More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tfu_0409 on replicon NC_007333
Organism: Thermobifida fusca YX



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008699  Noca_3854  ABC transporter related  61.42 
 
 		 611 aa  659    Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.53962  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0409  ABC transporter, ATP-binding subunit  100 
 
 		 596 aa  1175    Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.722245  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3161  ABC transporter-like protein  67.6 
 
 		 608 aa  730    Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.970833 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0513  ABC transporter related protein  60.37 
 
 		 592 aa  660    Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3996  ABC transporter related protein  76.22 
 
 		 592 aa  853    Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.181167 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3007  ABC transporter related  57.07 
 
 		 600 aa  641    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.333265  normal  0.911038 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8452  ABC transporter related  59.04 
 
 		 608 aa  646    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.030329  decreased coverage  0.00000193115 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2963  ABC transporter related  57.07 
 
 		 600 aa  641    Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.616286  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0990  ABC transporter related protein  67 
 
 		 588 aa  707    Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8616  ABC transporter ATP-binding protein  66.78 
 
 		 602 aa  709    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0650  ABC transporter related  60.44 
 
 		 590 aa  645    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3959  ABC transporter related  59.93 
 
 		 612 aa  631  1e-179  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.143764  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_32430  ATPase component of ABC transporters with duplicated ATPase domain protein  59.87 
 
 		 600 aa  625  1e-178  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.775156  normal  0.436846 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0493  ABC transporter related protein  59.7 
 
 		 602 aa  620  1e-176  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.518307  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0772  ABC transporter related  56.98 
 
 		 632 aa  613  9.999999999999999e-175  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.118352  normal  0.168546 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3518  ABC transporter related  56.67 
 
 		 587 aa  592  1e-168  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.284469  normal  0.409112 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_03410  ATPase component of ABC transporters with duplicated ATPase domain  55.46 
 
 		 628 aa  588  1e-167  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3947  ABC transporter related protein  56.93 
 
 		 601 aa  590  1e-167  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0784  ABC transporter related  56.81 
 
 		 598 aa  587  1e-166  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0865  ABC transporter related protein  57.43 
 
 		 608 aa  583  1.0000000000000001e-165  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.380755  normal  0.901463 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1285  ABC transporter related  52.62 
 
 		 610 aa  577  1.0000000000000001e-163  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000856042 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1521  ABC transporter related protein  54.23 
 
 		 601 aa  572  1.0000000000000001e-162  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0493324  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0728  ABC transporter related  56 
 
 		 598 aa  572  1.0000000000000001e-162  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000999119 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1215  ABC transporter related  52.21 
 
 		 608 aa  559  1e-158  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.207938  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1950  ABC transporter related  51.3 
 
 		 615 aa  556  1e-157  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.975434 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1047  ABC transporter related  56.74 
 
 		 606 aa  558  1e-157  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_05410  ATPase component of ABC transporters with duplicated ATPase domain  52.37 
 
 		 613 aa  555  1e-157  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.0302406  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3302  ABC transporter-related protein  50.57 
 
 		 606 aa  545  1e-154  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2978  ABC transporter related  52.65 
 
 		 596 aa  545  1e-153  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.013676  decreased coverage  0.00456661 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_30250  ATPase component of ABC transporters with duplicated ATPase domain  51.64 
 
 		 572 aa  541  9.999999999999999e-153  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.24394 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11685  macrolide ABC transporter ATP-binding protein  50.42 
 
 		 591 aa  540  9.999999999999999e-153  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.819157 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2744  ABC transporter related  47.78 
 
 		 609 aa  535  1e-151  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0977  ABC transporter related  52.91 
 
 		 616 aa  533  1e-150  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.126442  hitchhiker  0.00329401 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2722  ABC transporter related protein  48.02 
 
 		 631 aa  530  1e-149  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_15000  ATPase component of ABC transporters with duplicated ATPase domain  47.19 
 
 		 600 aa  522  1e-147  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.0302703  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4554  ABC transporter related  51.13 
 
 		 617 aa  525  1e-147  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_13340  ATPase component of ABC transporters with duplicated ATPase domain  55.24 
 
 		 630 aa  505  1e-141  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0691975  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0736  ABC transporter related  44.16 
 
 		 630 aa  499  1e-140  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_08180  ATPase component of ABC transporters with duplicated ATPase domain protein  44.23 
 
 		 632 aa  464  1e-129  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  0.195035 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1982  ABC transporter, ATP-binding protein  40.48 
 
 		 631 aa  422  1e-117  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000663544  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1964  ABC transporter, ATP-binding protein  40.48 
 
 		 631 aa  422  1e-117  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0386922  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3145  ABC transporter, ATP-binding protein  40.65 
 
 		 631 aa  423  1e-117  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.0000000568363  normal  0.0176571 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1613  ABC transporter-related protein  41.5 
 
 		 630 aa  425  1e-117  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.000050504  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2173  ABC transporter, ATP-binding protein  40.65 
 
 		 631 aa  424  1e-117  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00208736  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2225  ABC transporter, ATP-binding protein  40.48 
 
 		 631 aa  420  1e-116  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.0000195061  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2308  ABC transporter, ATP-binding protein  40.48 
 
 		 631 aa  422  1e-116  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000184058  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2000  ABC transporter related  40.46 
 
 		 631 aa  420  1e-116  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.000123424  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2010  ABC transporter ATP-binding protein  40.26 
 
 		 631 aa  416  9.999999999999999e-116  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  unclonable  0.00000675061  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1040  ABC transporter-related protein  39.51 
 
 		 629 aa  416  9.999999999999999e-116  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2164  ABC transporter ATP-binding protein  40.26 
 
 		 631 aa  416  9.999999999999999e-116  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00326588  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2190  ABC transporter, ATP-binding protein  40.16 
 
 		 631 aa  417  9.999999999999999e-116  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.783831 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0768  ABC transporter related  37.78 
 
 		 636 aa  414  1e-114  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1447  ABC transporter related  40.26 
 
 		 632 aa  412  1e-114  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1814  ABC transporter related  37.4 
 
 		 639 aa  412  1e-114  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2553  ABC transporter ATPase  38.86 
 
 		 642 aa  412  1e-114  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2868  ABC transporter, ATP-binding protein  38.82 
 
 		 642 aa  411  1e-113  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.914914  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0780  ATPase  40.23 
 
 		 630 aa  397  1e-109  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.989868  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1823  ABC transporter related  38.56 
 
 		 632 aa  397  1e-109  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  decreased coverage  0.00644209  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3220  ABC transporter related  37.36 
 
 		 653 aa  399  1e-109  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000221597  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0123  ABC transporter related  37.66 
 
 		 643 aa  394  1e-108  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1571  ABC transporter related  38.69 
 
 		 631 aa  389  1e-107  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.459004  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0375  ATPase  39.06 
 
 		 631 aa  390  1e-107  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1008  Fis family transcriptional regulator  38.07 
 
 		 629 aa  388  1e-106  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1500  ABC transporter related  37.25 
 
 		 630 aa  384  1e-105  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.384495  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0718  ABC transporter related  37.78 
 
 		 626 aa  380  1e-104  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.332523  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3897  ABC transporter related  36.95 
 
 		 613 aa  381  1e-104  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4406  ABC transporter related protein  35.49 
 
 		 630 aa  378  1e-103  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.336146  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_2115  ABC transporter related  33.55 
 
 		 621 aa  373  1e-102  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.0255573  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3225  ABC transporter related protein  54.17 
 
 		 377 aa  371  1e-101  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.704476  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4996  ABC transporter related  33.17 
 
 		 620 aa  367  1e-100  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2312  ABC transporter related  34.82 
 
 		 642 aa  365  1e-99  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2364  ABC transporter related  34.42 
 
 		 642 aa  363  4e-99  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.217741  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_07215  ABC transporter ATP-binding protein  32.05 
 
 		 622 aa  363  6e-99  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1093  ABC transporter related  34.47 
 
 		 634 aa  358  9.999999999999999e-98  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0760  ABC transporter related  35.65 
 
 		 625 aa  357  5e-97  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0743  ABC transporter related  35.65 
 
 		 625 aa  357  5e-97  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0800  ABC transporter, ATP-binding protein  32.22 
 
 		 622 aa  353  5e-96  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00285677 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1278  ABC transporter ATPase  35.51 
 
 		 625 aa  350  4e-95  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.760109  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3020  ABC transporter-like  34.98 
 
 		 646 aa  349  6e-95  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.511953  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3547  ABC transporter-like protein protein  33.7 
 
 		 640 aa  349  7e-95  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0383  ABC transporter, ATP-binding protein  34.57 
 
 		 627 aa  348  2e-94  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.386036  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1225  ABC transporter, ATP-binding protein  34.36 
 
 		 623 aa  347  5e-94  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.701491 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1381  ATPase  37.19 
 
 		 641 aa  345  1e-93  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.981261  normal  0.290816 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0299  ABC transporter related  33.86 
 
 		 642 aa  345  2e-93  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0514  ATPase  35.31 
 
 		 633 aa  342  1e-92  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.11743  normal  0.506629 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4068  ABC transporter related  33.81 
 
 		 630 aa  340  5.9999999999999996e-92  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.000000802504  hitchhiker  0.000858095 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_12061  ABC transporter ATPase  36.25 
 
 		 644 aa  338  1.9999999999999998e-91  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.393632  normal  0.504812 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6107  ABC transporter related protein  39.93 
 
 		 653 aa  338  1.9999999999999998e-91  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0008  ABC transporter related  32.91 
 
 		 620 aa  337  2.9999999999999997e-91  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.925372  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_03991  ABC transporter ATP-binding protein  35.27 
 
 		 652 aa  337  3.9999999999999995e-91  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1340  ABC transporter, ATP-binding protein  34.78 
 
 		 622 aa  335  2e-90  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0950  ATPase  33.49 
 
 		 641 aa  335  2e-90  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.61977  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_18141  hypothetical protein  33.33 
 
 		 641 aa  333  8e-90  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.0376333  normal  0.70207 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1822  ATPase  34.54 
 
 		 631 aa  329  9e-89  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0462  ABC transporter ATPase  35.36 
 
 		 626 aa  328  1.0000000000000001e-88  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0238  putative ABC transporter ATP-binding protein  38.13 
 
 		 559 aa  326  8.000000000000001e-88  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.331867 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2197  putative ABC transporter ATP-binding protein  36.55 
 
 		 551 aa  323  5e-87  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0490  putative ABC transporter ATP-binding protein  35.32 
 
 		 551 aa  321  1.9999999999999998e-86  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.191061  normal  0.167217 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_4019  putative ABC transporter ATP-binding protein  35.8 
 
 		 561 aa  317  3e-85  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.186099 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2240  putative ABC transporter ATP-binding protein  35.32 
 
 		 551 aa  317  4e-85  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.497585 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>