More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Namu_4554 on replicon NC_013235
Organism: Nakamurella multipartita DSM 44233



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013235  Namu_4554  ABC transporter related  100 
 
 
617 aa  1201    Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0650  ABC transporter related  57.72 
 
 
590 aa  627  1e-178  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_32430  ATPase component of ABC transporters with duplicated ATPase domain protein  55.45 
 
 
600 aa  595  1e-169  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.775156  normal  0.436846 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0493  ABC transporter related protein  52.76 
 
 
602 aa  566  1e-160  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.518307  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0409  ABC transporter, ATP-binding subunit  53.09 
 
 
596 aa  565  1.0000000000000001e-159  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.722245  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0784  ABC transporter related  52.82 
 
 
598 aa  563  1.0000000000000001e-159  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2963  ABC transporter related  50.08 
 
 
600 aa  562  1.0000000000000001e-159  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.616286  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3007  ABC transporter related  50.08 
 
 
600 aa  562  1.0000000000000001e-159  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.333265  normal  0.911038 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3996  ABC transporter related protein  54.25 
 
 
592 aa  552  1e-156  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.181167 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8452  ABC transporter related  51.92 
 
 
608 aa  550  1e-155  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.030329  decreased coverage  0.00000193115 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0728  ABC transporter related  52.5 
 
 
598 aa  551  1e-155  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000999119 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0513  ABC transporter related protein  52.17 
 
 
592 aa  546  1e-154  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_03410  ATPase component of ABC transporters with duplicated ATPase domain  51.8 
 
 
628 aa  539  9.999999999999999e-153  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3959  ABC transporter related  52.56 
 
 
612 aa  539  9.999999999999999e-153  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.143764  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11685  macrolide ABC transporter ATP-binding protein  48.64 
 
 
591 aa  520  1e-146  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.819157 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1521  ABC transporter related protein  49.68 
 
 
601 aa  519  1e-146  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0493324  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3161  ABC transporter-like protein  50.98 
 
 
608 aa  519  1e-146  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.970833 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0865  ABC transporter related protein  52.01 
 
 
608 aa  515  1.0000000000000001e-145  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.380755  normal  0.901463 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0977  ABC transporter related  51.52 
 
 
616 aa  517  1.0000000000000001e-145  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.126442  hitchhiker  0.00329401 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3854  ABC transporter related  49.27 
 
 
611 aa  518  1.0000000000000001e-145  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.53962  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1285  ABC transporter related  47.6 
 
 
610 aa  513  1e-144  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000856042 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3302  ABC transporter-related protein  47 
 
 
606 aa  514  1e-144  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8616  ABC transporter ATP-binding protein  50.73 
 
 
602 aa  513  1e-144  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0772  ABC transporter related  50.86 
 
 
632 aa  515  1e-144  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.118352  normal  0.168546 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0990  ABC transporter related protein  51.31 
 
 
588 aa  510  1e-143  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3947  ABC transporter related protein  49.92 
 
 
601 aa  508  9.999999999999999e-143  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_05410  ATPase component of ABC transporters with duplicated ATPase domain  48.15 
 
 
613 aa  503  1e-141  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.0302406  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_30250  ATPase component of ABC transporters with duplicated ATPase domain  49.75 
 
 
572 aa  504  1e-141  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.24394 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3518  ABC transporter related  48.94 
 
 
587 aa  501  1e-140  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.284469  normal  0.409112 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1215  ABC transporter related  47.19 
 
 
608 aa  499  1e-140  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.207938  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2978  ABC transporter related  48.32 
 
 
596 aa  496  1e-139  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.013676  decreased coverage  0.00456661 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1950  ABC transporter related  47.6 
 
 
615 aa  493  9.999999999999999e-139  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.975434 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2722  ABC transporter related protein  46.95 
 
 
631 aa  482  1e-135  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1047  ABC transporter related  52.31 
 
 
606 aa  482  1e-135  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_15000  ATPase component of ABC transporters with duplicated ATPase domain  44.43 
 
 
600 aa  476  1e-133  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.0302703  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2744  ABC transporter related  43.82 
 
 
609 aa  478  1e-133  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0736  ABC transporter related  41.29 
 
 
630 aa  449  1e-125  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_08180  ATPase component of ABC transporters with duplicated ATPase domain protein  43.33 
 
 
632 aa  443  1e-123  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal  0.195035 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_13340  ATPase component of ABC transporters with duplicated ATPase domain  51.09 
 
 
630 aa  435  1e-120  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0691975  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3220  ABC transporter related  37.9 
 
 
653 aa  422  1e-117  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000221597  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3145  ABC transporter, ATP-binding protein  36.75 
 
 
631 aa  409  1.0000000000000001e-112  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.0000000568363  normal  0.0176571 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2173  ABC transporter, ATP-binding protein  36.6 
 
 
631 aa  408  1.0000000000000001e-112  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00208736  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1040  ABC transporter-related protein  37.13 
 
 
629 aa  408  1.0000000000000001e-112  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0768  ABC transporter related  36.57 
 
 
636 aa  408  1.0000000000000001e-112  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2190  ABC transporter, ATP-binding protein  36.5 
 
 
631 aa  402  1e-111  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.783831 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1571  ABC transporter related  37.42 
 
 
631 aa  402  1e-111  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.459004  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2000  ABC transporter related  36.35 
 
 
631 aa  404  1e-111  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.000123424  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2225  ABC transporter, ATP-binding protein  36.45 
 
 
631 aa  400  9.999999999999999e-111  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.0000195061  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1814  ABC transporter related  35.03 
 
 
639 aa  400  9.999999999999999e-111  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1982  ABC transporter, ATP-binding protein  36.29 
 
 
631 aa  400  9.999999999999999e-111  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000663544  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1964  ABC transporter, ATP-binding protein  36.29 
 
 
631 aa  400  9.999999999999999e-111  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0386922  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1447  ABC transporter related  37.5 
 
 
632 aa  401  9.999999999999999e-111  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2308  ABC transporter, ATP-binding protein  36.45 
 
 
631 aa  401  9.999999999999999e-111  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000184058  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1613  ABC transporter-related protein  37.21 
 
 
630 aa  397  1e-109  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.000050504  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0123  ABC transporter related  35.31 
 
 
643 aa  396  1e-109  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2010  ABC transporter ATP-binding protein  36.14 
 
 
631 aa  395  1e-108  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  unclonable  0.00000675061  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2164  ABC transporter ATP-binding protein  36.14 
 
 
631 aa  395  1e-108  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00326588  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_07215  ABC transporter ATP-binding protein  34.62 
 
 
622 aa  387  1e-106  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2312  ABC transporter related  34.84 
 
 
642 aa  383  1e-105  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_12061  ABC transporter ATPase  35.14 
 
 
644 aa  385  1e-105  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.393632  normal  0.504812 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2868  ABC transporter, ATP-binding protein  34.57 
 
 
642 aa  385  1e-105  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.914914  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1822  ATPase  38.69 
 
 
631 aa  382  1e-104  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0375  ATPase  37.33 
 
 
631 aa  380  1e-104  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1500  ABC transporter related  35.31 
 
 
630 aa  382  1e-104  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.384495  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2364  ABC transporter related  34.52 
 
 
642 aa  382  1e-104  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.217741  normal 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2553  ABC transporter ATPase  34.76 
 
 
642 aa  381  1e-104  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1008  Fis family transcriptional regulator  35.74 
 
 
629 aa  380  1e-104  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0514  ATPase  38.63 
 
 
633 aa  377  1e-103  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.11743  normal  0.506629 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3897  ABC transporter related  34.58 
 
 
613 aa  378  1e-103  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3020  ABC transporter-like  35.67 
 
 
646 aa  373  1e-102  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.511953  normal 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0950  ATPase  35.09 
 
 
641 aa  370  1e-101  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.61977  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4406  ABC transporter related protein  34.82 
 
 
630 aa  372  1e-101  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.336146  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1823  ABC transporter related  35.56 
 
 
632 aa  372  1e-101  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  decreased coverage  0.00644209  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0299  ABC transporter related  33.03 
 
 
642 aa  371  1e-101  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_03991  ABC transporter ATP-binding protein  37.11 
 
 
652 aa  371  1e-101  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0718  ABC transporter related  36.42 
 
 
626 aa  369  1e-100  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.332523  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4068  ABC transporter related  36.48 
 
 
630 aa  366  1e-100  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.000000802504  hitchhiker  0.000858095 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4996  ABC transporter related  32.67 
 
 
620 aa  367  1e-100  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_2115  ABC transporter related  32.67 
 
 
621 aa  367  1e-100  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.0255573  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_18141  hypothetical protein  34.78 
 
 
641 aa  363  4e-99  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.0376333  normal  0.70207 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3547  ABC transporter-like protein protein  34.55 
 
 
640 aa  363  4e-99  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0780  ATPase  37.07 
 
 
630 aa  362  1e-98  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.989868  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0800  ABC transporter, ATP-binding protein  33.07 
 
 
622 aa  362  2e-98  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00285677 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1278  ABC transporter ATPase  34.4 
 
 
625 aa  360  5e-98  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.760109  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1225  ABC transporter, ATP-binding protein  33.8 
 
 
623 aa  353  5e-96  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.701491 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0383  ABC transporter, ATP-binding protein  33.7 
 
 
627 aa  353  8e-96  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.386036  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1093  ABC transporter related  33.74 
 
 
634 aa  353  8e-96  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0743  ABC transporter related  33.91 
 
 
625 aa  352  2e-95  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0760  ABC transporter related  33.91 
 
 
625 aa  352  2e-95  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1340  ABC transporter, ATP-binding protein  39.27 
 
 
622 aa  350  4e-95  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1381  ATPase  37.6 
 
 
641 aa  347  3e-94  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.981261  normal  0.290816 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0008  ABC transporter related  31.02 
 
 
620 aa  338  9.999999999999999e-92  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.925372  normal 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0462  ABC transporter ATPase  38.43 
 
 
626 aa  338  9.999999999999999e-92  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1648  ABC transporter ATPase  34.51 
 
 
623 aa  330  7e-89  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1361  putative ABC transporter ATP-binding protein  37.22 
 
 
561 aa  329  8e-89  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000127735  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4119  putative ABC transporter ATP-binding protein  36.16 
 
 
555 aa  327  4.0000000000000003e-88  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_4019  putative ABC transporter ATP-binding protein  36.47 
 
 
561 aa  325  2e-87  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.186099 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3581  putative ABC transporter ATP-binding protein  36.97 
 
 
555 aa  323  5e-87  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.078032  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3681  putative ABC transporter ATP-binding protein  37.71 
 
 
553 aa  322  9.999999999999999e-87  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3595  putative ABC transporter ATP-binding protein  36.78 
 
 
555 aa  321  1.9999999999999998e-86  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.431194  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>