More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Synpcc7942_1381 on replicon NC_007604
Organism: Synechococcus elongatus PCC 7942



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013161  Cyan8802_2364  ABC transporter related  56.54 
 
 		 642 aa  758    Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.217741  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3020  ABC transporter-like  58.14 
 
 		 646 aa  759    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.511953  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2312  ABC transporter related  57.17 
 
 		 642 aa  749    Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1381  ATPase  100 
 
 		 641 aa  1287    Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.981261  normal  0.290816 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3547  ABC transporter-like protein protein  56.54 
 
 		 640 aa  730    'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0299  ABC transporter related  55.9 
 
 		 642 aa  753    Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_03991  ABC transporter ATP-binding protein  50.08 
 
 		 652 aa  626  1e-178  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0514  ATPase  51.87 
 
 		 633 aa  612  9.999999999999999e-175  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.11743  normal  0.506629 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0950  ATPase  48.38 
 
 		 641 aa  609  1e-173  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.61977  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_18141  hypothetical protein  47.85 
 
 		 641 aa  608  9.999999999999999e-173  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.0376333  normal  0.70207 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1040  ABC transporter-related protein  48.98 
 
 		 629 aa  603  1.0000000000000001e-171  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1822  ATPase  50.16 
 
 		 631 aa  601  1e-170  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1814  ABC transporter related  46.87 
 
 		 639 aa  591  1e-167  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1447  ABC transporter related  48.28 
 
 		 632 aa  589  1e-167  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1500  ABC transporter related  46.87 
 
 		 630 aa  583  1.0000000000000001e-165  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.384495  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3220  ABC transporter related  46.54 
 
 		 653 aa  582  1.0000000000000001e-165  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000221597  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1008  Fis family transcriptional regulator  46.87 
 
 		 629 aa  580  1e-164  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2553  ABC transporter ATPase  45.65 
 
 		 642 aa  579  1e-164  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2868  ABC transporter, ATP-binding protein  45.26 
 
 		 642 aa  575  1.0000000000000001e-163  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.914914  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1823  ABC transporter related  46.08 
 
 		 632 aa  572  1.0000000000000001e-162  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  decreased coverage  0.00644209  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_12061  ABC transporter ATPase  45.78 
 
 		 644 aa  574  1.0000000000000001e-162  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.393632  normal  0.504812 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1613  ABC transporter-related protein  47.42 
 
 		 630 aa  572  1e-161  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.000050504  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2225  ABC transporter, ATP-binding protein  47.34 
 
 		 631 aa  567  1e-160  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.0000195061  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2308  ABC transporter, ATP-binding protein  47.52 
 
 		 631 aa  566  1e-160  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000184058  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2000  ABC transporter related  47.26 
 
 		 631 aa  562  1.0000000000000001e-159  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.000123424  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1982  ABC transporter, ATP-binding protein  47.42 
 
 		 631 aa  565  1.0000000000000001e-159  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000663544  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1964  ABC transporter, ATP-binding protein  47.42 
 
 		 631 aa  565  1.0000000000000001e-159  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0386922  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0123  ABC transporter related  45.95 
 
 		 643 aa  565  1.0000000000000001e-159  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2173  ABC transporter, ATP-binding protein  47.34 
 
 		 631 aa  563  1.0000000000000001e-159  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00208736  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3145  ABC transporter, ATP-binding protein  47.49 
 
 		 631 aa  563  1.0000000000000001e-159  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.0000000568363  normal  0.0176571 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2010  ABC transporter ATP-binding protein  47.2 
 
 		 631 aa  560  1e-158  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  unclonable  0.00000675061  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2190  ABC transporter, ATP-binding protein  47.2 
 
 		 631 aa  561  1e-158  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.783831 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2164  ABC transporter ATP-binding protein  47.2 
 
 		 631 aa  560  1e-158  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00326588  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0375  ATPase  47.02 
 
 		 631 aa  557  1e-157  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1571  ABC transporter related  46.38 
 
 		 631 aa  557  1e-157  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.459004  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0780  ATPase  45.77 
 
 		 630 aa  538  9.999999999999999e-153  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.989868  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_07215  ABC transporter ATP-binding protein  41.78 
 
 		 622 aa  533  1e-150  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0718  ABC transporter related  46.42 
 
 		 626 aa  532  1e-150  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.332523  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_2115  ABC transporter related  43.26 
 
 		 621 aa  524  1e-147  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.0255573  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4996  ABC transporter related  41.19 
 
 		 620 aa  519  1e-146  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1225  ABC transporter, ATP-binding protein  42.63 
 
 		 623 aa  512  1e-144  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.701491 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4068  ABC transporter related  42.72 
 
 		 630 aa  505  9.999999999999999e-143  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.000000802504  hitchhiker  0.000858095 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3897  ABC transporter related  40.8 
 
 		 613 aa  506  9.999999999999999e-143  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1093  ABC transporter related  40.31 
 
 		 634 aa  508  9.999999999999999e-143  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4406  ABC transporter related protein  42.64 
 
 		 630 aa  508  9.999999999999999e-143  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.336146  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0008  ABC transporter related  38.99 
 
 		 620 aa  490  1e-137  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.925372  normal  1 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0768  ABC transporter related  39.97 
 
 		 636 aa  482  1e-134  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0800  ABC transporter, ATP-binding protein  41.5 
 
 		 622 aa  481  1e-134  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00285677 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0660  ABC transporter related  41.82 
 
 		 626 aa  466  9.999999999999999e-131  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.14515  normal  0.023928 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2360  ABC transporter related  41.93 
 
 		 642 aa  455  1.0000000000000001e-126  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.257541  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0743  ABC transporter related  37.5 
 
 		 625 aa  452  1.0000000000000001e-126  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0760  ABC transporter related  37.5 
 
 		 625 aa  452  1.0000000000000001e-126  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0462  ABC transporter ATPase  41.37 
 
 		 626 aa  450  1e-125  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0383  ABC transporter, ATP-binding protein  36.97 
 
 		 627 aa  446  1.0000000000000001e-124  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.386036  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1340  ABC transporter, ATP-binding protein  39.94 
 
 		 622 aa  447  1.0000000000000001e-124  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3785  ABC transporter related  41.45 
 
 		 628 aa  447  1.0000000000000001e-124  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.485733  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3059  ABC transporter related  41.45 
 
 		 628 aa  448  1.0000000000000001e-124  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1199  ABC transporter related  42.19 
 
 		 648 aa  447  1.0000000000000001e-124  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.219582  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3340  ABC transporter, duplicated ATPase subunits  41.2 
 
 		 645 aa  446  1.0000000000000001e-124  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.790276  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2125  ABC transporter related  40.59 
 
 		 641 aa  443  1e-123  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.279958 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1204  ABC transporter related  41.01 
 
 		 648 aa  444  1e-123  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0899  ABC transporter related  40.83 
 
 		 663 aa  442  9.999999999999999e-123  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.998664  normal  0.488704 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0642  ABC transporter related  41.23 
 
 		 629 aa  439  9.999999999999999e-123  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.64323  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2523  ABC transporter-related protein  40.87 
 
 		 641 aa  442  9.999999999999999e-123  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.377883  normal  0.503235 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0828  ABC transporter related  40.66 
 
 		 636 aa  437  1e-121  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5700  ABC transporter, fused ATPase subunits  40.15 
 
 		 649 aa  436  1e-121  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2382  ABC transporter related  39.63 
 
 		 649 aa  438  1e-121  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.629954  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1749  ABC transporter related  39.47 
 
 		 661 aa  436  1e-121  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2279  ABC transporter related  40.25 
 
 		 649 aa  436  1e-121  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4373  ABC transporter-related protein  41.4 
 
 		 629 aa  437  1e-121  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0223118  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2397  ABC transporter related  40.25 
 
 		 649 aa  437  1e-121  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2361  ABC transporter related  39.47 
 
 		 661 aa  436  1e-121  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0918  ABC transporter related  40.4 
 
 		 688 aa  435  1e-120  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.101083 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3285  ABC transporter related  38.75 
 
 		 636 aa  429  1e-119  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.000000124669  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2810  ABC transporter ATPase  43.14 
 
 		 631 aa  427  1e-118  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2479  ABC transporter-related protein  40.1 
 
 		 634 aa  427  1e-118  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0549886  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0975  ABC transporter ATP-binding protein  40.66 
 
 		 636 aa  424  1e-117  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  decreased coverage  0.000424481  normal  0.109741 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4229  ABC transporter related  40.21 
 
 		 648 aa  422  1e-117  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.868359 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0721  ABC transporter related  41.19 
 
 		 640 aa  419  1e-116  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2700  ABC transporter related  39.35 
 
 		 640 aa  421  1e-116  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.725807  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3318  ABC transporter related protein  38.71 
 
 		 632 aa  421  1e-116  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0413  ABC transporter related  41 
 
 		 641 aa  422  1e-116  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  decreased coverage  0.00715783  hitchhiker  0.000000249616 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1648  ABC transporter ATPase  39.63 
 
 		 623 aa  421  1e-116  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2087  ABC transporter, ATP-binding protein  38.86 
 
 		 648 aa  418  9.999999999999999e-116  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2207  ABC transporter, ATP-binding protein  38.86 
 
 		 648 aa  418  9.999999999999999e-116  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.829349  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2525  ABC transporter, ATP-binding protein  38.86 
 
 		 660 aa  418  9.999999999999999e-116  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0939  ABC transporter, ATP-binding protein  38.7 
 
 		 648 aa  417  9.999999999999999e-116  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0496893  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1136  ABC transporter, ATP-binding protein  38.86 
 
 		 660 aa  417  9.999999999999999e-116  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1144  ABC transporter, ATP-binding protein  38.86 
 
 		 660 aa  417  9.999999999999999e-116  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.261137  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0693  ABC transporter, ATP-binding protein  38.86 
 
 		 648 aa  418  9.999999999999999e-116  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1278  ABC transporter ATPase  37.87 
 
 		 625 aa  419  9.999999999999999e-116  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.760109  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0928  ABC transporter related  38.34 
 
 		 633 aa  415  1e-114  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.11608e-27 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3830  ABC transporter-related protein  41.42 
 
 		 632 aa  413  1e-114  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.457691 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1126  ABC transporter related  40.65 
 
 		 634 aa  414  1e-114  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  0.239651 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1298  ABC transporter, ATP-binding protein  38.86 
 
 		 1065 aa  414  1e-114  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.524137  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0568  ABC transporter related protein  37.09 
 
 		 632 aa  412  1e-114  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2351  putative ABC transporter ATP-binding protein  40.62 
 
 		 559 aa  415  1e-114  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.701309  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4771  ABC transporter related  40.79 
 
 		 635 aa  414  1e-114  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2171  ABC transporter related  40.9 
 
 		 645 aa  405  1.0000000000000001e-112  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.380674  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2105  putative ABC transporter ATP-binding protein  41.75 
 
 		 555 aa  405  1e-111  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>