More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mjls_2978 on replicon NC_009077
Organism: Mycobacterium sp. JLS



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008726  Mvan_3302  ABC transporter-related protein  66.07 
 
 
606 aa  772    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2722  ABC transporter related protein  63.4 
 
 
631 aa  744    Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2978  ABC transporter related  100 
 
 
596 aa  1177    Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.013676  decreased coverage  0.00456661 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_13340  ATPase component of ABC transporters with duplicated ATPase domain  58.06 
 
 
630 aa  682    Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0691975  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_30250  ATPase component of ABC transporters with duplicated ATPase domain  67.76 
 
 
572 aa  723    Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.24394 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2744  ABC transporter related  57.52 
 
 
609 aa  687    Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11685  macrolide ABC transporter ATP-binding protein  64.21 
 
 
591 aa  741    Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.819157 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0977  ABC transporter related  60.9 
 
 
616 aa  671    Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.126442  hitchhiker  0.00329401 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1521  ABC transporter related protein  79.53 
 
 
601 aa  926    Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0493324  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1950  ABC transporter related  64.89 
 
 
615 aa  740    Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.975434 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_15000  ATPase component of ABC transporters with duplicated ATPase domain  54.01 
 
 
600 aa  633  1e-180  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.0302703  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1285  ABC transporter related  55.95 
 
 
610 aa  628  1e-178  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000856042 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_05410  ATPase component of ABC transporters with duplicated ATPase domain  56.84 
 
 
613 aa  620  1e-176  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.0302406  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1215  ABC transporter related  57.29 
 
 
608 aa  618  1e-176  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.207938  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3225  ABC transporter related protein  83.29 
 
 
377 aa  608  1e-173  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.704476  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0736  ABC transporter related  49.21 
 
 
630 aa  590  1e-167  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_08180  ATPase component of ABC transporters with duplicated ATPase domain protein  49.69 
 
 
632 aa  585  1.0000000000000001e-165  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal  0.195035 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0865  ABC transporter related protein  56.51 
 
 
608 aa  570  1e-161  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.380755  normal  0.901463 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3854  ABC transporter related  50.89 
 
 
611 aa  548  1e-155  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.53962  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1047  ABC transporter related  56.07 
 
 
606 aa  547  1e-154  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0409  ABC transporter, ATP-binding subunit  52.65 
 
 
596 aa  548  1e-154  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.722245  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3007  ABC transporter related  49.83 
 
 
600 aa  531  1e-149  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.333265  normal  0.911038 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2963  ABC transporter related  49.83 
 
 
600 aa  531  1e-149  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.616286  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3996  ABC transporter related protein  53.07 
 
 
592 aa  526  1e-148  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.181167 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0990  ABC transporter related protein  52.58 
 
 
588 aa  525  1e-148  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8452  ABC transporter related  51.14 
 
 
608 aa  525  1e-148  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.030329  decreased coverage  0.00000193115 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3959  ABC transporter related  50.89 
 
 
612 aa  520  1e-146  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.143764  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0772  ABC transporter related  49.37 
 
 
632 aa  511  1e-143  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.118352  normal  0.168546 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0513  ABC transporter related protein  49.67 
 
 
592 aa  511  1e-143  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3161  ABC transporter-like protein  50.89 
 
 
608 aa  502  1e-141  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.970833 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3947  ABC transporter related protein  50.66 
 
 
601 aa  497  1e-139  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0784  ABC transporter related  51.86 
 
 
598 aa  494  9.999999999999999e-139  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3518  ABC transporter related  49.59 
 
 
587 aa  493  9.999999999999999e-139  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.284469  normal  0.409112 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0493  ABC transporter related protein  53.67 
 
 
602 aa  490  1e-137  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.518307  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0728  ABC transporter related  51.78 
 
 
598 aa  489  1e-137  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000999119 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_32430  ATPase component of ABC transporters with duplicated ATPase domain protein  49.84 
 
 
600 aa  488  1e-136  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.775156  normal  0.436846 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0650  ABC transporter related  49.25 
 
 
590 aa  485  1e-135  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_03410  ATPase component of ABC transporters with duplicated ATPase domain  48.57 
 
 
628 aa  479  1e-134  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8616  ABC transporter ATP-binding protein  49.43 
 
 
602 aa  479  1e-134  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4554  ABC transporter related  47.61 
 
 
617 aa  452  1e-125  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1040  ABC transporter-related protein  37.91 
 
 
629 aa  372  1e-101  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0338  ABC transporter, ATP-binding protein  59.27 
 
 
704 aa  367  1e-100  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1500  ABC transporter related  36.36 
 
 
630 aa  362  1e-98  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.384495  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1823  ABC transporter related  36.07 
 
 
632 aa  361  2e-98  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  decreased coverage  0.00644209  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3220  ABC transporter related  36.78 
 
 
653 aa  359  8e-98  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000221597  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1046  ABC transporter ATPase  59.93 
 
 
758 aa  358  9.999999999999999e-98  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1447  ABC transporter related  36.31 
 
 
632 aa  355  1e-96  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1008  Fis family transcriptional regulator  35.99 
 
 
629 aa  354  2e-96  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2173  ABC transporter, ATP-binding protein  36.51 
 
 
631 aa  354  2.9999999999999997e-96  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00208736  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3145  ABC transporter, ATP-binding protein  36.35 
 
 
631 aa  352  1e-95  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.0000000568363  normal  0.0176571 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1814  ABC transporter related  32.6 
 
 
639 aa  349  9e-95  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2000  ABC transporter related  35.88 
 
 
631 aa  347  3e-94  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.000123424  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1982  ABC transporter, ATP-binding protein  35.73 
 
 
631 aa  344  2e-93  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000663544  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1964  ABC transporter, ATP-binding protein  35.73 
 
 
631 aa  344  2e-93  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0386922  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2225  ABC transporter, ATP-binding protein  35.73 
 
 
631 aa  344  2.9999999999999997e-93  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.0000195061  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2308  ABC transporter, ATP-binding protein  35.73 
 
 
631 aa  344  2.9999999999999997e-93  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000184058  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0780  ATPase  37.88 
 
 
630 aa  342  9e-93  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.989868  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0375  ATPase  36.92 
 
 
631 aa  341  2.9999999999999998e-92  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2190  ABC transporter, ATP-binding protein  35.41 
 
 
631 aa  340  5.9999999999999996e-92  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.783831 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2010  ABC transporter ATP-binding protein  35.41 
 
 
631 aa  338  1.9999999999999998e-91  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  unclonable  0.00000675061  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2164  ABC transporter ATP-binding protein  35.41 
 
 
631 aa  338  1.9999999999999998e-91  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00326588  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2868  ABC transporter, ATP-binding protein  33.8 
 
 
642 aa  338  1.9999999999999998e-91  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.914914  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2553  ABC transporter ATPase  33.96 
 
 
642 aa  337  3.9999999999999995e-91  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_07215  ABC transporter ATP-binding protein  33.28 
 
 
622 aa  336  7e-91  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1613  ABC transporter-related protein  35.99 
 
 
630 aa  336  9e-91  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.000050504  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_2115  ABC transporter related  32.7 
 
 
621 aa  334  2e-90  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.0255573  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0718  ABC transporter related  35.65 
 
 
626 aa  333  4e-90  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.332523  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0768  ABC transporter related  34.57 
 
 
636 aa  333  5e-90  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0123  ABC transporter related  33.9 
 
 
643 aa  332  2e-89  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4068  ABC transporter related  34.31 
 
 
630 aa  331  2e-89  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.000000802504  hitchhiker  0.000858095 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0299  ABC transporter related  31.68 
 
 
642 aa  330  3e-89  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2312  ABC transporter related  32.4 
 
 
642 aa  330  4e-89  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3020  ABC transporter-like  32.92 
 
 
646 aa  328  1.0000000000000001e-88  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.511953  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4996  ABC transporter related  31.06 
 
 
620 aa  327  3e-88  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2364  ABC transporter related  31.47 
 
 
642 aa  327  5e-88  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.217741  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1571  ABC transporter related  35.09 
 
 
631 aa  325  2e-87  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.459004  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1381  ATPase  35.85 
 
 
641 aa  320  5e-86  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.981261  normal  0.290816 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3897  ABC transporter related  36.35 
 
 
613 aa  318  2e-85  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0760  ABC transporter related  34.77 
 
 
625 aa  316  7e-85  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0743  ABC transporter related  34.77 
 
 
625 aa  316  7e-85  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4406  ABC transporter related protein  33.02 
 
 
630 aa  315  9.999999999999999e-85  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.336146  normal 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0383  ABC transporter, ATP-binding protein  34.44 
 
 
627 aa  313  6.999999999999999e-84  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.386036  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1093  ABC transporter related  31.85 
 
 
634 aa  312  1e-83  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3547  ABC transporter-like protein protein  31.91 
 
 
640 aa  308  1.0000000000000001e-82  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0008  ABC transporter related  31.24 
 
 
620 aa  305  1.0000000000000001e-81  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.925372  normal 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1278  ABC transporter ATPase  33.76 
 
 
625 aa  305  1.0000000000000001e-81  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.760109  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0950  ATPase  32.13 
 
 
641 aa  298  2e-79  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.61977  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3230  ABC transporter related protein  73.45 
 
 
228 aa  298  2e-79  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1225  ABC transporter, ATP-binding protein  31.81 
 
 
623 aa  298  3e-79  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.701491 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_18141  hypothetical protein  31.97 
 
 
641 aa  294  3e-78  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.0376333  normal  0.70207 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0800  ABC transporter, ATP-binding protein  30.93 
 
 
622 aa  292  1e-77  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00285677 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0514  ATPase  34.38 
 
 
633 aa  291  2e-77  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.11743  normal  0.506629 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_12061  ABC transporter ATPase  30.36 
 
 
644 aa  287  2.9999999999999996e-76  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.393632  normal  0.504812 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1262  ABC transporter, ATPase subunit  31.09 
 
 
598 aa  284  3.0000000000000004e-75  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1822  ATPase  33.49 
 
 
631 aa  283  9e-75  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1340  ABC transporter, ATP-binding protein  32.8 
 
 
622 aa  279  1e-73  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6107  ABC transporter related protein  36.21 
 
 
653 aa  279  1e-73  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009357  OSTLU_30493  ABC(ATP-binding) family transporter  36.26 
 
 
723 aa  271  2e-71  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal  0.658611 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_03991  ABC transporter ATP-binding protein  30.53 
 
 
652 aa  270  5e-71  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3318  ABC transporter related protein  32.47 
 
 
632 aa  267  4e-70  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>