More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Fjoh_4996 on replicon NC_009441
Organism: Flavobacterium johnsoniae UW101



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009441  Fjoh_4996  ABC transporter related  100 
 
 
620 aa  1253    Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_2115  ABC transporter related  70.1 
 
 
621 aa  919    Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.0255573  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4406  ABC transporter related protein  49.68 
 
 
630 aa  637    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.336146  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_07215  ABC transporter ATP-binding protein  67.9 
 
 
622 aa  879    Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1093  ABC transporter related  48.81 
 
 
634 aa  606  9.999999999999999e-173  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4068  ABC transporter related  48.49 
 
 
630 aa  599  1e-170  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.000000802504  hitchhiker  0.000858095 
 
 
-
 
NC_002950  PG1225  ABC transporter, ATP-binding protein  46.38 
 
 
623 aa  587  1e-166  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.701491 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0008  ABC transporter related  44.3 
 
 
620 aa  550  1e-155  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.925372  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0800  ABC transporter, ATP-binding protein  45.69 
 
 
622 aa  546  1e-154  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00285677 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3145  ABC transporter, ATP-binding protein  45.58 
 
 
631 aa  529  1e-149  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.0000000568363  normal  0.0176571 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2173  ABC transporter, ATP-binding protein  45.43 
 
 
631 aa  527  1e-148  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00208736  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2308  ABC transporter, ATP-binding protein  45.11 
 
 
631 aa  524  1e-147  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000184058  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1982  ABC transporter, ATP-binding protein  45.11 
 
 
631 aa  523  1e-147  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000663544  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1964  ABC transporter, ATP-binding protein  45.11 
 
 
631 aa  523  1e-147  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0386922  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2225  ABC transporter, ATP-binding protein  45.11 
 
 
631 aa  521  1e-146  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.0000195061  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2190  ABC transporter, ATP-binding protein  44.95 
 
 
631 aa  521  1e-146  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.783831 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2000  ABC transporter related  44.64 
 
 
631 aa  520  1e-146  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.000123424  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2010  ABC transporter ATP-binding protein  44.79 
 
 
631 aa  517  1.0000000000000001e-145  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  unclonable  0.00000675061  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2164  ABC transporter ATP-binding protein  44.79 
 
 
631 aa  517  1.0000000000000001e-145  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00326588  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1613  ABC transporter-related protein  44.23 
 
 
630 aa  513  1e-144  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.000050504  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3220  ABC transporter related  42.26 
 
 
653 aa  509  1e-143  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000221597  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2312  ABC transporter related  41.11 
 
 
642 aa  506  9.999999999999999e-143  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2364  ABC transporter related  40.47 
 
 
642 aa  507  9.999999999999999e-143  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.217741  normal 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2553  ABC transporter ATPase  43.17 
 
 
642 aa  506  9.999999999999999e-143  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1814  ABC transporter related  41.57 
 
 
639 aa  502  1e-141  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2868  ABC transporter, ATP-binding protein  43.17 
 
 
642 aa  503  1e-141  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.914914  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0299  ABC transporter related  41.12 
 
 
642 aa  503  1e-141  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0123  ABC transporter related  43.21 
 
 
643 aa  496  1e-139  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1040  ABC transporter-related protein  41.65 
 
 
629 aa  488  1e-136  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1381  ATPase  41.04 
 
 
641 aa  482  1e-135  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.981261  normal  0.290816 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1447  ABC transporter related  41.68 
 
 
632 aa  485  1e-135  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1571  ABC transporter related  42.22 
 
 
631 aa  483  1e-135  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.459004  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3020  ABC transporter-like  40.71 
 
 
646 aa  481  1e-134  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.511953  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3547  ABC transporter-like protein protein  40.38 
 
 
640 aa  478  1e-134  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1500  ABC transporter related  40.51 
 
 
630 aa  473  1e-132  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.384495  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1823  ABC transporter related  39.75 
 
 
632 aa  469  1.0000000000000001e-131  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  decreased coverage  0.00644209  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0718  ABC transporter related  38.46 
 
 
626 aa  469  1.0000000000000001e-131  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.332523  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1008  Fis family transcriptional regulator  40.69 
 
 
629 aa  463  1e-129  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0768  ABC transporter related  39.06 
 
 
636 aa  455  1e-127  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0375  ATPase  40.44 
 
 
631 aa  446  1.0000000000000001e-124  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0760  ABC transporter related  38.24 
 
 
625 aa  442  1e-123  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0743  ABC transporter related  38.24 
 
 
625 aa  442  1e-123  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1278  ABC transporter ATPase  39.94 
 
 
625 aa  441  9.999999999999999e-123  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.760109  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3897  ABC transporter related  39.16 
 
 
613 aa  436  1e-121  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009357  OSTLU_30493  ABC(ATP-binding) family transporter  41.59 
 
 
723 aa  436  1e-121  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal  0.658611 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0780  ATPase  38.03 
 
 
630 aa  431  1e-119  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.989868  normal 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0514  ATPase  37.95 
 
 
633 aa  424  1e-117  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.11743  normal  0.506629 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_18141  hypothetical protein  37.89 
 
 
641 aa  422  1e-117  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.0376333  normal  0.70207 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0950  ATPase  38.14 
 
 
641 aa  420  1e-116  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.61977  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1822  ATPase  37.85 
 
 
631 aa  416  9.999999999999999e-116  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_12061  ABC transporter ATPase  37.56 
 
 
644 aa  418  9.999999999999999e-116  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.393632  normal  0.504812 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0383  ABC transporter, ATP-binding protein  37.24 
 
 
627 aa  411  1e-113  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.386036  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_03991  ABC transporter ATP-binding protein  35.93 
 
 
652 aa  411  1e-113  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011697  PHATRDRAFT_41351  predicted protein  36.42 
 
 
679 aa  407  1.0000000000000001e-112  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3285  ABC transporter related  35.84 
 
 
636 aa  403  1e-111  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.000000124669  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0928  ABC transporter related  34.65 
 
 
633 aa  397  1e-109  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.11608e-27 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2479  ABC transporter-related protein  35.86 
 
 
634 aa  391  1e-107  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0549886  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3318  ABC transporter related protein  35.23 
 
 
632 aa  391  1e-107  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1648  ABC transporter ATPase  38.09 
 
 
623 aa  389  1e-107  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1340  ABC transporter, ATP-binding protein  36.66 
 
 
622 aa  387  1e-106  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0462  ABC transporter ATPase  37.86 
 
 
626 aa  385  1e-105  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0568  ABC transporter related protein  35.2 
 
 
632 aa  371  1e-101  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0660  ABC transporter related  35.28 
 
 
626 aa  363  5.0000000000000005e-99  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.14515  normal  0.023928 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1845  putative ABC transporter ATP-binding protein  37.38 
 
 
556 aa  363  5.0000000000000005e-99  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000460921 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0889  putative ABC transporter ATP-binding protein  36.77 
 
 
554 aa  360  6e-98  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2360  ABC transporter related  34.32 
 
 
642 aa  359  8e-98  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.257541  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2430  putative ABC transporter ATP-binding protein  37.28 
 
 
595 aa  358  9.999999999999999e-98  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8452  ABC transporter related  35.46 
 
 
608 aa  358  9.999999999999999e-98  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.030329  decreased coverage  0.00000193115 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2197  putative ABC transporter ATP-binding protein  37.71 
 
 
551 aa  358  1.9999999999999998e-97  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2279  ABC transporter related  32.77 
 
 
649 aa  358  1.9999999999999998e-97  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3221  putative ABC transporter ATP-binding protein  37.64 
 
 
589 aa  356  6.999999999999999e-97  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2397  ABC transporter related  32.35 
 
 
649 aa  356  6.999999999999999e-97  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0409  ABC transporter, ATP-binding subunit  33.17 
 
 
596 aa  355  8.999999999999999e-97  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.722245  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6107  ABC transporter related protein  34.34 
 
 
653 aa  354  2e-96  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1329  ABC transporter related protein  37.71 
 
 
554 aa  355  2e-96  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.461505  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2523  ABC transporter-related protein  33.13 
 
 
641 aa  355  2e-96  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.377883  normal  0.503235 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3007  ABC transporter related  32.47 
 
 
600 aa  354  2.9999999999999997e-96  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.333265  normal  0.911038 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2913  putative ABC transporter ATP-binding protein  37.48 
 
 
555 aa  354  2.9999999999999997e-96  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.010089  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1799  putative ABC transporter ATP-binding protein  37.31 
 
 
554 aa  354  2.9999999999999997e-96  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.255837 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3161  ABC transporter-like protein  33.49 
 
 
608 aa  354  2.9999999999999997e-96  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.970833 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3917  putative ABC transporter ATP-binding protein  37.2 
 
 
554 aa  354  2.9999999999999997e-96  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2351  putative ABC transporter ATP-binding protein  35.26 
 
 
559 aa  354  2.9999999999999997e-96  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.701309  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2963  ABC transporter related  32.47 
 
 
600 aa  354  2.9999999999999997e-96  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.616286  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4024  putative ABC transporter ATP-binding protein  37.2 
 
 
554 aa  353  5e-96  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.640286  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2105  putative ABC transporter ATP-binding protein  35.56 
 
 
555 aa  353  7e-96  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3159  putative ABC transporter ATP-binding protein  36.89 
 
 
555 aa  352  1e-95  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000146292 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2255  putative ABC transporter ATP-binding protein  36.83 
 
 
555 aa  352  1e-95  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3380  ABC transporter related  32.87 
 
 
651 aa  352  1e-95  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4057  putative ABC transporter ATP-binding protein  37.2 
 
 
554 aa  352  1e-95  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2382  ABC transporter related  32.92 
 
 
649 aa  352  1e-95  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.629954  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1895  ABC transporter related  33.59 
 
 
656 aa  352  1e-95  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.438014  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3066  putative ABC transporter ATP-binding protein  37.45 
 
 
555 aa  352  2e-95  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  hitchhiker  0.00794174  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2061  ABC transporter, ATPase subunit  33.54 
 
 
654 aa  352  2e-95  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0990  ABC transporter related protein  33.33 
 
 
588 aa  351  2e-95  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7358  putative ABC transporter ATP-binding protein  36.71 
 
 
554 aa  351  3e-95  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2810  putative ABC transporter ATP-binding protein  36.7 
 
 
555 aa  351  3e-95  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.923334 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1749  ABC transporter related  32.77 
 
 
661 aa  350  4e-95  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2361  ABC transporter related  32.77 
 
 
661 aa  350  4e-95  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3681  putative ABC transporter ATP-binding protein  37.45 
 
 
553 aa  350  5e-95  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2008  putative ABC transporter ATP-binding protein  36.08 
 
 
551 aa  350  6e-95  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>