More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Amir_0650 on replicon NC_013093
Organism: Actinosynnema mirum DSM 43827



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007333  Tfu_0409  ABC transporter, ATP-binding subunit  60.44 
 
 
596 aa  655    Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.722245  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0493  ABC transporter related protein  61.98 
 
 
602 aa  663    Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.518307  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_32430  ATPase component of ABC transporters with duplicated ATPase domain protein  73.8 
 
 
600 aa  806    Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.775156  normal  0.436846 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0650  ABC transporter related  100 
 
 
590 aa  1152    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0784  ABC transporter related  60.77 
 
 
598 aa  641    Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3996  ABC transporter related protein  61.05 
 
 
592 aa  643    Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.181167 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0728  ABC transporter related  60.57 
 
 
598 aa  629  1e-179  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000999119 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0513  ABC transporter related protein  58.42 
 
 
592 aa  625  1e-178  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0990  ABC transporter related protein  61.46 
 
 
588 aa  622  1e-177  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3959  ABC transporter related  58.4 
 
 
612 aa  615  1e-175  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.143764  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3161  ABC transporter-like protein  58.92 
 
 
608 aa  616  1e-175  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.970833 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3854  ABC transporter related  55.81 
 
 
611 aa  611  9.999999999999999e-175  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.53962  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8452  ABC transporter related  54.88 
 
 
608 aa  595  1e-169  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.030329  decreased coverage  0.00000193115 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0772  ABC transporter related  56.04 
 
 
632 aa  591  1e-167  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.118352  normal  0.168546 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8616  ABC transporter ATP-binding protein  57.48 
 
 
602 aa  589  1e-167  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4554  ABC transporter related  57.89 
 
 
617 aa  583  1.0000000000000001e-165  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0865  ABC transporter related protein  57.1 
 
 
608 aa  573  1.0000000000000001e-162  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.380755  normal  0.901463 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2963  ABC transporter related  53.21 
 
 
600 aa  573  1.0000000000000001e-162  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.616286  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3007  ABC transporter related  53.21 
 
 
600 aa  573  1.0000000000000001e-162  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.333265  normal  0.911038 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3947  ABC transporter related protein  56.86 
 
 
601 aa  574  1.0000000000000001e-162  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_03410  ATPase component of ABC transporters with duplicated ATPase domain  53.02 
 
 
628 aa  563  1.0000000000000001e-159  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_05410  ATPase component of ABC transporters with duplicated ATPase domain  50.65 
 
 
613 aa  542  1e-153  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.0302406  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3518  ABC transporter related  54.15 
 
 
587 aa  536  1e-151  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.284469  normal  0.409112 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1047  ABC transporter related  57.54 
 
 
606 aa  536  1e-151  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1285  ABC transporter related  49.75 
 
 
610 aa  533  1e-150  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000856042 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1521  ABC transporter related protein  50.33 
 
 
601 aa  518  1.0000000000000001e-145  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0493324  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1950  ABC transporter related  49.03 
 
 
615 aa  516  1.0000000000000001e-145  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.975434 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1215  ABC transporter related  49.57 
 
 
608 aa  511  1e-143  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.207938  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2744  ABC transporter related  46.82 
 
 
609 aa  496  1e-139  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2978  ABC transporter related  49.58 
 
 
596 aa  492  9.999999999999999e-139  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.013676  decreased coverage  0.00456661 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11685  macrolide ABC transporter ATP-binding protein  48.5 
 
 
591 aa  489  1e-137  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.819157 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_15000  ATPase component of ABC transporters with duplicated ATPase domain  46.59 
 
 
600 aa  489  1e-137  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.0302703  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_30250  ATPase component of ABC transporters with duplicated ATPase domain  49.83 
 
 
572 aa  492  1e-137  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.24394 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2722  ABC transporter related protein  44.97 
 
 
631 aa  476  1e-133  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_13340  ATPase component of ABC transporters with duplicated ATPase domain  44.87 
 
 
630 aa  469  1.0000000000000001e-131  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0691975  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0977  ABC transporter related  49.52 
 
 
616 aa  471  1.0000000000000001e-131  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.126442  hitchhiker  0.00329401 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3302  ABC transporter-related protein  45.78 
 
 
606 aa  467  9.999999999999999e-131  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0736  ABC transporter related  40.51 
 
 
630 aa  424  1e-117  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_08180  ATPase component of ABC transporters with duplicated ATPase domain protein  41.15 
 
 
632 aa  419  1e-116  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal  0.195035 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1040  ABC transporter-related protein  37.96 
 
 
629 aa  417  9.999999999999999e-116  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2308  ABC transporter, ATP-binding protein  38.61 
 
 
631 aa  415  1e-114  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000184058  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1613  ABC transporter-related protein  40.06 
 
 
630 aa  412  1e-114  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.000050504  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2225  ABC transporter, ATP-binding protein  38.61 
 
 
631 aa  413  1e-114  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.0000195061  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2000  ABC transporter related  38.29 
 
 
631 aa  414  1e-114  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.000123424  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1982  ABC transporter, ATP-binding protein  38.45 
 
 
631 aa  414  1e-114  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000663544  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1964  ABC transporter, ATP-binding protein  38.45 
 
 
631 aa  414  1e-114  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0386922  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2173  ABC transporter, ATP-binding protein  38.61 
 
 
631 aa  414  1e-114  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00208736  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3145  ABC transporter, ATP-binding protein  38.77 
 
 
631 aa  414  1e-114  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.0000000568363  normal  0.0176571 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2010  ABC transporter ATP-binding protein  38.45 
 
 
631 aa  410  1e-113  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  unclonable  0.00000675061  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1814  ABC transporter related  36.44 
 
 
639 aa  409  1e-113  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2164  ABC transporter ATP-binding protein  38.45 
 
 
631 aa  410  1e-113  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00326588  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2190  ABC transporter, ATP-binding protein  38.29 
 
 
631 aa  410  1e-113  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.783831 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3220  ABC transporter related  37.87 
 
 
653 aa  403  1e-111  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000221597  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2553  ABC transporter ATPase  36.75 
 
 
642 aa  404  1e-111  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2868  ABC transporter, ATP-binding protein  36.75 
 
 
642 aa  401  9.999999999999999e-111  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.914914  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1447  ABC transporter related  37.6 
 
 
632 aa  395  1e-109  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0768  ABC transporter related  35.14 
 
 
636 aa  391  1e-107  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1571  ABC transporter related  37.34 
 
 
631 aa  391  1e-107  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.459004  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0123  ABC transporter related  35.74 
 
 
643 aa  389  1e-106  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1500  ABC transporter related  36.78 
 
 
630 aa  384  1e-105  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.384495  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0375  ATPase  37.66 
 
 
631 aa  382  1e-105  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1008  Fis family transcriptional regulator  36.29 
 
 
629 aa  384  1e-105  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_07215  ABC transporter ATP-binding protein  33.7 
 
 
622 aa  382  1e-104  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0780  ATPase  37.88 
 
 
630 aa  382  1e-104  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.989868  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3897  ABC transporter related  36.24 
 
 
613 aa  382  1e-104  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4406  ABC transporter related protein  35.82 
 
 
630 aa  378  1e-103  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.336146  normal 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_12061  ABC transporter ATPase  34.46 
 
 
644 aa  377  1e-103  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.393632  normal  0.504812 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1823  ABC transporter related  35.17 
 
 
632 aa  374  1e-102  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  decreased coverage  0.00644209  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0718  ABC transporter related  36.1 
 
 
626 aa  370  1e-101  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.332523  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4068  ABC transporter related  35.7 
 
 
630 aa  372  1e-101  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.000000802504  hitchhiker  0.000858095 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1822  ATPase  37.58 
 
 
631 aa  370  1e-101  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_2115  ABC transporter related  33.6 
 
 
621 aa  370  1e-101  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.0255573  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0950  ATPase  35.19 
 
 
641 aa  360  3e-98  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.61977  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_18141  hypothetical protein  35.04 
 
 
641 aa  360  4e-98  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.0376333  normal  0.70207 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0514  ATPase  36.99 
 
 
633 aa  360  5e-98  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.11743  normal  0.506629 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0299  ABC transporter related  32.61 
 
 
642 aa  359  8e-98  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4996  ABC transporter related  31.67 
 
 
620 aa  357  3.9999999999999996e-97  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_03991  ABC transporter ATP-binding protein  35.56 
 
 
652 aa  355  8.999999999999999e-97  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1340  ABC transporter, ATP-binding protein  34.05 
 
 
622 aa  354  2e-96  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1381  ATPase  37.58 
 
 
641 aa  354  2e-96  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.981261  normal  0.290816 
 
 
-
 
NC_002950  PG1225  ABC transporter, ATP-binding protein  33.12 
 
 
623 aa  350  3e-95  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.701491 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2312  ABC transporter related  32.45 
 
 
642 aa  350  4e-95  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2364  ABC transporter related  31.98 
 
 
642 aa  347  5e-94  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.217741  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3225  ABC transporter related protein  50.54 
 
 
377 aa  343  4e-93  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.704476  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0743  ABC transporter related  34 
 
 
625 aa  343  5.999999999999999e-93  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0760  ABC transporter related  34 
 
 
625 aa  343  5.999999999999999e-93  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0800  ABC transporter, ATP-binding protein  31.54 
 
 
622 aa  343  5.999999999999999e-93  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00285677 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1278  ABC transporter ATPase  33.12 
 
 
625 aa  342  1e-92  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.760109  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3020  ABC transporter-like  33.23 
 
 
646 aa  341  2.9999999999999998e-92  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.511953  normal 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0383  ABC transporter, ATP-binding protein  33.55 
 
 
627 aa  338  9.999999999999999e-92  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.386036  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0008  ABC transporter related  32.48 
 
 
620 aa  338  1.9999999999999998e-91  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.925372  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3547  ABC transporter-like protein protein  32.04 
 
 
640 aa  332  2e-89  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1093  ABC transporter related  31.39 
 
 
634 aa  330  4e-89  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0462  ABC transporter ATPase  34.26 
 
 
626 aa  328  2.0000000000000001e-88  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6107  ABC transporter related protein  38.09 
 
 
653 aa  327  4.0000000000000003e-88  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1262  ABC transporter, ATPase subunit  33.28 
 
 
598 aa  327  5e-88  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009357  OSTLU_30493  ABC(ATP-binding) family transporter  32.4 
 
 
723 aa  322  9.999999999999999e-87  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal  0.658611 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0928  ABC transporter related  34.69 
 
 
633 aa  322  1.9999999999999998e-86  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.11608e-27 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3318  ABC transporter related protein  34.49 
 
 
632 aa  321  1.9999999999999998e-86  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1644  putative ABC transporter ATP-binding protein  35.93 
 
 
559 aa  321  3e-86  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>