More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dfer_4068 on replicon NC_013037
Organism: Dyadobacter fermentans DSM 18053



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013061  Phep_0008  ABC transporter related  49.92 
 
 
620 aa  644    Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.925372  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4068  ABC transporter related  100 
 
 
630 aa  1293    Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.000000802504  hitchhiker  0.000858095 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_2115  ABC transporter related  49.84 
 
 
621 aa  647    Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.0255573  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1093  ABC transporter related  51.88 
 
 
634 aa  658    Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4406  ABC transporter related protein  60.09 
 
 
630 aa  786    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.336146  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_07215  ABC transporter ATP-binding protein  51.66 
 
 
622 aa  674    Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4996  ABC transporter related  49.13 
 
 
620 aa  622  1e-177  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0800  ABC transporter, ATP-binding protein  47.63 
 
 
622 aa  610  1e-173  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00285677 
 
 
-
 
NC_002950  PG1225  ABC transporter, ATP-binding protein  47.14 
 
 
623 aa  590  1e-167  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.701491 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2364  ABC transporter related  44.77 
 
 
642 aa  558  1e-158  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.217741  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2312  ABC transporter related  44.31 
 
 
642 aa  543  1e-153  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0299  ABC transporter related  43.41 
 
 
642 aa  540  9.999999999999999e-153  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1040  ABC transporter-related protein  44.76 
 
 
629 aa  534  1e-150  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3220  ABC transporter related  44.75 
 
 
653 aa  535  1e-150  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000221597  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1814  ABC transporter related  45.29 
 
 
639 aa  534  1e-150  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1982  ABC transporter, ATP-binding protein  44.84 
 
 
631 aa  529  1e-149  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000663544  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1964  ABC transporter, ATP-binding protein  44.84 
 
 
631 aa  529  1e-149  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0386922  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2308  ABC transporter, ATP-binding protein  45 
 
 
631 aa  530  1e-149  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000184058  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2000  ABC transporter related  45.03 
 
 
631 aa  530  1e-149  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.000123424  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1613  ABC transporter-related protein  45.5 
 
 
630 aa  530  1e-149  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.000050504  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2225  ABC transporter, ATP-binding protein  45 
 
 
631 aa  527  1e-148  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.0000195061  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1447  ABC transporter related  45.2 
 
 
632 aa  525  1e-148  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2190  ABC transporter, ATP-binding protein  44.84 
 
 
631 aa  526  1e-148  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.783831 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2010  ABC transporter ATP-binding protein  44.69 
 
 
631 aa  524  1e-147  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  unclonable  0.00000675061  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2164  ABC transporter ATP-binding protein  44.69 
 
 
631 aa  524  1e-147  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00326588  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0123  ABC transporter related  45.88 
 
 
643 aa  525  1e-147  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1571  ABC transporter related  43.01 
 
 
631 aa  520  1e-146  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.459004  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2173  ABC transporter, ATP-binding protein  44.38 
 
 
631 aa  520  1e-146  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00208736  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3145  ABC transporter, ATP-binding protein  44.53 
 
 
631 aa  521  1e-146  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.0000000568363  normal  0.0176571 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1500  ABC transporter related  43.32 
 
 
630 aa  518  1.0000000000000001e-145  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.384495  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0718  ABC transporter related  43.44 
 
 
626 aa  516  1.0000000000000001e-145  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.332523  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1008  Fis family transcriptional regulator  43.79 
 
 
629 aa  514  1e-144  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3020  ABC transporter-like  43.43 
 
 
646 aa  509  1e-143  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.511953  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3547  ABC transporter-like protein protein  43.43 
 
 
640 aa  509  1e-143  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1823  ABC transporter related  43.3 
 
 
632 aa  504  1e-141  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  decreased coverage  0.00644209  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2868  ABC transporter, ATP-binding protein  43.81 
 
 
642 aa  503  1e-141  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.914914  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2553  ABC transporter ATPase  43.72 
 
 
642 aa  503  1e-141  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0375  ATPase  43.72 
 
 
631 aa  499  1e-140  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0780  ATPase  43.17 
 
 
630 aa  496  1e-139  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.989868  normal 
 
 
-
 
NC_009357  OSTLU_30493  ABC(ATP-binding) family transporter  46.44 
 
 
723 aa  496  1e-139  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal  0.658611 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1381  ATPase  42.72 
 
 
641 aa  490  1e-137  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.981261  normal  0.290816 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0768  ABC transporter related  40.66 
 
 
636 aa  483  1e-135  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3897  ABC transporter related  40.91 
 
 
613 aa  474  1e-132  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1278  ABC transporter ATPase  41.29 
 
 
625 aa  469  1.0000000000000001e-131  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.760109  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1340  ABC transporter, ATP-binding protein  41.57 
 
 
622 aa  461  9.999999999999999e-129  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0514  ATPase  40.34 
 
 
633 aa  456  1e-127  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.11743  normal  0.506629 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_03991  ABC transporter ATP-binding protein  40.43 
 
 
652 aa  457  1e-127  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0462  ABC transporter ATPase  42.01 
 
 
626 aa  452  1e-125  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_12061  ABC transporter ATPase  39.69 
 
 
644 aa  446  1.0000000000000001e-124  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.393632  normal  0.504812 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0950  ATPase  38.76 
 
 
641 aa  443  1e-123  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.61977  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_18141  hypothetical protein  38.29 
 
 
641 aa  445  1e-123  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.0376333  normal  0.70207 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1822  ATPase  39.35 
 
 
631 aa  441  9.999999999999999e-123  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0760  ABC transporter related  38.59 
 
 
625 aa  441  9.999999999999999e-123  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0743  ABC transporter related  38.59 
 
 
625 aa  441  9.999999999999999e-123  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1648  ABC transporter ATPase  41.97 
 
 
623 aa  435  1e-120  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011697  PHATRDRAFT_41351  predicted protein  37.41 
 
 
679 aa  428  1e-118  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0383  ABC transporter, ATP-binding protein  36.31 
 
 
627 aa  421  1e-116  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.386036  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2479  ABC transporter-related protein  38.55 
 
 
634 aa  412  1e-114  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0549886  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3285  ABC transporter related  38.28 
 
 
636 aa  409  1e-113  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.000000124669  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0928  ABC transporter related  37.95 
 
 
633 aa  408  1.0000000000000001e-112  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.11608e-27 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3318  ABC transporter related protein  38.03 
 
 
632 aa  408  1.0000000000000001e-112  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0660  ABC transporter related  37.16 
 
 
626 aa  408  1.0000000000000001e-112  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.14515  normal  0.023928 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2197  putative ABC transporter ATP-binding protein  40.08 
 
 
551 aa  399  1e-109  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3007  ABC transporter related  35.64 
 
 
600 aa  394  1e-108  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.333265  normal  0.911038 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2963  ABC transporter related  35.64 
 
 
600 aa  394  1e-108  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.616286  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2441  putative ABC transporter ATP-binding protein  38.7 
 
 
558 aa  391  1e-107  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00204105  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0758  putative ABC transporter ATP-binding protein  38.29 
 
 
557 aa  387  1e-106  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0568  ABC transporter related protein  34.58 
 
 
632 aa  387  1e-106  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_4019  putative ABC transporter ATP-binding protein  38.43 
 
 
561 aa  388  1e-106  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.186099 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0740  putative ABC transporter ATP-binding protein  38.1 
 
 
557 aa  384  1e-105  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6107  ABC transporter related protein  38.61 
 
 
653 aa  382  1e-105  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0762  putative ABC transporter ATP-binding protein  39.6 
 
 
555 aa  384  1e-105  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2061  ABC transporter, ATPase subunit  37.44 
 
 
654 aa  384  1e-105  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3627  putative ABC transporter ATP-binding protein  39.42 
 
 
551 aa  385  1e-105  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.108497 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1895  ABC transporter related  36.99 
 
 
656 aa  384  1e-105  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.438014  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2881  putative ABC transporter ATP-binding protein  39.44 
 
 
555 aa  379  1e-104  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.41932  normal  0.0832413 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2991  putative ABC transporter ATP-binding protein  38.66 
 
 
559 aa  379  1e-104  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.187094  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2913  putative ABC transporter ATP-binding protein  39.44 
 
 
555 aa  380  1e-104  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.010089  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4510  putative ABC transporter ATP-binding protein  39.23 
 
 
555 aa  379  1e-104  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.29936  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0661  putative ABC transporter ATP-binding protein  39.08 
 
 
560 aa  379  1e-104  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0513  ABC transporter related protein  35.36 
 
 
592 aa  379  1e-104  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2279  ABC transporter related  37.13 
 
 
649 aa  380  1e-104  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0587  putative ABC transporter ATP-binding protein  40.39 
 
 
551 aa  380  1e-104  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0490  putative ABC transporter ATP-binding protein  39.49 
 
 
551 aa  380  1e-104  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.191061  normal  0.167217 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3159  putative ABC transporter ATP-binding protein  39.44 
 
 
555 aa  380  1e-104  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000146292 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1281  putative ABC transporter ATP-binding protein  38.29 
 
 
561 aa  381  1e-104  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.0000308368  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0889  putative ABC transporter ATP-binding protein  39.37 
 
 
554 aa  380  1e-104  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2810  putative ABC transporter ATP-binding protein  39.07 
 
 
555 aa  380  1e-104  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.923334 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8452  ABC transporter related  36.01 
 
 
608 aa  380  1e-104  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.030329  decreased coverage  0.00000193115 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3221  putative ABC transporter ATP-binding protein  39.03 
 
 
589 aa  379  1e-104  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2255  putative ABC transporter ATP-binding protein  37.62 
 
 
555 aa  380  1e-104  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1845  putative ABC transporter ATP-binding protein  38.74 
 
 
556 aa  382  1e-104  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000460921 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1448  putative ABC transporter ATP-binding protein  39.8 
 
 
555 aa  379  1e-104  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.391667  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2240  putative ABC transporter ATP-binding protein  40.39 
 
 
551 aa  380  1e-104  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.497585 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2098  putative ABC transporter ATP-binding protein  38.46 
 
 
555 aa  381  1e-104  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.249977 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2397  ABC transporter related  37.13 
 
 
649 aa  380  1e-104  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1644  putative ABC transporter ATP-binding protein  37.8 
 
 
559 aa  378  1e-103  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4602  ABC transporter, ATP-binding protein  38.66 
 
 
563 aa  379  1e-103  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.29694  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3059  ABC transporter related  36.44 
 
 
628 aa  377  1e-103  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3066  putative ABC transporter ATP-binding protein  38.69 
 
 
555 aa  377  1e-103  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  hitchhiker  0.00794174  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>