		 625 aa  424  1e-117  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.760109  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1340  ABC transporter, ATP-binding protein  38.73 
 
 		 622 aa  419  1e-116  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_03991  ABC transporter ATP-binding protein  35.75 
 
 		 652 aa  416  9.999999999999999e-116  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0514  ATPase  37.31 
 
 		 633 aa  415  1e-114  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.11743  normal  0.506629 
 
 
-
 
NC_011697  PHATRDRAFT_41351  predicted protein  37.26 
 
 		 679 aa  407  1.0000000000000001e-112  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_18141  hypothetical protein  35.18 
 
 		 641 aa  402  9.999999999999999e-111  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.0376333  normal  0.70207 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_12061  ABC transporter ATPase  36.12 
 
 		 644 aa  399  9.999999999999999e-111  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.393632  normal  0.504812 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0950  ATPase  34.83 
 
 		 641 aa  397  1e-109  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.61977  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1822  ATPase  36.24 
 
 		 631 aa  399  1e-109  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0743  ABC transporter related  36.16 
 
 		 625 aa  396  1e-109  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0760  ABC transporter related  36.16 
 
 		 625 aa  396  1e-109  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1648  ABC transporter ATPase  39.84 
 
 		 623 aa  394  1e-108  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0383  ABC transporter, ATP-binding protein  34.8 
 
 		 627 aa  392  1e-107  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.386036  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0928  ABC transporter related  36.8 
 
 		 633 aa  389  1e-106  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.11608e-27 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3318  ABC transporter related protein  37.21 
 
 		 632 aa  384  1e-105  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2479  ABC transporter-related protein  35.71 
 
 		 634 aa  382  1e-105  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0549886  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3285  ABC transporter related  35.75 
 
 		 636 aa  379  1e-103  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.000000124669  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0238  putative ABC transporter ATP-binding protein  37.24 
 
 		 559 aa  371  1e-101  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.331867 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2105  putative ABC transporter ATP-binding protein  37.83 
 
 		 555 aa  363  8e-99  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0568  ABC transporter related protein  33.75 
 
 		 632 aa  359  7e-98  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0660  ABC transporter related  34.83 
 
 		 626 aa  358  1.9999999999999998e-97  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.14515  normal  0.023928 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1284  putative ABC transporter ATP-binding protein  36.02 
 
 		 670 aa  356  5.999999999999999e-97  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6107  ABC transporter related protein  38.05 
 
 		 653 aa  355  1e-96  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1845  putative ABC transporter ATP-binding protein  37.62 
 
 		 556 aa  352  8.999999999999999e-96  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000460921 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1926  putative ABC transporter ATP-binding protein  36.13 
 
 		 559 aa  352  1e-95  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000000896956  normal  0.905041 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2397  ABC transporter related  33.13 
 
 		 649 aa  352  1e-95  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2392  putative ABC transporter ATP-binding protein  37.89 
 
 		 551 aa  351  2e-95  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.935698  normal  0.570925 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3380  ABC transporter related  35.61 
 
 		 651 aa  350  3e-95  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2351  putative ABC transporter ATP-binding protein  36.18 
 
 		 559 aa  351  3e-95  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.701309  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2441  putative ABC transporter ATP-binding protein  36.83 
 
 		 558 aa  350  4e-95  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00204105  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1644  putative ABC transporter ATP-binding protein  35.99 
 
 		 559 aa  348  1e-94  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2061  ABC transporter, ATPase subunit  34.78 
 
 		 654 aa  348  1e-94  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1527  putative ABC transporter ATP-binding protein  36.43 
 
 		 559 aa  348  2e-94  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2279  ABC transporter related  33.28 
 
 		 649 aa  347  3e-94  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_4019  putative ABC transporter ATP-binding protein  36.28 
 
 		 561 aa  345  1e-93  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.186099 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0918  ABC transporter related  33.77 
 
 		 688 aa  344  2e-93  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.101083 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5234  ABC transporter related protein  37.43 
 
 		 555 aa  344  2e-93  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.547616  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1816  ABC transporter-related protein  34.09 
 
 		 654 aa  344  2.9999999999999997e-93  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0210138  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1895  ABC transporter related  34.35 
 
 		 656 aa  343  4e-93  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.438014  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0409  ABC transporter, ATP-binding subunit  34.47 
 
 		 596 aa  342  1e-92  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.722245  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1204  ABC transporter related  34.63 
 
 		 648 aa  342  1e-92  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2008  putative ABC transporter ATP-binding protein  37.19 
 
 		 551 aa  342  1e-92  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2125  ABC transporter related  33.89 
 
 		 641 aa  340  2.9999999999999998e-92  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.279958 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2382  ABC transporter related  33.28 
 
 		 649 aa  340  2.9999999999999998e-92  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.629954  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2430  putative ABC transporter ATP-binding protein  36.7 
 
 		 595 aa  340  5.9999999999999996e-92  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1749  ABC transporter related  33.12 
 
 		 661 aa  339  7e-92  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2361  ABC transporter related  33.12 
 
 		 661 aa  339  7e-92  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3627  putative ABC transporter ATP-binding protein  35.86 
 
 		 551 aa  339  8e-92  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.108497 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1057  putative ABC transporter ATP-binding protein  35.42 
 
 		 559 aa  339  8e-92  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3426  putative ABC transporter ATP-binding protein  34.52 
 
 		 561 aa  338  9.999999999999999e-92  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0809  putative ABC transporter ATP-binding protein  35.58 
 
 		 560 aa  338  9.999999999999999e-92  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2580  putative ABC transporter ATP-binding protein  35.82 
 
 		 560 aa  339  9.999999999999999e-92  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.471915  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2810  putative ABC transporter ATP-binding protein  35.48 
 
 		 555 aa  338  1.9999999999999998e-91  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.923334 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0834  putative ABC transporter ATP-binding protein  34.52 
 
 		 561 aa  338  1.9999999999999998e-91  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00294599  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2216  putative ABC transporter ATP-binding protein  36.6 
 
 		 547 aa  338  1.9999999999999998e-91  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.885012  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3159  putative ABC transporter ATP-binding protein  35.48 
 
 		 555 aa  338  1.9999999999999998e-91  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000146292 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>