More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PMN2A_0950 on replicon NC_007335
Organism: Prochlorococcus marinus str. NATL2A



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007335  PMN2A_0950  ATPase  100 
 
 
641 aa  1301    Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.61977  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_18141  hypothetical protein  97.5 
 
 
641 aa  1267    Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.0376333  normal  0.70207 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1822  ATPase  63.99 
 
 
631 aa  835    Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0514  ATPase  64.78 
 
 
633 aa  837    Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.11743  normal  0.506629 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_12061  ABC transporter ATPase  68.69 
 
 
644 aa  911    Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.393632  normal  0.504812 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_03991  ABC transporter ATP-binding protein  65.02 
 
 
652 aa  877    Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2364  ABC transporter related  50.23 
 
 
642 aa  634  1e-180  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.217741  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2312  ABC transporter related  50.23 
 
 
642 aa  618  1e-176  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0299  ABC transporter related  47.83 
 
 
642 aa  606  9.999999999999999e-173  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3020  ABC transporter-like  47.76 
 
 
646 aa  600  1e-170  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.511953  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3547  ABC transporter-like protein protein  46.76 
 
 
640 aa  573  1.0000000000000001e-162  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1381  ATPase  48.07 
 
 
641 aa  566  1e-160  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.981261  normal  0.290816 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1500  ABC transporter related  42.7 
 
 
630 aa  506  9.999999999999999e-143  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.384495  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1040  ABC transporter-related protein  43.23 
 
 
629 aa  507  9.999999999999999e-143  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0123  ABC transporter related  43.38 
 
 
643 aa  496  1e-139  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1814  ABC transporter related  41.68 
 
 
639 aa  498  1e-139  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1008  Fis family transcriptional regulator  42.26 
 
 
629 aa  497  1e-139  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3220  ABC transporter related  40.92 
 
 
653 aa  489  1e-137  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000221597  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1823  ABC transporter related  42.49 
 
 
632 aa  487  1e-136  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  decreased coverage  0.00644209  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1447  ABC transporter related  41.97 
 
 
632 aa  488  1e-136  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0718  ABC transporter related  40.9 
 
 
626 aa  478  1e-133  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.332523  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0375  ATPase  41.28 
 
 
631 aa  473  1e-132  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1613  ABC transporter-related protein  41.09 
 
 
630 aa  470  1.0000000000000001e-131  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.000050504  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2308  ABC transporter, ATP-binding protein  40.46 
 
 
631 aa  466  9.999999999999999e-131  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000184058  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2225  ABC transporter, ATP-binding protein  40.46 
 
 
631 aa  466  9.999999999999999e-131  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.0000195061  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2190  ABC transporter, ATP-binding protein  40.78 
 
 
631 aa  468  9.999999999999999e-131  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.783831 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1982  ABC transporter, ATP-binding protein  40.46 
 
 
631 aa  466  9.999999999999999e-131  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000663544  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1964  ABC transporter, ATP-binding protein  40.46 
 
 
631 aa  466  9.999999999999999e-131  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0386922  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0780  ATPase  40.75 
 
 
630 aa  466  9.999999999999999e-131  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.989868  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2000  ABC transporter related  40.31 
 
 
631 aa  466  9.999999999999999e-131  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.000123424  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2010  ABC transporter ATP-binding protein  40.31 
 
 
631 aa  464  1e-129  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  unclonable  0.00000675061  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2164  ABC transporter ATP-binding protein  40.31 
 
 
631 aa  464  1e-129  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00326588  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3145  ABC transporter, ATP-binding protein  40 
 
 
631 aa  462  1e-129  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.0000000568363  normal  0.0176571 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2173  ABC transporter, ATP-binding protein  40 
 
 
631 aa  463  1e-129  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00208736  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2553  ABC transporter ATPase  41.74 
 
 
642 aa  456  1e-127  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1571  ABC transporter related  39.78 
 
 
631 aa  453  1.0000000000000001e-126  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.459004  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2868  ABC transporter, ATP-binding protein  41.28 
 
 
642 aa  452  1.0000000000000001e-126  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.914914  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0768  ABC transporter related  39.59 
 
 
636 aa  444  1e-123  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1225  ABC transporter, ATP-binding protein  38.27 
 
 
623 aa  444  1e-123  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.701491 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3897  ABC transporter related  38.3 
 
 
613 aa  441  9.999999999999999e-123  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_07215  ABC transporter ATP-binding protein  38.27 
 
 
622 aa  436  1e-121  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_2115  ABC transporter related  38.79 
 
 
621 aa  425  1e-117  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.0255573  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4406  ABC transporter related protein  39.31 
 
 
630 aa  425  1e-117  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.336146  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4068  ABC transporter related  38.22 
 
 
630 aa  422  1e-117  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.000000802504  hitchhiker  0.000858095 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4996  ABC transporter related  38.14 
 
 
620 aa  420  1e-116  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0383  ABC transporter, ATP-binding protein  35.85 
 
 
627 aa  414  1e-114  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.386036  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1340  ABC transporter, ATP-binding protein  38.35 
 
 
622 aa  411  1e-113  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0800  ABC transporter, ATP-binding protein  37.98 
 
 
622 aa  412  1e-113  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00285677 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1278  ABC transporter ATPase  36.52 
 
 
625 aa  410  1e-113  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.760109  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0008  ABC transporter related  36.97 
 
 
620 aa  406  1.0000000000000001e-112  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.925372  normal 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0743  ABC transporter related  35.17 
 
 
625 aa  400  9.999999999999999e-111  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0760  ABC transporter related  35.17 
 
 
625 aa  400  9.999999999999999e-111  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0462  ABC transporter ATPase  37.93 
 
 
626 aa  400  9.999999999999999e-111  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1093  ABC transporter related  34.83 
 
 
634 aa  397  1e-109  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0660  ABC transporter related  36.88 
 
 
626 aa  390  1e-107  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.14515  normal  0.023928 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1527  putative ABC transporter ATP-binding protein  39.47 
 
 
559 aa  383  1e-105  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2351  putative ABC transporter ATP-binding protein  38.94 
 
 
559 aa  385  1e-105  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.701309  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2810  ABC transporter ATPase  37.42 
 
 
631 aa  376  1e-103  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3285  ABC transporter related  36.69 
 
 
636 aa  372  1e-101  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.000000124669  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3318  ABC transporter related protein  35.67 
 
 
632 aa  370  1e-101  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2105  putative ABC transporter ATP-binding protein  38.33 
 
 
555 aa  372  1e-101  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1329  ABC transporter related protein  39.34 
 
 
554 aa  370  1e-101  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.461505  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4119  putative ABC transporter ATP-binding protein  39.42 
 
 
555 aa  366  1e-100  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0928  ABC transporter related  35.3 
 
 
633 aa  367  1e-100  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.11608e-27 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3059  ABC transporter related  37.19 
 
 
628 aa  366  1e-100  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2360  ABC transporter related  35.76 
 
 
642 aa  365  1e-99  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.257541  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0568  ABC transporter related protein  35.11 
 
 
632 aa  365  2e-99  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2700  ABC transporter related  34.87 
 
 
640 aa  365  2e-99  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.725807  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2255  putative ABC transporter ATP-binding protein  38.4 
 
 
555 aa  365  2e-99  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1648  ABC transporter ATPase  35.84 
 
 
623 aa  365  2e-99  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2479  ABC transporter-related protein  36.32 
 
 
634 aa  364  3e-99  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0549886  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3785  ABC transporter related  36.78 
 
 
628 aa  364  3e-99  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.485733  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0238  putative ABC transporter ATP-binding protein  38.3 
 
 
559 aa  364  3e-99  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.331867 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1281  putative ABC transporter ATP-binding protein  36.87 
 
 
561 aa  363  4e-99  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.0000308368  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0893  putative ABC transporter ATP-binding protein  38.18 
 
 
560 aa  362  1e-98  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.100195  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0642  ABC transporter related  35.82 
 
 
629 aa  362  1e-98  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.64323  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1199  ABC transporter related  35.98 
 
 
648 aa  362  1e-98  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.219582  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1117  putative ABC transporter ATP-binding protein  38.29 
 
 
558 aa  362  1e-98  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.406197  hitchhiker  0.00000247304 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1137  putative ABC transporter ATP-binding protein  36.31 
 
 
560 aa  362  1e-98  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  decreased coverage  0.000210355  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2523  ABC transporter-related protein  36.07 
 
 
641 aa  361  2e-98  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.377883  normal  0.503235 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1284  putative ABC transporter ATP-binding protein  36.18 
 
 
670 aa  360  4e-98  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2441  putative ABC transporter ATP-binding protein  37.08 
 
 
558 aa  358  1.9999999999999998e-97  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00204105  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0889  putative ABC transporter ATP-binding protein  39.42 
 
 
554 aa  358  1.9999999999999998e-97  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0490  putative ABC transporter ATP-binding protein  37.64 
 
 
551 aa  358  1.9999999999999998e-97  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.191061  normal  0.167217 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_08326  putative ATP-binding component of ABC transporter  37.43 
 
 
564 aa  357  2.9999999999999997e-97  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1794  putative ABC transporter ATP-binding protein  37.64 
 
 
555 aa  357  5e-97  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.482874  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3426  ABC transporter related protein  37.37 
 
 
554 aa  356  7.999999999999999e-97  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.543642 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1058  putative ABC transporter ATP-binding protein  35.75 
 
 
560 aa  356  8.999999999999999e-97  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1998  putative ABC transporter ATP-binding protein  38.08 
 
 
563 aa  356  8.999999999999999e-97  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.237018  n/a   
 
 
-
 
NC_009357  OSTLU_30493  ABC(ATP-binding) family transporter  37.21 
 
 
723 aa  355  1e-96  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal  0.658611 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0587  putative ABC transporter ATP-binding protein  37.26 
 
 
551 aa  355  1e-96  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3380  ABC transporter related  34.59 
 
 
651 aa  355  1e-96  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2171  ABC transporter related  35.13 
 
 
645 aa  355  1e-96  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.380674  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2240  putative ABC transporter ATP-binding protein  37.26 
 
 
551 aa  355  1e-96  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.497585 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1845  putative ABC transporter ATP-binding protein  38.21 
 
 
556 aa  355  1e-96  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000460921 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2098  putative ABC transporter ATP-binding protein  38.39 
 
 
555 aa  354  2e-96  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.249977 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0740  putative ABC transporter ATP-binding protein  37.48 
 
 
557 aa  354  2.9999999999999997e-96  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2580  putative ABC transporter ATP-binding protein  35.2 
 
 
560 aa  354  2.9999999999999997e-96  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.471915  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1644  putative ABC transporter ATP-binding protein  36.14 
 
 
559 aa  353  4e-96  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0431  putative ATP-binding component of a transport system  37.65 
 
 
641 aa  353  4e-96  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000000359167  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>