More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gobs_0493 on replicon NC_013757
Organism: Geodermatophilus obscurus DSM 43160



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009953  Sare_0728  ABC transporter related  60.87 
 
 		 598 aa  650    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000999119 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0409  ABC transporter, ATP-binding subunit  59.7 
 
 		 596 aa  645    Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.722245  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0772  ABC transporter related  58.93 
 
 		 632 aa  635    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.118352  normal  0.168546 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0784  ABC transporter related  62.04 
 
 		 598 aa  676    Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0650  ABC transporter related  61.98 
 
 		 590 aa  676    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0493  ABC transporter related protein  100 
 
 		 602 aa  1186    Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.518307  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3959  ABC transporter related  58.39 
 
 		 612 aa  632  1e-180  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.143764  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3996  ABC transporter related protein  60.03 
 
 		 592 aa  622  1e-177  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.181167 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0513  ABC transporter related protein  59.27 
 
 		 592 aa  616  1e-175  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8452  ABC transporter related  56.38 
 
 		 608 aa  614  9.999999999999999e-175  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.030329  decreased coverage  0.00000193115 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0990  ABC transporter related protein  61.28 
 
 		 588 aa  610  1e-173  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_32430  ATPase component of ABC transporters with duplicated ATPase domain protein  57 
 
 		 600 aa  607  9.999999999999999e-173  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.775156  normal  0.436846 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3161  ABC transporter-like protein  57.77 
 
 		 608 aa  608  9.999999999999999e-173  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.970833 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3947  ABC transporter related protein  58.78 
 
 		 601 aa  605  9.999999999999999e-173  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3854  ABC transporter related  55.7 
 
 		 611 aa  596  1e-169  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.53962  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2963  ABC transporter related  54.35 
 
 		 600 aa  593  1e-168  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.616286  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3007  ABC transporter related  54.35 
 
 		 600 aa  593  1e-168  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.333265  normal  0.911038 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8616  ABC transporter ATP-binding protein  56.55 
 
 		 602 aa  583  1.0000000000000001e-165  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0865  ABC transporter related protein  58.56 
 
 		 608 aa  577  1.0000000000000001e-163  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.380755  normal  0.901463 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1285  ABC transporter related  52.7 
 
 		 610 aa  564  1.0000000000000001e-159  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000856042 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3518  ABC transporter related  55.29 
 
 		 587 aa  557  1e-157  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.284469  normal  0.409112 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_03410  ATPase component of ABC transporters with duplicated ATPase domain  52.69 
 
 		 628 aa  552  1e-156  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_05410  ATPase component of ABC transporters with duplicated ATPase domain  52.51 
 
 		 613 aa  545  1e-154  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.0302406  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4554  ABC transporter related  52.44 
 
 		 617 aa  540  9.999999999999999e-153  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1047  ABC transporter related  56.96 
 
 		 606 aa  535  1e-151  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1215  ABC transporter related  51.35 
 
 		 608 aa  536  1e-151  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.207938  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1521  ABC transporter related protein  52.6 
 
 		 601 aa  526  1e-148  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0493324  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2722  ABC transporter related protein  47.5 
 
 		 631 aa  518  1e-146  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11685  macrolide ABC transporter ATP-binding protein  47.93 
 
 		 591 aa  507  9.999999999999999e-143  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.819157 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0977  ABC transporter related  51.37 
 
 		 616 aa  505  9.999999999999999e-143  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.126442  hitchhiker  0.00329401 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1950  ABC transporter related  49.35 
 
 		 615 aa  507  9.999999999999999e-143  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.975434 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2978  ABC transporter related  51.57 
 
 		 596 aa  506  9.999999999999999e-143  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.013676  decreased coverage  0.00456661 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3302  ABC transporter-related protein  47.64 
 
 		 606 aa  500  1e-140  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_30250  ATPase component of ABC transporters with duplicated ATPase domain  50.77 
 
 		 572 aa  502  1e-140  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.24394 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_15000  ATPase component of ABC transporters with duplicated ATPase domain  45.8 
 
 		 600 aa  482  1e-135  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.0302703  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2744  ABC transporter related  45.41 
 
 		 609 aa  478  1e-133  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_13340  ATPase component of ABC transporters with duplicated ATPase domain  53.28 
 
 		 630 aa  468  9.999999999999999e-131  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0691975  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0736  ABC transporter related  40.7 
 
 		 630 aa  435  1e-120  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_08180  ATPase component of ABC transporters with duplicated ATPase domain protein  46.1 
 
 		 632 aa  419  9.999999999999999e-116  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  0.195035 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3220  ABC transporter related  36.29 
 
 		 653 aa  403  1e-111  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000221597  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0123  ABC transporter related  35.15 
 
 		 643 aa  403  1e-111  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2225  ABC transporter, ATP-binding protein  37.15 
 
 		 631 aa  399  9.999999999999999e-111  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.0000195061  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1982  ABC transporter, ATP-binding protein  37.15 
 
 		 631 aa  399  9.999999999999999e-111  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000663544  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1964  ABC transporter, ATP-binding protein  37.15 
 
 		 631 aa  399  9.999999999999999e-111  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0386922  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1814  ABC transporter related  34.85 
 
 		 639 aa  399  9.999999999999999e-111  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2308  ABC transporter, ATP-binding protein  37.15 
 
 		 631 aa  400  9.999999999999999e-111  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000184058  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3145  ABC transporter, ATP-binding protein  37.77 
 
 		 631 aa  396  1e-109  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.0000000568363  normal  0.0176571 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2010  ABC transporter ATP-binding protein  36.99 
 
 		 631 aa  396  1e-109  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  unclonable  0.00000675061  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2190  ABC transporter, ATP-binding protein  36.99 
 
 		 631 aa  398  1e-109  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.783831 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2000  ABC transporter related  36.68 
 
 		 631 aa  397  1e-109  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.000123424  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1447  ABC transporter related  37.98 
 
 		 632 aa  396  1e-109  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2164  ABC transporter ATP-binding protein  36.99 
 
 		 631 aa  396  1e-109  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00326588  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2173  ABC transporter, ATP-binding protein  37.15 
 
 		 631 aa  398  1e-109  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00208736  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_07215  ABC transporter ATP-binding protein  33.28 
 
 		 622 aa  389  1e-107  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2868  ABC transporter, ATP-binding protein  35.68 
 
 		 642 aa  391  1e-107  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.914914  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1613  ABC transporter-related protein  36.44 
 
 		 630 aa  388  1e-106  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.000050504  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2553  ABC transporter ATPase  35.68 
 
 		 642 aa  389  1e-106  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1823  ABC transporter related  36.54 
 
 		 632 aa  383  1e-105  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  decreased coverage  0.00644209  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1040  ABC transporter-related protein  35.46 
 
 		 629 aa  384  1e-105  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0768  ABC transporter related  34.66 
 
 		 636 aa  376  1e-103  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0718  ABC transporter related  37.46 
 
 		 626 aa  376  1e-103  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.332523  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1571  ABC transporter related  36.08 
 
 		 631 aa  372  1e-102  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.459004  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1008  Fis family transcriptional regulator  35.95 
 
 		 629 aa  374  1e-102  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0780  ATPase  37.7 
 
 		 630 aa  372  1e-101  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.989868  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0375  ATPase  38.32 
 
 		 631 aa  370  1e-101  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1225  ABC transporter, ATP-binding protein  35.88 
 
 		 623 aa  367  1e-100  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.701491 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0800  ABC transporter, ATP-binding protein  33.12 
 
 		 622 aa  365  1e-100  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00285677 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1500  ABC transporter related  35.02 
 
 		 630 aa  369  1e-100  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.384495  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3020  ABC transporter-like  35.5 
 
 		 646 aa  364  3e-99  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.511953  normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0514  ATPase  36.02 
 
 		 633 aa  360  3e-98  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.11743  normal  0.506629 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3897  ABC transporter related  33.94 
 
 		 613 aa  358  9.999999999999999e-98  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4406  ABC transporter related protein  34.85 
 
 		 630 aa  358  1.9999999999999998e-97  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.336146  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0299  ABC transporter related  32.15 
 
 		 642 aa  358  1.9999999999999998e-97  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_2115  ABC transporter related  32.38 
 
 		 621 aa  357  2.9999999999999997e-97  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.0255573  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2364  ABC transporter related  32.97 
 
 		 642 aa  354  2.9999999999999997e-96  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.217741  normal  1 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0743  ABC transporter related  35.69 
 
 		 625 aa  353  4e-96  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0760  ABC transporter related  35.69 
 
 		 625 aa  353  4e-96  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0383  ABC transporter, ATP-binding protein  34.78 
 
 		 627 aa  353  5.9999999999999994e-96  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.386036  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1278  ABC transporter ATPase  34.23 
 
 		 625 aa  353  5.9999999999999994e-96  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.760109  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2312  ABC transporter related  32.51 
 
 		 642 aa  352  1e-95  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3225  ABC transporter related protein  52.28 
 
 		 377 aa  350  3e-95  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.704476  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4996  ABC transporter related  32.19 
 
 		 620 aa  350  6e-95  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4068  ABC transporter related  33.39 
 
 		 630 aa  348  2e-94  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.000000802504  hitchhiker  0.000858095 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1381  ATPase  35.87 
 
 		 641 aa  342  9e-93  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.981261  normal  0.290816 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6107  ABC transporter related protein  39.14 
 
 		 653 aa  342  1e-92  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3547  ABC transporter-like protein protein  34.37 
 
 		 640 aa  342  1e-92  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1340  ABC transporter, ATP-binding protein  33.83 
 
 		 622 aa  340  4e-92  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0008  ABC transporter related  31.25 
 
 		 620 aa  337  5e-91  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.925372  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1822  ATPase  33.86 
 
 		 631 aa  337  5e-91  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_12061  ABC transporter ATPase  30.93 
 
 		 644 aa  337  5e-91  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.393632  normal  0.504812 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_03991  ABC transporter ATP-binding protein  34.91 
 
 		 652 aa  335  1e-90  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0950  ATPase  33.18 
 
 		 641 aa  327  3e-88  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.61977  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_18141  hypothetical protein  32.87 
 
 		 641 aa  325  1e-87  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.0376333  normal  0.70207 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1361  putative ABC transporter ATP-binding protein  35.7 
 
 		 561 aa  319  1e-85  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000127735  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0036  putative ABC transporter ATP-binding protein  38.52 
 
 		 555 aa  318  2e-85  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0037  putative ABC transporter ATP-binding protein  38.52 
 
 		 555 aa  318  2e-85  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.264543  normal  0.674738 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2216  putative ABC transporter ATP-binding protein  37.24 
 
 		 547 aa  315  9.999999999999999e-85  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.885012  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0462  ABC transporter ATPase  34.1 
 
 		 626 aa  315  9.999999999999999e-85  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3681  putative ABC transporter ATP-binding protein  38.01 
 
 		 553 aa  313  3.9999999999999997e-84  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2441  putative ABC transporter ATP-binding protein  36.7 
 
 		 558 aa  313  6.999999999999999e-84  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00204105  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>