More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Syncc9902_1822 on replicon NC_007513
Organism: Synechococcus sp. CC9902



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008820  P9303_03991  ABC transporter ATP-binding protein  74.04 
 
 
652 aa  965    Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0950  ATPase  63.99 
 
 
641 aa  848    Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.61977  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1822  ATPase  100 
 
 
631 aa  1274    Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0514  ATPase  82.78 
 
 
633 aa  1038    Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.11743  normal  0.506629 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_12061  ABC transporter ATPase  62.6 
 
 
644 aa  842    Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.393632  normal  0.504812 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_18141  hypothetical protein  63.68 
 
 
641 aa  838    Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.0376333  normal  0.70207 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2364  ABC transporter related  47.6 
 
 
642 aa  597  1e-169  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.217741  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0299  ABC transporter related  45.65 
 
 
642 aa  593  1e-168  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2312  ABC transporter related  47.99 
 
 
642 aa  588  1e-167  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3020  ABC transporter-like  47.21 
 
 
646 aa  586  1e-166  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.511953  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3547  ABC transporter-like protein protein  46.57 
 
 
640 aa  574  1.0000000000000001e-162  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1381  ATPase  50 
 
 
641 aa  573  1.0000000000000001e-162  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.981261  normal  0.290816 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1814  ABC transporter related  42.95 
 
 
639 aa  523  1e-147  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1040  ABC transporter-related protein  42.45 
 
 
629 aa  507  9.999999999999999e-143  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1447  ABC transporter related  43.1 
 
 
632 aa  496  1e-139  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3220  ABC transporter related  42.84 
 
 
653 aa  498  1e-139  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000221597  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1008  Fis family transcriptional regulator  42.81 
 
 
629 aa  496  1e-139  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1500  ABC transporter related  42.39 
 
 
630 aa  495  9.999999999999999e-139  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.384495  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1823  ABC transporter related  41.85 
 
 
632 aa  487  1e-136  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  decreased coverage  0.00644209  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0718  ABC transporter related  43.22 
 
 
626 aa  485  1e-136  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.332523  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1613  ABC transporter-related protein  42.77 
 
 
630 aa  483  1e-135  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.000050504  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2190  ABC transporter, ATP-binding protein  41.98 
 
 
631 aa  483  1e-135  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.783831 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2308  ABC transporter, ATP-binding protein  41.82 
 
 
631 aa  479  1e-134  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000184058  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2225  ABC transporter, ATP-binding protein  41.82 
 
 
631 aa  478  1e-133  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.0000195061  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2010  ABC transporter ATP-binding protein  41.67 
 
 
631 aa  478  1e-133  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  unclonable  0.00000675061  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1982  ABC transporter, ATP-binding protein  41.67 
 
 
631 aa  478  1e-133  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000663544  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1964  ABC transporter, ATP-binding protein  41.67 
 
 
631 aa  478  1e-133  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0386922  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0780  ATPase  42.72 
 
 
630 aa  476  1e-133  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.989868  normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2164  ABC transporter ATP-binding protein  41.67 
 
 
631 aa  478  1e-133  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00326588  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0123  ABC transporter related  41.46 
 
 
643 aa  476  1e-133  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2000  ABC transporter related  41.67 
 
 
631 aa  473  1e-132  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.000123424  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1571  ABC transporter related  41.82 
 
 
631 aa  472  1e-132  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.459004  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3145  ABC transporter, ATP-binding protein  41.51 
 
 
631 aa  473  1e-132  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.0000000568363  normal  0.0176571 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2173  ABC transporter, ATP-binding protein  41.19 
 
 
631 aa  470  1.0000000000000001e-131  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00208736  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0375  ATPase  41.9 
 
 
631 aa  464  1e-129  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2553  ABC transporter ATPase  39.97 
 
 
642 aa  446  1.0000000000000001e-124  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1225  ABC transporter, ATP-binding protein  40.03 
 
 
623 aa  444  1e-123  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.701491 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2868  ABC transporter, ATP-binding protein  39.81 
 
 
642 aa  442  1e-123  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.914914  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3897  ABC transporter related  37.09 
 
 
613 aa  438  1e-121  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0383  ABC transporter, ATP-binding protein  36.89 
 
 
627 aa  429  1e-119  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.386036  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0768  ABC transporter related  37.5 
 
 
636 aa  431  1e-119  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4406  ABC transporter related protein  38.85 
 
 
630 aa  427  1e-118  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.336146  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_07215  ABC transporter ATP-binding protein  35.9 
 
 
622 aa  426  1e-118  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4996  ABC transporter related  37.85 
 
 
620 aa  426  1e-118  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_2115  ABC transporter related  37.36 
 
 
621 aa  427  1e-118  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.0255573  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4068  ABC transporter related  39.2 
 
 
630 aa  427  1e-118  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.000000802504  hitchhiker  0.000858095 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0800  ABC transporter, ATP-binding protein  38.24 
 
 
622 aa  412  1e-114  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00285677 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1093  ABC transporter related  36.15 
 
 
634 aa  410  1e-113  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0008  ABC transporter related  37.06 
 
 
620 aa  406  1.0000000000000001e-112  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.925372  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2351  putative ABC transporter ATP-binding protein  38.75 
 
 
559 aa  399  1e-109  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.701309  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0760  ABC transporter related  36.54 
 
 
625 aa  399  1e-109  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0743  ABC transporter related  36.54 
 
 
625 aa  399  1e-109  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1340  ABC transporter, ATP-binding protein  37.18 
 
 
622 aa  394  1e-108  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0462  ABC transporter ATPase  38.04 
 
 
626 aa  393  1e-108  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0568  ABC transporter related protein  37.48 
 
 
632 aa  391  1e-107  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0660  ABC transporter related  37.44 
 
 
626 aa  381  1e-104  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.14515  normal  0.023928 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1284  putative ABC transporter ATP-binding protein  38.73 
 
 
670 aa  380  1e-104  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1278  ABC transporter ATPase  35.1 
 
 
625 aa  381  1e-104  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.760109  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0893  putative ABC transporter ATP-binding protein  39.11 
 
 
560 aa  376  1e-103  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.100195  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2105  putative ABC transporter ATP-binding protein  39.25 
 
 
555 aa  376  1e-103  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0238  putative ABC transporter ATP-binding protein  38.49 
 
 
559 aa  374  1e-102  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.331867 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2810  ABC transporter ATPase  39.66 
 
 
631 aa  374  1e-102  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2700  ABC transporter related  37.54 
 
 
640 aa  373  1e-102  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.725807  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1199  ABC transporter related  37.81 
 
 
648 aa  373  1e-102  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.219582  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2255  putative ABC transporter ATP-binding protein  38.06 
 
 
555 aa  373  1e-102  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1648  ABC transporter ATPase  38.36 
 
 
623 aa  374  1e-102  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1614  putative ABC transporter ATP-binding protein  39.67 
 
 
556 aa  372  1e-102  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.682319  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3785  ABC transporter related  37.33 
 
 
628 aa  372  1e-101  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.485733  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1527  putative ABC transporter ATP-binding protein  37.84 
 
 
559 aa  370  1e-101  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0928  ABC transporter related  36.16 
 
 
633 aa  370  1e-101  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.11608e-27 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1329  ABC transporter related protein  40 
 
 
554 aa  371  1e-101  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.461505  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3059  ABC transporter related  37.02 
 
 
628 aa  371  1e-101  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2216  putative ABC transporter ATP-binding protein  39.11 
 
 
547 aa  368  1e-100  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.885012  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2360  ABC transporter related  37.13 
 
 
642 aa  367  1e-100  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.257541  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5234  ABC transporter related protein  38.27 
 
 
555 aa  366  1e-100  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.547616  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2479  ABC transporter-related protein  35.71 
 
 
634 aa  369  1e-100  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0549886  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3318  ABC transporter related protein  36.38 
 
 
632 aa  369  1e-100  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2523  ABC transporter-related protein  37.69 
 
 
641 aa  368  1e-100  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.377883  normal  0.503235 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_08326  putative ATP-binding component of ABC transporter  38.57 
 
 
564 aa  366  1e-100  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0413  ABC transporter related  37.97 
 
 
641 aa  367  1e-100  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  decreased coverage  0.00715783  hitchhiker  0.000000249616 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1281  putative ABC transporter ATP-binding protein  38.73 
 
 
561 aa  365  1e-99  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.0000308368  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4373  ABC transporter-related protein  37.77 
 
 
629 aa  365  1e-99  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0223118  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3285  ABC transporter related  35.99 
 
 
636 aa  365  2e-99  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.000000124669  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2240  putative ABC transporter ATP-binding protein  37.61 
 
 
551 aa  363  5.0000000000000005e-99  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.497585 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0587  putative ABC transporter ATP-binding protein  37.61 
 
 
551 aa  363  5.0000000000000005e-99  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2552  ABC transporter-like protein  39.71 
 
 
554 aa  363  7.0000000000000005e-99  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.410797 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1998  putative ABC transporter ATP-binding protein  37.94 
 
 
563 aa  362  8e-99  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.237018  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2008  putative ABC transporter ATP-binding protein  39.74 
 
 
551 aa  362  1e-98  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5700  ABC transporter, fused ATPase subunits  37.48 
 
 
649 aa  361  2e-98  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1058  putative ABC transporter ATP-binding protein  37.77 
 
 
560 aa  361  2e-98  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_22290  putative ABC transporter ATP-binding protein  39.75 
 
 
559 aa  361  2e-98  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.793295  normal  0.525138 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6107  ABC transporter related protein  37.82 
 
 
653 aa  361  2e-98  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2441  putative ABC transporter ATP-binding protein  38.08 
 
 
558 aa  361  3e-98  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00204105  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1137  putative ABC transporter ATP-binding protein  37.95 
 
 
560 aa  360  4e-98  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  decreased coverage  0.000210355  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3426  putative ABC transporter ATP-binding protein  36.76 
 
 
561 aa  360  5e-98  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1113  ABC transporter ATPase component  36.38 
 
 
635 aa  360  5e-98  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00085111  normal  0.933236 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1644  putative ABC transporter ATP-binding protein  36.87 
 
 
559 aa  360  6e-98  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1845  putative ABC transporter ATP-binding protein  37.38 
 
 
556 aa  360  6e-98  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000460921 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0834  putative ABC transporter ATP-binding protein  36.76 
 
 
561 aa  359  7e-98  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00294599  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0490  putative ABC transporter ATP-binding protein  37.25 
 
 
551 aa  359  7e-98  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.191061  normal  0.167217 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>