More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pnec_1126 on replicon NC_010531
Organism: Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011992  Dtpsy_3059  ABC transporter related  61.73 
 
 		 628 aa  740    Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2171  ABC transporter related  56.75 
 
 		 645 aa  673    Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.380674  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4771  ABC transporter related  60.82 
 
 		 635 aa  714    Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1136  ABC transporter, ATP-binding protein  57.88 
 
 		 660 aa  694    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0975  ABC transporter ATP-binding protein  62.2 
 
 		 636 aa  738    Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  decreased coverage  0.000424481  normal  0.109741 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2207  ABC transporter, ATP-binding protein  57.88 
 
 		 648 aa  696    Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.829349  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2087  ABC transporter, ATP-binding protein  57.88 
 
 		 648 aa  696    Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0721  ABC transporter related  92.99 
 
 		 640 aa  1170    Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0838  ABC transporter related  54.43 
 
 		 646 aa  648    Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.0257096 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2360  ABC transporter related  60.34 
 
 		 642 aa  728    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.257541  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2279  ABC transporter related  57.39 
 
 		 649 aa  706    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2125  ABC transporter related  57.41 
 
 		 641 aa  710    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.279958 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1298  ABC transporter, ATP-binding protein  57.88 
 
 		 1065 aa  697    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.524137  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0693  ABC transporter, ATP-binding protein  57.88 
 
 		 648 aa  696    Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5700  ABC transporter, fused ATPase subunits  57.7 
 
 		 649 aa  708    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1144  ABC transporter, ATP-binding protein  57.88 
 
 		 660 aa  694    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.261137  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0918  ABC transporter related  58.63 
 
 		 688 aa  700    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.101083 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4373  ABC transporter-related protein  61.04 
 
 		 629 aa  729    Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0223118  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2700  ABC transporter related  54.33 
 
 		 640 aa  645    Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.725807  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2382  ABC transporter related  58.72 
 
 		 649 aa  706    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.629954  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0939  ABC transporter, ATP-binding protein  57.1 
 
 		 648 aa  699    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0496893  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0181  ferric-enterobactin ABC transporter ATPase  64.45 
 
 		 626 aa  769    Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.530164  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0828  ABC transporter related  62.66 
 
 		 636 aa  748    Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0642  ABC transporter related  61.26 
 
 		 629 aa  754    Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.64323  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1126  ABC transporter related  100 
 
 		 634 aa  1286    Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  0.239651 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1199  ABC transporter related  54.7 
 
 		 648 aa  635    Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.219582  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4229  ABC transporter related  62.73 
 
 		 648 aa  768    Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.868359 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3340  ABC transporter, duplicated ATPase subunits  57.43 
 
 		 645 aa  717    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.790276  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1605  ABC transporter related  55.92 
 
 		 644 aa  639    Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0890354  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2523  ABC transporter-related protein  60.57 
 
 		 641 aa  721    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.377883  normal  0.503235 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0660  ABC transporter related  62.03 
 
 		 626 aa  763    Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.14515  normal  0.023928 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1749  ABC transporter related  58.57 
 
 		 661 aa  704    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3785  ABC transporter related  61.89 
 
 		 628 aa  740    Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.485733  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0413  ABC transporter related  62.38 
 
 		 641 aa  759    Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  decreased coverage  0.00715783  hitchhiker  0.000000249616 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2525  ABC transporter, ATP-binding protein  57.88 
 
 		 660 aa  695    Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0899  ABC transporter related  62.66 
 
 		 663 aa  746    Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.998664  normal  0.488704 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2397  ABC transporter related  57.39 
 
 		 649 aa  706    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2361  ABC transporter related  58.57 
 
 		 661 aa  704    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3830  ABC transporter-related protein  63.5 
 
 		 632 aa  754    Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.457691 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1204  ABC transporter related  57.89 
 
 		 648 aa  713    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2810  ABC transporter ATPase  55.61 
 
 		 631 aa  624  1e-177  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0568  ABC transporter related protein  47.09 
 
 		 632 aa  561  1e-158  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0138  ABC transporter related  47.91 
 
 		 643 aa  551  1e-155  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2052  ABC transporter related  45.51 
 
 		 640 aa  549  1e-155  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0425216  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0618  ABC transporter related  47.49 
 
 		 635 aa  550  1e-155  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000117313 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2640  ABC transporter ATPase component  46.2 
 
 		 637 aa  542  1e-153  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2551  ABC transporter ATPase component  46.2 
 
 		 637 aa  542  1e-153  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1988  ABC transporter ATPase component  46.2 
 
 		 637 aa  543  1e-153  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2398  ABC transporter related  47.46 
 
 		 650 aa  544  1e-153  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1632  ABC transporter related  48.81 
 
 		 627 aa  539  9.999999999999999e-153  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.27498  normal  0.259057 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2006  ABC transporter related  45.05 
 
 		 647 aa  541  9.999999999999999e-153  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1681  ABC transporter ATPase component  46.27 
 
 		 649 aa  535  1e-151  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0499  ABC transporter related  49.45 
 
 		 631 aa  538  1e-151  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.107412  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1650  ABC transporter ATPase component  46.84 
 
 		 637 aa  532  1e-150  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1950  ABC transporter related  44.04 
 
 		 653 aa  532  1e-150  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0431  putative ATP-binding component of a transport system  46.38 
 
 		 641 aa  534  1e-150  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000000359167  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1649  ABC transporter related  48.05 
 
 		 642 aa  531  1e-149  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.39648  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1602  ABC transporter ATPase component  44.58 
 
 		 638 aa  530  1e-149  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.52947  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2131  ABC transporter ATP-binding protein  48.52 
 
 		 642 aa  528  1e-148  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.40675  normal  0.030462 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3521  ABC transporter, ATP-binding protein  48.51 
 
 		 636 aa  526  1e-148  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3609  ABC transporter related  48.52 
 
 		 642 aa  528  1e-148  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.677442  normal  0.278537 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2893  ABC transporter, ATP-binding protein  46.51 
 
 		 620 aa  522  1e-147  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.669618  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0609  ABC transporter, ATP-binding protein  48.09 
 
 		 632 aa  523  1e-147  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.446122  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02012  ABC transporter, ATP-binding protein  44.38 
 
 		 646 aa  523  1e-147  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0535295  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3294  ABC transporter  48.04 
 
 		 636 aa  522  1e-147  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.313351  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2512  ABC transporter related  46.51 
 
 		 620 aa  522  1e-147  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.926021  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1673  ABC transporter related  48.05 
 
 		 642 aa  525  1e-147  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.437344 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1542  ABC transporter ATPase component  44.77 
 
 		 640 aa  523  1e-147  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2065  ABC transporter ATPase component  46.36 
 
 		 636 aa  519  1e-146  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1761  ABC transporter related  45.23 
 
 		 642 aa  520  1e-146  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02335  ABC transporter ATPase component  45.2 
 
 		 639 aa  522  1e-146  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2170  ABC transporter ATPase component  44.78 
 
 		 635 aa  521  1e-146  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00000710719  normal  0.220785 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1461  ABC transporter ATPase component  44.78 
 
 		 635 aa  520  1e-146  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.185296  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1609  ABC transporter ATPase component  44.46 
 
 		 640 aa  521  1e-146  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.111541 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1603  ABC transporter ATPase component  44.46 
 
 		 640 aa  521  1e-146  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0251377  normal  0.331537 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00393  ABC transporter ATP-binding protein  48.22 
 
 		 615 aa  517  1.0000000000000001e-145  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1853  ABC transporter ATPase component  44.46 
 
 		 640 aa  518  1.0000000000000001e-145  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2563  ABC transporter related protein  46.31 
 
 		 637 aa  516  1.0000000000000001e-145  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.0140209 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1582  ABC transporter related  44.1 
 
 		 648 aa  515  1.0000000000000001e-145  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  hitchhiker  0.0018197  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1634  ABC transporter ATPase component  43.94 
 
 		 641 aa  517  1.0000000000000001e-145  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.202979  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1388  ABC transporter related  47.01 
 
 		 623 aa  516  1.0000000000000001e-145  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0285354  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1113  ABC transporter ATPase component  45.41 
 
 		 635 aa  513  1e-144  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00085111  normal  0.933236 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2184  ABC transporter ATP-binding protein  47.69 
 
 		 639 aa  514  1e-144  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.448903  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2568  ABC transporter ATPase component  43.75 
 
 		 641 aa  514  1e-144  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.452475  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2608  ABC transporter ATPase component  43.59 
 
 		 641 aa  513  1e-144  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00157626  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003440  ABC transporter ATP-binding protein uup  44.88 
 
 		 639 aa  514  1e-144  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.550149  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_2095  ABC transporter related  47.54 
 
 		 623 aa  513  1e-144  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.958097  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2683  ABC transporter ATPase component  43.75 
 
 		 641 aa  514  1e-144  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0324813  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1776  ABC transporter ATPase component  43.75 
 
 		 641 aa  514  1e-144  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.205391  hitchhiker  0.000192841 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1744  ABC transporter ATPase component  45.09 
 
 		 634 aa  511  1e-143  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.30913  hitchhiker  0.0000434555 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1419  ABC transporter:AAA ATPase  43.47 
 
 		 648 aa  509  1e-143  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  0.148207 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_14160  ABC transporter, ATP binding component  47.64 
 
 		 639 aa  510  1e-143  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1093  ABC transporter ATPase component  45.34 
 
 		 639 aa  511  1e-143  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.140566  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1020  ABC transporter ATPase component  45.25 
 
 		 635 aa  509  1e-143  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00168337  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1814  ABC transporter ATPase component  44.67 
 
 		 639 aa  509  1e-143  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000485056  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1792  ABC transporter ATPase component  45.3 
 
 		 642 aa  511  1e-143  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1103  ABC transporter ATPase component  45.25 
 
 		 635 aa  508  9.999999999999999e-143  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.320404 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1576  ABC transporter related  47.89 
 
 		 641 aa  506  9.999999999999999e-143  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.712623 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2368  ABC transporter ATPase component  44.94 
 
 		 635 aa  506  9.999999999999999e-143  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.561386  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1064  ABC transporter ATPase component  44.78 
 
 		 635 aa  506  9.999999999999999e-143  Escherichia coli E24377A  Bacteria  unclonable  0.0000000000187784  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>