More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PHATRDRAFT_41351 on replicon NC_011697
Organism: Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011697  PHATRDRAFT_41351  predicted protein  100 
 
 
679 aa  1390    Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_2115  ABC transporter related  36.91 
 
 
621 aa  420  1e-116  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.0255573  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1225  ABC transporter, ATP-binding protein  39.38 
 
 
623 aa  414  1e-114  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.701491 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_07215  ABC transporter ATP-binding protein  36.39 
 
 
622 aa  414  1e-114  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4068  ABC transporter related  37.33 
 
 
630 aa  406  1.0000000000000001e-112  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.000000802504  hitchhiker  0.000858095 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4996  ABC transporter related  36.42 
 
 
620 aa  408  1.0000000000000001e-112  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1093  ABC transporter related  37.26 
 
 
634 aa  406  1.0000000000000001e-112  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0008  ABC transporter related  34.3 
 
 
620 aa  401  9.999999999999999e-111  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.925372  normal 
 
 
-
 
NC_009357  OSTLU_30493  ABC(ATP-binding) family transporter  41.96 
 
 
723 aa  394  1e-108  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal  0.658611 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0768  ABC transporter related  34.08 
 
 
636 aa  381  1e-104  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4406  ABC transporter related protein  36.05 
 
 
630 aa  376  1e-103  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.336146  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0800  ABC transporter, ATP-binding protein  37.07 
 
 
622 aa  377  1e-103  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00285677 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0299  ABC transporter related  35.01 
 
 
642 aa  371  1e-101  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0123  ABC transporter related  35.43 
 
 
643 aa  365  2e-99  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1571  ABC transporter related  35.63 
 
 
631 aa  364  3e-99  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.459004  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1278  ABC transporter ATPase  35.29 
 
 
625 aa  363  6e-99  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.760109  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3220  ABC transporter related  35.56 
 
 
653 aa  353  4e-96  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000221597  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2308  ABC transporter, ATP-binding protein  34.98 
 
 
631 aa  353  5e-96  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000184058  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2173  ABC transporter, ATP-binding protein  34.88 
 
 
631 aa  353  5.9999999999999994e-96  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00208736  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3145  ABC transporter, ATP-binding protein  34.88 
 
 
631 aa  353  5.9999999999999994e-96  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.0000000568363  normal  0.0176571 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1982  ABC transporter, ATP-binding protein  34.98 
 
 
631 aa  353  7e-96  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000663544  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1964  ABC transporter, ATP-binding protein  34.98 
 
 
631 aa  353  7e-96  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0386922  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2225  ABC transporter, ATP-binding protein  34.58 
 
 
631 aa  352  1e-95  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.0000195061  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3020  ABC transporter-like  34.55 
 
 
646 aa  352  1e-95  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.511953  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2010  ABC transporter ATP-binding protein  34.98 
 
 
631 aa  352  2e-95  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  unclonable  0.00000675061  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2164  ABC transporter ATP-binding protein  34.98 
 
 
631 aa  352  2e-95  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00326588  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2000  ABC transporter related  34.98 
 
 
631 aa  351  3e-95  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.000123424  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1814  ABC transporter related  33.19 
 
 
639 aa  350  4e-95  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2190  ABC transporter, ATP-binding protein  34.68 
 
 
631 aa  348  1e-94  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.783831 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1340  ABC transporter, ATP-binding protein  34.42 
 
 
622 aa  347  3e-94  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1613  ABC transporter-related protein  34.44 
 
 
630 aa  347  5e-94  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.000050504  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2364  ABC transporter related  33.08 
 
 
642 aa  341  2e-92  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.217741  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2312  ABC transporter related  32.82 
 
 
642 aa  341  2.9999999999999998e-92  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3547  ABC transporter-like protein protein  34.15 
 
 
640 aa  340  7e-92  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1500  ABC transporter related  34.93 
 
 
630 aa  332  1e-89  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.384495  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0718  ABC transporter related  32.23 
 
 
626 aa  329  8e-89  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.332523  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3897  ABC transporter related  35.99 
 
 
613 aa  326  7e-88  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1008  Fis family transcriptional regulator  33.79 
 
 
629 aa  321  1.9999999999999998e-86  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2351  putative ABC transporter ATP-binding protein  33.64 
 
 
559 aa  318  2e-85  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.701309  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1648  ABC transporter ATPase  34.47 
 
 
623 aa  317  3e-85  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1040  ABC transporter-related protein  33.44 
 
 
629 aa  316  7e-85  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2868  ABC transporter, ATP-binding protein  32.54 
 
 
642 aa  315  1.9999999999999998e-84  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.914914  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0462  ABC transporter ATPase  34.83 
 
 
626 aa  314  2.9999999999999996e-84  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2553  ABC transporter ATPase  32.53 
 
 
642 aa  314  3.9999999999999997e-84  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1284  putative ABC transporter ATP-binding protein  33.16 
 
 
670 aa  310  5.9999999999999995e-83  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0950  ATPase  32.03 
 
 
641 aa  308  2.0000000000000002e-82  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.61977  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0743  ABC transporter related  31.64 
 
 
625 aa  307  4.0000000000000004e-82  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0760  ABC transporter related  31.64 
 
 
625 aa  307  4.0000000000000004e-82  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1447  ABC transporter related  31.98 
 
 
632 aa  307  5.0000000000000004e-82  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1823  ABC transporter related  33.13 
 
 
632 aa  306  6e-82  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  decreased coverage  0.00644209  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0416  putative ABC transporter ATP-binding protein  35.5 
 
 
553 aa  306  1.0000000000000001e-81  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_08326  putative ATP-binding component of ABC transporter  32.97 
 
 
564 aa  305  2.0000000000000002e-81  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_18141  hypothetical protein  31.41 
 
 
641 aa  305  2.0000000000000002e-81  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.0376333  normal  0.70207 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2916  putative ABC transporter ATP-binding protein  34.42 
 
 
563 aa  303  6.000000000000001e-81  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0621526  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0238  putative ABC transporter ATP-binding protein  32.8 
 
 
559 aa  302  1e-80  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.331867 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1822  ATPase  34.75 
 
 
631 aa  302  1e-80  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0514  ATPase  33.59 
 
 
633 aa  303  1e-80  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.11743  normal  0.506629 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0383  ABC transporter, ATP-binding protein  33.51 
 
 
627 aa  301  2e-80  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.386036  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1466  putative ABC transporter ATP-binding protein  35.81 
 
 
558 aa  301  3e-80  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.000105508  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2430  putative ABC transporter ATP-binding protein  36.29 
 
 
595 aa  299  9e-80  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0490  putative ABC transporter ATP-binding protein  34.67 
 
 
551 aa  299  1e-79  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.191061  normal  0.167217 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0780  ATPase  33.23 
 
 
630 aa  298  2e-79  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.989868  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2626  putative ABC transporter ATP-binding protein  35.07 
 
 
578 aa  297  4e-79  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.663821  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1998  putative ABC transporter ATP-binding protein  33.09 
 
 
563 aa  297  4e-79  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.237018  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1864  putative ABC transporter ATP-binding protein  35.25 
 
 
560 aa  297  4e-79  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.733773  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0889  putative ABC transporter ATP-binding protein  35.4 
 
 
554 aa  296  8e-79  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1527  putative ABC transporter ATP-binding protein  34.07 
 
 
559 aa  295  2e-78  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2255  putative ABC transporter ATP-binding protein  33.82 
 
 
555 aa  295  2e-78  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0660  ABC transporter related  33.74 
 
 
626 aa  295  2e-78  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.14515  normal  0.023928 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2441  putative ABC transporter ATP-binding protein  34.46 
 
 
558 aa  294  3e-78  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00204105  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1926  putative ABC transporter ATP-binding protein  34.27 
 
 
559 aa  294  4e-78  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000000896956  normal  0.905041 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1381  ATPase  32.2 
 
 
641 aa  294  4e-78  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.981261  normal  0.290816 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0372  putative ABC transporter ATP-binding protein  35.21 
 
 
556 aa  294  4e-78  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5234  ABC transporter related protein  34.38 
 
 
555 aa  293  5e-78  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.547616  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0762  putative ABC transporter ATP-binding protein  35.77 
 
 
555 aa  293  6e-78  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1644  putative ABC transporter ATP-binding protein  34.27 
 
 
559 aa  293  8e-78  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_12061  ABC transporter ATPase  31.84 
 
 
644 aa  293  9e-78  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.393632  normal  0.504812 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1845  putative ABC transporter ATP-binding protein  34.46 
 
 
556 aa  293  9e-78  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000460921 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6107  ABC transporter related protein  34.36 
 
 
653 aa  291  2e-77  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1117  putative ABC transporter ATP-binding protein  32.34 
 
 
558 aa  291  2e-77  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.406197  hitchhiker  0.00000247304 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0893  putative ABC transporter ATP-binding protein  33.77 
 
 
560 aa  291  2e-77  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.100195  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1403  putative ABC transporter ATP-binding protein  34.19 
 
 
556 aa  291  3e-77  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.595923  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2991  putative ABC transporter ATP-binding protein  34.14 
 
 
559 aa  291  3e-77  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.187094  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3883  putative ABC transporter ATP-binding protein  33.21 
 
 
559 aa  291  4e-77  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1060  putative ABC transporter ATP-binding protein  34.91 
 
 
554 aa  290  5.0000000000000004e-77  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.298194  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0375  ATPase  34.63 
 
 
631 aa  290  5.0000000000000004e-77  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0619  ABC transporter ATP-binding protein uup  30.17 
 
 
646 aa  290  6e-77  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.828103  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0758  putative ABC transporter ATP-binding protein  33.02 
 
 
557 aa  290  7e-77  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2392  putative ABC transporter ATP-binding protein  34.62 
 
 
551 aa  290  8e-77  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.935698  normal  0.570925 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1057  putative ABC transporter ATP-binding protein  33.4 
 
 
559 aa  290  8e-77  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3627  putative ABC transporter ATP-binding protein  33.52 
 
 
551 aa  289  1e-76  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.108497 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2098  putative ABC transporter ATP-binding protein  35.38 
 
 
555 aa  289  1e-76  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.249977 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2008  putative ABC transporter ATP-binding protein  34 
 
 
551 aa  289  1e-76  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0740  putative ABC transporter ATP-binding protein  33.27 
 
 
557 aa  288  2e-76  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2240  putative ABC transporter ATP-binding protein  34 
 
 
551 aa  288  2.9999999999999996e-76  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.497585 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0587  putative ABC transporter ATP-binding protein  34 
 
 
551 aa  288  2.9999999999999996e-76  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0563  putative ABC transporter ATP-binding protein  33.52 
 
 
572 aa  287  4e-76  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.499297  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0809  putative ABC transporter ATP-binding protein  33.58 
 
 
560 aa  287  4e-76  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2105  putative ABC transporter ATP-binding protein  32.91 
 
 
555 aa  287  4e-76  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1296  putative ABC transporter ATP-binding protein  33.39 
 
 
555 aa  287  5e-76  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.341182  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>