More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gmet_2479 on replicon NC_007517
Organism: Geobacter metallireducens GS-15



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011146  Gbem_3318  ABC transporter related protein  64.53 
 
 		 632 aa  790    Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2479  ABC transporter-related protein  100 
 
 		 634 aa  1273    Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0549886  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0928  ABC transporter related  64.59 
 
 		 633 aa  793    Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.11608e-27 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3285  ABC transporter related  66.93 
 
 		 636 aa  838    Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.000000124669  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3380  ABC transporter related  45.65 
 
 		 651 aa  495  1e-139  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2061  ABC transporter, ATPase subunit  43.85 
 
 		 654 aa  494  9.999999999999999e-139  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1895  ABC transporter related  43.4 
 
 		 656 aa  489  1e-137  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.438014  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6107  ABC transporter related protein  44.41 
 
 		 653 aa  479  1e-134  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1816  ABC transporter-related protein  43.56 
 
 		 654 aa  481  1e-134  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0210138  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1040  ABC transporter-related protein  40.85 
 
 		 629 aa  474  1e-132  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1644  putative ABC transporter ATP-binding protein  41.94 
 
 		 559 aa  456  1e-127  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2152  putative ABC transporter ATP-binding protein  42.94 
 
 		 556 aa  453  1.0000000000000001e-126  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.0875259  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3426  putative ABC transporter ATP-binding protein  41.87 
 
 		 561 aa  453  1.0000000000000001e-126  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0893  putative ABC transporter ATP-binding protein  42.24 
 
 		 560 aa  453  1.0000000000000001e-126  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.100195  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1571  ABC transporter related  41.07 
 
 		 631 aa  452  1.0000000000000001e-126  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.459004  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0834  putative ABC transporter ATP-binding protein  41.68 
 
 		 561 aa  452  1.0000000000000001e-126  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00294599  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2312  ABC transporter related  38.59 
 
 		 642 aa  455  1.0000000000000001e-126  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1057  putative ABC transporter ATP-binding protein  41.46 
 
 		 559 aa  453  1.0000000000000001e-126  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1823  ABC transporter related  40.13 
 
 		 632 aa  452  1e-125  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  decreased coverage  0.00644209  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2364  ABC transporter related  38.14 
 
 		 642 aa  449  1e-125  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.217741  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5309  ABC transporter related protein  43.51 
 
 		 559 aa  449  1e-125  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1466  putative ABC transporter ATP-binding protein  43.86 
 
 		 558 aa  450  1e-125  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.000105508  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2441  putative ABC transporter ATP-binding protein  41.23 
 
 		 558 aa  450  1e-125  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00204105  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0661  putative ABC transporter ATP-binding protein  42.43 
 
 		 560 aa  449  1e-125  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1058  putative ABC transporter ATP-binding protein  41.68 
 
 		 560 aa  446  1.0000000000000001e-124  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1794  putative ABC transporter ATP-binding protein  44 
 
 		 555 aa  446  1.0000000000000001e-124  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.482874  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1926  putative ABC transporter ATP-binding protein  41.37 
 
 		 559 aa  446  1.0000000000000001e-124  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000000896956  normal  0.905041 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1281  putative ABC transporter ATP-binding protein  41.87 
 
 		 561 aa  446  1.0000000000000001e-124  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.0000308368  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5234  ABC transporter related protein  41.71 
 
 		 555 aa  448  1.0000000000000001e-124  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.547616  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0918  ABC transporter related  39.35 
 
 		 688 aa  448  1.0000000000000001e-124  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.101083 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2098  putative ABC transporter ATP-binding protein  42.45 
 
 		 555 aa  446  1.0000000000000001e-124  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.249977 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_4019  putative ABC transporter ATP-binding protein  41.31 
 
 		 561 aa  446  1.0000000000000001e-124  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.186099 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1500  ABC transporter related  39.05 
 
 		 630 aa  446  1.0000000000000001e-124  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.384495  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1008  Fis family transcriptional regulator  40.63 
 
 		 629 aa  448  1.0000000000000001e-124  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1982  ABC transporter, ATP-binding protein  38.9 
 
 		 631 aa  443  1e-123  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000663544  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1964  ABC transporter, ATP-binding protein  38.9 
 
 		 631 aa  443  1e-123  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0386922  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0809  putative ABC transporter ATP-binding protein  40.04 
 
 		 560 aa  443  1e-123  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2308  ABC transporter, ATP-binding protein  38.9 
 
 		 631 aa  444  1e-123  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000184058  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3241  putative ABC transporter ATP-binding protein  40.19 
 
 		 561 aa  444  1e-123  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000308971  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0660  ABC transporter related  40.65 
 
 		 626 aa  442  1e-123  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.14515  normal  0.023928 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0375  ATPase  41.67 
 
 		 631 aa  442  1e-123  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1447  ABC transporter related  39.4 
 
 		 632 aa  442  1e-123  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2279  ABC transporter related  39.51 
 
 		 649 aa  444  1e-123  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0299  ABC transporter related  38.33 
 
 		 642 aa  444  1e-123  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2397  ABC transporter related  39.51 
 
 		 649 aa  442  1e-123  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1137  putative ABC transporter ATP-binding protein  41.87 
 
 		 560 aa  441  9.999999999999999e-123  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  decreased coverage  0.000210355  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2225  ABC transporter, ATP-binding protein  38.9 
 
 		 631 aa  441  9.999999999999999e-123  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.0000195061  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3883  putative ABC transporter ATP-binding protein  42.77 
 
 		 559 aa  441  9.999999999999999e-123  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3618  putative ABC transporter ATP-binding protein  42.94 
 
 		 555 aa  441  9.999999999999999e-123  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0758  putative ABC transporter ATP-binding protein  40.8 
 
 		 557 aa  441  9.999999999999999e-123  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2495  putative ABC transporter ATP-binding protein  42.42 
 
 		 558 aa  441  9.999999999999999e-123  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.290369 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0568  ABC transporter related protein  39.09 
 
 		 632 aa  439  9.999999999999999e-123  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1687  putative ABC transporter ATP-binding protein  42.48 
 
 		 557 aa  442  9.999999999999999e-123  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.00296418  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5700  ABC transporter, fused ATPase subunits  39.32 
 
 		 649 aa  439  9.999999999999999e-123  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2580  putative ABC transporter ATP-binding protein  40.22 
 
 		 560 aa  441  9.999999999999999e-123  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.471915  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2382  ABC transporter related  39.01 
 
 		 649 aa  439  9.999999999999999e-123  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.629954  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3489  putative ABC transporter ATP-binding protein  42.94 
 
 		 555 aa  441  9.999999999999999e-123  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2190  ABC transporter, ATP-binding protein  38.58 
 
 		 631 aa  441  9.999999999999999e-123  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.783831 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2105  putative ABC transporter ATP-binding protein  41.97 
 
 		 555 aa  440  9.999999999999999e-123  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0822  putative ABC transporter ATP-binding protein  42.94 
 
 		 555 aa  441  9.999999999999999e-123  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2010  ABC transporter ATP-binding protein  38.74 
 
 		 631 aa  438  1e-121  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  unclonable  0.00000675061  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4939  putative ABC transporter ATP-binding protein  42.56 
 
 		 555 aa  436  1e-121  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.909016  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0740  putative ABC transporter ATP-binding protein  40.23 
 
 		 557 aa  436  1e-121  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4832  putative ABC transporter ATP-binding protein  42.56 
 
 		 555 aa  436  1e-121  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.218638  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1799  putative ABC transporter ATP-binding protein  41.62 
 
 		 554 aa  437  1e-121  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.255837 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1613  ABC transporter-related protein  38.39 
 
 		 630 aa  437  1e-121  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.000050504  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1361  putative ABC transporter ATP-binding protein  39.14 
 
 		 561 aa  438  1e-121  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000127735  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4905  putative ABC transporter ATP-binding protein  42.56 
 
 		 555 aa  436  1e-121  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2164  ABC transporter ATP-binding protein  38.74 
 
 		 631 aa  438  1e-121  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00326588  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1998  putative ABC transporter ATP-binding protein  40.52 
 
 		 563 aa  436  1e-121  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.237018  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2700  ABC transporter related  39.34 
 
 		 640 aa  438  1e-121  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.725807  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0552  putative ABC transporter ATP-binding protein  42.61 
 
 		 555 aa  437  1e-121  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4991  putative ABC transporter ATP-binding protein  42.56 
 
 		 555 aa  436  1e-121  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.170616  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2000  ABC transporter related  38.33 
 
 		 631 aa  438  1e-121  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.000123424  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4993  putative ABC transporter ATP-binding protein  42.56 
 
 		 555 aa  436  1e-121  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1749  ABC transporter related  38.85 
 
 		 661 aa  437  1e-121  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2868  ABC transporter, ATP-binding protein  39.59 
 
 		 642 aa  438  1e-121  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.914914  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2553  ABC transporter ATPase  39.35 
 
 		 642 aa  439  1e-121  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1117  putative ABC transporter ATP-binding protein  42.16 
 
 		 550 aa  436  1e-121  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.188653 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2361  ABC transporter related  38.85 
 
 		 661 aa  437  1e-121  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3606  ABC transporter related protein  42.61 
 
 		 555 aa  435  1e-120  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2913  putative ABC transporter ATP-binding protein  42.17 
 
 		 555 aa  433  1e-120  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.010089  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4941  putative ABC transporter ATP-binding protein  42.42 
 
 		 555 aa  432  1e-120  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.963786 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4627  putative ABC transporter ATP-binding protein  42.61 
 
 		 555 aa  435  1e-120  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1126  ABC transporter related  39.13 
 
 		 634 aa  434  1e-120  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  0.239651 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4939  putative ABC transporter ATP-binding protein  42.42 
 
 		 555 aa  432  1e-120  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0939  ABC transporter, ATP-binding protein  39.1 
 
 		 648 aa  432  1e-120  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0496893  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0718  ABC transporter related  37.88 
 
 		 626 aa  432  1e-120  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.332523  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2351  putative ABC transporter ATP-binding protein  41.52 
 
 		 559 aa  434  1e-120  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.701309  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3665  putative ABC transporter ATP-binding protein  42.61 
 
 		 555 aa  435  1e-120  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0563  putative ABC transporter ATP-binding protein  41.98 
 
 		 572 aa  433  1e-120  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.499297  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0721  ABC transporter related  39.29 
 
 		 640 aa  433  1e-120  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5906  putative ABC transporter ATP-binding protein  42.61 
 
 		 555 aa  435  1e-120  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1437  putative ABC transporter ATP-binding protein  42.22 
 
 		 554 aa  433  1e-120  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1845  putative ABC transporter ATP-binding protein  40.49 
 
 		 556 aa  432  1e-120  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000460921 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2173  ABC transporter, ATP-binding protein  38.74 
 
 		 631 aa  435  1e-120  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00208736  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4990  putative ABC transporter ATP-binding protein  42.42 
 
 		 555 aa  432  1e-120  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3145  ABC transporter, ATP-binding protein  38.74 
 
 		 631 aa  434  1e-120  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.0000000568363  normal  0.0176571 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1864  putative ABC transporter ATP-binding protein  42.72 
 
 		 560 aa  433  1e-120  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.733773  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3220  ABC transporter related  37.89 
 
 		 653 aa  435  1e-120  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000221597  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>