More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shel_15000 on replicon NC_013165
Organism: Slackia heliotrinireducens DSM 20476



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013530  Xcel_2722  ABC transporter related protein  53.9 
 
 		 631 aa  635    Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2744  ABC transporter related  60.4 
 
 		 609 aa  734    Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0736  ABC transporter related  52.68 
 
 		 630 aa  657    Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_15000  ATPase component of ABC transporters with duplicated ATPase domain  100 
 
 		 600 aa  1215    Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.0302703  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11685  macrolide ABC transporter ATP-binding protein  54.5 
 
 		 591 aa  631  1e-179  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.819157 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_08180  ATPase component of ABC transporters with duplicated ATPase domain protein  52.22 
 
 		 632 aa  627  1e-178  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  0.195035 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3302  ABC transporter-related protein  53.59 
 
 		 606 aa  627  1e-178  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1521  ABC transporter related protein  54.82 
 
 		 601 aa  622  1e-177  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0493324  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2978  ABC transporter related  54.01 
 
 		 596 aa  611  1e-173  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.013676  decreased coverage  0.00456661 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1950  ABC transporter related  53.92 
 
 		 615 aa  606  9.999999999999999e-173  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.975434 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_30250  ATPase component of ABC transporters with duplicated ATPase domain  55.06 
 
 		 572 aa  597  1e-169  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.24394 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0977  ABC transporter related  52.2 
 
 		 616 aa  567  1e-160  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.126442  hitchhiker  0.00329401 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1285  ABC transporter related  49.92 
 
 		 610 aa  555  1e-157  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000856042 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_13340  ATPase component of ABC transporters with duplicated ATPase domain  48.48 
 
 		 630 aa  556  1e-157  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0691975  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1215  ABC transporter related  49.83 
 
 		 608 aa  548  1e-154  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.207938  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_05410  ATPase component of ABC transporters with duplicated ATPase domain  49.09 
 
 		 613 aa  534  1e-150  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.0302406  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0865  ABC transporter related protein  49.92 
 
 		 608 aa  509  1e-143  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.380755  normal  0.901463 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0409  ABC transporter, ATP-binding subunit  47.19 
 
 		 596 aa  506  9.999999999999999e-143  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.722245  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3854  ABC transporter related  46.52 
 
 		 611 aa  506  9.999999999999999e-143  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.53962  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0990  ABC transporter related protein  47.67 
 
 		 588 aa  493  9.999999999999999e-139  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3959  ABC transporter related  46.24 
 
 		 612 aa  493  9.999999999999999e-139  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.143764  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3161  ABC transporter-like protein  48.03 
 
 		 608 aa  494  9.999999999999999e-139  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.970833 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2963  ABC transporter related  45.77 
 
 		 600 aa  486  1e-136  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.616286  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3007  ABC transporter related  45.77 
 
 		 600 aa  486  1e-136  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.333265  normal  0.911038 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_32430  ATPase component of ABC transporters with duplicated ATPase domain protein  48.36 
 
 		 600 aa  483  1e-135  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.775156  normal  0.436846 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0784  ABC transporter related  48.24 
 
 		 598 aa  483  1e-135  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1047  ABC transporter related  48.67 
 
 		 606 aa  484  1e-135  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_03410  ATPase component of ABC transporters with duplicated ATPase domain  51.29 
 
 		 628 aa  479  1e-134  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3996  ABC transporter related protein  46.5 
 
 		 592 aa  476  1e-133  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.181167 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8452  ABC transporter related  45.16 
 
 		 608 aa  473  1e-132  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.030329  decreased coverage  0.00000193115 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8616  ABC transporter ATP-binding protein  47.12 
 
 		 602 aa  472  1e-132  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0513  ABC transporter related protein  45.42 
 
 		 592 aa  471  1.0000000000000001e-131  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0650  ABC transporter related  46.26 
 
 		 590 aa  468  9.999999999999999e-131  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0728  ABC transporter related  47.56 
 
 		 598 aa  464  1e-129  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000999119 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3518  ABC transporter related  47.42 
 
 		 587 aa  457  1e-127  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.284469  normal  0.409112 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0772  ABC transporter related  42.99 
 
 		 632 aa  452  1.0000000000000001e-126  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.118352  normal  0.168546 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0493  ABC transporter related protein  45.3 
 
 		 602 aa  451  1e-125  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.518307  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3225  ABC transporter related protein  61.94 
 
 		 377 aa  451  1e-125  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.704476  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3947  ABC transporter related protein  45.58 
 
 		 601 aa  438  1e-121  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4554  ABC transporter related  44.21 
 
 		 617 aa  422  1e-116  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0338  ABC transporter, ATP-binding protein  63.25 
 
 		 704 aa  384  1e-105  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1046  ABC transporter ATPase  65.74 
 
 		 758 aa  382  1e-104  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1040  ABC transporter-related protein  37.29 
 
 		 629 aa  363  4e-99  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1500  ABC transporter related  35.51 
 
 		 630 aa  361  3e-98  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.384495  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0768  ABC transporter related  35.25 
 
 		 636 aa  356  5.999999999999999e-97  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1447  ABC transporter related  35.97 
 
 		 632 aa  354  2e-96  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0780  ATPase  35.95 
 
 		 630 aa  351  2e-95  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.989868  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2364  ABC transporter related  33.18 
 
 		 642 aa  348  2e-94  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.217741  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1823  ABC transporter related  35.11 
 
 		 632 aa  347  4e-94  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  decreased coverage  0.00644209  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2308  ABC transporter, ATP-binding protein  38.01 
 
 		 631 aa  344  2.9999999999999997e-93  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000184058  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2312  ABC transporter related  33.33 
 
 		 642 aa  344  2.9999999999999997e-93  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2225  ABC transporter, ATP-binding protein  38.01 
 
 		 631 aa  343  5e-93  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.0000195061  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1008  Fis family transcriptional regulator  35.16 
 
 		 629 aa  343  7e-93  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1982  ABC transporter, ATP-binding protein  37.83 
 
 		 631 aa  342  8e-93  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000663544  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1964  ABC transporter, ATP-binding protein  37.83 
 
 		 631 aa  342  8e-93  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0386922  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2010  ABC transporter ATP-binding protein  37.64 
 
 		 631 aa  342  1e-92  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  unclonable  0.00000675061  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2164  ABC transporter ATP-binding protein  37.64 
 
 		 631 aa  342  1e-92  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00326588  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2173  ABC transporter, ATP-binding protein  38.01 
 
 		 631 aa  342  1e-92  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00208736  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2190  ABC transporter, ATP-binding protein  37.83 
 
 		 631 aa  341  2e-92  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.783831 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2000  ABC transporter related  37.83 
 
 		 631 aa  341  2e-92  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.000123424  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3145  ABC transporter, ATP-binding protein  38.01 
 
 		 631 aa  340  5e-92  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.0000000568363  normal  0.0176571 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_07215  ABC transporter ATP-binding protein  33.02 
 
 		 622 aa  337  3.9999999999999995e-91  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1571  ABC transporter related  34.84 
 
 		 631 aa  337  3.9999999999999995e-91  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.459004  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1613  ABC transporter-related protein  37.9 
 
 		 630 aa  335  1e-90  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.000050504  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3220  ABC transporter related  37.6 
 
 		 653 aa  333  4e-90  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000221597  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3020  ABC transporter-like  32.71 
 
 		 646 aa  332  1e-89  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.511953  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1814  ABC transporter related  36.06 
 
 		 639 aa  331  3e-89  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0299  ABC transporter related  31.37 
 
 		 642 aa  330  6e-89  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3547  ABC transporter-like protein protein  33.7 
 
 		 640 aa  328  2.0000000000000001e-88  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4406  ABC transporter related protein  35.1 
 
 		 630 aa  323  4e-87  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.336146  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0375  ATPase  34.53 
 
 		 631 aa  321  1.9999999999999998e-86  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0718  ABC transporter related  33.75 
 
 		 626 aa  321  1.9999999999999998e-86  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.332523  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1278  ABC transporter ATPase  34.65 
 
 		 625 aa  322  1.9999999999999998e-86  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.760109  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2553  ABC transporter ATPase  34.69 
 
 		 642 aa  317  5e-85  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2868  ABC transporter, ATP-binding protein  34.5 
 
 		 642 aa  315  1.9999999999999998e-84  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.914914  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_2115  ABC transporter related  32.57 
 
 		 621 aa  312  9e-84  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.0255573  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3897  ABC transporter related  35.37 
 
 		 613 aa  311  2e-83  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_03991  ABC transporter ATP-binding protein  31.16 
 
 		 652 aa  305  2.0000000000000002e-81  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_12061  ABC transporter ATPase  30.78 
 
 		 644 aa  304  3.0000000000000004e-81  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.393632  normal  0.504812 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_18141  hypothetical protein  32.46 
 
 		 641 aa  302  1e-80  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.0376333  normal  0.70207 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0383  ABC transporter, ATP-binding protein  32.28 
 
 		 627 aa  301  2e-80  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.386036  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4996  ABC transporter related  32.63 
 
 		 620 aa  301  3e-80  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0514  ATPase  32.45 
 
 		 633 aa  301  3e-80  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.11743  normal  0.506629 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0950  ATPase  32.3 
 
 		 641 aa  300  5e-80  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.61977  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0123  ABC transporter related  34.82 
 
 		 643 aa  300  6e-80  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1093  ABC transporter related  30.75 
 
 		 634 aa  298  2e-79  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1822  ATPase  31.29 
 
 		 631 aa  298  2e-79  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4068  ABC transporter related  34.88 
 
 		 630 aa  298  2e-79  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.000000802504  hitchhiker  0.000858095 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0743  ABC transporter related  32.65 
 
 		 625 aa  298  2e-79  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0760  ABC transporter related  32.65 
 
 		 625 aa  298  2e-79  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6107  ABC transporter related protein  34.7 
 
 		 653 aa  296  6e-79  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0008  ABC transporter related  30.6 
 
 		 620 aa  292  1e-77  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.925372  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2171  putative ABC transporter ATP-binding protein  35.66 
 
 		 553 aa  287  2.9999999999999996e-76  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3221  putative ABC transporter ATP-binding protein  34.75 
 
 		 589 aa  285  1.0000000000000001e-75  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2810  putative ABC transporter ATP-binding protein  35.52 
 
 		 555 aa  285  2.0000000000000002e-75  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.923334 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1381  ATPase  34.6 
 
 		 641 aa  285  2.0000000000000002e-75  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.981261  normal  0.290816 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3159  putative ABC transporter ATP-binding protein  35.33 
 
 		 555 aa  285  2.0000000000000002e-75  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000146292 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2903  putative ABC transporter ATP-binding protein  34.11 
 
 		 553 aa  283  4.0000000000000003e-75  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0207119 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2913  putative ABC transporter ATP-binding protein  35.52 
 
 		 555 aa  283  8.000000000000001e-75  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.010089  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3681  putative ABC transporter ATP-binding protein  35.47 
 
 		 553 aa  281  2e-74  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>