More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SAG1340 on replicon NC_004116
Organism: Streptococcus agalactiae 2603V/R



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_004116  SAG1340  ABC transporter, ATP-binding protein  100 
 
 
622 aa  1264    Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0462  ABC transporter ATPase  77.6 
 
 
626 aa  963    Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1648  ABC transporter ATPase  58.52 
 
 
623 aa  694    Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0768  ABC transporter related  47.63 
 
 
636 aa  591  1e-167  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1278  ABC transporter ATPase  49.12 
 
 
625 aa  564  1.0000000000000001e-159  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.760109  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1571  ABC transporter related  46.36 
 
 
631 aa  542  1e-153  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.459004  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2308  ABC transporter, ATP-binding protein  43.33 
 
 
631 aa  526  1e-148  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000184058  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0383  ABC transporter, ATP-binding protein  44.62 
 
 
627 aa  523  1e-147  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.386036  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2173  ABC transporter, ATP-binding protein  43.81 
 
 
631 aa  522  1e-147  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00208736  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2225  ABC transporter, ATP-binding protein  43.33 
 
 
631 aa  524  1e-147  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.0000195061  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2010  ABC transporter ATP-binding protein  43.17 
 
 
631 aa  525  1e-147  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  unclonable  0.00000675061  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1982  ABC transporter, ATP-binding protein  43.33 
 
 
631 aa  525  1e-147  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000663544  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1964  ABC transporter, ATP-binding protein  43.33 
 
 
631 aa  525  1e-147  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0386922  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1814  ABC transporter related  44.3 
 
 
639 aa  525  1e-147  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2164  ABC transporter ATP-binding protein  43.17 
 
 
631 aa  525  1e-147  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00326588  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3145  ABC transporter, ATP-binding protein  43.97 
 
 
631 aa  523  1e-147  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.0000000568363  normal  0.0176571 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2190  ABC transporter, ATP-binding protein  43.85 
 
 
631 aa  524  1e-147  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.783831 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1613  ABC transporter-related protein  43.88 
 
 
630 aa  520  1e-146  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.000050504  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3220  ABC transporter related  42.26 
 
 
653 aa  520  1e-146  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000221597  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2000  ABC transporter related  42.86 
 
 
631 aa  511  1e-143  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.000123424  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0123  ABC transporter related  43.24 
 
 
643 aa  508  9.999999999999999e-143  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0743  ABC transporter related  43.37 
 
 
625 aa  504  1e-141  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0760  ABC transporter related  43.37 
 
 
625 aa  504  1e-141  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1040  ABC transporter-related protein  43.13 
 
 
629 aa  501  1e-140  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2868  ABC transporter, ATP-binding protein  42.59 
 
 
642 aa  496  1e-139  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.914914  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2553  ABC transporter ATPase  42.74 
 
 
642 aa  496  1e-139  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1823  ABC transporter related  43.38 
 
 
632 aa  492  9.999999999999999e-139  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  decreased coverage  0.00644209  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1008  Fis family transcriptional regulator  44.11 
 
 
629 aa  493  9.999999999999999e-139  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0299  ABC transporter related  41.67 
 
 
642 aa  488  1e-136  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1447  ABC transporter related  42.79 
 
 
632 aa  483  1e-135  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3897  ABC transporter related  41.56 
 
 
613 aa  481  1e-134  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3020  ABC transporter-like  41.33 
 
 
646 aa  479  1e-134  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.511953  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0780  ATPase  43.98 
 
 
630 aa  469  1.0000000000000001e-131  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.989868  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0375  ATPase  43.98 
 
 
631 aa  470  1.0000000000000001e-131  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2364  ABC transporter related  40.09 
 
 
642 aa  469  1.0000000000000001e-131  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.217741  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1500  ABC transporter related  41.63 
 
 
630 aa  471  1.0000000000000001e-131  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.384495  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3547  ABC transporter-like protein protein  40.53 
 
 
640 aa  466  9.999999999999999e-131  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2312  ABC transporter related  40.16 
 
 
642 aa  467  9.999999999999999e-131  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4406  ABC transporter related protein  39.12 
 
 
630 aa  466  9.999999999999999e-131  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.336146  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4068  ABC transporter related  40.85 
 
 
630 aa  458  1e-127  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.000000802504  hitchhiker  0.000858095 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_07215  ABC transporter ATP-binding protein  39.13 
 
 
622 aa  451  1e-125  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0718  ABC transporter related  41.16 
 
 
626 aa  452  1e-125  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.332523  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1225  ABC transporter, ATP-binding protein  38.89 
 
 
623 aa  441  9.999999999999999e-123  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.701491 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_2115  ABC transporter related  38.65 
 
 
621 aa  441  9.999999999999999e-123  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.0255573  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0008  ABC transporter related  38.9 
 
 
620 aa  441  9.999999999999999e-123  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.925372  normal 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_18141  hypothetical protein  38.51 
 
 
641 aa  430  1e-119  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.0376333  normal  0.70207 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1093  ABC transporter related  38.73 
 
 
634 aa  432  1e-119  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0950  ATPase  38.35 
 
 
641 aa  429  1e-118  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.61977  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1381  ATPase  39.62 
 
 
641 aa  424  1e-117  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.981261  normal  0.290816 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0800  ABC transporter, ATP-binding protein  38.7 
 
 
622 aa  424  1e-117  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00285677 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_03991  ABC transporter ATP-binding protein  37.85 
 
 
652 aa  421  1e-116  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0514  ATPase  37.97 
 
 
633 aa  418  9.999999999999999e-116  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.11743  normal  0.506629 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4996  ABC transporter related  36.66 
 
 
620 aa  406  1.0000000000000001e-112  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1822  ATPase  37.18 
 
 
631 aa  396  1e-109  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_12061  ABC transporter ATPase  35.45 
 
 
644 aa  394  1e-108  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.393632  normal  0.504812 
 
 
-
 
NC_009357  OSTLU_30493  ABC(ATP-binding) family transporter  35.7 
 
 
723 aa  380  1e-104  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal  0.658611 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2479  ABC transporter-related protein  38.24 
 
 
634 aa  373  1e-102  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0549886  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2523  ABC transporter-related protein  36.32 
 
 
641 aa  368  1e-100  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.377883  normal  0.503235 
 
 
-
 
NC_011697  PHATRDRAFT_41351  predicted protein  34.42 
 
 
679 aa  364  2e-99  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0828  ABC transporter related  35.12 
 
 
636 aa  355  2e-96  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2351  putative ABC transporter ATP-binding protein  36.06 
 
 
559 aa  354  2.9999999999999997e-96  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.701309  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0899  ABC transporter related  34.73 
 
 
663 aa  353  4e-96  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.998664  normal  0.488704 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_08326  putative ATP-binding component of ABC transporter  36.36 
 
 
564 aa  353  4e-96  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0660  ABC transporter related  34.13 
 
 
626 aa  353  5e-96  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.14515  normal  0.023928 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2700  ABC transporter related  35.31 
 
 
640 aa  352  1e-95  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.725807  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2125  ABC transporter related  34.17 
 
 
641 aa  352  2e-95  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.279958 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0975  ABC transporter ATP-binding protein  34.89 
 
 
636 aa  351  3e-95  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  decreased coverage  0.000424481  normal  0.109741 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0928  ABC transporter related  34.07 
 
 
633 aa  350  3e-95  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.11608e-27 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2626  putative ABC transporter ATP-binding protein  37.19 
 
 
578 aa  350  3e-95  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.663821  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0650  ABC transporter related  34.05 
 
 
590 aa  350  4e-95  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3161  ABC transporter-like protein  35.36 
 
 
608 aa  350  6e-95  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.970833 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2360  ABC transporter related  34.85 
 
 
642 aa  349  8e-95  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.257541  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1117  putative ABC transporter ATP-binding protein  36.85 
 
 
558 aa  348  1e-94  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.406197  hitchhiker  0.00000247304 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3007  ABC transporter related  33.67 
 
 
600 aa  348  1e-94  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.333265  normal  0.911038 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2963  ABC transporter related  33.67 
 
 
600 aa  348  1e-94  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.616286  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0568  ABC transporter related protein  34.48 
 
 
632 aa  347  4e-94  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1126  ABC transporter related  35.99 
 
 
634 aa  347  5e-94  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal  0.239651 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2098  putative ABC transporter ATP-binding protein  36.75 
 
 
555 aa  347  5e-94  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.249977 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1117  putative ABC transporter ATP-binding protein  34.6 
 
 
550 aa  346  8.999999999999999e-94  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.188653 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1794  putative ABC transporter ATP-binding protein  35.78 
 
 
555 aa  345  1e-93  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.482874  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3318  ABC transporter related protein  34.07 
 
 
632 aa  345  1e-93  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2197  putative ABC transporter ATP-binding protein  34.54 
 
 
551 aa  345  2e-93  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0705  putative ABC transporter ATP-binding protein  36.16 
 
 
555 aa  345  2e-93  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.0956761 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0674  putative ABC transporter ATP-binding protein  36.16 
 
 
555 aa  344  2.9999999999999997e-93  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.599551  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4510  putative ABC transporter ATP-binding protein  36.35 
 
 
555 aa  344  2.9999999999999997e-93  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.29936  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3785  ABC transporter related  34.5 
 
 
628 aa  344  2.9999999999999997e-93  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.485733  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1284  putative ABC transporter ATP-binding protein  35.57 
 
 
670 aa  344  2.9999999999999997e-93  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0721  ABC transporter related  35.33 
 
 
640 aa  343  4e-93  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1761  ABC transporter related  34.75 
 
 
642 aa  343  4e-93  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0661  putative ABC transporter ATP-binding protein  36.69 
 
 
560 aa  343  5e-93  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2061  ABC transporter, ATPase subunit  33.59 
 
 
654 aa  342  8e-93  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3285  ABC transporter related  37.44 
 
 
636 aa  342  8e-93  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.000000124669  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4264  putative ABC transporter ATP-binding protein  36.16 
 
 
554 aa  342  1e-92  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3059  ABC transporter related  34.34 
 
 
628 aa  342  1e-92  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4602  ABC transporter, ATP-binding protein  36.16 
 
 
563 aa  341  2e-92  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.29694  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0513  ABC transporter related protein  35.3 
 
 
592 aa  341  2e-92  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4875  putative ABC transporter ATP-binding protein  35.82 
 
 
554 aa  341  2e-92  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.54223  normal 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3581  putative ABC transporter ATP-binding protein  36.4 
 
 
555 aa  342  2e-92  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.078032  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2382  ABC transporter related  33.39 
 
 
649 aa  342  2e-92  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.629954  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0706  putative ABC transporter ATP-binding protein  35.78 
 
 
555 aa  341  2e-92  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.483075  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>