More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Syncc9605_0514 on replicon NC_007516
Organism: Synechococcus sp. CC9605



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007335  PMN2A_0950  ATPase  64.78 
 
 
641 aa  850    Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.61977  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_18141  hypothetical protein  64.15 
 
 
641 aa  840    Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.0376333  normal  0.70207 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1822  ATPase  82.78 
 
 
631 aa  1036    Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0514  ATPase  100 
 
 
633 aa  1276    Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.11743  normal  0.506629 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_12061  ABC transporter ATPase  63.24 
 
 
644 aa  842    Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.393632  normal  0.504812 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_03991  ABC transporter ATP-binding protein  72.96 
 
 
652 aa  945    Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2364  ABC transporter related  49.15 
 
 
642 aa  627  1e-178  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.217741  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2312  ABC transporter related  49.46 
 
 
642 aa  612  9.999999999999999e-175  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0299  ABC transporter related  47.05 
 
 
642 aa  605  9.999999999999999e-173  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3020  ABC transporter-like  48.14 
 
 
646 aa  593  1e-168  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.511953  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3547  ABC transporter-like protein protein  47.04 
 
 
640 aa  581  1e-164  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1381  ATPase  51.09 
 
 
641 aa  575  1.0000000000000001e-163  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.981261  normal  0.290816 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1814  ABC transporter related  44.15 
 
 
639 aa  544  1e-153  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3220  ABC transporter related  44.24 
 
 
653 aa  524  1e-147  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000221597  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1447  ABC transporter related  43.74 
 
 
632 aa  509  1e-143  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1040  ABC transporter-related protein  43.75 
 
 
629 aa  512  1e-143  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2308  ABC transporter, ATP-binding protein  43.86 
 
 
631 aa  502  1e-141  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000184058  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2190  ABC transporter, ATP-binding protein  43.86 
 
 
631 aa  502  1e-141  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.783831 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1613  ABC transporter-related protein  44.44 
 
 
630 aa  500  1e-140  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.000050504  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2225  ABC transporter, ATP-binding protein  43.86 
 
 
631 aa  499  1e-140  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.0000195061  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2010  ABC transporter ATP-binding protein  43.7 
 
 
631 aa  499  1e-140  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  unclonable  0.00000675061  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1982  ABC transporter, ATP-binding protein  43.7 
 
 
631 aa  500  1e-140  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000663544  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1964  ABC transporter, ATP-binding protein  43.7 
 
 
631 aa  500  1e-140  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0386922  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2164  ABC transporter ATP-binding protein  43.7 
 
 
631 aa  499  1e-140  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00326588  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1008  Fis family transcriptional regulator  43.3 
 
 
629 aa  499  1e-140  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2000  ABC transporter related  43.23 
 
 
631 aa  493  9.999999999999999e-139  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.000123424  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3145  ABC transporter, ATP-binding protein  43.39 
 
 
631 aa  494  9.999999999999999e-139  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.0000000568363  normal  0.0176571 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0123  ABC transporter related  42.81 
 
 
643 aa  493  9.999999999999999e-139  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0718  ABC transporter related  43.24 
 
 
626 aa  495  9.999999999999999e-139  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.332523  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1823  ABC transporter related  42.66 
 
 
632 aa  495  9.999999999999999e-139  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  decreased coverage  0.00644209  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2173  ABC transporter, ATP-binding protein  43.08 
 
 
631 aa  492  1e-137  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00208736  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1500  ABC transporter related  42.66 
 
 
630 aa  491  1e-137  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.384495  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1571  ABC transporter related  42.7 
 
 
631 aa  485  1e-136  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.459004  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0780  ATPase  42.43 
 
 
630 aa  483  1e-135  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.989868  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0375  ATPase  43.63 
 
 
631 aa  471  1.0000000000000001e-131  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2868  ABC transporter, ATP-binding protein  40.03 
 
 
642 aa  459  9.999999999999999e-129  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.914914  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2553  ABC transporter ATPase  39.81 
 
 
642 aa  458  1e-127  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_07215  ABC transporter ATP-binding protein  38.16 
 
 
622 aa  451  1e-125  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1225  ABC transporter, ATP-binding protein  40.44 
 
 
623 aa  444  1e-123  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.701491 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3897  ABC transporter related  37.94 
 
 
613 aa  443  1e-123  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4068  ABC transporter related  40.28 
 
 
630 aa  445  1e-123  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.000000802504  hitchhiker  0.000858095 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4996  ABC transporter related  37.95 
 
 
620 aa  434  1e-120  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0768  ABC transporter related  37.82 
 
 
636 aa  435  1e-120  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4406  ABC transporter related protein  37.93 
 
 
630 aa  427  1e-118  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.336146  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1093  ABC transporter related  37.31 
 
 
634 aa  426  1e-118  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_2115  ABC transporter related  37.29 
 
 
621 aa  422  1e-116  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.0255573  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0800  ABC transporter, ATP-binding protein  37.25 
 
 
622 aa  420  1e-116  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00285677 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1340  ABC transporter, ATP-binding protein  37.97 
 
 
622 aa  416  9.999999999999999e-116  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0383  ABC transporter, ATP-binding protein  36.41 
 
 
627 aa  415  1e-114  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.386036  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0462  ABC transporter ATPase  39.09 
 
 
626 aa  405  1.0000000000000001e-112  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2351  putative ABC transporter ATP-binding protein  38.7 
 
 
559 aa  405  1e-111  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.701309  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0760  ABC transporter related  35.71 
 
 
625 aa  405  1e-111  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0743  ABC transporter related  35.71 
 
 
625 aa  405  1e-111  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1278  ABC transporter ATPase  36.72 
 
 
625 aa  399  9.999999999999999e-111  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.760109  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0008  ABC transporter related  36.04 
 
 
620 aa  398  1e-109  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.925372  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0568  ABC transporter related protein  37.4 
 
 
632 aa  394  1e-108  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0238  putative ABC transporter ATP-binding protein  40.08 
 
 
559 aa  387  1e-106  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.331867 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1329  ABC transporter related protein  40.79 
 
 
554 aa  388  1e-106  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.461505  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0660  ABC transporter related  36.36 
 
 
626 aa  385  1e-105  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.14515  normal  0.023928 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2360  ABC transporter related  37.89 
 
 
642 aa  379  1e-104  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.257541  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2479  ABC transporter-related protein  37.19 
 
 
634 aa  380  1e-104  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0549886  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1199  ABC transporter related  38.46 
 
 
648 aa  380  1e-104  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.219582  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1284  putative ABC transporter ATP-binding protein  37.64 
 
 
670 aa  379  1e-104  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1614  putative ABC transporter ATP-binding protein  39.75 
 
 
556 aa  382  1e-104  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.682319  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2216  putative ABC transporter ATP-binding protein  39.82 
 
 
547 aa  379  1e-103  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.885012  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6107  ABC transporter related protein  40.04 
 
 
653 aa  378  1e-103  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2523  ABC transporter-related protein  37.29 
 
 
641 aa  376  1e-103  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.377883  normal  0.503235 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2105  putative ABC transporter ATP-binding protein  39.02 
 
 
555 aa  376  1e-103  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2552  ABC transporter-like protein  39.75 
 
 
554 aa  375  1e-102  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.410797 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1794  putative ABC transporter ATP-binding protein  39.89 
 
 
555 aa  373  1e-102  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.482874  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_08326  putative ATP-binding component of ABC transporter  38.46 
 
 
564 aa  373  1e-102  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5234  ABC transporter related protein  39.38 
 
 
555 aa  375  1e-102  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.547616  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_22290  putative ABC transporter ATP-binding protein  40.8 
 
 
559 aa  375  1e-102  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.793295  normal  0.525138 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1117  putative ABC transporter ATP-binding protein  38.35 
 
 
558 aa  372  1e-102  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.406197  hitchhiker  0.00000247304 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3426  ABC transporter related protein  39.06 
 
 
554 aa  373  1e-102  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.543642 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2255  putative ABC transporter ATP-binding protein  38.59 
 
 
555 aa  374  1e-102  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0893  putative ABC transporter ATP-binding protein  38.82 
 
 
560 aa  374  1e-102  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.100195  normal 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0300  putative ABC transporter ATP-binding protein  40.04 
 
 
559 aa  370  1e-101  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal  0.208774 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0928  ABC transporter related  35.39 
 
 
633 aa  371  1e-101  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.11608e-27 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2810  ABC transporter ATPase  39.29 
 
 
631 aa  370  1e-101  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4119  putative ABC transporter ATP-binding protein  39.35 
 
 
555 aa  371  1e-101  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2441  putative ABC transporter ATP-binding protein  38 
 
 
558 aa  371  1e-101  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00204105  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2700  ABC transporter related  37.64 
 
 
640 aa  370  1e-101  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.725807  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1527  putative ABC transporter ATP-binding protein  38.55 
 
 
559 aa  372  1e-101  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1998  putative ABC transporter ATP-binding protein  39.36 
 
 
563 aa  369  1e-101  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.237018  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3285  ABC transporter related  35.92 
 
 
636 aa  371  1e-101  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.000000124669  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3542  putative ABC transporter ATP-binding protein  39.29 
 
 
558 aa  370  1e-101  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.195737  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0661  putative ABC transporter ATP-binding protein  39.18 
 
 
560 aa  370  1e-101  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2382  ABC transporter related  36.46 
 
 
649 aa  367  1e-100  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.629954  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2279  ABC transporter related  36.62 
 
 
649 aa  367  1e-100  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3426  putative ABC transporter ATP-binding protein  37.5 
 
 
561 aa  367  1e-100  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1129  ABC transporter, ATP-binding protein YjiK  39.3 
 
 
558 aa  366  1e-100  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3318  ABC transporter related protein  35.74 
 
 
632 aa  367  1e-100  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5700  ABC transporter, fused ATPase subunits  36.46 
 
 
649 aa  366  1e-100  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2026  ABC transporter related protein  40.18 
 
 
557 aa  366  1e-100  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1845  putative ABC transporter ATP-binding protein  37.82 
 
 
556 aa  366  1e-100  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000460921 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3059  ABC transporter related  37.13 
 
 
628 aa  368  1e-100  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2397  ABC transporter related  36.46 
 
 
649 aa  367  1e-100  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1648  ABC transporter ATPase  37.97 
 
 
623 aa  369  1e-100  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2361  ABC transporter related  36.46 
 
 
661 aa  368  1e-100  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>