More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Lreu_0768 on replicon NC_009513
Organism: Lactobacillus reuteri DSM 20016



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009513  Lreu_0768  ABC transporter related  100 
 
 		 636 aa  1295    Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1278  ABC transporter ATPase  59.4 
 
 		 625 aa  754    Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.760109  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1571  ABC transporter related  49.92 
 
 		 631 aa  615  9.999999999999999e-175  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.459004  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2190  ABC transporter, ATP-binding protein  49.13 
 
 		 631 aa  613  9.999999999999999e-175  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.783831 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2173  ABC transporter, ATP-binding protein  48.82 
 
 		 631 aa  609  1e-173  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00208736  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2308  ABC transporter, ATP-binding protein  48.98 
 
 		 631 aa  609  1e-173  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000184058  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1982  ABC transporter, ATP-binding protein  48.98 
 
 		 631 aa  608  1e-173  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000663544  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1964  ABC transporter, ATP-binding protein  48.98 
 
 		 631 aa  608  1e-173  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0386922  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2225  ABC transporter, ATP-binding protein  48.98 
 
 		 631 aa  608  9.999999999999999e-173  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.0000195061  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2010  ABC transporter ATP-binding protein  48.82 
 
 		 631 aa  607  9.999999999999999e-173  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  unclonable  0.00000675061  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3145  ABC transporter, ATP-binding protein  48.82 
 
 		 631 aa  607  9.999999999999999e-173  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.0000000568363  normal  0.0176571 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2164  ABC transporter ATP-binding protein  48.82 
 
 		 631 aa  607  9.999999999999999e-173  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00326588  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2000  ABC transporter related  48.5 
 
 		 631 aa  604  1.0000000000000001e-171  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.000123424  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1613  ABC transporter-related protein  47.96 
 
 		 630 aa  590  1e-167  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.000050504  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1340  ABC transporter, ATP-binding protein  47.63 
 
 		 622 aa  573  1.0000000000000001e-162  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0462  ABC transporter ATPase  48.82 
 
 		 626 aa  568  1e-160  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0383  ABC transporter, ATP-binding protein  44.71 
 
 		 627 aa  552  1e-156  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.386036  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3220  ABC transporter related  43.67 
 
 		 653 aa  553  1e-156  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000221597  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1648  ABC transporter ATPase  47.57 
 
 		 623 aa  552  1e-156  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1814  ABC transporter related  43.44 
 
 		 639 aa  549  1e-155  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0743  ABC transporter related  43.81 
 
 		 625 aa  535  1e-151  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0760  ABC transporter related  43.81 
 
 		 625 aa  535  1e-151  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2553  ABC transporter ATPase  44.03 
 
 		 642 aa  533  1e-150  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2868  ABC transporter, ATP-binding protein  43.64 
 
 		 642 aa  531  1e-149  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.914914  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0123  ABC transporter related  43.53 
 
 		 643 aa  528  1e-148  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1500  ABC transporter related  42.68 
 
 		 630 aa  525  1e-147  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.384495  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1447  ABC transporter related  42.5 
 
 		 632 aa  516  1.0000000000000001e-145  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1040  ABC transporter-related protein  41.77 
 
 		 629 aa  516  1.0000000000000001e-145  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1008  Fis family transcriptional regulator  43.06 
 
 		 629 aa  516  1.0000000000000001e-145  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3897  ABC transporter related  42.15 
 
 		 613 aa  507  9.999999999999999e-143  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1823  ABC transporter related  41.42 
 
 		 632 aa  507  9.999999999999999e-143  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  decreased coverage  0.00644209  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0299  ABC transporter related  39.75 
 
 		 642 aa  499  1e-140  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_07215  ABC transporter ATP-binding protein  41.2 
 
 		 622 aa  497  1e-139  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2312  ABC transporter related  40.13 
 
 		 642 aa  491  1e-137  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0780  ATPase  41.1 
 
 		 630 aa  486  1e-136  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.989868  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2364  ABC transporter related  39.47 
 
 		 642 aa  488  1e-136  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.217741  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_2115  ABC transporter related  38.84 
 
 		 621 aa  482  1e-135  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.0255573  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0375  ATPase  41.91 
 
 		 631 aa  479  1e-134  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3020  ABC transporter-like  40.38 
 
 		 646 aa  477  1e-133  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.511953  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1093  ABC transporter related  39.56 
 
 		 634 aa  470  1.0000000000000001e-131  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4406  ABC transporter related protein  39.06 
 
 		 630 aa  471  1.0000000000000001e-131  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.336146  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3547  ABC transporter-like protein protein  40.03 
 
 		 640 aa  468  9.999999999999999e-131  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4996  ABC transporter related  39.06 
 
 		 620 aa  455  1.0000000000000001e-126  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0718  ABC transporter related  38.55 
 
 		 626 aa  454  1.0000000000000001e-126  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.332523  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0008  ABC transporter related  38.39 
 
 		 620 aa  451  1e-125  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.925372  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4068  ABC transporter related  39.97 
 
 		 630 aa  450  1e-125  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.000000802504  hitchhiker  0.000858095 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_18141  hypothetical protein  39.75 
 
 		 641 aa  446  1.0000000000000001e-124  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.0376333  normal  0.70207 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0950  ATPase  39.59 
 
 		 641 aa  444  1e-123  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.61977  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0800  ABC transporter, ATP-binding protein  37.28 
 
 		 622 aa  442  1e-123  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00285677 
 
 
-
 
NC_002950  PG1225  ABC transporter, ATP-binding protein  37.68 
 
 		 623 aa  441  9.999999999999999e-123  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.701491 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1381  ATPase  39.51 
 
 		 641 aa  436  1e-121  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.981261  normal  0.290816 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0514  ATPase  37.56 
 
 		 633 aa  431  1e-119  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.11743  normal  0.506629 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_03991  ABC transporter ATP-binding protein  37.67 
 
 		 652 aa  427  1e-118  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1822  ATPase  37.5 
 
 		 631 aa  428  1e-118  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_12061  ABC transporter ATPase  37.26 
 
 		 644 aa  417  9.999999999999999e-116  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.393632  normal  0.504812 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3285  ABC transporter related  36.26 
 
 		 636 aa  398  1e-109  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.000000124669  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0409  ABC transporter, ATP-binding subunit  37.78 
 
 		 596 aa  397  1e-109  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.722245  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2479  ABC transporter-related protein  37.19 
 
 		 634 aa  389  1e-107  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0549886  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0928  ABC transporter related  35.01 
 
 		 633 aa  389  1e-106  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.11608e-27 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3318  ABC transporter related protein  35.71 
 
 		 632 aa  387  1e-106  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009357  OSTLU_30493  ABC(ATP-binding) family transporter  35.63 
 
 		 723 aa  385  1e-105  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.658611 
 
 
-
 
NC_011697  PHATRDRAFT_41351  predicted protein  34.08 
 
 		 679 aa  381  1e-104  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2360  ABC transporter related  34.71 
 
 		 642 aa  373  1e-102  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.257541  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0650  ABC transporter related  35.14 
 
 		 590 aa  375  1e-102  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_08326  putative ATP-binding component of ABC transporter  38.76 
 
 		 564 aa  374  1e-102  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3007  ABC transporter related  34.87 
 
 		 600 aa  367  1e-100  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.333265  normal  0.911038 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0661  putative ABC transporter ATP-binding protein  37.52 
 
 		 560 aa  369  1e-100  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1058  putative ABC transporter ATP-binding protein  36.97 
 
 		 560 aa  369  1e-100  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1117  putative ABC transporter ATP-binding protein  38.42 
 
 		 558 aa  366  1e-100  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.406197  hitchhiker  0.00000247304 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2963  ABC transporter related  34.87 
 
 		 600 aa  367  1e-100  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.616286  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0918  ABC transporter related  33.9 
 
 		 688 aa  369  1e-100  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.101083 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2523  ABC transporter-related protein  33.33 
 
 		 641 aa  365  1e-99  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.377883  normal  0.503235 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2397  ABC transporter related  33.23 
 
 		 649 aa  365  1e-99  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3161  ABC transporter-like protein  36.09 
 
 		 608 aa  365  2e-99  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.970833 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3959  ABC transporter related  33.44 
 
 		 612 aa  365  2e-99  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.143764  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2441  putative ABC transporter ATP-binding protein  36.21 
 
 		 558 aa  364  2e-99  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00204105  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0499  ABC transporter related  34.33 
 
 		 631 aa  365  2e-99  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.107412  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0828  ABC transporter related  34.29 
 
 		 636 aa  363  4e-99  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2351  putative ABC transporter ATP-binding protein  36.19 
 
 		 559 aa  363  4e-99  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.701309  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0899  ABC transporter related  34.34 
 
 		 663 aa  363  4e-99  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.998664  normal  0.488704 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2279  ABC transporter related  33.07 
 
 		 649 aa  363  4e-99  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1137  putative ABC transporter ATP-binding protein  37.06 
 
 		 560 aa  363  6e-99  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  decreased coverage  0.000210355  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1466  putative ABC transporter ATP-binding protein  38.68 
 
 		 558 aa  363  6e-99  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.000105508  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5700  ABC transporter, fused ATPase subunits  33.23 
 
 		 649 aa  362  1e-98  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2382  ABC transporter related  33.44 
 
 		 649 aa  362  1e-98  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.629954  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1845  putative ABC transporter ATP-binding protein  38.98 
 
 		 556 aa  362  1e-98  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000460921 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0660  ABC transporter related  35.49 
 
 		 626 aa  361  2e-98  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.14515  normal  0.023928 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2580  putative ABC transporter ATP-binding protein  37.69 
 
 		 560 aa  361  2e-98  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.471915  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1281  putative ABC transporter ATP-binding protein  37.06 
 
 		 561 aa  360  4e-98  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.0000308368  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1749  ABC transporter related  33.28 
 
 		 661 aa  360  4e-98  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1998  putative ABC transporter ATP-binding protein  37.57 
 
 		 563 aa  360  4e-98  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.237018  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2361  ABC transporter related  33.28 
 
 		 661 aa  360  4e-98  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0834  putative ABC transporter ATP-binding protein  37.07 
 
 		 561 aa  360  6e-98  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00294599  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3426  putative ABC transporter ATP-binding protein  37.07 
 
 		 561 aa  359  8e-98  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0975  ABC transporter ATP-binding protein  34.33 
 
 		 636 aa  358  1.9999999999999998e-97  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  decreased coverage  0.000424481  normal  0.109741 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_32430  ATPase component of ABC transporters with duplicated ATPase domain protein  34.96 
 
 		 600 aa  358  1.9999999999999998e-97  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.775156  normal  0.436846 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_03410  ATPase component of ABC transporters with duplicated ATPase domain  33.9 
 
 		 628 aa  358  1.9999999999999998e-97  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3854  ABC transporter related  34.76 
 
 		 611 aa  358  1.9999999999999998e-97  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.53962  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2700  ABC transporter related  33.28 
 
 		 640 aa  357  2.9999999999999997e-97  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.725807  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1204  ABC transporter related  35.18 
 
 		 648 aa  357  3.9999999999999996e-97  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>