More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gbem_3318 on replicon NC_011146
Organism: Geobacter bemidjiensis Bem



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009483  Gura_3285  ABC transporter related  69.39 
 
 		 636 aa  871    Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.000000124669  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3318  ABC transporter related protein  100 
 
 		 632 aa  1286    Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2479  ABC transporter-related protein  64.95 
 
 		 634 aa  774    Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0549886  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0928  ABC transporter related  95.72 
 
 		 633 aa  1184    Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.11608e-27 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2061  ABC transporter, ATPase subunit  43.34 
 
 		 654 aa  470  1.0000000000000001e-131  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3380  ABC transporter related  42.6 
 
 		 651 aa  462  1e-129  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1895  ABC transporter related  42.6 
 
 		 656 aa  462  1e-129  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.438014  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1816  ABC transporter-related protein  42.9 
 
 		 654 aa  458  1e-127  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0210138  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2312  ABC transporter related  38.47 
 
 		 642 aa  455  1.0000000000000001e-126  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1040  ABC transporter-related protein  40.25 
 
 		 629 aa  454  1.0000000000000001e-126  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1644  putative ABC transporter ATP-binding protein  41.92 
 
 		 559 aa  451  1e-125  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0568  ABC transporter related protein  39.12 
 
 		 632 aa  450  1e-125  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1057  putative ABC transporter ATP-binding protein  40.84 
 
 		 559 aa  449  1e-125  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2364  ABC transporter related  37.75 
 
 		 642 aa  449  1e-125  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.217741  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1794  putative ABC transporter ATP-binding protein  43.16 
 
 		 555 aa  444  1e-123  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.482874  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0834  putative ABC transporter ATP-binding protein  40.96 
 
 		 561 aa  444  1e-123  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00294599  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2441  putative ABC transporter ATP-binding protein  42.06 
 
 		 558 aa  445  1e-123  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00204105  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6107  ABC transporter related protein  39.91 
 
 		 653 aa  445  1e-123  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1500  ABC transporter related  38.41 
 
 		 630 aa  444  1e-123  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.384495  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0642  ABC transporter related  40.44 
 
 		 629 aa  443  1e-123  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.64323  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2279  ABC transporter related  38.39 
 
 		 649 aa  443  1e-123  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0299  ABC transporter related  38.31 
 
 		 642 aa  442  1e-123  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1466  putative ABC transporter ATP-binding protein  43.32 
 
 		 558 aa  441  9.999999999999999e-123  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.000105508  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4373  ABC transporter-related protein  41.12 
 
 		 629 aa  440  9.999999999999999e-123  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0223118  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1926  putative ABC transporter ATP-binding protein  40 
 
 		 559 aa  441  9.999999999999999e-123  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000000896956  normal  0.905041 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3426  putative ABC transporter ATP-binding protein  40.77 
 
 		 561 aa  441  9.999999999999999e-123  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2700  ABC transporter related  40.54 
 
 		 640 aa  442  9.999999999999999e-123  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.725807  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1204  ABC transporter related  38.73 
 
 		 648 aa  440  9.999999999999999e-123  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0939  ABC transporter, ATP-binding protein  39.16 
 
 		 648 aa  439  9.999999999999999e-123  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0496893  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2351  putative ABC transporter ATP-binding protein  42.37 
 
 		 559 aa  439  9.999999999999999e-123  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.701309  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5234  ABC transporter related protein  40.84 
 
 		 555 aa  439  9.999999999999999e-123  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.547616  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2397  ABC transporter related  38.39 
 
 		 649 aa  442  9.999999999999999e-123  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0918  ABC transporter related  38.85 
 
 		 688 aa  441  9.999999999999999e-123  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.101083 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3241  putative ABC transporter ATP-binding protein  40.25 
 
 		 561 aa  441  9.999999999999999e-123  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000308971  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_08326  putative ATP-binding component of ABC transporter  40.71 
 
 		 564 aa  437  1e-121  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2382  ABC transporter related  38.7 
 
 		 649 aa  436  1e-121  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.629954  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1144  ABC transporter, ATP-binding protein  39.32 
 
 		 660 aa  436  1e-121  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.261137  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2207  ABC transporter, ATP-binding protein  39.32 
 
 		 648 aa  436  1e-121  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.829349  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2991  putative ABC transporter ATP-binding protein  42.52 
 
 		 559 aa  436  1e-121  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.187094  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2087  ABC transporter, ATP-binding protein  39.32 
 
 		 648 aa  436  1e-121  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0693  ABC transporter, ATP-binding protein  39.32 
 
 		 648 aa  436  1e-121  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1749  ABC transporter related  38.7 
 
 		 661 aa  436  1e-121  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2525  ABC transporter, ATP-binding protein  39.32 
 
 		 660 aa  436  1e-121  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0181  ferric-enterobactin ABC transporter ATPase  41.03 
 
 		 626 aa  437  1e-121  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.530164  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3426  ABC transporter related protein  43.17 
 
 		 554 aa  436  1e-121  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.543642 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1136  ABC transporter, ATP-binding protein  39.32 
 
 		 660 aa  436  1e-121  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2361  ABC transporter related  38.7 
 
 		 661 aa  436  1e-121  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2225  ABC transporter, ATP-binding protein  39.06 
 
 		 631 aa  432  1e-120  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.0000195061  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1982  ABC transporter, ATP-binding protein  39.06 
 
 		 631 aa  434  1e-120  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000663544  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1964  ABC transporter, ATP-binding protein  39.06 
 
 		 631 aa  434  1e-120  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0386922  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0893  putative ABC transporter ATP-binding protein  41.21 
 
 		 560 aa  434  1e-120  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.100195  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2360  ABC transporter related  39.75 
 
 		 642 aa  435  1e-120  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.257541  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003440  ABC transporter ATP-binding protein uup  37.6 
 
 		 639 aa  433  1e-120  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.550149  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1298  ABC transporter, ATP-binding protein  39.32 
 
 		 1065 aa  432  1e-120  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.524137  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5700  ABC transporter, fused ATPase subunits  38.12 
 
 		 649 aa  432  1e-120  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1613  ABC transporter-related protein  38.69 
 
 		 630 aa  434  1e-120  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.000050504  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0721  ABC transporter related  40.87 
 
 		 640 aa  432  1e-120  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1442  putative ABC transporter ATP-binding protein  43.74 
 
 		 559 aa  432  1e-120  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.465539  normal  0.471645 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1117  putative ABC transporter ATP-binding protein  39.96 
 
 		 558 aa  433  1e-120  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.406197  hitchhiker  0.00000247304 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1199  ABC transporter related  39.81 
 
 		 648 aa  433  1e-120  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.219582  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4229  ABC transporter related  39.7 
 
 		 648 aa  434  1e-120  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.868359 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3340  ABC transporter, duplicated ATPase subunits  38.45 
 
 		 645 aa  434  1e-120  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.790276  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5309  ABC transporter related protein  42.72 
 
 		 559 aa  432  1e-120  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1284  putative ABC transporter ATP-binding protein  41.51 
 
 		 670 aa  435  1e-120  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0661  putative ABC transporter ATP-binding protein  42.53 
 
 		 560 aa  433  1e-120  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1522  ABC transporter related protein  43.53 
 
 		 556 aa  433  1e-120  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.256666  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0660  ABC transporter related  39.59 
 
 		 626 aa  434  1e-120  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.14515  normal  0.023928 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_4019  putative ABC transporter ATP-binding protein  40.56 
 
 		 561 aa  435  1e-120  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.186099 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2308  ABC transporter, ATP-binding protein  39.06 
 
 		 631 aa  434  1e-120  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000184058  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2125  ABC transporter related  38.88 
 
 		 641 aa  433  1e-120  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.279958 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1447  ABC transporter related  38.64 
 
 		 632 aa  431  1e-119  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1853  ABC transporter ATPase component  37.91 
 
 		 640 aa  432  1e-119  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2010  ABC transporter ATP-binding protein  38.9 
 
 		 631 aa  429  1e-119  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  unclonable  0.00000675061  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3785  ABC transporter related  40.19 
 
 		 628 aa  431  1e-119  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.485733  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2216  putative ABC transporter ATP-binding protein  43.07 
 
 		 547 aa  431  1e-119  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.885012  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1281  putative ABC transporter ATP-binding protein  41.38 
 
 		 561 aa  431  1e-119  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.0000308368  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2164  ABC transporter ATP-binding protein  38.9 
 
 		 631 aa  429  1e-119  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00326588  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2190  ABC transporter, ATP-binding protein  38.9 
 
 		 631 aa  432  1e-119  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.783831 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0238  putative ABC transporter ATP-binding protein  41.4 
 
 		 559 aa  429  1e-119  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.331867 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1571  ABC transporter related  38.96 
 
 		 631 aa  430  1e-119  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.459004  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2255  putative ABC transporter ATP-binding protein  41.62 
 
 		 555 aa  429  1e-119  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1126  ABC transporter related  40.44 
 
 		 634 aa  431  1e-119  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  0.239651 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1117  putative ABC transporter ATP-binding protein  42.11 
 
 		 550 aa  432  1e-119  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.188653 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4119  putative ABC transporter ATP-binding protein  41.65 
 
 		 555 aa  431  1e-119  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2105  putative ABC transporter ATP-binding protein  42.21 
 
 		 555 aa  431  1e-119  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1614  putative ABC transporter ATP-binding protein  43.29 
 
 		 556 aa  432  1e-119  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.682319  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2568  ABC transporter ATPase component  37.85 
 
 		 641 aa  428  1e-118  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.452475  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0490  putative ABC transporter ATP-binding protein  41.76 
 
 		 551 aa  429  1e-118  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.191061  normal  0.167217 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3883  putative ABC transporter ATP-binding protein  41.52 
 
 		 559 aa  428  1e-118  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0838  ABC transporter related  39.69 
 
 		 646 aa  427  1e-118  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.0257096 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2000  ABC transporter related  38.77 
 
 		 631 aa  428  1e-118  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.000123424  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3145  ABC transporter, ATP-binding protein  38.9 
 
 		 631 aa  428  1e-118  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.0000000568363  normal  0.0176571 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1776  ABC transporter ATPase component  37.85 
 
 		 641 aa  428  1e-118  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.205391  hitchhiker  0.000192841 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2683  ABC transporter ATPase component  37.85 
 
 		 641 aa  428  1e-118  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0324813  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3452  putative ABC transporter ATP-binding protein  42.31 
 
 		 549 aa  428  1e-118  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.747993  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1634  ABC transporter ATPase component  37.54 
 
 		 641 aa  426  1e-118  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.202979  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2916  putative ABC transporter ATP-binding protein  39.78 
 
 		 563 aa  426  1e-118  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0621526  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3547  ABC transporter-like protein protein  38.41 
 
 		 640 aa  426  1e-118  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1603  ABC transporter ATPase component  37.44 
 
 		 640 aa  427  1e-118  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0251377  normal  0.331537 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_10980  putative ABC transporter ATP-binding protein  44.42 
 
 		 558 aa  427  1e-118  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>