More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SERP0383 on replicon NC_002976
Organism: Staphylococcus epidermidis RP62A



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002976  SERP0383  ABC transporter, ATP-binding protein  100 
 
 		 627 aa  1280    Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.386036  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0760  ABC transporter related  80.22 
 
 		 625 aa  1025    Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0743  ABC transporter related  80.22 
 
 		 625 aa  1025    Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1571  ABC transporter related  48.42 
 
 		 631 aa  570  1e-161  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.459004  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0768  ABC transporter related  44.71 
 
 		 636 aa  552  1e-156  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2000  ABC transporter related  45.73 
 
 		 631 aa  548  1e-155  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.000123424  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3145  ABC transporter, ATP-binding protein  45.97 
 
 		 631 aa  551  1e-155  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.0000000568363  normal  0.0176571 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2190  ABC transporter, ATP-binding protein  46.04 
 
 		 631 aa  551  1e-155  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.783831 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1982  ABC transporter, ATP-binding protein  45.97 
 
 		 631 aa  550  1e-155  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000663544  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1964  ABC transporter, ATP-binding protein  45.97 
 
 		 631 aa  550  1e-155  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0386922  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2173  ABC transporter, ATP-binding protein  45.66 
 
 		 631 aa  551  1e-155  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00208736  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2308  ABC transporter, ATP-binding protein  45.97 
 
 		 631 aa  549  1e-155  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000184058  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1613  ABC transporter-related protein  46.03 
 
 		 630 aa  549  1e-155  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.000050504  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2225  ABC transporter, ATP-binding protein  45.97 
 
 		 631 aa  546  1e-154  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.0000195061  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2010  ABC transporter ATP-binding protein  45.66 
 
 		 631 aa  546  1e-154  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  unclonable  0.00000675061  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2164  ABC transporter ATP-binding protein  45.66 
 
 		 631 aa  546  1e-154  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00326588  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3220  ABC transporter related  43.12 
 
 		 653 aa  517  1.0000000000000001e-145  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000221597  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1278  ABC transporter ATPase  45.08 
 
 		 625 aa  514  1e-144  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.760109  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1340  ABC transporter, ATP-binding protein  44.62 
 
 		 622 aa  506  9.999999999999999e-143  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1040  ABC transporter-related protein  40.99 
 
 		 629 aa  498  1e-140  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1814  ABC transporter related  41.71 
 
 		 639 aa  497  1e-139  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1447  ABC transporter related  41.85 
 
 		 632 aa  495  9.999999999999999e-139  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0462  ABC transporter ATPase  44.72 
 
 		 626 aa  494  9.999999999999999e-139  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1648  ABC transporter ATPase  45.32 
 
 		 623 aa  486  1e-136  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0123  ABC transporter related  41.31 
 
 		 643 aa  474  1e-132  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2868  ABC transporter, ATP-binding protein  40.78 
 
 		 642 aa  473  1e-132  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.914914  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1500  ABC transporter related  39.84 
 
 		 630 aa  469  1.0000000000000001e-131  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.384495  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2364  ABC transporter related  40 
 
 		 642 aa  469  1.0000000000000001e-131  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.217741  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2553  ABC transporter ATPase  40.78 
 
 		 642 aa  471  1.0000000000000001e-131  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2312  ABC transporter related  40.31 
 
 		 642 aa  467  9.999999999999999e-131  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1008  Fis family transcriptional regulator  39.9 
 
 		 629 aa  466  9.999999999999999e-131  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1823  ABC transporter related  39.78 
 
 		 632 aa  464  1e-129  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  decreased coverage  0.00644209  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0299  ABC transporter related  39.44 
 
 		 642 aa  456  1e-127  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_07215  ABC transporter ATP-binding protein  41.55 
 
 		 622 aa  453  1.0000000000000001e-126  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0718  ABC transporter related  40.06 
 
 		 626 aa  449  1e-125  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.332523  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3020  ABC transporter-like  39 
 
 		 646 aa  442  1e-123  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.511953  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3897  ABC transporter related  38.85 
 
 		 613 aa  443  1e-123  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0780  ATPase  39.2 
 
 		 630 aa  442  1e-123  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.989868  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0375  ATPase  39.74 
 
 		 631 aa  444  1e-123  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3547  ABC transporter-like protein protein  38.03 
 
 		 640 aa  426  1e-118  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4406  ABC transporter related protein  38.46 
 
 		 630 aa  422  1e-117  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.336146  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1822  ATPase  36.89 
 
 		 631 aa  420  1e-116  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0008  ABC transporter related  39.03 
 
 		 620 aa  420  1e-116  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.925372  normal  1 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_18141  hypothetical protein  35.92 
 
 		 641 aa  417  9.999999999999999e-116  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.0376333  normal  0.70207 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0950  ATPase  35.85 
 
 		 641 aa  414  1e-114  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.61977  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_03991  ABC transporter ATP-binding protein  35.67 
 
 		 652 aa  412  1e-114  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4996  ABC transporter related  37.24 
 
 		 620 aa  411  1e-113  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0514  ATPase  36.41 
 
 		 633 aa  407  1.0000000000000001e-112  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.11743  normal  0.506629 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1381  ATPase  36.97 
 
 		 641 aa  402  1e-111  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.981261  normal  0.290816 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4068  ABC transporter related  36.31 
 
 		 630 aa  400  9.999999999999999e-111  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.000000802504  hitchhiker  0.000858095 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_2115  ABC transporter related  36.16 
 
 		 621 aa  397  1e-109  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.0255573  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1225  ABC transporter, ATP-binding protein  34.98 
 
 		 623 aa  394  1e-108  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.701491 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_12061  ABC transporter ATPase  35.74 
 
 		 644 aa  394  1e-108  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.393632  normal  0.504812 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0800  ABC transporter, ATP-binding protein  36.13 
 
 		 622 aa  394  1e-108  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00285677 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1093  ABC transporter related  34.8 
 
 		 634 aa  392  1e-107  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2197  putative ABC transporter ATP-binding protein  39.24 
 
 		 551 aa  382  1e-105  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2008  putative ABC transporter ATP-binding protein  38.58 
 
 		 551 aa  373  1e-102  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2360  ABC transporter related  35.78 
 
 		 642 aa  370  1e-101  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.257541  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0587  putative ABC transporter ATP-binding protein  37.52 
 
 		 551 aa  371  1e-101  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2240  putative ABC transporter ATP-binding protein  37.52 
 
 		 551 aa  371  1e-101  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.497585 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2700  ABC transporter related  35.33 
 
 		 640 aa  370  1e-101  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.725807  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_08326  putative ATP-binding component of ABC transporter  36.61 
 
 		 564 aa  368  1e-100  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0490  putative ABC transporter ATP-binding protein  37.14 
 
 		 551 aa  367  1e-100  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.191061  normal  0.167217 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1284  putative ABC transporter ATP-binding protein  37.59 
 
 		 670 aa  366  1e-100  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2279  ABC transporter related  36.6 
 
 		 649 aa  366  1e-100  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2397  ABC transporter related  35.58 
 
 		 649 aa  367  1e-100  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2810  ABC transporter ATPase  36.14 
 
 		 631 aa  365  1e-99  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2479  ABC transporter-related protein  34.45 
 
 		 634 aa  365  1e-99  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0549886  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2351  putative ABC transporter ATP-binding protein  37.85 
 
 		 559 aa  365  1e-99  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.701309  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0918  ABC transporter related  35.65 
 
 		 688 aa  364  3e-99  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.101083 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2382  ABC transporter related  35.95 
 
 		 649 aa  363  6e-99  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.629954  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2991  putative ABC transporter ATP-binding protein  36.69 
 
 		 559 aa  363  6e-99  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.187094  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5700  ABC transporter, fused ATPase subunits  35.47 
 
 		 649 aa  362  1e-98  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1527  putative ABC transporter ATP-binding protein  35.3 
 
 		 559 aa  362  1e-98  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2523  ABC transporter-related protein  35.19 
 
 		 641 aa  362  1e-98  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.377883  normal  0.503235 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1749  ABC transporter related  35.78 
 
 		 661 aa  362  1e-98  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3285  ABC transporter related  35.67 
 
 		 636 aa  362  1e-98  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.000000124669  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2361  ABC transporter related  35.78 
 
 		 661 aa  362  1e-98  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1998  putative ABC transporter ATP-binding protein  35.62 
 
 		 563 aa  361  2e-98  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.237018  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3627  putative ABC transporter ATP-binding protein  37.05 
 
 		 551 aa  361  2e-98  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.108497 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2255  putative ABC transporter ATP-binding protein  37.57 
 
 		 555 aa  360  3e-98  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2125  ABC transporter related  35.42 
 
 		 641 aa  360  5e-98  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.279958 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1281  putative ABC transporter ATP-binding protein  36.02 
 
 		 561 aa  357  3.9999999999999996e-97  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.0000308368  n/a   
 
 
-
 
NC_009357  OSTLU_30493  ABC(ATP-binding) family transporter  38.05 
 
 		 723 aa  356  6.999999999999999e-97  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.658611 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1137  putative ABC transporter ATP-binding protein  36.94 
 
 		 560 aa  356  6.999999999999999e-97  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  decreased coverage  0.000210355  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1058  putative ABC transporter ATP-binding protein  37.01 
 
 		 560 aa  356  6.999999999999999e-97  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2087  ABC transporter, ATP-binding protein  35.13 
 
 		 648 aa  355  1e-96  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2525  ABC transporter, ATP-binding protein  35.13 
 
 		 660 aa  355  1e-96  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2207  ABC transporter, ATP-binding protein  35.13 
 
 		 648 aa  355  1e-96  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.829349  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1988  ABC transporter ATPase component  34.7 
 
 		 637 aa  355  1e-96  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0693  ABC transporter, ATP-binding protein  35.13 
 
 		 648 aa  355  1e-96  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0661  putative ABC transporter ATP-binding protein  35.92 
 
 		 560 aa  355  1e-96  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2916  putative ABC transporter ATP-binding protein  35.93 
 
 		 563 aa  355  1e-96  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0621526  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1136  ABC transporter, ATP-binding protein  35.13 
 
 		 660 aa  355  2e-96  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1144  ABC transporter, ATP-binding protein  35.13 
 
 		 660 aa  355  2e-96  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.261137  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2441  putative ABC transporter ATP-binding protein  36.09 
 
 		 558 aa  354  2.9999999999999997e-96  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00204105  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1298  ABC transporter, ATP-binding protein  35.13 
 
 		 1065 aa  354  2.9999999999999997e-96  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.524137  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2551  ABC transporter ATPase component  34.54 
 
 		 637 aa  354  2.9999999999999997e-96  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3340  ABC transporter, duplicated ATPase subunits  34.57 
 
 		 645 aa  354  2.9999999999999997e-96  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.790276  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2640  ABC transporter ATPase component  34.54 
 
 		 637 aa  354  2.9999999999999997e-96  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>