More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Jden_1950 on replicon NC_013174
Organism: Jonesia denitrificans DSM 20603



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013172  Bfae_13340  ATPase component of ABC transporters with duplicated ATPase domain  56.92 
 
 		 630 aa  691    Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0691975  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2978  ABC transporter related  65.21 
 
 		 596 aa  764    Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.013676  decreased coverage  0.00456661 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11685  macrolide ABC transporter ATP-binding protein  60.16 
 
 		 591 aa  728    Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.819157 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_30250  ATPase component of ABC transporters with duplicated ATPase domain  68.92 
 
 		 572 aa  776    Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.24394 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0865  ABC transporter related protein  59.02 
 
 		 608 aa  648    Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.380755  normal  0.901463 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_05410  ATPase component of ABC transporters with duplicated ATPase domain  56.49 
 
 		 613 aa  655    Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.0302406  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_15000  ATPase component of ABC transporters with duplicated ATPase domain  54.99 
 
 		 600 aa  650    Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.0302703  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0977  ABC transporter related  62.68 
 
 		 616 aa  711    Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.126442  hitchhiker  0.00329401 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1950  ABC transporter related  100 
 
 		 615 aa  1238    Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.975434 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1521  ABC transporter related protein  65.86 
 
 		 601 aa  783    Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0493324  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0736  ABC transporter related  51.02 
 
 		 630 aa  637    Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2722  ABC transporter related protein  65.56 
 
 		 631 aa  808    Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1285  ABC transporter related  60 
 
 		 610 aa  699    Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000856042 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1215  ABC transporter related  58.93 
 
 		 608 aa  672    Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.207938  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2744  ABC transporter related  56.51 
 
 		 609 aa  674    Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3302  ABC transporter-related protein  60.38 
 
 		 606 aa  736    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_08180  ATPase component of ABC transporters with duplicated ATPase domain protein  49.05 
 
 		 632 aa  587  1e-166  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  0.195035 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3854  ABC transporter related  52.29 
 
 		 611 aa  587  1e-166  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.53962  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0409  ABC transporter, ATP-binding subunit  51.62 
 
 		 596 aa  577  1.0000000000000001e-163  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.722245  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1047  ABC transporter related  54.85 
 
 		 606 aa  569  1e-161  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2963  ABC transporter related  49.51 
 
 		 600 aa  561  1e-158  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.616286  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3007  ABC transporter related  49.51 
 
 		 600 aa  561  1e-158  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.333265  normal  0.911038 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0513  ABC transporter related protein  51.29 
 
 		 592 aa  556  1e-157  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8452  ABC transporter related  50.72 
 
 		 608 aa  553  1e-156  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.030329  decreased coverage  0.00000193115 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3959  ABC transporter related  50.08 
 
 		 612 aa  554  1e-156  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.143764  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3996  ABC transporter related protein  52.12 
 
 		 592 aa  554  1e-156  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.181167 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3225  ABC transporter related protein  74.66 
 
 		 377 aa  551  1e-155  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.704476  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0784  ABC transporter related  52.09 
 
 		 598 aa  548  1e-154  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0990  ABC transporter related protein  51.14 
 
 		 588 aa  545  1e-153  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3161  ABC transporter-like protein  50.81 
 
 		 608 aa  542  1e-153  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.970833 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0772  ABC transporter related  49.92 
 
 		 632 aa  536  1e-151  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.118352  normal  0.168546 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_03410  ATPase component of ABC transporters with duplicated ATPase domain  50.41 
 
 		 628 aa  538  1e-151  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0728  ABC transporter related  51.26 
 
 		 598 aa  529  1e-149  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000999119 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3518  ABC transporter related  49.84 
 
 		 587 aa  526  1e-148  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.284469  normal  0.409112 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0650  ABC transporter related  48.86 
 
 		 590 aa  521  1e-146  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_32430  ATPase component of ABC transporters with duplicated ATPase domain protein  47.13 
 
 		 600 aa  513  1e-144  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.775156  normal  0.436846 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8616  ABC transporter ATP-binding protein  49.84 
 
 		 602 aa  512  1e-144  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3947  ABC transporter related protein  49.11 
 
 		 601 aa  515  1e-144  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0493  ABC transporter related protein  49.35 
 
 		 602 aa  506  9.999999999999999e-143  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.518307  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4554  ABC transporter related  47.6 
 
 		 617 aa  467  9.999999999999999e-131  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1046  ABC transporter ATPase  60.13 
 
 		 758 aa  372  1e-101  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1040  ABC transporter-related protein  34.78 
 
 		 629 aa  367  1e-100  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0338  ABC transporter, ATP-binding protein  58.47 
 
 		 704 aa  368  1e-100  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1447  ABC transporter related  35.96 
 
 		 632 aa  362  8e-99  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0780  ATPase  36.41 
 
 		 630 aa  361  2e-98  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.989868  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1500  ABC transporter related  34.62 
 
 		 630 aa  361  3e-98  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.384495  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2173  ABC transporter, ATP-binding protein  34.93 
 
 		 631 aa  354  2.9999999999999997e-96  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00208736  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3220  ABC transporter related  36.92 
 
 		 653 aa  353  5.9999999999999994e-96  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000221597  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3145  ABC transporter, ATP-binding protein  34.78 
 
 		 631 aa  352  1e-95  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.0000000568363  normal  0.0176571 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2000  ABC transporter related  34.31 
 
 		 631 aa  351  3e-95  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.000123424  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1008  Fis family transcriptional regulator  34.36 
 
 		 629 aa  348  1e-94  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1982  ABC transporter, ATP-binding protein  34.31 
 
 		 631 aa  348  2e-94  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000663544  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1964  ABC transporter, ATP-binding protein  34.31 
 
 		 631 aa  348  2e-94  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0386922  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2308  ABC transporter, ATP-binding protein  34.31 
 
 		 631 aa  348  2e-94  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000184058  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2225  ABC transporter, ATP-binding protein  34.31 
 
 		 631 aa  346  6e-94  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.0000195061  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1823  ABC transporter related  34 
 
 		 632 aa  345  1e-93  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  decreased coverage  0.00644209  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2190  ABC transporter, ATP-binding protein  33.85 
 
 		 631 aa  343  5.999999999999999e-93  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.783831 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2010  ABC transporter ATP-binding protein  34 
 
 		 631 aa  342  2e-92  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  unclonable  0.00000675061  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2164  ABC transporter ATP-binding protein  34 
 
 		 631 aa  342  2e-92  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00326588  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1814  ABC transporter related  37.64 
 
 		 639 aa  339  9e-92  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1613  ABC transporter-related protein  37.9 
 
 		 630 aa  339  9e-92  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.000050504  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_2115  ABC transporter related  32.2 
 
 		 621 aa  339  9.999999999999999e-92  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.0255573  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0375  ATPase  34.5 
 
 		 631 aa  336  5.999999999999999e-91  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2364  ABC transporter related  33.02 
 
 		 642 aa  333  5e-90  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.217741  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_07215  ABC transporter ATP-binding protein  32.24 
 
 		 622 aa  333  6e-90  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0768  ABC transporter related  32 
 
 		 636 aa  332  1e-89  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2312  ABC transporter related  32.92 
 
 		 642 aa  332  1e-89  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3897  ABC transporter related  34.35 
 
 		 613 aa  331  2e-89  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1571  ABC transporter related  32.52 
 
 		 631 aa  328  1.0000000000000001e-88  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.459004  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2553  ABC transporter ATPase  33.54 
 
 		 642 aa  327  6e-88  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2868  ABC transporter, ATP-binding protein  33.39 
 
 		 642 aa  325  1e-87  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.914914  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4068  ABC transporter related  32.97 
 
 		 630 aa  325  1e-87  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.000000802504  hitchhiker  0.000858095 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0123  ABC transporter related  32.36 
 
 		 643 aa  324  2e-87  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1381  ATPase  34.19 
 
 		 641 aa  324  3e-87  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.981261  normal  0.290816 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0299  ABC transporter related  32.23 
 
 		 642 aa  322  9.000000000000001e-87  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3020  ABC transporter-like  32.57 
 
 		 646 aa  319  7.999999999999999e-86  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.511953  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4996  ABC transporter related  30.96 
 
 		 620 aa  318  1e-85  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4406  ABC transporter related protein  34.56 
 
 		 630 aa  314  2.9999999999999996e-84  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.336146  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0718  ABC transporter related  32.05 
 
 		 626 aa  314  2.9999999999999996e-84  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.332523  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3547  ABC transporter-like protein protein  31.36 
 
 		 640 aa  311  2e-83  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0743  ABC transporter related  32.77 
 
 		 625 aa  311  2e-83  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0760  ABC transporter related  32.77 
 
 		 625 aa  311  2e-83  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1278  ABC transporter ATPase  32.92 
 
 		 625 aa  305  2.0000000000000002e-81  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.760109  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_18141  hypothetical protein  30.46 
 
 		 641 aa  304  3.0000000000000004e-81  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.0376333  normal  0.70207 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0950  ATPase  30.67 
 
 		 641 aa  304  4.0000000000000003e-81  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.61977  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1225  ABC transporter, ATP-binding protein  31.64 
 
 		 623 aa  300  5e-80  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.701491 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_12061  ABC transporter ATPase  30.33 
 
 		 644 aa  300  6e-80  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.393632  normal  0.504812 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0800  ABC transporter, ATP-binding protein  33.83 
 
 		 622 aa  298  1e-79  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00285677 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0008  ABC transporter related  32.45 
 
 		 620 aa  298  2e-79  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.925372  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1093  ABC transporter related  30.37 
 
 		 634 aa  296  5e-79  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0514  ATPase  32.02 
 
 		 633 aa  289  1e-76  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.11743  normal  0.506629 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_03991  ABC transporter ATP-binding protein  32.58 
 
 		 652 aa  289  1e-76  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0383  ABC transporter, ATP-binding protein  31.15 
 
 		 627 aa  288  2e-76  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.386036  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1262  ABC transporter, ATPase subunit  30.71 
 
 		 598 aa  284  3.0000000000000004e-75  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1822  ATPase  31.06 
 
 		 631 aa  281  2e-74  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2430  putative ABC transporter ATP-binding protein  35.7 
 
 		 595 aa  280  6e-74  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1895  ABC transporter related  36.3 
 
 		 656 aa  278  1e-73  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.438014  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0462  ABC transporter ATPase  32.36 
 
 		 626 aa  279  1e-73  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0889  putative ABC transporter ATP-binding protein  33.91 
 
 		 554 aa  277  4e-73  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2061  ABC transporter, ATPase subunit  36.3 
 
 		 654 aa  275  1.0000000000000001e-72  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>